ХНРНПА2В1
ХНРНПА2В1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | HNRNPA2B1 , HNRNPA2, HNRNPB1, HNRPA2, HNRPA2B1, HNRPB1, IBMPFD2, RNPA2, SNRPB1, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A2/B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | ПРОПУСКАТЬ : 600124 ; МГИ : 104819 ; Гомологен : 22992 ; Генные карты : ХНРНПА2В1 ; ОМА : HNRNPA2B1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины А2/В1 — белок , который у человека кодируется HNRNPA2B1 геном . [ 5 ]
Структура
[ редактировать ]Ген HNRNPA2B1 содержит 12 экзонов, включая специфичный для белка B1 мини-экзон из 36 нуклеотидов. Вся длина организации интрона/экзона HNRNPA2B1 идентична таковой у гена HNRNPA1 , что указывает на общее происхождение за счет дупликации генов. [ 6 ]
Функция
[ редактировать ]Этот ген принадлежит к подсемейству A/B повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP представляют собой РНК-связывающие белки и образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают отличными свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, имеет два повтора доменов квази-RRM, которые связываются с РНК. Было описано, что этот ген генерирует два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, которые кодируют разные изоформы. [ 7 ] HnRNPA2B1 является аутоантигеном при аутоиммунных заболеваниях, таких как ревматоидный артрит , системная красная волчанка и смешанные заболевания соединительной ткани . Когда его называют аутоантигеном , hnRNPA2B1 также известен как RA33 .
Белки HNRNPA2 и HNRNPB1 участвуют в упаковке возникающей мРНК, альтернативном сплайсинге, а также в транспортировке, трансляции и стабилизации цитоплазматической РНК. HNRNPA2 и HNRNPB1 также участвуют в поддержании теломер, пролиферации и дифференцировке клеток, а также в транспорте глюкозы. [ 8 ] [ 9 ]
Функцию гена HNRNPA2B1 можно эффективно исследовать путем нокдауна siRNA на основании независимой проверки. [ 10 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что HNRPA2B1 взаимодействует с казеинкиназой 2, альфа 1 . [ 11 ]
Роль в заболеваниях
[ редактировать ]Мутация p.D290V/302V в hnRNPA2B1 связана с деменцией, миопатией, болезнью Педжета костей и БАС . [ 12 ] Мутации в hnRNPA2B1 и hnRNPA1 вызывают боковой амиотрофический склероз и мультисистемную протеинопатию . [ 13 ] Обнаружено, что hnRNPA2/B1 активирует циклооксигеназу-2 и способствует росту опухоли при раке легких человека. [ 14 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000122566 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004980 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Биамонти Дж., Руджиу М., Сакконе С., Делла Валле Дж., Рива С. (август 1994 г.). «Два гомологичных гена, возникших в результате дупликации, кодируют белки hnRNP человека А2 и А1» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (11): 1996–2002. дои : 10.1093/нар/22.11.1996 . ПМК 308112 . ПМИД 8029005 .
- ^ «Ошибка 403» .
- ^ «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A2/B1 HNRPA2B1» .
- ^ «HNRNPA2B1 гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A2/B1 [Homo sapiens (человек)] – Ген – NCBI» .
- ^ «Ошибка 403» .
- ^ Мункачи Г, Штупински З, Герман П, Бан Б, Пенцвалло З, Сарвас Н, Дьерфи Б (1 января 2016 г.). «Проверка эффективности подавления РНКи с использованием данных генного массива показывает 18,5% частоты неудач в 429 независимых экспериментах» . Молекулярная терапия: нуклеиновые кислоты . 5 (9): е366. дои : 10.1038/mtna.2016.66 . ISSN 2162-2531 . ПМК 5056990 . ПМИД 27673562 .
- ^ Панчетти Ф., Боссер Р., Крехан А., Пьерин В., Итарте Э., Бахс О. (июнь 1999 г.). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин А2 взаимодействует с протеинкиназой CK2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 260 (1): 17–22. дои : 10.1006/bbrc.1999.0849 . ПМИД 10381337 .
