Белковый домен EIF-W2
| П2 | |||
|---|---|---|---|
 кристаллическая структура каталитического фрагмента фактора инициации эукариот 2b эпсилон | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | П2 | ||
| Пфам | ПФ02020 | ||
| Пфам Клан | CL0020 | ||
| ИнтерПро | ИПР003307 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1пак / ОБЪЕМ / СУПФАМ | ||
| |||
В молекулярной биологии белковый домен eIF4-гамма/eIF5/eIF2-эпсилон представляет собой семейство эволюционно родственных белков . Этот домен находится на С-конце нескольких трансляции факторов инициации . [ 1 ] Впервые он был обнаружен на самых С-концах дрожжевого белка GCD6, eIF-2B epsilon, и двух других эукариотических факторов инициации трансляции, eIF-4 gamma и eIF-5, и может участвовать во взаимодействии eIF-2B, eIF-4 гамма и eIF-5 с eIF-2. [ 1 ]
Функция
[ редактировать ]В молекулярной биологии домен eIF-W2 функционирует как сайт связывания для киназы Mnk eIF4E . [ 2 ] фермент, фосфорилирующий фактор инициации эукариот 4E ( eIF4E ). W2 Для eIF2B-эпсилон С-концевой домен участвует в обмене гуаниновых нуклеотидов на eIF2. Для eIF5 домен W2 участвует в формировании многофакторного комплекса (MFC) с eIF1 , eIF2-GTP , eIF3 и Met-tRNAiMet. и С-концевой домен W2 eIF5 прилегающая к нему N-концевая линкерная область ответственны за активность GDI против eIF2-GDP. [ 3 ]
Доменная структура
[ редактировать ]Домен W2 имеет глобулярную складку и состоит исключительно из альфа-спиралей . [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Структуру С-концевое ядро , можно разделить на структурное две N-концевые спирали к которому прикреплены . Ядро содержит две области, богатые ароматическими/кислотными остатками (блоки АА), важные для обеспечения белок-белковых взаимодействий .
Эта запись охватывает весь домен W2, входящий в клан TPR .
Перевод
[ редактировать ]Инициация трансляции — это хорошо регулируемый и высокоскоординированный клеточный процесс у эукариот, в который включены по меньшей мере 11 эукариотических факторов инициации (eIF). [ 7 ] Эти факторы объединяются, образуя прединициационный комплекс.
Факторы инициации эукариот
[ редактировать ]W2 Домен (два инвариантных триптофана ) представляет собой область, состоящую примерно из 165 аминокислот , которая находится на С-конце следующих эукариотических факторов инициации (eIF):
- Эукариотический трансляции фактор инициации 2B-эпсилон (eIF-2B-эпсилон) [1]
- Эукариотический фактор инициации трансляции 4 гамма (eIF-4-гамма) [2]
- , активирующий ГТФазу Эукариотический фактор инициации трансляции 5 (eIF-5), белок (GAP), специфичный для eIF2 [3]
Примеры
[ редактировать ]Гены, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают AAG1 , BZW1 , BZW2 , EIF2B5 , EIF4G1 , EIF4G2 , EIF4G3 и EIF5 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Кунин Е.В. (1995). «Мультидоменная организация эукариотических субъединиц фактора инициации трансляции гуаниновых нуклеотидов eIF-2B, выявленная с помощью анализа мотивов консервативных последовательностей» . Белковая наука . 4 (8): 1608–1617. дои : 10.1002/pro.5560040819 . ПМК 2143190 . ПМИД 8520487 .
- ^ Сингх Ч.Р., Ватанабэ Р., Чжоу Д., Дженнингс М.Д., Фукао А., Ли Б. и др. (2011). «Механизмы регуляции трансляции человеческим белком-миметиком eIF5» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (19): 8314–28. дои : 10.1093/nar/gkr339 . ПМК 3201852 . ПМИД 21745818 .
- ^ Фукунага Р., Хантер Т. (1997). «MNK1, новая протеинкиназа, активируемая MAP-киназой, выделенная с помощью нового метода скрининга экспрессии для идентификации субстратов протеинкиназы» . ЭМБО Дж . 16 (8): 1921–33. дои : 10.1093/emboj/16.8.1921 . ПМЦ 1169795 . ПМИД 9155018 .
- ^ Боесен Т., Мохаммад С.С., Павитт Г.Д., Андерсен Г.Р. (март 2004 г.). «Структура каталитического фрагмента фактора инициации трансляции 2В и идентификация критически важного каталитического остатка» . Ж. Биол. Хим . 279 (11): 10584–92. дои : 10.1074/jbc.M311055200 . ПМИД 14681227 .
- ^ Вэй Цзы, Сюэ Ю, Сюй Х, Гун В (май 2006 г.). «Кристаллическая структура С-концевого домена eIF5 S.cerevisiae». Дж. Мол. Биол . 359 (1): 1–9. дои : 10.1016/j.jmb.2006.03.037 . ПМИД 16616930 .
- ^ Бениоссек С., Шютц П., Буманн М., Лимахер А., Усон И., Бауманн У. (июль 2006 г.). «Кристаллическая структура карбокси-концевого домена человеческого фактора инициации трансляции eIF5». Дж. Мол. Биол . 360 (2): 457–65. дои : 10.1016/j.jmb.2006.05.021 . ПМИД 16781736 .
- ^ Кунин Е.В. (август 1995 г.). «Мультидоменная организация эукариотических субъединиц фактора инициации трансляции гуаниновых нуклеотидов eIF-2B, выявленная с помощью анализа мотивов консервативных последовательностей» . Белковая наука . 4 (8): 1608–17. дои : 10.1002/pro.5560040819 . ПМК 2143190 . ПМИД 8520487 .