АКД (ген)

АКД
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2I46
Идентификаторы
Псевдонимы	ACD , PIP1, PTOP, TINT1, TPP1, гомолог адренокортикальной дисплазии, субъединица шелтеринового комплекса и фактор рекрутирования теломеразы, субъединица шелтеринового комплекса ACD и фактор рекрутирования теломеразы
Внешние идентификаторы	Опустить : 609377 ; МГИ : 87873 ; Гомологен : 23391 ; GeneCards : ACD ; ОМА : ACD — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	67,660,810 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	106,427,734 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; oocyte; ; secondary oocyte; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; left ovary; ; right frontal lobe; ; right ovary; ; right testis; ; granulocyte;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; ventricular zone; ; blastocyst; ; primary oocyte; ; ganglionic eminence; ; thymus; ; neural tube; ; right kidney; ; superior frontal gyrus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; telomeric DNA binding; DNA polymerase binding; protein binding; protein-containing complex binding;
Cellular component	nuclear telomere cap complex; chromosome; telomere; nucleus; nucleoplasm; nuclear body; shelterin complex;
Biological process	skeletal system development; positive regulation of single-stranded telomeric DNA binding; protection from non-homologous end joining at telomere; protein localization to chromosome, telomeric region; embryonic limb morphogenesis; establishment of protein localization to telomere; urogenital system development; intracellular protein transport; telomere assembly; segmentation; telomere maintenance; telomere capping; negative regulation of telomere maintenance via telomerase; positive regulation of telomere maintenance via telomerase; positive regulation of telomerase activity; mitotic telomere maintenance via semi-conservative replication; telomere-telomerase complex assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	65057
	497652
	ENSG00000102977
	ЭНСМУСГ00000038000
	Q96AP0
	Q5EE38
	НМ_001082486 ; НМ_001082487 ; НМ_022914
	НМ_001012638 ; НМ_001348349
	НП_001075955 ; НП_075065
	НП_001012656 ; НП_001335278
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомолог белка адренокортикальной дисплазии — белок , который у человека кодируется ACD геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует белок, участвующий в функции теломер. Этот белок является одним из шести основных белков теломерного комплекса телосома/укрытие, который функционирует для поддержания длины теломер и защиты концов теломер. Благодаря взаимодействию с другими компонентами этот белок играет ключевую роль в сборке и стабилизации этого комплекса и опосредует доступ теломеразы к теломерам. Для этого гена обнаружено множество вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. Этот ген, который также называют TPP1, отличается от несвязанного с ним гена TPP1 на хромосоме 11, который кодирует трипептидилпептидазу I. ^{[ 7 ]}

TPP1 является компонентом теломер-специфического комплекса шелтерина , который облегчает репликацию двухцепочечных участков теломерной ДНК и защищает конец теломер от нерегулируемой активности репарации ДНК. TPP1 в основном функционирует как регулятор рекрутирования, активации и регуляции теломеразы. ^{[ 8 ]} Хотя TPP1 первоначально был описан как связующий фактор между TRF1 и TRF2 , которые участвуют в пути с POT1 в качестве отрицательного регулятора зависимого от теломеразы контроля длины теломер, ^{[ 9 ]} более поздние исследования показывают, что TPP1 может напрямую стимулировать теломеразную активность теломер. ^{[ 10 ]} TPP1 необходим и достаточен для привлечения фермента теломеразы к теломерам и является единственным белком шелтерина, находящимся в прямом контакте с теломеразой. ^{[ 11 ]}

часть складки олигонуклеотида/олигосахарида (OB) TPP1, называемая патчем TEL , которая взаимодействует с каталитической субъединицей теломеразы, hTERT , необходима для активации теломеразы. Было доказано, что ^{[ 12 ]} TPP1 также был продемонстрирован как единственный путь, необходимый для рекрутирования теломеразы на концы хромосом, а также он определяет гомеостаз длины теломер в hESCs. ^{[ 12 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ACD (ген) взаимодействует с POT1. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 13 ]} и TINF2 . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