- ^ Ким Х.Дж., Ким Н.К., Ван Ю.Д., Скарборо Э.А., Мур Дж., Диас З., Маклиа К.С., Фрейбаум Б., Ли С., Моллиекс А., Канагарадж А.П., Картер Р., Бойлан К.Б., Войтас А.М., Радемакерс Р., Пинкус Дж.Л., Гринберг С.А. , Трояновски Дж.К., Трейнор Б.Дж., Смит Б.Н., Топп С., Гази А.С., Миллер Дж., Шоу CE, Котлорс М., Киршнер Дж., Пестронк А., Ли Ю.Р., Форд А.Ф., Гитлер А.Д., Бенатар М., Кинг О.Д., Кимонис В.Е., Росс Э.Д., Вейль CC, Шортер Дж., Тейлор Дж.П. (2013). «Мутации в прионоподобных доменах hnRNPA2B1 и hnRNPA1 вызывают мультисистемную протеинопатию и БАС» . Природа . 495 (7442): 467–73. Бибкод : 2013Natur.495..467K . дои : 10.1038/nature11922 . ПМЦ 3756911 . ПМИД 23455423 .
- ^ Ким Х.Дж., Ким Н.К., Ван Ю.Д., Скарборо Э.А., Мур Дж., Диас З. и др. Мутации в прионоподобных доменах в hnRNPA2B1 и hnRNPA1 вызывают мультисистемную протеинопатию и БАС. Природа 2013;495:467–73. Доступно по адресу: https://www.researchgate.net/publication/235770144_Mutations_in_prion-like_domains_in_hnRNPA2B1_and_hnRNPA1_cause_multisystem_proteinoptic_and_ALS [Проверено 28 марта 2017 г.].
- ^ Сюань Ян, Ван Цзиншу, Пан Лиин, Лу Цзянь-Цзюнь, И Цаньхуэй, Ли Чжэнлинь, Юй Вэньдань, Ли Мэй, Сюй Тинтин, Ян Вэньцзин, Тан Чжипэн, Тан Жаньрань, Сяо Сяншэн, Мэн Суншу, Чэнь Имин, Лю Квентин , Хуан Вэньлинь, Го Вэй, Цуй Сяонань, Дэн Уго, (2016), hnRNPA2/B1 активирует циклооксигеназу-2 и способствует росту опухолей при раке легких человека, Molecular Oncology, 10, doi: 10.1016/j.molonc.2015.11.010. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1016/j.molonc.2015.11.010/abstract;jsessionid=F7FAA0EE2ECB0751450320F2792BFD9E.f03t01
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Доусон С.Дж., Уайт, Лос-Анджелес (1992). «Лечение эндокардита, вызванного Haemophilus aphrophilus, ципрофлоксацином». Дж. Заразить . 24 (3): 317–20. дои : 10.1016/S0163-4453(05)80037-4 . ПМИД 1602151 .
- Баув Г., Расмуссен Х.Х., ван ден Булке М., ван Дамм Дж., Пуйпе М., Гессер Б., Селис Дж.Э., Вандекеркхове Дж. (1990). «Двумерный гель-электрофорез, электроблоттинг белков и микросеквенирование: прямая связь между белками и генами». Электрофорез . 11 (7): 528–36. дои : 10.1002/elps.1150110703 . ПМИД 1699755 . S2CID 24768114 .
- Уилк Х.Э., Шефер К.П., Агрис П.Ф., Боак А.М., Ковач С.А. (1991). «Ассоциация U1 SnRNP с HnRNP включает начальное неспецифическое независимое от сайта сплайсинга взаимодействие белка U1 SnRNP с HnRNA». Мол. Клетка. Биохим . 106 (1): 55–66. дои : 10.1007/BF00231189 . ПМИД 1833625 . S2CID 22696966 .
