РБМ8А

РБМ8А
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1P27, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2XB2, 3EX7
Идентификаторы
Псевдонимы	RBM8A , BOV-1A, BOV-1B, BOV-1C, C1DELq21.1, DEL1q21.1, MDS014, RBM8, RBM8B, TAR, Y14, ZNRP, ZRNP1, белок 8A РНК-связывающего мотива
Внешние идентификаторы	Опустить : 605313 ; МГИ : 1913129 ; Гомологен : 3744 ; Генные карты : RBM8A ; ОМА : RBM8A — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	145,927,678 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	96,541,107 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; Achilles tendon; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; gastrocnemius muscle; ; islet of Langerhans; ; skin of abdomen; ; monocyte; ; right testis; ; left testis;
	Top expressed in
	embryo; ; embryo; ; interventricular septum; ; ventricular zone; ; blastocyst; ; yolk sac; ; morula; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; epiblast; ; neural layer of retina;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding; nucleic acid binding; RNA binding; mRNA binding;
Cellular component	cytosol; catalytic step 2 spliceosome; exon-exon junction complex; neuronal cell body; dendrite; spliceosomal complex; nucleus; cytoplasm; nucleoplasm; nuclear speck; U2-type catalytic step 1 spliceosome;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; termination of RNA polymerase II transcription; mRNA transport; RNA processing; mRNA processing; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; mRNA export from nucleus; mRNA 3'-end processing; regulation of translation; RNA export from nucleus; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; RNA splicing; transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	9939
	60365
	ENSG00000265241
	ENSMUSG00000038374
	Q9Y5S9
	Q9CWZ3
	НМ_005105
	НМ_001102407 ; НМ_025875
	НП_005096
	НП_001095877 ; НП_080151
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

РНК-связывающий белок 8А — это белок , который у человека кодируется RBM8A геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген кодирует белок с консервативным РНК-связывающим мотивом. Белок обнаруживается преимущественно в ядре, хотя он присутствует и в цитоплазме. Он преимущественно связан с мРНК, полученными путем сплайсинга, включая как ядерные мРНК, так и вновь экспортированные цитоплазматические мРНК. Считается, что белок остается связанным со сплайсированными мРНК в качестве метки, указывающей, где присутствовали интроны, таким образом связывая события до и после сплайсинга мРНК. Ранее считалось, что этот белок кодируют два гена: RBM8A и RBM8B; сейчас считается, что локус RBM8B является псевдогеном. Два альтернативных стартовых кодона приводят к образованию двух форм белка, и этот ген также использует несколько сайтов полиаденилирования. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RBM8A взаимодействует с IPO13 . ^{[ 8 ]} МАГОХ ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} и УПФ3А . ^{[ 11 ]}

Связанные генные проблемы

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000265241 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000038374 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Конклин, округ Колумбия, Риксон М.В., Кюстнер Р.Э., Маурер М.Ф., Уитмор Т.Е., Миллар Р.П. (октябрь 2000 г.). «Клонирование и экспрессия генов нового человеческого рибонуклеопротеина». Биохим Биофиз Акта . 1492 (2–3): 465–9. дои : 10.1016/s0167-4781(00)00090-7 . ПМИД 11004516 .
^ Салисиони А.М., Си М., Вандервир Л.А., Балсара Б., Теста-младший, Данбрэк Р.Л.-младший, Годвин А.К. (октябрь 2000 г.). «Идентификация и структурный анализ человеческих RBM8A и RBM8B: два высококонсервативных белка РНК-связывающего мотива, которые взаимодействуют с OVCA1, кандидатом в супрессоры опухолей». Геномика . 69 (1): 54–62. дои : 10.1006/geno.2000.6315 . ПМИД 11013075 .
^ «Ген Энтрез: белок 8А РНК-связывающего мотива RBM8A» .
^ Мингот, Дж. М.; Костка С; Крафт Р; Хартманн Э; Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . ЭМБО Дж . 20 (14). Англия: 3685–94. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ISSN 0261-4189 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .
^ Чжао, XF; Новак, штат Нью-Джерси; Показывает туберкулез; Аплан П.Д. (январь 2000 г.). «MAGOH взаимодействует с новым РНК-связывающим белком». Геномика . 63 (1). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 145–8. дои : 10.1006/geno.1999.6064 . ISSN 0888-7543 . ПМИД 10662555 .
^ Катаока, Н.; Дьем, доктор медицинских наук; Ким В.Н.; Ён Дж; Дрейфус Г. (ноябрь 2001 г.). «Magoh, человеческий гомолог белка mago nashi Drosophila, является компонентом зависимого от сплайсинга комплекса экзон-экзонного соединения» . ЭМБО Дж . 20 (22). Англия: 6424–33. дои : 10.1093/emboj/20.22.6424 . ISSN 0261-4189 . ПМЦ 125744 . ПМИД 11707413 .
^ Ким, В.Н.; Катаока Н; Дрейфус Г. (сентябрь 2001 г.). «Роль нонсенс-опосредованного фактора распада hUpf3 в зависимом от сплайсинга комплексе экзон-экзон». Наука . 293 (5536). США: 1832–1836 гг. Бибкод : 2001Sci...293.1832K . дои : 10.1126/science.1062829 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 11546873 . S2CID 12018200 .
^ Клопоцки Э., Шульце Х., Штраус Г. и др. (февраль 2007 г.). «Сложный образец наследования, напоминающий аутосомно-рецессивное наследование с микроделецией при синдроме тромбоцитопении и отсутствия лучевой кости» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 80 (2): 232–40. дои : 10.1086/510919 . ПМК 1785342 . ПМИД 17236129 .

