ТРИЛ (ген)

ТРЕЛЬ
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIL , KIAA0644, интерактор TLR4 с повторами, богатыми лейцином
Внешние идентификаторы	Опустить : 613356 ; МГИ : 1914123 ; Гомологен : 69404 ; GeneCards : TRIL ; ОМА : ТРИЛ — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	28,958,330 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	53,797,815 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	internal globus pallidus; ; external globus pallidus; ; dorsal motor nucleus of vagus nerve; ; Pars compacta; ; pars reticulata; ; caudate nucleus; ; putamen; ; Region I of hippocampus proper; ; amygdala; ; nucleus accumbens;
	Top expressed in
	Gonadal ridge; ; vestibular sensory epithelium; ; utricle; ; vas deferens; ; renal corpuscle; ; medullary collecting duct; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; maxillary prominence; ; limb bud; ; mandibular prominence;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	lipopolysaccharide binding;
Cellular component	integral component of membrane; lipopolysaccharide receptor complex; membrane; extracellular space; extracellular matrix;
Biological process	regulation of cytokine production involved in immune response; innate immune response; inflammatory response; toll-like receptor 4 signaling pathway; immune system process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9865
	66873
	ENSG00000255690
	ENSMUSG00000043496
	Q7L0X0
	Q9DBY4
	НМ_014817
	НМ_025817
	НП_055632
	НП_080093
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

KIAA0644 , также известный как TRIL или TLR4-интерактор с богатыми лейцином повторами , представляет собой белок , который у человека кодируется KIAA0644 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Точная функция KIAA0644 неизвестна. Однако он является членом семейства белков , богатых лейцином , которые, как известно, участвуют в белок-белковых взаимодействиях. Известно, что этот белок взаимодействует с белком TLR4 .

TRIL является компонентом комплекса TLR4 и индуцируется в ряде типов клеток липополисахаридом ( ЛПС). ^{[ 6 ]}

Белковая последовательность

Основная изоформа человеческого белка имеет длину 811 аминокислот и состоит в основном из остатков лейцина (17%), аланина и аргинина (~10%) и глицина (~8,5%). Предполагается, что последовательность белка состоит в основном из α-спиралей и нескольких β-листов.

Гомология

KIAA0644 хорошо консервативен среди млекопитающих, но может быть обнаружен у всех хордовых с более низкой идентичностью последовательностей.

Джин район

Ген KIAA0644 является соседом нижележащего гена, связывающего элемент мРНК-цАМФ, и вышестоящего гена мРНК-карбоксипептидазы и серинкарбоксипептидазы. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000255690 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043496 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: интерактор TRIL TLR4 с повторами, богатыми лейцином» . Проверено 13 мая 2010 г.
^ Карпентер С., Карлсон Т., Деллакасагранде Дж., Гарсия А., Гиббонс С., Герцог П., Лайонс А., Лин Л.Л., Линч М., Мони Т., Мерфи С., Зайдл К.Дж., Уэллс С., Данн А., О'Нил Л.А. (сентябрь 2009 г.) . «TRIL, функциональный компонент сигнального комплекса TLR4, высоко экспрессируемый в мозге» . Дж. Иммунол . 183 (6): 3989–3995. doi : 10.4049/jimmunol.0901518 . ПМИД 19710467 .
^ «НЦБИ Энтрез» . Проверено 13 мая 2010 г.
^ Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» (PDF) . ДНК Рез . 5 (3): 169–176. дои : 10.1093/dnares/5.3.169 . ПМИД 9734811 .

Дальнейшее чтение

Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Шерер С.В., Чунг Дж., Макдональд Дж.Р. и др. (2003). «Человеческая хромосома 7: последовательность ДНК и биология» . Наука . 300 (5620): 767–772. Бибкод : 2003Sci...300..767S . дои : 10.1126/science.1083423 . ПМК 2882961 . ПМИД 12690205 .
Бюссов К., Кэхилл Д., Нитфельд В. и др. (1998). «Метод глобальной экспрессии белков и скрининга антител на фильтрах высокой плотности массивной библиотеки кДНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 26 (21): 5007–5008. дои : 10.1093/нар/26.21.5007 . ПМЦ 147919 . ПМИД 9776767 .
Уилер Х.Э., Меттер Э.Дж., Танака Т. и др. (2009). Гибсон Дж. (ред.). «Последовательное использование транскрипционного профилирования, количественного картирования признаков экспрессии и ассоциации генов влияет на MMP20 в старении почек человека» . ПЛОС Генет . 5 (10): e1000685. дои : 10.1371/journal.pgen.1000685 . ПМК 2752811 . ПМИД 19834535 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000255690 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043496 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: интерактор TRIL TLR4 с повторами, богатыми лейцином» . Проверено 13 мая 2010 г.

[pmid19710467-6] Карпентер С., Карлсон Т., Деллакасагранде Дж., Гарсия А., Гиббонс С., Герцог П., Лайонс А., Лин Л.Л., Линч М., Мони Т., Мерфи С., Зайдл К.Дж., Уэллс С., Данн А., О'Нил Л.А. (сентябрь 2009 г.) . «TRIL, функциональный компонент сигнального комплекса TLR4, высоко экспрессируемый в мозге» . Дж. Иммунол . 183 (6): 3989–3995. doi : 10.4049/jimmunol.0901518 . ПМИД 19710467 .

[Gene_Neighborhood-7] «НЦБИ Энтрез» . Проверено 13 мая 2010 г.

[pmid9734811-8] Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» (PDF) . ДНК Рез . 5 (3): 169–176. дои : 10.1093/dnares/5.3.169 . ПМИД 9734811 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]