- Берд К.Г., Суонсон М.С., Герлах М., Дрейфус Г. (1989). «Первичные структуры гетерогенных ядерных белков рибонуклеопротеинов A2, B1 и C2: разнообразие РНК-связывающих белков создается небольшими пептидными вставками» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (24): 9788–92. Бибкод : 1989PNAS...86.9788B . дои : 10.1073/pnas.86.24.9788 . ПМК 298587 . ПМИД 2557628 .
- Кумар А., Уильямс К.Р., Сзер В. (1986). «Очистка и доменная структура основных белков hnRNP A1 и A2 и их связь с одноцепочечными ДНК-связывающими белками» . Ж. Биол. Хим . 261 (24): 11266–73. дои : 10.1016/S0021-9258(18)67378-8 . ПМИД 3733753 .
- Фаура М., Ренау-Пикерас Дж., Бахс О., Боссер Р. (1995). «Дифференциальное распределение гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов в тканях крыс». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 217 (2): 554–60. дои : 10.1006/bbrc.1995.2811 . ПМИД 7503735 .
- Козу Т., Генрих Б., Шефер К.П. (1995). «Структура и экспрессия гена (HNRPA2B1), кодирующего белок A2/B1 hnRNP человека». Геномика . 25 (2): 365–71. дои : 10.1016/0888-7543(95)80035-К . ПМИД 7789969 .
- Просмотреть статью PubMed Google Scholar Ван Лаер Л., Ван Кэмп Дж., Грин Э.Д., Хейзинг Э.Х., Виллемс П.Дж. (1997). «Физическое картирование гена HOXA1 и гена hnRPA2B1 в контиге YAC хромосомы 7p14-p15 человека». Хм. Жене 99 (6): 831–3. дои : 10.1007/s004390050457 . ПМИД 9187682 . S2CID 42177403 .
- Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджух П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (1998). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Нат. Жене . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД 9731529 . S2CID 585778 .
- Монтуэнга Л.М., Чжоу Дж., Авис И., Вос М., Мартинес А., Каттитта Ф., Трестон А.М., Сандей М., Малшайн Дж.Л. (1998). «Экспрессия гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина A2/B1 меняется на критических стадиях развития легких млекопитающих». Являюсь. Дж. Респир. Клетка Мол. Биол . 19 (4): 554–62. дои : 10.1165/ajrcmb.19.4.3185 . HDL : 10171/20162 . ПМИД 9761751 .
- Панчетти Ф., Боссер Р., Крехан А., Пьерин В., Итарте Э., Бахс О. (1999). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин А2 взаимодействует с протеинкиназой CK2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 260 (1): 17–22. дои : 10.1006/bbrc.1999.0849 . ПМИД 10381337 .
- Гамильтон Б.Дж., Николс Р.К., Цукамото Х., Боадо Р.Дж., Пардридж В.М., Ригби В.Ф. (1999). «hnRNP A2 и hnRNP L связывают 3'UTR мРНК транспортера глюкозы 1 и существуют в виде комплекса in vivo» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 261 (3): 646–51. дои : 10.1006/bbrc.1999.1040 . ПМИД 10441480 .
- Николс Р.К., Ван XW, Тан Дж., Гамильтон Б.Дж., Хай Ф.А., Хершман Х.Р., Ригби В.Ф. (2000). «Домен RGG в hnRNP A2 влияет на субклеточную локализацию». Эксп. Сотовый Res . 256 (2): 522–32. дои : 10.1006/excr.2000.4827 . ПМИД 10772824 .
- Мацуи М., Хоригучи Х., Камма Х., Фудзивара М., Оцубо Р., Огата Т. (2000). «Специфическая для семенников и стадии развития экспрессия изоформ сплайсинга hnRNP A2/B1, B0a/b». Биохим. Биофиз. Акта . 1493 (1–2): 33–40. дои : 10.1016/s0167-4781(00)00154-8 . ПМИД 10978504 .
