Streptomyces albidoflavus

Streptomyces albidoflavus
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Actinomycetota
Сорт:	Актиномицетия
Заказ:	Streptomycetales
Семья:	Streptomycetaceae
Род:	Streptomyces
Разновидность:	Сент -Альбидофлавус
Биномиальное название
	Streptomyces albidoflavus ; (Росси Дория, 1891) Waksman and Henrici 1948 (утвержденные списки 1980)
Тип напряжения
	Как 4,1291, ATCC 25429, BCRC 13699, CBS 419.34, CCRC 126371, IMRC 10209, IMRC 82, IMRC 41006, IMRUK 86006, ISP 5455, JCM 4446, KCC S-0446, KCC S-0466, KCC S-1072, MTCC 9326, NBIMCC 2810, NBIMCC 2886, NBIMCC 2810, NBIMCC 280133, NBRC 1243, NRRL B-1271, NRRL B-263, NBRC 1243, NRRL B-1271, NRRL B-263, NRRC-263, NRRC-263, NRRC-263, NBRC 1243, NRRL B-1271, NRRL63, NBRC 1243, NRRL B-1271, NRRR63, NBRC 1243, NRRL B-1271, NRRL63, NBRC 1243, NRRL B-1271, NBRL B-263, NBRC. NRRL-ISP 5455, RIA 1202, штамм ATCC 25422, VKM AC-746, VTTM E-991429
Синонимы
	« Actinomyces albidoflavus » (Rossi Doria 1891), Gasperini 1894 ; " Actinomyces Globisporus subsp. Caucasicus " Kudrina 1957 ; " Actinomyces sampsonii " Миллард и Барр 1926 ; " Cladothrix Albido-Blonde " [ sic ] (Rossi Doria 1891) MACE 1901 ; Streptomyces Canescens Waksman 1957 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces Champavatii Uma и Narasimha Rao 1959 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces coelicolor (Müller 1908) Waksman and Henrici 1948 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces Felleus Lindenbein 1952 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces Globisporus subsp. Caucasicus (Kudrina 1957) Pridham et al . 1958 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces griseus subsp. Solvifaciens Pridham 1970 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces Limosus Lindenbein 1952 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces Odorifer (Rullmann 1895) Waksman 1953 (утвержденные списки 1980) ; Streptomyces Sampsonii (Millard and Burr 1926) Waksman 1953 (утвержденные списки 1980) ; " Streptothrix albidoflava " Росси Дория 1891 ; " Streptrix albidoflava " [ sic ] Росси Дория 1891 ; " Streptothrix Coelicolor " Müller 1908 ;

Streptomyces albidoflavus - это виды бактерий из рода Streptomyces , который был выделен из почвы из Польши . ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Streptomyces albidoflavus производит дибутиловые фталат и стрептотины . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Маленькая некодирующая РНК

Бактериальные малые РНК участвуют в посттранскрипционной регуляции. Использование глубокого секвенирования S. albidoflavus транскриптом был проанализирован в конце экспоненциального роста. 63 небольших РНК были идентифицированы. Выражение 11 из них было подтверждено северным блотом. Было показано, что SRNAs присутствуют только у видов Streptomyces . ^{[ 8 ]}

SRNA SCR4677 ( Streptomyces Coelicolor SRNA 4677) расположена во внутренней области между геном SCO4677 против сигма-фактора и предполагаемым регуляторным геном белка SCO4676 . SCR4677 Экспрессия требует активности SCO4677 , а сама SRNA SCR4677, по -видимому, влияет на уровни транскриптов, связанных с SCO4676 . ^{[ 9 ]}

Цели двух из некодирующих РНК S. albidoflavus были идентифицированы. Некодирующая РНК глютамин -синтетазы I было показано, что модулирует выработку антибиотиков. ^{[ 10 ]} Маленькая РНК SCR5239 ( Streptomyces coelicolor SRNA вверх по течению от SCO5239) имеет две мишени. Он ингибирует экспрессию агаразы DAGA путем прямого спаривания оснований в область кодирования DAGA и подавляет трансляцию метиониновой синтазы метеза (SCO0985) на 5 -дюймовом раме открытого считывания . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Синтез жирных кислот

Кристаллическая структура доступна для S. albidoflavus [ацил-карьера-протеин] S- малонилтрансфераза . albidoflavus ACP -MT S. S участвует как в жирных кислот синтезе II II, так и в поликетид -синтазе и структурно сходна с Escherichia coli . аналогом ^{[ 13 ]}

Использование в биотехнологии

Штаммы S. albidoflavus продуцируют различные антибиотики , включая актинородин , метиленомицин , ундецилпродигизин , ^{[ 14 ]} и перимицин . ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} Некоторые штаммы S. albidoflavus могут использоваться для экспрессии гетерологичной белка . ^{[ 17 ]}