Дальнейшее чтение

Уилсон К.Ф., Фортес П., Сингх США и др. (1999). «Комплекс, связывающий ядерный кэп, является новой мишенью передачи сигнала, связанной с рецептором фактора роста» . Ж. Биол. Хим . 274 (7): 4166–73. дои : 10.1074/jbc.274.7.4166 . ПМИД 9933612 .
Чжао XF, Новак, Нью-Джерси, Показывает туберкулез, Aplan PD (2000). «MAGOH взаимодействует с новым РНК-связывающим белком». Геномика . 63 (1): 145–8. дои : 10.1006/geno.1999.6064 . ПМИД 10662555 .
Катаока Н., Йонг Дж., Ким В.Н. и др. (2000). «Сплайсинг пре-мРНК отпечатывает мРНК в ядре с новым РНК-связывающим белком, который сохраняется в цитоплазме» . Мол. Клетка . 6 (3): 673–82. дои : 10.1016/S1097-2765(00)00065-4 . ПМИД 11030346 .
Чжан QH, Е М, Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геном Рез . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .
Ле Хир Х., Изаурральде Э., Макват Л.Е., Мур М.Дж. (2001). «Сплайсосома откладывает несколько белков на 20–24 нуклеотида выше экзон-экзонных соединений мРНК» . ЭМБО Дж . 19 (24): 6860–9. дои : 10.1093/emboj/19.24.6860 . ПМК 305905 . ПМИД 11118221 .
Мингот Дж.М., Костка С., Крафт Р. и др. (2001). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . ЭМБО Дж . 20 (14): 3685–94. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .
Ким В.Н., Катаока Н., Дрейфус Г. (2001). «Роль нонсенс-опосредованного фактора распада hUpf3 в зависимом от сплайсинга комплексе экзон-экзон». Наука . 293 (5536): 1832–6. Бибкод : 2001Sci...293.1832K . дои : 10.1126/science.1062829 . ПМИД 11546873 . S2CID 12018200 .
Ликке-Андерсен Дж., Шу, доктор медицинских наук, Стейц Дж. А. (2001). «Передача положения экзон-экзонных соединений с механизмом наблюдения за мРНК с помощью белка RNPS1». Наука . 293 (5536): 1836–9. Бибкод : 2001Sci...293.1836L . дои : 10.1126/science.1062786 . ПМИД 11546874 . S2CID 389385 .
Хачет О, Эфрусси А (2002). «Дрозофила Y14 перемещается к задней части ооцита и необходима для транспорта мРНК Оскара» . Курс. Биол . 11 (21): 1666–74. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00508-5 . ПМИД 11696323 . S2CID 2373806 .
Фаурхольм Б., Миллар Р.П., Кац А.А. (2002). «Гены, кодирующие рецептор гонадотропин-рилизинг-гормона II типа и рибонуклеопротеин RBM8A у человека, перекрываются в двух геномных локусах». Геномика . 78 (1–2): 15–8. дои : 10.1006/geno.2001.6650 . ПМИД 11707068 .
Катаока Н., Дием М.Д., Ким В.Н. и др. (2002). «Magoh, человеческий гомолог белка mago nashi Drosophila, является компонентом зависимого от сплайсинга комплекса экзон-экзонного соединения» . ЭМБО Дж . 20 (22): 6424–33. дои : 10.1093/emboj/20.22.6424 . ПМЦ 125744 . ПМИД 11707413 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Окубо К., Митани Х., Нарусэ К. и др. (2002). «Консервативная физическая связь GnRH-R и RBM8 в геномах медаки и человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 327–31. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00161-4 . ПМИД 12054603 .
Лежен Ф., Исигаки Ю., Ли Х., Макват Л.Е. (2002). «Комплекс соединения экзонов обнаруживается на мРНК, связанной с CBP80, но не связанной с eIF4E, в клетках млекопитающих: динамика ремоделирования мРНП» . ЭМБО Дж . 21 (13): 3536–45. дои : 10.1093/emboj/cdf345 . ПМК 126094 . ПМИД 12093754 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Геринг Н.Х., Ной-Йилик Г., Шелл Т. и др. (2003). «Y14 и hUpf3b образуют комплекс, активирующий NMD» . Мол. Клетка . 11 (4): 939–49. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00142-4 . ПМИД 12718880 .
Фрибур С., Гатфилд Д., Изаурральде Э., Конти Э. (2003). «Новый способ распознавания RBD-белка в комплексе Y14-Mago». Нат. Структура. Биол . 10 (6): 433–9. дои : 10.1038/nsb926 . ПМИД 12730685 . S2CID 40116577 .
Лау К.К., Дьем, М.Д., Дрейфус Г., Ван Дуйн Г.Д. (2004). «Структура ядра Y14-Маго экзонного комплекса соединения» . Курс. Биол . 13 (11): 933–41. дои : 10.1016/S0960-9822(03)00328-2 . ПМИД 12781131 . S2CID 14752714 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000265241 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000038374 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11004516-5] Конклин, округ Колумбия, Риксон М.В., Кюстнер Р.Э., Маурер М.Ф., Уитмор Т.Е., Миллар Р.П. (октябрь 2000 г.). «Клонирование и экспрессия генов нового человеческого рибонуклеопротеина». Биохим Биофиз Акта . 1492 (2–3): 465–9. дои : 10.1016/s0167-4781(00)00090-7 . ПМИД 11004516 .