ПОТ1 ^{[ 14 ]}
hTERT ^{[ 10 ]}^{[ 9 ]}
ИНН2 ^{[ 15 ]}
ТРФ1 ^{[ 15 ]}
ТРФ2 ^{[ 15 ]}
Теломераза ^{[ 16 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000102977 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038000 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Йе Дж.З., Хоккемейер Д., Крутчинский А.Н., Лоайза Д., Хупер С.М., Хаит Б.Т., де Ланге Т. (июль 2004 г.). «POT1-взаимодействующий белок PIP1: регулятор длины теломер, который рекрутирует POT1 в комплекс TIN2/TRF1» . Генс Дев . 18 (14): 1649–54. дои : 10.1101/gad.1215404 . ПМЦ 478187 . ПМИД 15231715 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Лю Д., Сафари А., О'Коннор М.С., Чан Д.В., Легелер А., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «PTOP взаимодействует с POT1 и регулирует его локализацию на теломерах». Nat Cell Biol . 6 (7): 673–80. дои : 10.1038/ncb1142 . ПМИД 15181449 . S2CID 11543383 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог адренокортикальной дисплазии ACD (мышь)» .
^ Карлседер Дж. (сентябрь 2014 г.). «Современное редактирование генома сочетается с теломерами: множество функций TPP1» . Гены и развитие . 28 (17): 1857–8. дои : 10.1101/gad.250316.114 . ПМК 4197952 . ПМИД 25184673 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Хоккемейер Д., Палм В., Элс Т., Дэниелс Дж.П., Такай К.К., Йе Дж.З., Киган С.Э., де Ланге Т., Хаммер Г.Д. (август 2007 г.). «Защита теломер с помощью Pot1 млекопитающих требует взаимодействия с Tpp1». Структурная и молекулярная биология природы . 14 (8): 754–61. дои : 10.1038/nsmb1270 . ПМИД 17632522 . S2CID 84294729 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Нандакумар Дж., Белл К.Ф., Вайденфельд И., Зауг А.Дж., Лейнванд Л.А., Чех Т.Р. (декабрь 2012 г.). «Участок TEL теломерного белка TPP1 опосредует рекрутирование и процессивность теломеразы» . Природа . 492 (7428): 285–9. Бибкод : 2012Natur.492..285N . дои : 10.1038/nature11648 . ПМЦ 3521872 . ПМИД 23103865 .
^ Гриль С., Нандакумар Дж. (2021). «Молекулярные механизмы нарушений биологии теломер» . Журнал биологической химии . 296 : 100064. doi : 10.1074/jbc.REV120.014017 . ПМЦ 7948428 . ПМИД 33482595 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Секстон А.Н., Регаладо С.Г., Лай К.С., Кост Г.Дж., О'Нил К.М., Урнов Ф.Д., Грегори П.Д., Джениш Р., Коллинз К., Хоккемейер Д. (сентябрь 2014 г.). «Генетическая и молекулярная идентификация трех функций TPP1 человека в действии теломеразы: рекрутирование, активация и регуляция заданного значения гомеостаза» . Гены и развитие . 28 (17): 1885–99. дои : 10.1101/gad.246819.114 . ПМК 4197946 . ПМИД 25128433 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Такай К.К., Хупер С., Блэквуд С., Ганди Р., де Ланге Т. (январь 2010 г.). «Стехиометрия компонентов шелтерина in vivo» . Журнал биологической химии . 285 (2): 1457–67. дои : 10.1074/jbc.M109.038026 . ПМК 2801271 . ПМИД 19864690 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с О'Коннор М.С., Сафари А., Синь Х., Лю Д., Сунъян З. (август 2006 г.). «Критическая роль взаимодействия TPP1 и TIN2 в сборке теломерного комплекса высокого порядка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (32): 11874–9. Бибкод : 2006PNAS..10311874O . дои : 10.1073/pnas.0605303103 . ПМЦ 1567669 . ПМИД 16880378 .
^ Зауг А.Дж., Поделл Э.Р., Нандакумар Дж., Чех Т.Р. (март 2010 г.). «Функциональное взаимодействие между теломерным белком TPP1 и теломеразой» . Гены и развитие . 24 (6): 613–22. дои : 10.1101/gad.1881810 . ПМЦ 2841338 . ПМИД 20231318 .

Внешние ссылки

человека ACD Расположение генома ACD и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
человека Расположение генома TPP1 и страница сведений о гене TPP1 в браузере генома UCSC .
PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для гомолога белка адренокортикальной дисплазии человека.

