MAP1LC3A

MAP1LC3A
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3ECI, 3WAL, 3WAN, 4ZDV
Идентификаторы
Псевдонимы	MAP1LC3A , ATG8E, LC3, LC3A, MAP1ALC3, MAP1BLC3, ассоциированный с микротрубочками белок 1, легкая цепь 3 альфа
Внешние идентификаторы	Опустить : 601242 ; МГИ : 1915661 ; Гомологен : 12021 ; Генные карты : MAP1LC3A ; OMA : MAP1LC3A — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	34,560,345 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	155,119,993 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; right frontal lobe; ; Brodmann area 9; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; prefrontal cortex; ; hypothalamus; ; C1 segment; ; amygdala; ; anterior pituitary;
	Top expressed in
	lip; ; muscle of thigh; ; right ventricle; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; seminiferous tubule; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; digastric muscle; ; triceps brachii muscle;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	phosphatidylethanolamine binding; protein binding; phospholipid binding; ubiquitin protein ligase binding; microtubule binding;
Cellular component	cytoplasm; organelle membrane; cytosol; late endosome; membrane; autophagosome; microtubule; cytoskeleton; cytoplasmic vesicle; endomembrane system; autolysosome; autophagosome membrane; synapse;
Biological process	autophagy; autophagy of mitochondrion; autophagosome assembly; response to iron(II) ion; response to lead ion; response to nutrient levels; cellular response to amino acid starvation; response to morphine; cellular response to hydrogen peroxide; cellular response to copper ion; cellular response to nitrogen starvation; cellular response to starvation; macroautophagy; autophagosome maturation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84557
	66734
	ENSG00000101460
	ENSMUSG00000027602
	Q9H492
	Q91VR7
	НМ_032514 ; НМ_181509
	НМ_025735
	НП_115903 ; НП_852610
	НП_080011
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Связанные с микротрубочками белки 1A/1B легкой цепи 3A представляют собой белок , который у человека кодируется MAP1LC3A геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.

Функция

MAP1A и MAP1B представляют собой белки, ассоциированные с микротрубочками , которые опосредуют физические взаимодействия между микротрубочками и компонентами цитоскелета . Каждая из MAP1A и MAP1B состоит из субъединицы тяжелой цепи и множества субъединиц легкой цепи. Белок, кодируемый этим геном, является одной из субъединиц легкой цепи и может ассоциироваться либо с MAP1A, либо с MAP1B. ^{[ 7 ]}

MAPLC3A — один из гомологов дрожжевого ATG8 млекопитающих , важного маркера и эффектора аутофагии . ^{[ 8 ]}

Регулирование

MAP1LC3A регулируется несколькими посттрансляционными модификациями . К ним относятся ковалентная связь С-конца с фосфатидилэтаноламином в аутофагических мембранах фосфорилирование протеинкиназой А. и ^{[ 9 ]} что подавляет его функции аутофагии. Нековалентные взаимодействия важны для функций нацеливания груза при селективной аутофагии. Например, было показано, что он взаимодействует с секвестосомой 1 . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101460 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027602 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Манн СС, Хаммарбек Дж. А. (май 1997 г.). «Локализация гена и экспрессия легкой цепи 3 в процессе развития: общая субъединица ассоциированного с микротрубочками белка 1A (MAP1A) и MAP1B». J Neurosci Res . 43 (5): 535–44. doi : 10.1002/(SICI)1097-4547(19960301)43:5<535::AID-JNR3>3.0.CO;2-J . ПМИД 8833088 . S2CID 23515321 .
^ Панкив С., Клаузен Т.Х., Ламарк Т., Брех А., Брюун Дж.А., Оутцен Х., Оверватн А., Бьоркой Г., Йохансен Т. (август 2007 г.). «p62/SQSTM1 напрямую связывается с Atg8/LC3, способствуя деградации агрегатов убиквитинированных белков путем аутофагии» . J Биол Хим . 282 (33): 24131–45. дои : 10.1074/jbc.M702824200 . ПМИД 17580304 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: MAP1LC3A, ассоциированный с микротрубочками белок 1 легкой цепи 3 альфа» .
^ Валенте Дж., Морани Ф., Никотра Дж., Фуско Н., Пераккио С., Титоне Р., Алабисо О., Арисио Р., Кацарос Д., Бенедетто С., Исидоро С. (2014). «Экспрессия и клиническое значение белков аутофагии BECLIN 1 и LC3 при раке яичников» . Биомед Рес Инт . 2014 : 462658. doi : 10.1155/2014/462658 . ПМК 4127242 . ПМИД 25136588 .
^ Черра С.Дж., Кулич С.М., Уечи Г., Баласубрамани М., Маунтцурис Дж., Дэй Б.В., Чу К.Т. (август 2010 г.). «Регуляция белка аутофагии LC3 путем фосфорилирования» . Дж. Клеточная Биол . 190 (4): 533–9. дои : 10.1083/jcb.201002108 . ПМК 2928022 . ПМИД 20713600 .
^ Швец Э., Фасс Э., Шерц-Шуваль Р., Элазар З. (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62/SQSTM1 в аутофагосомы» . Дж. Клеточная наука . 121 (Часть 16): 2685–95. дои : 10.1242/jcs.026005 . ПМИД 18653543 .