[pmid11013075-6] Салисиони А.М., Си М., Вандервир Л.А., Балсара Б., Теста-младший, Данбрэк Р.Л.-младший, Годвин А.К. (октябрь 2000 г.). «Идентификация и структурный анализ человеческих RBM8A и RBM8B: два высококонсервативных белка РНК-связывающего мотива, которые взаимодействуют с OVCA1, кандидатом в супрессоры опухолей». Геномика . 69 (1): 54–62. дои : 10.1006/geno.2000.6315 . ПМИД 11013075 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: белок 8А РНК-связывающего мотива RBM8A» .

[pmid11447110-8] Мингот, Дж. М.; Костка С; Крафт Р; Хартманн Э; Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . ЭМБО Дж . 20 (14). Англия: 3685–94. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ISSN 0261-4189 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .

[pmid10662555-9] Чжао, XF; Новак, штат Нью-Джерси; Показывает туберкулез; Аплан П.Д. (январь 2000 г.). «MAGOH взаимодействует с новым РНК-связывающим белком». Геномика . 63 (1). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 145–8. дои : 10.1006/geno.1999.6064 . ISSN 0888-7543 . ПМИД 10662555 .

[pmid11707413-10] Катаока, Н.; Дьем, доктор медицинских наук; Ким В.Н.; Ён Дж; Дрейфус Г. (ноябрь 2001 г.). «Magoh, человеческий гомолог белка mago nashi Drosophila, является компонентом зависимого от сплайсинга комплекса экзон-экзонного соединения» . ЭМБО Дж . 20 (22). Англия: 6424–33. дои : 10.1093/emboj/20.22.6424 . ISSN 0261-4189 . ПМЦ 125744 . ПМИД 11707413 .

[pmid11546873-11] Ким, В.Н.; Катаока Н; Дрейфус Г. (сентябрь 2001 г.). «Роль нонсенс-опосредованного фактора распада hUpf3 в зависимом от сплайсинга комплексе экзон-экзон». Наука . 293 (5536). США: 1832–1836 гг. Бибкод : 2001Sci...293.1832K . дои : 10.1126/science.1062829 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 11546873 . S2CID 12018200 .

[pmid17236129-12] Клопоцки Э., Шульце Х., Штраус Г. и др. (февраль 2007 г.). «Сложный образец наследования, напоминающий аутосомно-рецессивное наследование с микроделецией при синдроме тромбоцитопении и отсутствия лучевой кости» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 80 (2): 232–40. дои : 10.1086/510919 . ПМК 1785342 . ПМИД 17236129 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]