Полюс
Полюс | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | VAPA , VAP-33, VAP-A, VAP33, HVAP-33, AMP-Associated Protein A, VAMP-A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Омим : 605703 ; MGI : 1353561 ; Гомологен : 37824 ; Genecards : vapa ; OMA : vasa - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Ассоциированный VAMP белок А (или ассоциированный с везикулом мембранного белка, ассоциированный белок А), представляет собой белок , который у людей кодируется VAPA геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Вместе с VAPB и VAPC он образует семейство белков VAP . Они являются неотъемлемыми мембранными белками эндоплазматической ретикулума типа II и вездесущими среди эукариот. [ 8 ]
VAPA повсеместно экспрессируется в тканях человека [ 5 ] и считается, что он участвует в обороте мембран путем взаимодействия с ловушками , [ 9 ] в регуляции липидного транспорта и метаболизма, [ 8 ] и в разворачиваемом белковом ответе ( UPR ). [ 8 ]
Белковая структура
[ редактировать ]Белок разделен на три разных домена. [ 5 ] Во-первых, N-концевой бета-лист с иммуноглобулиноподобным складом, который разделяет гомологию с помощью мажорного сперматозоида с нематодом ( MSP ). Во-вторых, центральная домен с катушкой . Затем, наконец, С-концевой трансмембранный домен (TMD), который обычно присутствует в белках суперсемейства T-SNARE и был обнаружен в других белках, связанных с везикулярным транспортом. [ 10 ] VAPA может образовывать гомодимерные, а также гетеропомерные димеры с VAPB по взаимодействию через их (TMD). [ 5 ]
Внутриклеточная локализация
[ редактировать ]Из -за его повсеместного выражения, [ 5 ] Внутриклеточная локализация и функция VAPA могут варьироваться между типами клеток. Однако в основном расположен в ER, [ 11 ] Аппарат Гольджи и везикулярное трубчатое компартмент или промежуточный компартмент Er-Golgi , [ 9 ] Органелла эукариотических клеток, состоящих в слитых везикулах, полученных из ER, которые переносят белки из ER в аппарат Гольджи. [ 12 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]VAPA было задокументировано для взаимодействия с тремя различными группами белков: белков, связанных с трафиком и слиянием пузырьков, белками, содержащими мотив FFAT и вирусные белки. [ 8 ]
Везикул трафик и слияние
[ редактировать ]VAPA способен связывать ряд белков SNARE, включая синтаксин1A , RBET1 и RSEC22. связанными с мембранным механизмом Он также связывается с белками , слияния [ 9 ]
Вирусные белки
[ редактировать ]Было обнаружено, что VAP -белки являются важными факторами хозяина для нескольких вирусов. [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]
Белки VAP связываются с неструктурными белками вируса гепатита С NS5A и NS5B, позволяя механическому обращению РНК репликации вируса устанавливать на липидном плот -мембране клетки-хозяина. [ 16 ]
VAPA также связывается с несколькими вирусными белками из семейства норовирусов и важна для эффективности репликации вируса. [ 13 ] [ 14 ] Неструктурные белки NS1 и NS2 способны связывать VAPA благодаря мимике последовательности мотива FFAT, вероятно, дают такое же преимущество репликации вируса, что и для вируса гепатита С. [ 14 ]
FFAT MOTIF
[ редактировать ]N-концевая MSP-гомологичная часть VAPA способна связываться с мотивом FFAT , конкретным мотивам последовательности, разделяющим несколько липидных связывающих белков, включая оксистерол-связывающий белок ( OSBP ). [ 17 ] [ 18 ]
Функция
[ редактировать ]Одна из предложенных его функций заключается в замедлении потока липидов обратно к ER, когда происходит неправильное сворачивание белка, чтобы уменьшить количество напряжения, вызванного UPR. VAP будет регулировать этот процесс, ингибируя мембранные контакты. [ 19 ]
Связанные заболевания
[ редактировать ]SNP P56S в домене MSP VAPB участвует в начале болезни Лу Герига, также называемой амиотрофическим боковым склерозом ( ALS ), где пациент теряет контроль и функцию мышц. Дегенеценция моторных нейронов, наблюдаемых в таких условиях, может быть связано с неспособностью VAPB регулировать липидную функцию вокруг ER и последующие последствия для функции клеток. [ 19 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000101558 - ENSEMBL , май 2017 г.
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024091 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый и Nishimura Y, Hayashi M, Inada H, Tanaka T (январь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика гомологов млекопитающих мембранных белков, ассоциированных с везикулами, белков, ассоциированных с мембранным белком». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 254 (1): 21–6. doi : 10.1006/bbrc.1998.9876 . PMID 9920726 .