Дальнейшее чтение

Снасель Й, Пихова I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Фолиа Биол. (Прага) . 42 (5): 227–30. дои : 10.1007/BF02818986 . ПМИД 8997639 . S2CID 7617882 .
Валлин М., Дейнум Дж., Губар Л., Дэниэлсон У.Х. (1990). «Протеолитическое расщепление белков, связанных с микротрубочками, ретровирусными протеиназами» . Дж. Генерал Вирол . 71 (9): 1985–91. дои : 10.1099/0022-1317-71-9-1985 . ПМИД 2212989 .
Шенфельд Т.А., МакКеррачер Л., Обар Р., Валле Р.Б. (1989). «MAP 1A и MAP 1B представляют собой структурно родственные белки, ассоциированные с микротрубочками, с различными паттернами развития в ЦНС» . Дж. Нейроски . 9 (5): 1712–30. doi : 10.1523/JNEUROSCI.09-05-01712.1989 . ПМК 6569839 . ПМИД 2470876 .
Манн СС, Хаммарбек Дж.А. (1994). «Молекулярная характеристика легкой цепи 3. Субъединица, связывающая микротрубочки MAP1A и MAP1B» . Ж. Биол. Хим . 269 (15): 11492–7. дои : 10.1016/S0021-9258(19)78150-2 . ПМИД 7908909 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Бонне С., Буше Д., Лазерег С. и др. (2001). «Дифференциальная регуляция связывания белков MAP1A, MAP1B и MAP2, связанных с микротрубочками, путем полиглутамилирования тубулина» . Ж. Биол. Хим . 276 (16): 12839–48. дои : 10.1074/jbc.M011380200 . ПМИД 11278895 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20-й хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Хэ Х., Данг Ю., Дай Ф. и др. (2003). «Посттрансляционные модификации трех членов семейства MAP1LC3 человека и обнаружение нового типа модификации MAP1LC3B» . Ж. Биол. Хим . 278 (31): 29278–87. дои : 10.1074/jbc.M303800200 . ПМИД 12740394 .
Танида И., Соу Ю.С., Эзаки Дж. и др. (2004). «HsAtg4B/HsApg4B/аутофагин-1 расщепляет карбоксильные концы трех гомологов человеческого Atg8 и делипидирует конъюгаты легкой цепи белка, ассоциированного с микротрубочками, и конъюгата фосфолипида, связанного с рецептором GABAA» . Ж. Биол. Хим . 279 (35): 36268–76. дои : 10.1074/jbc.M401461200 . ПМИД 15187094 .
Коуно Т., Мизугути М., Танида И. и др. (2005). «Резонансные назначения 1H, 13C и 15N легкой цепи-3 белка, ассоциированного с микротрубочками человека». Дж. Биомол. ЯМР . 29 (3): 415–6. doi : 10.1023/B:JNMR.0000032505.99071.ea . ПМИД 15213446 . S2CID 23561733 .
Гёлер Х., Лаловски М., Стельцль У. и др. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона» . Мол. Клетка . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . ПМИД 15383276 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Коуно Т., Мизугути М., Танида И. и др. (2005). «Структура раствора легкой цепи 3 белка, ассоциированного с микротрубочками, и идентификация ее функциональных субдоменов» . Ж. Биол. Хим . 280 (26): 24610–7. дои : 10.1074/jbc.M413565200 . ПМИД 15857831 .
Соу Ю.С., Танида И., Комацу М. и др. (2006). «Фосфатидилсерин в дополнение к фосфатидилэтаноламину является мишенью in vitro модификаторов Atg8 млекопитающих, LC3, GABARAP и GATE-16» . Ж. Биол. Хим . 281 (6): 3017–24. дои : 10.1074/jbc.M505888200 . ПМИД 16303767 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101460 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027602 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8833088-5] Манн СС, Хаммарбек Дж. А. (май 1997 г.). «Локализация гена и экспрессия легкой цепи 3 в процессе развития: общая субъединица ассоциированного с микротрубочками белка 1A (MAP1A) и MAP1B». J Neurosci Res . 43 (5): 535–44. doi : 10.1002/(SICI)1097-4547(19960301)43:5<535::AID-JNR3>3.0.CO;2-J . ПМИД 8833088 . S2CID 23515321 .

[pmid17580304-6] Панкив С., Клаузен Т.Х., Ламарк Т., Брех А., Брюун Дж.А., Оутцен Х., Оверватн А., Бьоркой Г., Йохансен Т. (август 2007 г.). «p62/SQSTM1 напрямую связывается с Atg8/LC3, способствуя деградации агрегатов убиквитинированных белков путем аутофагии» . J Биол Хим . 282 (33): 24131–45. дои : 10.1074/jbc.M702824200 . ПМИД 17580304 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: MAP1LC3A, ассоциированный с микротрубочками белок 1 легкой цепи 3 альфа» .

[8] Валенте Дж., Морани Ф., Никотра Дж., Фуско Н., Пераккио С., Титоне Р., Алабисо О., Арисио Р., Кацарос Д., Бенедетто С., Исидоро С. (2014). «Экспрессия и клиническое значение белков аутофагии BECLIN 1 и LC3 при раке яичников» . Биомед Рес Инт . 2014 : 462658. doi : 10.1155/2014/462658 . ПМК 4127242 . ПМИД 25136588 .

[pmid20713600-9] Черра С.Дж., Кулич С.М., Уечи Г., Баласубрамани М., Маунтцурис Дж., Дэй Б.В., Чу К.Т. (август 2010 г.). «Регуляция белка аутофагии LC3 путем фосфорилирования» . Дж. Клеточная Биол . 190 (4): 533–9. дои : 10.1083/jcb.201002108 . ПМК 2928022 . ПМИД 20713600 .

[pmid18653543-10] Швец Э., Фасс Э., Шерц-Шуваль Р., Элазар З. (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62/SQSTM1 в аутофагосомы» . Дж. Клеточная наука . 121 (Часть 16): 2685–95. дои : 10.1242/jcs.026005 . ПМИД 18653543 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]