Репарация ДНК

KU Гомолог SCF55.25c . Он содержит щелочную щелочную фосфатазу (SAP-подобную) домен на C-конце . S. albidoflavus продуцирует (предположительно) однодоменный белок Sc9h11.09c , который является гомологичным для лигд -мышки, который является общим для многих бактериальных лигдов. ( Лигды являются подсемейством ДНК -лигаз . У бактерий многие, но не все лигды имеют дополнительные нуклеазы , разветвленные из универсально присутствующего домена центральной лигазы . Если присутствует - как в этом случае - нуклеазный домен представляет собой расширение N -конце .) ^{[ 18 ]}

Генетика

Геном состоит из одной линейной молекулы, и хотя KU ожидается выполнить конечное поддержание, до сих пор не наблюдается. ^{[ 18 ]}

Смотрите также

Список Streptomyces видов

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} LPSN BACTERIO.NET
^ Штамм Streptomyces albidoflavus
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Uniprot
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур [1]
^ Swiontek Brzezinska, M.; Jankiewicz, U.; Бурковская А. (2013). «Очистка и характеристика противогрибковых компонентов Streptomyces albidoflavus». Прикладная биохимия и микробиология . 49 (5): 451. doi : 10.1134/s0003683813050025 . S2CID 17097515 .
^ Рой, Рн; Laskar, S.; Sen, SK (2006). «Дибутил -фталат, биоактивное соединение, продуцируемое Streptomyces albidoflavus 321.2» . Микробиологические исследования . 161 (2): 121–6. doi : 10.1016/j.micres.2005.06.007 . PMID 16427514 .
^ Стюарт Шапиро (1989). Регуляция вторичного метаболизма в актиномицетах . CRC Press. ISBN 0-8493-6927-4 .
^ Vockenhuber MP, Sharma CM, Statt MG, Schmidt D, Xu Z, Dietrich S, et al. (Май 2011). «Глубокая идентификация небольших некодирующих РНК в Streptomyces coelicolor» . РНК -биология . 8 (3): 468–77. doi : 10.4161/rna.8.3.14421 . PMC 3218513 . PMID 21521948 .
^ Moody MJ, Jones SE, Elliot MA (2014-01-01). «Сложная внутриопероническая динамика, опосредованная небольшой РНК в streptomyces coelicolor » . Plos один . 9 (1): E85856. Bibcode : 2014ploso ... 985856H . doi : 10.1371/journal.pone.0085856 . PMC 3896431 . PMID 24465751 .
^ D'Alia D, Nieselt K, Steigele S, Müller J, Verburg I, Takano E (February 2010). "Noncoding RNA of glutamine synthetase I modulates antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2)". Journal of Bacteriology. 192 (4): 1160–4. doi:10.1128/JB.01374-09. PMC 2812974. PMID 19966003.
^ Vockenhuber MP, Suess B (February 2012). "Streptomyces coelicolor sRNA scr5239 inhibits agarase expression by direct base pairing to the dagA coding region". Microbiology. 158 (Pt 2): 424–435. doi:10.1099/mic.0.054205-0. PMID 22075028.
^ Vockenhuber MP, Heueis N, Suess B (2015-01-01). "Identification of metE as a second target of the sRNA scr5239 in Streptomyces coelicolor". PLOS ONE. 10 (3): e0120147. Bibcode:2015PLoSO..1020147V. doi:10.1371/journal.pone.0120147. PMC 4365011. PMID 25785836.
^ White, Stephen W.; Zheng, Jie; Zhang, Yong-Mei; Rock, Charles O. (2005). "The Structural Biology of Type II Fatty Acid Biosynthesis". Annual Review of Biochemistry. 74 (1). Annual Reviews: 791–831. doi:10.1146/annurev.biochem.74.082803.133524. ISSN 0066-4154. PMID 15952903.
^ Brian P, Riggle PJ, Santos RA, Champness WC (June 1996). "Global negative regulation of Streptomyces coelicolor antibiotic synthesis mediated by an absA-encoded putative signal transduction system". Journal of Bacteriology. 178 (11): 3221–31. doi:10.1128/jb.178.11.3221-3231.1996. PMC 178074. PMID 8655502.
^ Liu CM, McDaniel LE, Schaffner CP (March 1972). "Fungimycin, biogenesis of its aromatic moiety". The Journal of Antibiotics. 25 (3): 187–8. doi:10.7164/antibiotics.25.187. PMID 5034814.
^ Lee CH, Schaffner CP (May 1969). "Perimycin. The structure of some degradation products". Tetrahedron. 25 (10): 2229–32. doi:10.1016/S0040-4020(01)82770-8. PMID 5788396.
^ "Streptomyces coelicolor". John Innes Center. Archived from the original on 19 October 2005. Retrieved 25 January 2010.
^ Jump up to: ^a ^b Pitcher, Robert S.; Brissett, Nigel C.; Doherty, Aidan J. (2007). "Nonhomologous End-Joining in Bacteria: A Microbial Perspective". Annual Review of Microbiology. 61 (1). Annual Reviews: 259–282. doi:10.1146/annurev.micro.61.080706.093354. ISSN 0066-4227. PMID 17506672.

