5'-3' экзорибонуклеаза 2

XRN2
Идентификаторы
Псевдонимы	XRN2 , введите: 22803, 5'-3' экзорибонуклеаза 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608851 ; МГИ : 894687 ; Гомологен : 6927 ; Генные карты : XRN2 ; ОМА : XRN2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	21,389,825 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	146,919,920 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; ganglionic eminence; ; gonad; ; islet of Langerhans; ; smooth muscle tissue; ; Achilles tendon; ; appendix; ; gallbladder; ; ventricular zone; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; yolk sac; ; Gonadal ridge; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; neural layer of retina; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; abdominal wall; ; spermatid;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; 5'-3' exoribonuclease activity; 5'-3' exonuclease activity; metal ion binding; protein binding; nucleic acid binding; nuclease activity; transcription termination site sequence-specific DNA binding; exonuclease activity; hydrolase activity; 3'-5'-exoribonuclease activity; RNA binding;
Cellular component	membrane; aggresome; nucleolus; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	RNA processing; regulation of transcription, DNA-templated; DNA-templated transcription, termination; mRNA processing; RNA catabolic process; transcription, DNA-templated; DNA catabolic process, exonucleolytic; spermatogenesis; RNA metabolic process; nucleobase-containing compound metabolic process; neuron differentiation; retina development in camera-type eye; rRNA processing; RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic; hippocampus development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	22803
	24128
	ENSG00000088930
	ENSMUSG00000027433
	Q9H0D6
	Q9DBR1
	НМ_012255 ; НМ_001317960
	НМ_011917 ; НМ_001356402 ; НМ_001356403
	НП_001304889 ; НП_036387
	НП_036047 ; НП_001343331 ; НП_001343332
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

5'-3'-экзорибонуклеаза 2 (XRN2), также известная как Dhm1-подобный белок , представляет собой экзорибонуклеазный фермент , который у человека кодируется XRN2 геном . ^{[ 5 ]}

Человеческий ген, кодирующий XRN2, имеет сходство с мышиным Dhm1 и дрожжевыми генами Dhp1 ( Schizosaccharomyces pombe ) или RAT1 ( Saccharomyces ). Ген дрожжей участвует в гомологичной рекомбинации и РНК метаболизме , таких как синтез РНК, транспортировка и терминация РНК. ^{[ 6 ]} Исследования комплементации показывают, что Dhm1 выполняет у мышей ту же функцию, что и Dhp1.

Функция

Человеческий XRN2 участвует в торпедной модели терминации транскрипции. ^{[ 7 ]}

Гомолог C. elegans , XRN-2, участвует в деградации некоторых зрелых микроРНК и их вытеснении из miRISC . микроРНК ^{[ 8 ]}

Было показано, что у дрожжей белок Rat1 также участвует в модели терминации транскрипции торпеды. Когда сайт полиаденилирования обнаруживается на возникающей РНК и расщепляется РНК-полимеразой II , фактор Rtt103 рекрутирует Rat1 и прикрепляет его к свободному концу. Экзонуклеазная активность Rat1 разрушает цепь РНК и останавливает транскрипцию после захвата полимеразы. ^{[ 6 ]}

См. также

Xrn1

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000088930 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027433 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Чжан М, Ю Л, Синь Ю, Ху П, Фу Ц, Ю С, Чжао С (июль 1999 г.). «Клонирование и картирование гена XRN2 на хромосоме человека 20p11.1-p11.2». Геномика . 59 (2): 252–4. дои : 10.1006/geno.1999.5866 . ПМИД 10409438 .
^ Jump up to: ^а ^б Дэвид Толлерви (ноябрь 2004 г.). «Уничтожение торпедой». Природа . 432 (7016): 456–457. дои : 10.1038/432456a . ПМИД 15565140 . S2CID 6823163 .
^ Уэст С., Громак Н., Праудфут, Нью-Джерси (ноябрь 2004 г.). «Человеческая 5' -> 3' экзонуклеаза Xrn2 способствует терминации транскрипции в сайтах котранскрипционного расщепления» . Природа . 432 (7016): 522–5. Бибкод : 2004Natur.432..522W . дои : 10.1038/nature03035 . ПМИД 15565158 . S2CID 4365304 .
^ Чаттерджи С., Гроссханс Х. (сентябрь 2009 г.). «Активный оборот модулирует активность зрелых микроРНК у Caenorhabditis elegans». Природа . 461 (7263): 546–9. Бибкод : 2009Natur.461..546C . дои : 10.1038/nature08349 . ПМИД 19734881 . S2CID 4414841 .

