тимопоэтин

ТМПО
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1GJJ, 1H9F, 1H9E
Идентификаторы
Псевдонимы	ТМПО , CMD1T, LAP2, LEMD4, PRO0868, TP, тимопоэтин
Внешние идентификаторы	Опустить : 188380 ; МГИ : 106920 ; Гомологен : 31144 ; GeneCards : ТМПО ; ОМА : ТМПО - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	98,550,351 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	91,017,177 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; Achilles tendon; ; monocyte; ; trabecular bone; ; tonsil; ; lymph node; ; rectum; ; epithelium of colon; ; oocyte;
	Top expressed in
	ectoderm; ; otic vesicle; ; otic placode; ; ventricular zone; ; mandibular prominence; ; saccule; ; maxillary prominence; ; dermis; ; thymus; ; atrium;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; lamin binding; cadherin binding; protein binding;
Cellular component	chromatin; nuclear envelope; nucleus; chromosome; cytoplasm; integral component of membrane; nuclear inner membrane; nuclear membrane; membrane;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7112
	21917
	ENSG00000120802
	ENSMUSG00000019961
	P42166 ; P42167
	Q61029 ; Q61033
	НМ_001032283 ; НМ_001032284 ; НМ_001307975 ; НМ_003276
showНМ_001080129 ; НМ_001080130 ; НМ_001080131 ; НМ_001080132 ; НМ_001080134 ;
	NM_011605; NM_001283048
showНП_001027454 ; НП_001027455 ; НП_001294904 ; НП_003267 ; НП_001027454.1 ;
	NP_001027455.1; NP_001294904.1; NP_001027454.1
showНП_001073598 ; НП_001073599 ; НП_001073600 ; НП_001073601 ; NP_001269977 ;
	NP_035735; NP_035735.2
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Связанный с пластинкой полипептид 2 (LAP2), изоформы бета/гамма, представляет собой белок , который у человека кодируется TMPO геном . ^[5]^[6] LAP2 представляет собой белок внутренней ядерной мембраны (INM) . ^[7]

Тимопоэтин представляет собой белок, участвующий в индукции CD90 в тимусе . Ген тимопоэтина (TMPO) кодирует три альтернативно сплайсированные мРНК, кодирующие белки массой 75 кДа (альфа), 51 кДа (бета) и 39 кДа (гамма), которые повсеместно экспрессируются во всех клетках. Ген TMPO человека картирован на участке хромосомы 12q22 и состоит из восьми экзонов. ТМПО-альфа присутствует диффузно и экспрессируется в ядре клетки, тогда как ТМПО-бета и гамма локализованы в ядерной мембране. ТМРО бета является человеческим гомологом мышиного белка LAP2. LAP2 играет роль в регуляции ядерной архитектуры путем связывания ламина B1 и хромосом. Это взаимодействие регулируется фосфорилированием во время митоза. Учитывая ядерную локализацию трех изоформ ТМРО, маловероятно, что эти белки играют какую-либо роль в индукции CD90.

