Nnt (гены)

ННТ
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1DJL, 1PT9, 1U31
Идентификаторы
Псевдонимы	NNT , GCCD4, никотинамид нуклеотид -трансидрогеназа
Внешние идентификаторы	Омим : 607878 ; MGI : 109279 ; Гомологен : 7445 ; GeneCards : NNT ; OMA : NNT - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	43,707,405 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	119,545,533 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right ventricle; ; muscle of thigh; ; biceps brachii; ; thoracic diaphragm; ; left ventricle; ; right auricle; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; gastrocnemius muscle; ; vastus lateralis muscle;
	Top expressed in
	right kidney; ; granulocyte; ; muscle of thigh; ; tail of embryo; ; ventricular zone; ; genital tubercle; ; yolk sac; ; urethra; ; embryo; ; neural tube;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	oxidoreductase activity; NAD binding; NAD(P)+ transhydrogenase (AB-specific) activity; NAD(P)+ transhydrogenase (B-specific) activity; NAD(P)+ transhydrogenase activity; NADP binding;
Cellular component	integral component of membrane; mitochondrial inner membrane; membrane; mitochondrion; mitochondrial respirasome;
Biological process	reactive oxygen species metabolic process; tricarboxylic acid cycle; NADPH regeneration; proton transmembrane transport; negative regulation of protein phosphorylation; positive regulation of mitochondrial membrane potential; oxygen homeostasis; response to vitamin; negative regulation of apoptotic process; cell redox homeostasis; cellular oxidant detoxification; positive regulation of hydrogen peroxide catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23530
	18115
	ENSG00000112992
	Ensmusg00000025453
	Q13423
	Q61941
	NM_012343 ; NM_182977 ; NM_001331026
	NM_008710 ; NM_001308506
	NP_001317955 ; NP_036475 ; NP_892022
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

NAD (P) трансидрогеназа, митохондриальный - это фермент , который у людей кодируется NNT геном на хромосоме 5. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Ген NNT содержит 26 экзонов и кодирует белок траншидрогеназы , который составляет ~ 109 кДа в молекулярной массе и участвует в антиоксидантной защите в митохондриях . Для этого гена были обнаружены два альтернативных варианта сплайсинга, кодирующих один и тот же белок. ^{[ 7 ]}

Структура

Трансидрогеназы, включая NNT, могут существовать в «открытой» конформации, ^{[ 8 ]} Там, где субстраты могут связываться, а продукты могут диссоциации, при которых кольца дигидроникотинамида и никотинамида удерживаются отдельно для блокировки переноса гидрида. Он может существовать в «окклюзированной» конформации, где субстраты перемещаются в приложение, чтобы разрешить окислительно -восстановительную химию. ^{[ 8 ]} Белок содержит три субъединицы (DI, DII и DIII), с компонентом DII, охватывающей внутреннюю митохондриальную мембрану. ^{[ 9 ]} Рентгеновская кристаллографическая структура белка показывает, что протонная накачка, вероятно, связана с изменениями в сродстве связывания Diii для NADP (+) и NADPH. Первый мотив Betaalphabetaalphabeta of Diii содержит отпечаток пальца Gly-X-Gly-xx-Ala/Val, тогда как никотинамидное кольцо NADP (+) расположено на гребне, где оно может взаимодействовать с NADH на субъединице DI. ^{[ 9 ]}

Функция

NAD (P) траншидрогеназа, митохондриальная является интегральным белком внутренней митохондриальной мембраны . Фермент объединяет перенос гидрида восстанавливающего эквивалента между NAD (H) и NADP (+) для транслокации протона через внутреннюю митохондриальную мембрану . В большинстве физиологических условий фермент использует энергию из митохондриального протонного градиента, чтобы получить высокие концентрации NADPH. Полученный NADPH используется для биосинтеза, а также в реакциях внутри митохондрий, необходимых для удаления активных форм кислорода , таких как для сохранения уменьшенного пула глутатиона (высокое отношение GSH/GSSG). Фермент может быть инактивирован путем окислительных модификаций. ^{[ 10 ]}

Реакция катализирована:

Nadph + nad + = nadp + + nadh.

