Барьер для фактора автоинтеграции 1

БАНФ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1QCK, 2ODG, 1CI4, 2BZF, 2EZY, 2EZZ, 2EZX
Идентификаторы
Псевдонимы	BANF1 , BAF, BCRP1, D14S1460, NGPS, фактор барьера для автоинтеграции 1, фактор ядерной сборки BAF 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603811 ; МГИ : 1346330 ; Гомологен : 2866 ; GeneCards : BANF1 ; OMA : BANF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	66,004,149 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	5,417,196 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; right uterine tube; ; muscle of thigh; ; apex of heart; ; gastrocnemius muscle; ; ascending aorta; ; body of uterus; ; Descending thoracic aorta; ; right coronary artery;
	Top expressed in
	somite; ; embryo; ; medial ganglionic eminence; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; epiblast; ; embryo; ; thymus; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; hand;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; protein C-terminus binding; enzyme binding; protein homodimerization activity; protein N-terminus binding; LEM domain binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; extracellular exosome; condensed chromosome; nucleus; chromosome; nucleoplasm; cytosol; nuclear envelope;
Biological process	mitotic nuclear membrane reassembly; response to virus; mitotic nuclear membrane disassembly; DNA integration; establishment of integrated proviral latency; viral process; nuclear transport; negative regulation of viral genome replication; chromosome segregation; chromosome condensation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8815
	23825
	ENSG00000175334
	ENSMUSG00000024844
	О75531
	О54962
	НМ_003860 ; НМ_001143985
	НМ_001038231 ; НМ_001286608 ; НМ_011793
	НП_001137457 ; НП_003851
	НП_001033320 ; НП_001273537 ; НП_035923
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор барьера аутоинтеграции — это белок , который у человека кодируется BANF1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он является членом препятствующих аутоинтеграции семейства белков, .

Функция

Белок, кодируемый этим геном, был идентифицирован по его способности защищать ретровирусы от внутримолекулярной интеграции и, следовательно, способствовать межмолекулярной интеграции в геном клетки-хозяина. Эндогенная функция белка неизвестна. Белок образует гомодимер, который локализуется в ядре и специфически связывается с хромосомами во время митоза . Этот белок связывается с ДНК неспецифическим образом, и исследования на грызунах показывают, что он также связывается с полипептидом 2, ассоциированным с ламинной пластинкой , компонентом ядерной пластинки . ^{[ 6 ]} Он также связывается с доменом LEM, содержащим белки LAP2 , Emerin и MAN1 . Способность белка связывать ДНК модулируется концентрацией АТФ. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что барьер для аутоинтеграционного фактора 1 взаимодействует с тимопоэтином . ^{[ 8 ]}

Клиническая значимость

Было показано, что мутации в этом гене вызывают наследственный прогероидный синдром . ^{[ 9 ]}

См. также

Ретровирусная интеграция

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000175334 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000024844 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ли М.С., Крейги Р. (март 1998 г.). «Ранее неопознанный белок-хозяин защищает ретровирусную ДНК от аутоинтеграции» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (4): 1528–33. Бибкод : 1998PNAS...95.1528L . дои : 10.1073/pnas.95.4.1528 . ЧВК 19075 . ПМИД 9465049 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: барьер BANF1 для фактора автоинтеграции 1» .
^ Шридхаран С., Курзава Н., Вернер Т., Гюнтер И., Хельм Д., Хубер В., Банщефф М., Савицкий М.М. (март 2019 г.). «Профилирование растворимости и термостабильности в масштабе всего протеома показывает четкую регуляторную роль АТФ» . Природные коммуникации . 10 (1): 1155. Бибкод : 2019NatCo..10.1155S . дои : 10.1038/s41467-019-09107-y . ПМК 6411743 . ПМИД 30858367 .
^ Фурукава К. (август 1999 г.). «Белок 1, связывающий LAP2 (L2BP1/BAF), является кандидатом в медиатор взаимодействия LAP2-хроматина». Дж. Клеточная наука . 112 (Часть 15): 2485–92. дои : 10.1242/jcs.112.15.2485 . ПМИД 10393804 .
^ Мост XS, Кесада В, Осорио Ф.Г., Кабанильяс Р., Кадиньянос Х., Монах Х.М., Ордонес Г.Р., Бридж Д.А., Гутьеррес-Фернандес А., Фанжул-Фернандес М., Леви Н., Фрейхе Х.М., Лопес-Отин С (май 2011 г.). «Секвенирование экзома и функциональный анализ идентифицируют мутацию BANF1 как причину наследственного прогероидного синдрома» . Являюсь. Дж. Хум. Жене 88 (5): 650–6. дои : 10.1016/j.ajhg.2011.04.010 . ПМК 3146734 . ПМИД 21549337 .