Взаимодействия

Было показано, что тимопоэтин взаимодействует с фактором барьера аутоинтеграции 1 . ^[8] АКАП8Л , ^[9]^[10] ЛМНБ1 ^[11]^[12] и ЛМНА . ^[13]^[14]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120802 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019961 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Харрис К.А., Андрюк П.Дж., Клайн С., Чан Х.К., Натараджан А., Секерка Дж.Дж., Гольдштейн Г. (июль 1994 г.). «Три различных тимопоэтина человека происходят из альтернативно сплайсированных мРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (14): 6283–7. Бибкод : 1994PNAS...91.6283H . дои : 10.1073/pnas.91.14.6283 . ПМК 44185 . ПМИД 7517549 .
^ «Энтрез Ген: ТМПО тимопоэтин» .
^ Холмер Л., Ворман Х.Дж. (ноябрь 2001 г.). «Белки внутренней ядерной мембраны: функции и нацеливание». Клеточные и молекулярные науки о жизни . 58 (12–13): 1741–7. дои : 10.1007/PL00000813 . ПМИД 11766875 . S2CID 20902309 .
^ Фурукава К. (август 1999 г.). «Белок 1, связывающий LAP2 (L2BP1/BAF), является кандидатом в медиатор взаимодействия LAP2-хроматина». Журнал клеточной науки . 112 (Пт 15) (15): 2485–92. дои : 10.1242/jcs.112.15.2485 . ПМИД 10393804 .
^ Мартинс С.Б., Эйде Т., Стин Р.Л., Янсен Т., Сколхегг Б.С., Коллас П. (ноябрь 2000 г.). «HA95 — это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки» . Журнал клеточной науки . 113 Пт 21 (21): 3703–13. дои : 10.1242/jcs.113.21.3703 . ПМИД 11034899 .
^ Мартинс С., Эйквар С., Фурукава К., Коллас П. (январь 2003 г.). «HA95 и LAP2 beta опосредуют новое взаимодействие хроматина и ядерной оболочки, участвующее в инициации репликации ДНК» . Журнал клеточной биологии . 160 (2): 177–88. дои : 10.1083/jcb.200210026 . ПМК 2172640 . ПМИД 12538639 .
^ Фурукава К., Кондо Т. (февраль 1998 г.). «Идентификация связанного с ламиной полипептид-2-связывающего домена ламина B-типа» . Европейский журнал биохимии . 251 (3): 729–33. дои : 10.1046/j.1432-1327.1998.2510729.x . ПМИД 9490046 .
^ Фойснер Р., Джерас Л. (июль 1993 г.). «Интегральные мембранные белки ядерной оболочки взаимодействуют с ламинами и хромосомами, и связывание модулируется митотическим фосфорилированием». Клетка . 73 (7): 1267–79. дои : 10.1016/0092-8674(93)90355-Т . ПМИД 8324822 . S2CID 10641633 .
^ Маркевич Э., Дечат Т., Фойснер Р., Куинлан Р.А., Хатчисон С.Дж. (декабрь 2002 г.). «Ламин A/C-связывающий белок LAP2альфа необходим для ядерного закрепления белка ретинобластомы» . Молекулярная биология клетки . 13 (12): 4401–13. doi : 10.1091/mbc.E02-07-0450 . ПМК 138642 . ПМИД 12475961 .
^ Дечат Т., Корбей Б., Воан О.А., Влчек С., Хатчисон С.Дж., Фойснер Р. (октябрь 2000 г.). «Связанный с ламиной полипептид 2альфа связывает внутриядерные ламины А-типа». Журнал клеточной науки . 113 Пт 19 (19): 3473–84. дои : 10.1242/jcs.113.19.3473 . ПМИД 10984438 .