Клиническое значение

NAD (P) Траншидрогеназа, митохондриальная численность может быть связана с сердечной недостаточностью человека . ^{[ 11 ]} активность в митохондриях и способности митохондрий поддерживать градиенты протонов , что может негативно влиять сердца частичная потеря митохондриальной активности митохондриальной активности NAD (P) трансидрогеназы негативно влияет на NADPH-зависимую ферментную В сбой Усугубляет окислительное повреждение клеточных белков. ^{[ 11 ]}

Мутации в гене NNT были связаны с семейным дефицитом глюкокортикоидов 1 , тяжелым аутосомно -рецессивным к гормона воздействию адренокортикотропному у человека, характеризующегося нечувствительностью заболеванием ^{[ 12 ]} Дефицит глюкокортикоидов 1 обычно проявляется у новорожденных до раннего детства с эпизодами гипогликемии и других симптомов, связанных с дефицитом кортизола, включая неспособность процветать, рецидивирующие заболевания или инфекции, судороги и шок. Диагноз подтверждается с низким измерением кортизола плазмы в присутствии повышенного уровня адренокортикотропного гормона , а также нормальных альдостерона и плазмы . ренина измерений ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000112992 - Ensembl , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000025453 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Arkblad EL, Helou K, Levan G, Rydström J (сентябрь 1997). «Картирование гена никотинамида нуклеотид -нуклеотида крысы и мыши». Геном млекопитающих . 8 (9): 703. DOI : 10.1007/S003359900546 . PMID 9271681 . S2CID 33003109 .
^ Зигер Б., Уэйр Дж (май 1998). «Клонирование и выведенная аминокислотная последовательность никотинамида нуклеотид -трансидрогеназы человека». Последовательность ДНК . 7 (6): 369–73. doi : 10.3109/10425179709034058 . PMID 9524818 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: NNT Никотинамид нуклеотид -траншидрогеназа» .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Джексон Дж.Б. (2003). «Протонная транслокация трансидрогеназой». Фебс Летт . 545 (1): 18–24. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 00388-0 . PMID 12788487 . S2CID 29235071 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} White SA, Peake SJ, McSweeney S, Leonard G, Cotton NP, Jackson JB (2000). «Структура с высоким разрешением компонента NADP (H)-связывающего (DIII) протон-транслокации траншидрогеназы из митохондрий сердца человека» . Структура 8 (1): 1–12. doi : 10.1016/s0969-2126 (00) 00075-7 . PMID 10673423 .
^ Forsmark-andrée P, Persson B, Rady R, Dallner G, Ernster L (1996). «Окислительная модификация никотинамидной нуклеотид -траншидрогеназы в подчиненных частицах: эффект эндогенного убиквинола». Архи Биохимия. Биофиз . 336 (1): 113–20. doi : 10.1006/abbi.1996.0538 . PMID 8951041 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Ширан Ф.Л., Райдстрем Дж., Шакхпонова М.И., Пест для Пествл Н.Б., Пепе С. (2010). «Уменьшенная активность NADPH Transhydrogenase и митохондриальная окислительно -восстановительная регуляция при миокарде с неудачным человеком» . Биохим. Биофиз. Акт . 1797 (6–7): 1138–48. doi : 10.1016/j.bbabio.2010.04.002 . PMID 20388492 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Meimaridou E, Kowalczyk J, Guasti L, Hughes CR, Wagner F, Frommolt P, Nürnberg P, Mann NP, Banerjee R, Saka HN, Chapple JP, King PJ, Clark AJ, Metherell LA (Jul 2012). «Мутации в NNT, кодирующем никотинамид нуклеотид -траншидрогеназу, вызывают семейный дефицит глюкокортикоидов» . Природа генетика . 44 (7): 740–2. doi : 10.1038/ng.2299 . PMC 3386896 . PMID 22634753 .