Дальнейшее чтение

де Ланге Т. (2005). «Шелтерин: белковый комплекс, который формирует и защищает теломеры человека» . Генс Дев . 19 (18): 2100–10. дои : 10.1101/gad.1346005 . ПМИД 16166375 .
Сунян З, Лю Д (2006). «Внутри интерактома теломер млекопитающих: регуляция и регуляторная активность теломер». Крит. Преподобный Эукариот. Джин Экспр . 16 (2): 103–18. doi : 10.1615/critreveukargeneexpr.v16.i2.10 . ПМИД 16749892 .
Кристофари Г., Сикора К., Лингнер Дж. (2007). «Теломераза отключена» . АКС хим. Биол . 2 (3): 155–8. дои : 10.1021/cb700037c . ПМИД 17373762 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Хауталинг Б.Р., Каттонаро Л., Чанг В., Смит С. (2005). «Динамическая молекулярная связь между регулятором длины теломер TRF1 и защитником конца хромосомы TRF2» . Курс. Биол . 14 (18): 1621–31. дои : 10.1016/j.cub.2004.08.052 . ПМИД 15380063 . S2CID 19036934 .
Киган С.Э., Хатц Дж.Э., Эльза Т., Адамска М., Шах С.П., Кент А.Е., Хаус Дж.М., Бимер В.Г., Хаммер Г.Д. (2005). «Мочеполовая и каудальная дисгенезия у мышей с адренокортикальной дисплазией (acd) вызвана мутацией сплайсинга в новом теломерном регуляторе» . Хм. Мол. Жене . 14 (1): 113–23. дои : 10.1093/hmg/ddi011 . ПМИД 15537664 .
Хатц Дж.Э., Краузе А.С., Ахерманн Дж.К., Вилен Э., Таубер М., Лекуантр С., Маккейб Э.Р., Хаммер Г.Д., Киган К.Э. (2006). «Ассоциация IMAGe и врожденная гипоплазия надпочечников: в гене ACD не обнаружено болезнетворных мутаций». Мол. Жене. Метаб . 88 (1): 66–70. дои : 10.1016/j.ymgme.2006.01.006 . ПМИД 16504561 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.И. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
О'Коннор М.С., Сафари А., Синь Х., Лю Д., Сунъян З. (2006). «Критическая роль взаимодействия TPP1 и TIN2 в сборке теломерного комплекса высокого порядка» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (32): 11874–9. Бибкод : 2006PNAS..10311874O . дои : 10.1073/pnas.0605303103 . ПМЦ 1567669 . ПМИД 16880378 .
Синь Х, Лю Д., Ван М., Сафари А., Ким Х., Сунь В., О'Коннор М.С., Сунян З. (2007). «TPP1 является гомологом TEBP-бета инфузорий и взаимодействует с POT1, рекрутируя теломеразу». Природа . 445 (7127): 559–62. Бибкод : 2007Natur.445..559X . дои : 10.1038/nature05469 . ПМИД 17237767 . S2CID 4347362 .
Ван Ф., Поделл Э.Р., Зауг А.Дж., Ян Й., Бачу П., Чех Т.Р., Лей М. (2007). «Теломерный комплекс POT1-TPP1 представляет собой фактор процессивности теломеразы» (PDF) . Природа . 445 (7127): 506–10. Бибкод : 2007Natur.445..506W . дои : 10.1038/nature05454 . hdl : 2027.42/62923 . ПМИД 17237768 . S2CID 4383587 .
Ван Ф., Поделл Э.Р., Зауг А.Дж., Ян Й., Бачу П., Чех Т.Р., Лей М. (2007). «Теломерный комплекс POT1-TPP1 представляет собой фактор процессивности теломеразы» (PDF) . Природа . 445 (7127): 506–10. Бибкод : 2007Natur.445..506W . дои : 10.1038/nature05454 . hdl : 2027.42/62923 . ПМИД 17237768 . S2CID 4383587 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000102977 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038000 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid15231715-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с Йе Дж.З., Хоккемейер Д., Крутчинский А.Н., Лоайза Д., Хупер С.М., Хаит Б.Т., де Ланге Т. (июль 2004 г.). «POT1-взаимодействующий белок PIP1: регулятор длины теломер, который рекрутирует POT1 в комплекс TIN2/TRF1» . Генс Дев . 18 (14): 1649–54. дои : 10.1101/gad.1215404 . ПМЦ 478187 . ПМИД 15231715 .