Внешние ссылки

человека XRN2 Расположение генома XRN2 и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Ленер Б., Сандерсон К.М. (2004). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геном Рез . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2001). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20-й хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Лу Ю, Лю П, Джеймс М и др. (2010). «Генетические варианты, цис-регулирующие экспрессию Xrn2, способствуют риску возникновения спонтанной опухоли легких» . Онкоген . 29 (7): 1041–9. дои : 10.1038/onc.2009.396 . ПМК 6019621 . ПМИД 19915612 .
Лежен Ф., Ли Х, Макват Л.Е. (2003). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК в клетках млекопитающих включает декапирование, деаденилирование и экзонуклеолитическую активность» . Мол. Клетка . 12 (3): 675–87. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . ПМИД 14527413 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Ян XC, Салливан К.Д., Марзлафф В.Ф., Домински З. (2009). «Исследование 5'-экзонуклеазной и эндонуклеазной активности CPSF-73 при процессинге пре-мРНК гистонов» . Мол. Клетка. Биол . 29 (1): 31–42. дои : 10.1128/MCB.00776-08 . ПМК 2612496 . ПМИД 18955505 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Шерл А., Куте И., Деон С. и др. (2002). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека» . Мол. Биол. Клетка . 13 (11): 4100–9. doi : 10.1091/mbc.E02-05-0271 . ПМЦ 133617 . ПМИД 12429849 .
Канеко С., Розенблатт-Розен О, Мейерсон М, Мэнли Дж.Л. (2007). «Многофункциональный белок p54nrb/PSF рекрутирует экзонуклеазу XRN2 для облегчения 3'-процессинга пре-мРНК и терминации транскрипции» . Генс Дев . 21 (14): 1779–89. дои : 10.1101/gad.1565207 . ПМК 1920172 . ПМИД 17639083 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Громак Н., Уэст С., Праудфут, Нью-Джерси (2006). «Сайты паузы способствуют терминации транскрипции РНК-полимеразы II млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 26 (10): 3986–96. дои : 10.1128/MCB.26.10.3986-3996.2006 . ПМЦ 1488997 . ПМИД 16648491 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Ли Дж., Чжэн Х., Цзи С. и др. (2005). «Новый сплайсинговый вариант человеческого гена XRN2 в основном экспрессируется в лейкоцитах крови». Секв. ДНК . 16 (2): 143–6. дои : 10.1080/10425170500066771 . ПМИД 16147866 . S2CID 35865401 .
Группа программы сбора генов млекопитающих, Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Гроуз Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Труды Национальной академии наук . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .

Внешние ссылки

XRN2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000088930 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027433 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10409438-5] Чжан М, Ю Л, Синь Ю, Ху П, Фу Ц, Ю С, Чжао С (июль 1999 г.). «Клонирование и картирование гена XRN2 на хромосоме человека 20p11.1-p11.2». Геномика . 59 (2): 252–4. дои : 10.1006/geno.1999.5866 . ПМИД 10409438 .

[torpedo-6] Jump up to: ^а ^б Дэвид Толлерви (ноябрь 2004 г.). «Уничтожение торпедой». Природа . 432 (7016): 456–457. дои : 10.1038/432456a . ПМИД 15565140 . S2CID 6823163 .

[pmid15565158-7] Уэст С., Громак Н., Праудфут, Нью-Джерси (ноябрь 2004 г.). «Человеческая 5' -> 3' экзонуклеаза Xrn2 способствует терминации транскрипции в сайтах котранскрипционного расщепления» . Природа . 432 (7016): 522–5. Бибкод : 2004Natur.432..522W . дои : 10.1038/nature03035 . ПМИД 15565158 . S2CID 4365304 .

[pmid19734881-8] Чаттерджи С., Гроссханс Х. (сентябрь 2009 г.). «Активный оборот модулирует активность зрелых микроРНК у Caenorhabditis elegans». Природа . 461 (7263): 546–9. Бибкод : 2009Natur.461..546C . дои : 10.1038/nature08349 . ПМИД 19734881 . S2CID 4414841 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]