- Чжоу Дж., Оллред, округ Колумбия, Авис И, Мартинес А., Вос М.Д., Смит Л., Трестон А.М., Малшайн Дж.Л. (2001). «Дифференциальная экспрессия маркера раннего обнаружения рака легких, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина-A2/B1 (hnRNP-A2/B1) при нормальном и неопластическом раке молочной железы» . Рак молочной железы Рез. Обращаться . 66 (3): 217–24. дои : 10.1023/А:1010631915831 . ПМИД 11510693 . S2CID 27708432 .
- Пиоли П.А., Ригби В.Ф. (2001). «Белок фон Хиппель-Линдау взаимодействует с гетероядерным рибонуклеопротеином а2 и регулирует его экспрессию» . Ж. Биол. Хим . 276 (43): 40346–52. дои : 10.1074/jbc.M105391200 . ПМИД 11517223 .
- Ким Ш., Дирсен М., Ферререс Х.К., Фунтулакис М., Любец Г. (2001). «Повышение уровня белка гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина A2 / B1 в мозге плода с синдромом Дауна». Экспрессия белка в мозге с синдромом Дауна . стр. 273–80. дои : 10.1007/978-3-7091-6262-0_22 . ISBN 978-3-211-83704-7 . ПМИД 11771750 .
{{cite book}}
:|journal=
игнорируется ( помогите ) - Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
- Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
- Ли С., Чжан П., Фрейбаум Б.Д. и др. (2016). «Генетическое взаимодействие hnRNPA2B1 и DNAJB6 в модели мультисистемной протеинопатии у дрозофилы» . Молекулярная генетика человека . 25 (5): 936–950. дои : 10.1093/hmg/ddv627 . ПМЦ 4754048 . ПМИД 26744327 .
- Герман С., Фишер А., Пресуми Дж., Хоффманн М., Кундерс М.И., Эскриу В., Аппараилли Ф., Штайнер Г. (2015). «Подавление воспаления и эрозии кости с помощью РНК-интерференции, опосредованного подавлением гетерогенного ядерного RNP A2/B1 в двух экспериментальных моделях ревматоидного артрита» . Артрит и ревматология . 67 (9): 2536–2546. дои : 10.1002/арт.39223 . ПМИД 26017221 .
- Кентаро И, Синдзи К, Сёко У, Акихито М, Нозоми О, Тацуки С, Сенко Т, Томоэ К, Ёичи Т, Кенго М, Такао Ю, Шинго Д, Исаму С, Фумио С (2015). «Ридайфен G, аналог тамоксифена, является мощным противораковым препаратом, действующим за счет комбинаторной ассоциации с множеством клеточных факторов». Биоорганическая и медицинская химия . 23 (18): 6118–6124. дои : 10.1016/j.bmc.2015.08.001 . ПМИД 26314924 .
- Гейсслер Р., Симкин А., Флосс Д., Патель Р., Фогарти Э.А., Шеллер Дж., Гримсон А. (2016). «Распространенный путь распада мРНК, специфичный для последовательности, опосредованный hnRNP A1 и A2/B1» . Гены и развитие . 30 (9): 1070–1085. дои : 10.1101/gad.277392.116 . ПМЦ 4863738 . ПМИД 27151978 .
- ЦЮ XH, ЛЮ JL, ЧЖОН XW, LI X, ЧЖАН ЦГ (2015). «Взгляд на роль hnRNP A2/B1 и AXL при немелкоклеточном раке легкого» . Письма об онкологии . 10 (3): 1677–1685. дои : 10.3892/ol.2015.3457 . ПМЦ 4533760 . ПМИД 26622731 .
- Аларкон Ч.Р., Гударзи Х., Ли Х., Лю Икс, Тавазои С., Тавазои С.Ф. (2015). «HNRNPA2B1 является медиатором m6A-зависимых событий процессинга ядерной РНК» . Клетка . 162 (6): 1299–1308. дои : 10.1016/j.cell.2015.08.011 . ПМЦ 4673968 . ПМИД 26321680 .