[pmid15181449-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с Лю Д., Сафари А., О'Коннор М.С., Чан Д.В., Легелер А., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «PTOP взаимодействует с POT1 и регулирует его локализацию на теломерах». Nat Cell Biol . 6 (7): 673–80. дои : 10.1038/ncb1142 . ПМИД 15181449 . S2CID 11543383 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог адренокортикальной дисплазии ACD (мышь)» .

[pmid25184673-8] Карлседер Дж. (сентябрь 2014 г.). «Современное редактирование генома сочетается с теломерами: множество функций TPP1» . Гены и развитие . 28 (17): 1857–8. дои : 10.1101/gad.250316.114 . ПМК 4197952 . ПМИД 25184673 .

[pmid176325222-9] Перейти обратно: ^а ^б Хоккемейер Д., Палм В., Элс Т., Дэниелс Дж.П., Такай К.К., Йе Дж.З., Киган С.Э., де Ланге Т., Хаммер Г.Д. (август 2007 г.). «Защита теломер с помощью Pot1 млекопитающих требует взаимодействия с Tpp1». Структурная и молекулярная биология природы . 14 (8): 754–61. дои : 10.1038/nsmb1270 . ПМИД 17632522 . S2CID 84294729 .

[pmid231038652-10] Перейти обратно: ^а ^б Нандакумар Дж., Белл К.Ф., Вайденфельд И., Зауг А.Дж., Лейнванд Л.А., Чех Т.Р. (декабрь 2012 г.). «Участок TEL теломерного белка TPP1 опосредует рекрутирование и процессивность теломеразы» . Природа . 492 (7428): 285–9. Бибкод : 2012Natur.492..285N . дои : 10.1038/nature11648 . ПМЦ 3521872 . ПМИД 23103865 .

[pmid33482595-11] Гриль С., Нандакумар Дж. (2021). «Молекулярные механизмы нарушений биологии теломер» . Журнал биологической химии . 296 : 100064. doi : 10.1074/jbc.REV120.014017 . ПМЦ 7948428 . ПМИД 33482595 .

[pmid25128433-12] Перейти обратно: ^а ^б Секстон А.Н., Регаладо С.Г., Лай К.С., Кост Г.Дж., О'Нил К.М., Урнов Ф.Д., Грегори П.Д., Джениш Р., Коллинз К., Хоккемейер Д. (сентябрь 2014 г.). «Генетическая и молекулярная идентификация трех функций TPP1 человека в действии теломеразы: рекрутирование, активация и регуляция заданного значения гомеостаза» . Гены и развитие . 28 (17): 1885–99. дои : 10.1101/gad.246819.114 . ПМК 4197946 . ПМИД 25128433 .

[pmid16189514-13] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid19864690-14] Такай К.К., Хупер С., Блэквуд С., Ганди Р., де Ланге Т. (январь 2010 г.). «Стехиометрия компонентов шелтерина in vivo» . Журнал биологической химии . 285 (2): 1457–67. дои : 10.1074/jbc.M109.038026 . ПМК 2801271 . ПМИД 19864690 .

[pmid16880378-15] Перейти обратно: ^а ^б ^с О'Коннор М.С., Сафари А., Синь Х., Лю Д., Сунъян З. (август 2006 г.). «Критическая роль взаимодействия TPP1 и TIN2 в сборке теломерного комплекса высокого порядка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (32): 11874–9. Бибкод : 2006PNAS..10311874O . дои : 10.1073/pnas.0605303103 . ПМЦ 1567669 . ПМИД 16880378 .

[pmid20231318-16] Зауг А.Дж., Поделл Э.Р., Нандакумар Дж., Чех Т.Р. (март 2010 г.). «Функциональное взаимодействие между теломерным белком TPP1 и теломеразой» . Гены и развитие . 24 (6): 613–22. дои : 10.1101/gad.1881810 . ПМЦ 2841338 . ПМИД 20231318 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]