Дальнейшее чтение

Харрис К.А., Андрюк П.Дж., Клайн С.В., Мэтью С., Секерка Дж.Дж., Гольдштейн Г. (июль 1995 г.). «Структура и картирование гена тимопоэтина человека (ТМПО) и взаимосвязь человеческого ТМПО бета с крысиным ламин-ассоциированным полипептидом 2». Геномика . 28 (2): 198–205. дои : 10.1006/geno.1995.1131 . ПМИД 8530026 .
Дечат Т., Влчек С., Фойснер Р. (апрель 2000 г.). «Обзор: изоформы полипептида 2, связанные с пластинкой, и родственные белки в динамике ядерной структуры, зависящей от клеточного цикла». Журнал структурной биологии . 129 (2–3): 335–45. дои : 10.1006/jsbi.2000.4212 . ПМИД 10806084 .
Туми Дж. Дж., Гольдштейн Дж., Льюис В.М., Билмир П.М., Гуд Р.А. (июнь 1977 г.). «Биоанализное определение уровней тимопоэтина и гормона тимуса в плазме человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 74 (6): 2541–5. Бибкод : 1977PNAS...74.2541T . дои : 10.1073/pnas.74.6.2541 . ПМК 432209 . ПМИД 302007 .
Хивнер Г.А., Аудхья Т., Гольдштейн Г. (февраль 1990 г.). «Пептидные аналоги тимопентина различают различные специфичности рецептора тимопоэтина на двух линиях Т-клеток человека». Регуляторные пептиды . 27 (2): 257–62. дои : 10.1016/0167-0115(90)90044-W . ПМИД 2158125 . S2CID 12562672 .
Фучелло А., Аудхья Т., Талле М.А., Гольдштейн Г. (январь 1984 г.). «Иммуноанализ на тимопоэтин бычьей сыворотки: распознавание спленина с помощью моноклональных антител». Архив биохимии и биофизики . 228 (1): 292–8. дои : 10.1016/0003-9861(84)90070-5 . ПМИД 6364989 .
Хара Х, Хаяши К, Охта К, Ито Н, Охта М (ноябрь 1994 г.). «Новый ген-предшественник тимопоэтина из тимуса человека». Международная биохимия и молекулярная биология . 34 (5): 927–33. ПМИД 7703909 .
Гольдштейн Г., Шлезингер Д.Х., Аудхья Т. (июнь 1994 г.). «Выделение и полная аминокислотная последовательность человеческого тимопоэтина и спленина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (13): 6249. Бибкод : 1994PNAS...91.6249G . дои : 10.1073/pnas.91.13.6249 . ПМК 44176 . ПМИД 8016147 .
Харрис К.А., Андрюк П.Дж., Клайн С.В., Мэтью С., Секерка Дж.Дж., Гольдштейн Г. (июль 1995 г.). «Структура и картирование гена тимопоэтина человека (ТМПО) и взаимосвязь человеческого ТМПО бета с крысиным ламин-ассоциированным полипептидом 2». Геномика . 28 (2): 198–205. дои : 10.1006/geno.1995.1131 . ПМИД 8530026 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Бергер Р., Теодор Л., Шохам Дж., Гоккель Э., Брок-Симони Ф., Авраам К.Б., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А., Рехави Г., Саймон А.Дж. (май 1996 г.). «Характеристика и локализация мышиного гена полипептида 2, связанного с тимопоэтином / пластинкой, и его продуктов альтернативного сплайсинга» . Геномные исследования . 6 (5): 361–70. дои : 10.1101/гр.6.5.361 . ПМИД 8743987 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Фурукава К., Фрице С.Э., Джераче Л. (февраль 1998 г.). «Основной домен LAP2, нацеленный на ядерную оболочку, совпадает с его областью связывания ламина, но отличается от его домена взаимодействия с хроматином» . Журнал биологической химии . 273 (7): 4213–9. дои : 10.1074/jbc.273.7.4213 . ПМИД 9461618 .
Фурукава К., Кондо Т. (февраль 1998 г.). «Идентификация связанного с ламиной полипептид-2-связывающего домена ламина B-типа» . Европейский журнал биохимии . 251 (3): 729–33. дои : 10.1046/j.1432-1327.1998.2510729.x . ПМИД 9490046 .
Дечат Т., Готцманн Дж., Стокингер А., Харрис К.А., Талле М.А., Сикерка Дж.Дж., Фойснер Р. (август 1998 г.). «Устойчивость LAP2альфа к детергентам и соли в интерфазных ядрах и зависимая от фосфорилирования ассоциация с хромосомами на ранних стадиях сборки ядра подразумевают функции в динамике ядерной структуры» . Журнал ЭМБО . 17 (16): 4887–902. дои : 10.1093/emboj/17.16.4887 . ПМК 1170818 . ПМИД 9707448 .
Фурукава К. (август 1999 г.). «Белок 1, связывающий LAP2 (L2BP1/BAF), является кандидатом в медиатор взаимодействия LAP2-хроматина». Журнал клеточной науки . 112 (Пт 15) (15): 2485–92. дои : 10.1242/jcs.112.15.2485 . ПМИД 10393804 .
Вебер П.Дж., Экхард К.П., Гонсер С., Отто Х., Фолкерс Г., Бек-Сикингер А.Г. (июнь 1999 г.). «О роли тимопоэтинов в пролиферации клеток. Иммунохимические данные о новых членах семейства тимопоэтинов человека». Биологическая химия . 380 (6): 653–60. дои : 10.1515/BC.1999.081 . ПМИД 10430029 . S2CID 12957414 .
Дечат Т., Корбей Б., Воан О.А., Влчек С., Хатчисон С.Дж., Фойснер Р. (октябрь 2000 г.). «Связанный с ламиной полипептид 2альфа связывает внутриядерные ламины А-типа». Журнал клеточной науки . 113 Пт 19 (19): 3473–84. дои : 10.1242/jcs.113.19.3473 . ПМИД 10984438 .
Мартинс С.Б., Эйде Т., Стин Р.Л., Янсен Т., Сколхегг Б.С., Коллас П. (ноябрь 2000 г.). «HA95 — это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки» . Журнал клеточной науки . 113 Пт 21 (21): 3703–13. дои : 10.1242/jcs.113.21.3703 . ПМИД 11034899 .