- ^ Weir ML, Klip A, Trimble WS (июль 1998 г.). «Идентификация человеческого гомолога мембранного белка, ассоциированного с пузырьком (VAMP) белка 33 кДа (VAP-33): широко экспрессированный белок, который связывается с вампиром» . Биохимический журнал . 333 (Pt 2) (2): 247–51. doi : 10.1042/bj3330247 . PMC 1219579 . PMID 9657962 .
- ^ «Ген Entrez: Vapa Vamp (ассоциированный с пузырьком мембранного белка), ассоциированный белок A, 33 кДа» .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый Lev S, Ben Halevy D, Peretti D, Dahan N (июнь 2008 г.). «Семейство белков VAP: от клеточных функций до заболевания двигательных нейронов». Тенденции в клеточной биологии . 18 (6): 282–90. doi : 10.1016/j.tcb.2008.03.006 . PMID 18468439 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в Weir ML, Xie H, Klip A, Trimble WS (август 2001 г.). «VAP-A не беспорядочно связывается как с V-, так и с TSNares». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 286 (3): 616–21. doi : 10.1006/bbrc.2001.5437 . PMID 11511104 .
- ^ Weimbs T, Low SH, Chapin SJ, Mostov Ke, Bucher P, Hofmann K (апрель 1997 г.). «Консервативный домен присутствует в разных семействах везикулярных слитых белков: новая суперсемейство» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (7): 3046–51. Bibcode : 1997pnas ... 94.3046W . doi : 10.1073/pnas.94.7.3046 . PMC 20319 . PMID 9096343 .
- ^ SkeHel PA, Fabian-Fine R, Kandel ER (февраль 2000 г.). «Мышиный VAP33 связан с эндоплазматической ретикулумом и микротрубочками» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (3): 1101–6. Bibcode : 2000pnas ... 97.1101S . doi : 10.1073/pnas.97.3.1101 . PMC 15535 . PMID 10655491 .
- ^ Appenzeller-Herzog C, Hauri HP (июнь 2006 г.). «Промежуточное отделение ER-Golgi (ERGIC): в поисках его идентичности и функции» . Журнал сотовой науки . 119 (Pt 11): 2173–83. doi : 10.1242/jcs.03019 . PMID 16723730 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Ettayebi K, Hardy Me (ноябрь 2003 г.). «Норвонный вирус Неструктурный белок P48 образует комплекс с регулятором SNARE VAP-A и предотвращает экспрессию клеточной поверхности вируса везикулярного вируса стоматита» . Журнал вирусологии . 77 (21): 11790–7. doi : 10.1128/jvi.77.21.11790-11797.2003 . PMC 229264 . PMID 14557663 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в McCune BT, Tang W, Lu J, Eaglesham JB, Thorne L, Mayer AE, Condiff E, NICE TJ, Goodfellow I, Krezel AM, Virgin HW (июль 2017 г.). «Норовирусы кооптируют функцию белков-хозяев VAPA и VAPB для репликации с помощью фенилаланино-фенилаланино-ацидического мотифа-мотифа в НС1/2 вирусного белка . Мбио . 8 (4): E00668–17. doi : 10.1128/mbio.00668-17 . PMC 5513711 . PMID 28698274 .
- ^ Ишикава-Сасаки К., Нагасима С., Танигучи К., Сасаки Дж (апрель 2018 г.). «Модель OSBP-опосредованного поставок холестерина к сайтам репликации РНК вируса AICHI с участием белковых взаимодействий между вирусными белками, ACBD3, OSBP, VAP-A/B и SAC1» . Журнал вирусологии . 92 (8): E01952–17. doi : 10.1128/JVI.01952-17 . PMC 5874406 . PMID 29367253 .
- ^ Gao L, Aizaki H, He JW, Lai MM (апрель 2004 г.). «Взаимодействие между вирусными неинтруктурными белками и белком-хозяином HVAP-33 опосредуют образование комплекса репликации РНК вируса гепатита С на липидном плоту» . Журнал вирусологии . 78 (7): 3480–8. doi : 10.1128/JVI.78.7.3480-3488.2004 . PMC 371042 . PMID 15016871 .
- ^ Wyles JP, McMaster CR, Ridgway ND (август 2002 г.). «Связанный с пузырьком мембранного белка белка-A (VAP-A) взаимодействует с оксистерол-связывающим белком для модификации экспорта из эндоплазматической ретикулумы» . Журнал биологической химии . 277 (33): 29908–18. doi : 10.1074/jbc.m201191200 . PMID 12023275 .