Внешние ссылки

Тип штамм Streptomyces albidoflavus при бактериальном погружении - метадатабаза бактериального разнообразия

Эта Streptomyces статья, связанная с , является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Streptomyces-albidoflavus-1] Jump up to: ^а ^{беременный} LPSN BACTERIO.NET

[2] Штамм Streptomyces albidoflavus

[UniProt-3] Jump up to: ^а ^{беременный} Uniprot

[DSM-4] Jump up to: ^а ^{беременный} Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур [1]

[5] Swiontek Brzezinska, M.; Jankiewicz, U.; Бурковская А. (2013). «Очистка и характеристика противогрибковых компонентов Streptomyces albidoflavus». Прикладная биохимия и микробиология . 49 (5): 451. doi : 10.1134/s0003683813050025 . S2CID 17097515 .

[6] Рой, Рн; Laskar, S.; Sen, SK (2006). «Дибутил -фталат, биоактивное соединение, продуцируемое Streptomyces albidoflavus 321.2» . Микробиологические исследования . 161 (2): 121–6. doi : 10.1016/j.micres.2005.06.007 . PMID 16427514 .

[7] Стюарт Шапиро (1989). Регуляция вторичного метаболизма в актиномицетах . CRC Press. ISBN 0-8493-6927-4 .

[8] Vockenhuber MP, Sharma CM, Statt MG, Schmidt D, Xu Z, Dietrich S, et al. (Май 2011). «Глубокая идентификация небольших некодирующих РНК в Streptomyces coelicolor» . РНК -биология . 8 (3): 468–77. doi : 10.4161/rna.8.3.14421 . PMC 3218513 . PMID 21521948 .

[9] Moody MJ, Jones SE, Elliot MA (2014-01-01). «Сложная внутриопероническая динамика, опосредованная небольшой РНК в streptomyces coelicolor » . Plos один . 9 (1): E85856. Bibcode : 2014ploso ... 985856H . doi : 10.1371/journal.pone.0085856 . PMC 3896431 . PMID 24465751 .

[10] D'Alia D, Nieselt K, Steigele S, Müller J, Verburg I, Takano E (February 2010). "Noncoding RNA of glutamine synthetase I modulates antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2)". Journal of Bacteriology. 192 (4): 1160–4. doi:10.1128/JB.01374-09. PMC 2812974. PMID 19966003.

[11] Vockenhuber MP, Suess B (February 2012). "Streptomyces coelicolor sRNA scr5239 inhibits agarase expression by direct base pairing to the dagA coding region". Microbiology. 158 (Pt 2): 424–435. doi:10.1099/mic.0.054205-0. PMID 22075028.

[12] Vockenhuber MP, Heueis N, Suess B (2015-01-01). "Identification of metE as a second target of the sRNA scr5239 in Streptomyces coelicolor". PLOS ONE. 10 (3): e0120147. Bibcode:2015PLoSO..1020147V. doi:10.1371/journal.pone.0120147. PMC 4365011. PMID 25785836.

[White-et-al-2005-13] White, Stephen W.; Zheng, Jie; Zhang, Yong-Mei; Rock, Charles O. (2005). "The Structural Biology of Type II Fatty Acid Biosynthesis". Annual Review of Biochemistry. 74 (1). Annual Reviews: 791–831. doi:10.1146/annurev.biochem.74.082803.133524. ISSN 0066-4154. PMID 15952903.

[pmid8655502-14] Brian P, Riggle PJ, Santos RA, Champness WC (June 1996). "Global negative regulation of Streptomyces coelicolor antibiotic synthesis mediated by an absA-encoded putative signal transduction system". Journal of Bacteriology. 178 (11): 3221–31. doi:10.1128/jb.178.11.3221-3231.1996. PMC 178074. PMID 8655502.

[aromatic-15] Liu CM, McDaniel LE, Schaffner CP (March 1972). "Fungimycin, biogenesis of its aromatic moiety". The Journal of Antibiotics. 25 (3): 187–8. doi:10.7164/antibiotics.25.187. PMID 5034814.

[Lee-16] Lee CH, Schaffner CP (May 1969). "Perimycin. The structure of some degradation products". Tetrahedron. 25 (10): 2229–32. doi:10.1016/S0040-4020(01)82770-8. PMID 5788396.

[JIC-17] "Streptomyces coelicolor". John Innes Center. Archived from the original on 19 October 2005. Retrieved 25 January 2010.

[Pitcher-et-al-2007-18] Jump up to: ^a ^b Pitcher, Robert S.; Brissett, Nigel C.; Doherty, Aidan J. (2007). "Nonhomologous End-Joining in Bacteria: A Microbial Perspective". Annual Review of Microbiology. 61 (1). Annual Reviews: 259–282. doi:10.1146/annurev.micro.61.080706.093354. ISSN 0066-4227. PMID 17506672.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]