Дальнейшее чтение

Джексон JB (Jun 2003). «Протонная транслокация трансидрогеназой». Письма Febs . 545 (1): 18–24. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 00388-0 . PMID 12788487 . S2CID 29235071 .
Arkblad EL, Betsholtz C, Rydström J (Mar 1996). «Последовательность кДНК накапливающей протон-никотинамид-нуклеотид-траншидрогеназы от человека и мыши» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика . 1273 (3): 203–5. doi : 10.1016/0005-2728 (95) 00159-x . PMID 8616157 .
Forsmark-andrée P, Persson B, Rady R, Dallner G, Ernster L (декабрь 1996 г.). «Окислительная модификация никотинамидной нуклеотид -траншидрогеназы в подчиненных частицах: эффект эндогенного убиквинола». Архивы биохимии и биофизики . 336 (1): 113–20. doi : 10.1006/abbi.1996.0538 . PMID 8951041 .
White SA, Peake SJ, McSweeney S, Leonard G, Cotton NP, Jackson JB (январь 2000). «Структура с высоким разрешением компонента NADP (H)-связывающего (DIII) протон-транслокации траншидрогеназы из митохондрий сердца человека» . Структура 8 (1): 1–12. doi : 10.1016/s0969-2126 (00) 00075-7 . PMID 10673423 .
Пик С.Дж., Джексон Дж.Б., Белая С.А. (апрель 2000 г.). «Компонент NADP (H) -связан (DIII) сердечного сердца траншидрогеназы: кристаллизация и предварительный кристаллографический анализ». Acta Crystallographica Раздел d . 56 (Pt 4): 489–91. Bibcode : 2000ccrd..56..489p . doi : 10.1107/s0907444900001542 . PMID 10739929 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (ноябрь 2000). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Исследование генома . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, потому что B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Behrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder A, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder. , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (март 2001 г.). «На пути к каталогу генов человека и белка: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Исследование генома . 11 (3): 422–35. Doi : 10.1101/gr.gr1547r . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Arkblad EL, Egorov M, Shakhparonov M, Romanova L, Polzikov M, Rydström J (сентябрь 2002 г.). «Экспрессия протонной никотинамидной нуклеотид-траншидрогеназы у мышей, мозга человека и C Elegans». Сравнительная биохимия и физиология б . 133 (1): 13–21. doi : 10.1016/s1096-4959 (02) 00107-0 . PMID 12223207 .
Тейлор С.В., Фахи Э., Чжан Б., Гленн Г.М., Уорнок Д.Е., Вили С., Мерфи А.Н., Гоухер С.П., Капальди Р.А., Гибсон Б.В., Гош С.С. (март 2003 г.). «Характеристика человеческого митохондриального протеома сердца». Nature Biotechnology . 21 (3): 281–6. doi : 10.1038/nbt793 . PMID 12592411 . S2CID 27329521 .
С Who Sho, Whol, Uttly de, Brake W, Watertleu R, Shutt, рядом с Jolder H, Netlistur H, Poletska и (Oecti1). «От Orfeomom до Bioloy: в функциональной Gipomics Pillinine» . Исследование генома . 14 (10b): 2136-44. Doi : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Й., Ота Т., Нишикава Т., Ямашита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К, Вакагури Х, Ишии С., Сугияма Т, Сайто К, Я Сон Й, Ири Р., Кушида Н., Йониама Т, Оцука Р., Канда К., Йокои Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Ишида С., Ишаби Т., Такахаши-Фудзи А., Танасе Т., Нагаи К, Кикучи Х, Накай К, Я Согай Т, Сугано С. года 2006 Январь Полем
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, Del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (январь 2006 г.). «База данных LIFEDB в 2006 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 34 (проблема базы данных): D415-8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000112992 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000025453 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9271681-5] Arkblad EL, Helou K, Levan G, Rydström J (сентябрь 1997). «Картирование гена никотинамида нуклеотид -нуклеотида крысы и мыши». Геном млекопитающих . 8 (9): 703. DOI : 10.1007/S003359900546 . PMID 9271681 . S2CID 33003109 .

[pmid9524818-6] Зигер Б., Уэйр Дж (май 1998). «Клонирование и выведенная аминокислотная последовательность никотинамида нуклеотид -трансидрогеназы человека». Последовательность ДНК . 7 (6): 369–73. doi : 10.3109/10425179709034058 . PMID 9524818 .

[entrez-7] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: NNT Никотинамид нуклеотид -траншидрогеназа» .

[Jackson_2003-8] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Джексон Дж.Б. (2003). «Протонная транслокация трансидрогеназой». Фебс Летт . 545 (1): 18–24. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 00388-0 . PMID 12788487 . S2CID 29235071 .

[ReferenceA-9] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} White SA, Peake SJ, McSweeney S, Leonard G, Cotton NP, Jackson JB (2000). «Структура с высоким разрешением компонента NADP (H)-связывающего (DIII) протон-транслокации траншидрогеназы из митохондрий сердца человека» . Структура 8 (1): 1–12. doi : 10.1016/s0969-2126 (00) 00075-7 . PMID 10673423 .

[10] Forsmark-andrée P, Persson B, Rady R, Dallner G, Ernster L (1996). «Окислительная модификация никотинамидной нуклеотид -траншидрогеназы в подчиненных частицах: эффект эндогенного убиквинола». Архи Биохимия. Биофиз . 336 (1): 113–20. doi : 10.1006/abbi.1996.0538 . PMID 8951041 .

[Sheeran_FL_2010-11] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Ширан Ф.Л., Райдстрем Дж., Шакхпонова М.И., Пест для Пествл Н.Б., Пепе С. (2010). «Уменьшенная активность NADPH Transhydrogenase и митохондриальная окислительно -восстановительная регуляция при миокарде с неудачным человеком» . Биохим. Биофиз. Акт . 1797 (6–7): 1138–48. doi : 10.1016/j.bbabio.2010.04.002 . PMID 20388492 .

[doi.10.1038/ng.2299-12] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Meimaridou E, Kowalczyk J, Guasti L, Hughes CR, Wagner F, Frommolt P, Nürnberg P, Mann NP, Banerjee R, Saka HN, Chapple JP, King PJ, Clark AJ, Metherell LA (Jul 2012). «Мутации в NNT, кодирующем никотинамид нуклеотид -траншидрогеназу, вызывают семейный дефицит глюкокортикоидов» . Природа генетика . 44 (7): 740–2. doi : 10.1038/ng.2299 . PMC 3386896 . PMID 22634753 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]