Внешние ссылки

Тимопоэтины Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120802 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019961 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7517549-5] Харрис К.А., Андрюк П.Дж., Клайн С., Чан Х.К., Натараджан А., Секерка Дж.Дж., Гольдштейн Г. (июль 1994 г.). «Три различных тимопоэтина человека происходят из альтернативно сплайсированных мРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (14): 6283–7. Бибкод : 1994PNAS...91.6283H . дои : 10.1073/pnas.91.14.6283 . ПМК 44185 . ПМИД 7517549 .

[entrez-6] «Энтрез Ген: ТМПО тимопоэтин» .

[Worman-7] Холмер Л., Ворман Х.Дж. (ноябрь 2001 г.). «Белки внутренней ядерной мембраны: функции и нацеливание». Клеточные и молекулярные науки о жизни . 58 (12–13): 1741–7. дои : 10.1007/PL00000813 . ПМИД 11766875 . S2CID 20902309 .

[pmid10393804-8] Фурукава К. (август 1999 г.). «Белок 1, связывающий LAP2 (L2BP1/BAF), является кандидатом в медиатор взаимодействия LAP2-хроматина». Журнал клеточной науки . 112 (Пт 15) (15): 2485–92. дои : 10.1242/jcs.112.15.2485 . ПМИД 10393804 .

[pmid11034899-9] Мартинс С.Б., Эйде Т., Стин Р.Л., Янсен Т., Сколхегг Б.С., Коллас П. (ноябрь 2000 г.). «HA95 — это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки» . Журнал клеточной науки . 113 Пт 21 (21): 3703–13. дои : 10.1242/jcs.113.21.3703 . ПМИД 11034899 .

[pmid12538639-10] Мартинс С., Эйквар С., Фурукава К., Коллас П. (январь 2003 г.). «HA95 и LAP2 beta опосредуют новое взаимодействие хроматина и ядерной оболочки, участвующее в инициации репликации ДНК» . Журнал клеточной биологии . 160 (2): 177–88. дои : 10.1083/jcb.200210026 . ПМК 2172640 . ПМИД 12538639 .

[pmid9490046-11] Фурукава К., Кондо Т. (февраль 1998 г.). «Идентификация связанного с ламиной полипептид-2-связывающего домена ламина B-типа» . Европейский журнал биохимии . 251 (3): 729–33. дои : 10.1046/j.1432-1327.1998.2510729.x . ПМИД 9490046 .

[pmid8324822-12] Фойснер Р., Джерас Л. (июль 1993 г.). «Интегральные мембранные белки ядерной оболочки взаимодействуют с ламинами и хромосомами, и связывание модулируется митотическим фосфорилированием». Клетка . 73 (7): 1267–79. дои : 10.1016/0092-8674(93)90355-Т . ПМИД 8324822 . S2CID 10641633 .

[pmid12475961-13] Маркевич Э., Дечат Т., Фойснер Р., Куинлан Р.А., Хатчисон С.Дж. (декабрь 2002 г.). «Ламин A/C-связывающий белок LAP2альфа необходим для ядерного закрепления белка ретинобластомы» . Молекулярная биология клетки . 13 (12): 4401–13. doi : 10.1091/mbc.E02-07-0450 . ПМК 138642 . ПМИД 12475961 .

[pmid10984438-14] Дечат Т., Корбей Б., Воан О.А., Влчек С., Хатчисон С.Дж., Фойснер Р. (октябрь 2000 г.). «Связанный с ламиной полипептид 2альфа связывает внутриядерные ламины А-типа». Журнал клеточной науки . 113 Пт 19 (19): 3473–84. дои : 10.1242/jcs.113.19.3473 . ПМИД 10984438 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]