Дальнейшее чтение

Гольдберг М., Харель А., Грюнбаум Ю. (2000). «Ядерная пластинка: молекулярная организация и взаимодействие с хроматином». Крит. Преподобный Эукариот. Джин Экспр . 9 (3–4): 285–93. doi : 10.1615/critreveukargeneexpr.v9.i3-4.130 . ПМИД 10651245 .
Сегура-Тоттен М., Уилсон К.Л. (2004). «BAF: роль в хроматине, ядерной структуре и интеграции ретровирусов». Тенденции клеточной биологии . 14 (5): 261–6. дои : 10.1016/j.tcb.2004.03.004 . ПМИД 15130582 .
Ван Маеле Б., Дебизер З. (2005). «Интеграция ВИЧ-1: взаимодействие между интегразой ВИЧ-1, клеточными и вирусными белками». Обзоры по СПИДу . 7 (1): 26–43. ПМИД 15875659 .
Ван Маеле Б., Бусшотс К., Вандекеркхове Л. и др. (2006). «Клеточные кофакторы интеграции ВИЧ-1». Тенденции биохимии. Наука . 31 (2): 98–105. дои : 10.1016/j.tibs.2005.12.002 . ПМИД 16403635 .
Ли М.С., Крейги Р. (1994). «Защита ретровирусной ДНК от аутоинтеграции: участие клеточного фактора» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (21): 9823–7. Бибкод : 1994PNAS...91.9823L . дои : 10.1073/pnas.91.21.9823 . ПМК 44909 . ПМИД 7937898 .
Уважаемый PH, Bankier AT, Piper MB (1998). «Метрическая СЧАСТЛИВАЯ карта 14 хромосомы человека в высоком разрешении». Геномика . 48 (2): 232–41. дои : 10.1006/geno.1997.5140 . ПМИД 9521877 .
Линч Р.А., Пайпер М., Банкир А. и др. (1999). «Геномная и функциональная карта области кластера точек разрыва хромосомы 14 t(12;14) при лейомиоме матки». Геномика . 52 (1): 17–26. дои : 10.1006/geno.1998.5406 . ПМИД 9740667 .
Цай М., Хуан Ю, Чжэн Р. и др. (1998). «Структура раствора клеточного фактора BAF, ответственного за защиту ретровирусной ДНК от аутоинтеграции». Нат. Структура. Биол . 5 (10): 903–9. дои : 10.1038/2345 . ПМИД 9783751 . S2CID 857675 .
Фурукава К. (1999). «Белок 1, связывающий LAP2 (L2BP1/BAF), является кандидатом в медиатор взаимодействия LAP2-хроматина». Дж. Клеточная наука . 112 (15): 2485–92. дои : 10.1242/jcs.112.15.2485 . ПМИД 10393804 .
Чжэн Р., Гирландо Р., Ли М.С. и др. (2000). «Фактор барьера для аутоинтеграции (BAF) соединяет ДНК в дискретный нуклеопротеидный комплекс более высокого порядка» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (16): 8997–9002. Бибкод : 2000PNAS...97.8997Z . дои : 10.1073/pnas.150240197 . ПМК 16810 . ПМИД 10908652 .
Умланд Т.К., Вэй С.К., Крейги Р., Дэвис Д.Р. (2000). «Структурные основы соединения ДНК с помощью фактора барьера к аутоинтеграции». Биохимия . 39 (31): 9130–8. дои : 10.1021/bi000572w . ПМИД 10924106 .
Харрис Д., Энгельман А. (2001). «Как структура, так и ДНК-связывающая функция фактора барьера аутоинтеграции способствуют восстановлению интеграции ВИЧ типа 1 in vitro» . Ж. Биол. Хим . 275 (50): 39671–7. дои : 10.1074/jbc.M002626200 . ПМИД 11005805 .
Ли К.К., Харагути Т., Ли Р.С. и др. (2002). «Различные функциональные домены в эмерине связывают ламин А и ДНК-мостиковый белок BAF». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 24): 4567–73. дои : 10.1242/jcs.114.24.4567 . ПМИД 11792821 .
Харагути Т., Коджин Т., Сегура-Тоттен М. и др. (2002). «BAF необходим для сборки emerin в реформируемую ядерную оболочку». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 24): 4575–85. дои : 10.1242/jcs.114.24.4575 . ПМИД 11792822 .
Сегура-Тоттен М., Ковальски А.К., Крейги Р., Уилсон К.Л. (2002). «Фактор барьера для автоинтеграции: основные роли в деконденсации хроматина и сборке ядра» . Дж. Клеточная Биол . 158 (3): 475–85. дои : 10.1083/jcb.200202019 . ПМК 2173821 . ПМИД 12163470 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Холаска Дж. М., Ли К. К., Ковальски А. К., Уилсон К. Л. (2003). «Безклеточный репрессор транскрипции (GCL) и фактор барьера аутоинтеграции (BAF) конкурируют за связывание с эмерином in vitro» . Ж. Биол. Хим . 278 (9): 6969–75. дои : 10.1074/jbc.M208811200 . ПМИД 12493765 .
Лин К.В., Энгельман А (2003). «Фактор барьера к аутоинтеграции является компонентом функциональных преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1-го типа» . Дж. Вирол . 77 (8): 5030–6. doi : 10.1128/JVI.77.8.5030-5036.2003 . ПМК 152146 . ПМИД 12663813 .