- ^ Wyles JP, Ridgway ND (июль 2004 г.). «Вамп-ассоциированный белок-А регулирует разделение оксистерол-связывающего белка белка-9 между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи». Экспериментальные исследования клеток . 297 (2): 533–47. doi : 10.1016/j.yexcr.2004.03.052 . PMID 15212954 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Ernst WL, Shome K, Wu CC, Gong X, Frizzell RA, Aridor M (март 2016 г.). «Вамп-ассоциированные белки (VAP) в качестве рецепторов, которые пара муковисцидозого трансмембранного регулятора проводимости (CFTR) с гомеостазом липидов» . Журнал биологической химии . 291 (10): 5206–20. doi : 10.1074/jbc.m115.692749 . PMC 4777854 . PMID 26740627 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Lapierre LA, Tuma PL, Navarre J, Goldenring JR, Anderson JM (ноябрь 1999). «VAP-33 локализуется как в популяции внутриклеточной пузырьки, так и с окклюдином в плотном соединении». Журнал сотовой науки . 112 (Pt 21) (21): 3723–32. doi : 10.1242/jcs.112.21.3723 . PMID 10523508 .
- Tu H, Shi St, Taylor DR, Yang T, My Yrcheff, Yes Y, Gorbalenya AE, Hwang SB, Lai MM (октябрь 1999). «РНК-полимераза вируса гепатита С и комплекс NS5A с манечным белком » Вирусология 263 (1): 30–4 Doi : 10.1006/ viro.1999.9 PMID 105444080
- Weir ML, Xie H, Klip A, Trimble WS (август 2001 г.). «VAP-A не беспорядочно связывается как с V-, так и с TSNares». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 286 (3): 616–21. doi : 10.1006/bbrc.2001.5437 . PMID 11511104 .
- Wyles JP, McMaster CR, Ridgway ND (август 2002 г.). «Связанный с пузырьком мембранного белка белка-A (VAP-A) взаимодействует с оксистерол-связывающим белком для модификации экспорта из эндоплазматической ретикулумы» . Журнал биологической химии . 277 (33): 29908–18. doi : 10.1074/jbc.m201191200 . PMID 12023275 .
- Matsuda A, Suzuki Y, Honda G, Muramatsu S, Matsuzaki O, Nagano Y, Doi T, Shimotohno K, Harada T, Nishida E, Hayashi H, Sugano S (май 2003 г.). «Крупномасштабная идентификация и характеристика генов человека, которые активируют сигнальные пути NF-Kappab и MAPK» . Онкоген . 22 (21): 3307–18. doi : 10.1038/sj.onc.1206406 . PMID 12761501 .
- Gao L, Aizaki H, He JW, Lai MM (апрель 2004 г.). «Взаимодействие между вирусными неинтруктурными белками и белком-хозяином HVAP-33 опосредуют образование комплекса репликации РНК вируса гепатита С на липидном плоту» . Журнал вирусологии . 78 (7): 3480–8. doi : 10.1128/JVI.78.7.3480-3488.2004 . PMC 371042 . PMID 15016871 .
- Эванс М.Дж., Райс С.М., Гофф С.П. (август 2004 г.). «Фосфорилирование неинтруктурного белка вируса гепатита С 5а модулирует его белковые взаимодействия и репликацию вирусной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (35): 13038–43. Bibcode : 2004pnas..10113038E . doi : 10.1073/pnas.0405152101 . PMC 516513 . PMID 15326295 .
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях» . Исследование генома . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101/gr.2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
- Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж.С., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смолььяр А., Босак С., Проявление Р, Растяжение примеси L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (Octoo 2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
- Hamamoto I, Nishimura Y, Okamoto T, Aizaki H, Liu M, Mori Y, Abe T, Suzuki T, Lai MM, Miyamura T, Moriishi K, Matsuura Y (ноябрь 2005 г.). «Человеческий VAP-B участвует в репликации вируса гепатита С посредством взаимодействия с NS5A и NS5B» . Журнал вирусологии . 79 (21): 13473–82. doi : 10.1128/JVI.79.21.13473-13482.2005 . PMC 1262604 . PMID 16227268 .
- Kawano M, Kumagai K, Nishijima M, Hanada K (октябрь 2006 г.). «Эффективное перенос церамида от эндоплазматической ретикулумы до аппарата Гольджи требует, связанного с VAMP-интернет-мотивом FFAT CERT» . Журнал биологической химии . 281 (40): 30279–88. doi : 10.1074/jbc.m605032200 . PMID 16895911 .