Jump to content

Полюс

Полюс
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы VAPA , VAP-33, VAP-A, VAP33, HVAP-33, AMP-Associated Protein A, VAMP-A
Внешние идентификаторы Омим : 605703 ; MGI : 1353561 ; Гомологен : 37824 ; Genecards : vapa ; OMA : vasa - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_003574
NM_194434

NM_013933
NM_001355402

Refseq (белок)

NP_003565
NP_919415

NP_038961
NP_001342331

Расположение (UCSC) CHR 18: 9,91 - 9,96 МБ Chr 17: 65,89 - 65,92 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Ассоциированный VAMP белок А (или ассоциированный с везикулом мембранного белка, ассоциированный белок А), представляет собой белок , который у людей кодируется VAPA геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Вместе с VAPB и VAPC он образует семейство белков VAP . Они являются неотъемлемыми мембранными белками эндоплазматической ретикулума типа II и вездесущими среди эукариот. [ 8 ]

VAPA повсеместно экспрессируется в тканях человека [ 5 ] и считается, что он участвует в обороте мембран путем взаимодействия с ловушками , [ 9 ] в регуляции липидного транспорта и метаболизма, [ 8 ] и в разворачиваемом белковом ответе ( UPR ). [ 8 ]

Белковая структура

[ редактировать ]

Белок разделен на три разных домена. [ 5 ] Во-первых, N-концевой бета-лист с иммуноглобулиноподобным складом, который разделяет гомологию с помощью мажорного сперматозоида с нематодом ( MSP ). Во-вторых, центральная домен с катушкой . Затем, наконец, С-концевой трансмембранный домен (TMD), который обычно присутствует в белках суперсемейства T-SNARE и был обнаружен в других белках, связанных с везикулярным транспортом. [ 10 ] VAPA может образовывать гомодимерные, а также гетеропомерные димеры с VAPB по взаимодействию через их (TMD). [ 5 ]

Внутриклеточная локализация

[ редактировать ]

Из -за его повсеместного выражения, [ 5 ] Внутриклеточная локализация и функция VAPA могут варьироваться между типами клеток. Однако в основном расположен в ER, [ 11 ] Аппарат Гольджи и везикулярное трубчатое компартмент или промежуточный компартмент Er-Golgi , [ 9 ] Органелла эукариотических клеток, состоящих в слитых везикулах, полученных из ER, которые переносят белки из ER в аппарат Гольджи. [ 12 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

VAPA было задокументировано для взаимодействия с тремя различными группами белков: белков, связанных с трафиком и слиянием пузырьков, белками, содержащими мотив FFAT и вирусные белки. [ 8 ]

Везикул трафик и слияние

[ редактировать ]

VAPA способен связывать ряд белков SNARE, включая синтаксин1A , RBET1 и RSEC22. связанными с мембранным механизмом Он также связывается с белками , слияния [ 9 ]

Вирусные белки

[ редактировать ]

Было обнаружено, что VAP -белки являются важными факторами хозяина для нескольких вирусов. [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]

Белки VAP связываются с неструктурными белками вируса гепатита С NS5A и NS5B, позволяя механическому обращению РНК репликации вируса устанавливать на липидном плот -мембране клетки-хозяина. [ 16 ]

VAPA также связывается с несколькими вирусными белками из семейства норовирусов и важна для эффективности репликации вируса. [ 13 ] [ 14 ] Неструктурные белки NS1 и NS2 способны связывать VAPA благодаря мимике последовательности мотива FFAT, вероятно, дают такое же преимущество репликации вируса, что и для вируса гепатита С. [ 14 ]

N-концевая MSP-гомологичная часть VAPA способна связываться с мотивом FFAT , конкретным мотивам последовательности, разделяющим несколько липидных связывающих белков, включая оксистерол-связывающий белок ( OSBP ). [ 17 ] [ 18 ]

Одна из предложенных его функций заключается в замедлении потока липидов обратно к ER, когда происходит неправильное сворачивание белка, чтобы уменьшить количество напряжения, вызванного UPR. VAP будет регулировать этот процесс, ингибируя мембранные контакты. [ 19 ]

Связанные заболевания

[ редактировать ]

SNP P56S в домене MSP VAPB участвует в начале болезни Лу Герига, также называемой амиотрофическим боковым склерозом ( ALS ), где пациент теряет контроль и функцию мышц. Дегенеценция моторных нейронов, наблюдаемых в таких условиях, может быть связано с неспособностью VAPB регулировать липидную функцию вокруг ER и последующие последствия для функции клеток. [ 19 ]

  1. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000101558 - ENSEMBL , май 2017 г.
  2. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024091 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый и Nishimura Y, Hayashi M, Inada H, Tanaka T (январь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика гомологов млекопитающих мембранных белков, ассоциированных с везикулами, белков, ассоциированных с мембранным белком». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 254 (1): 21–6. doi : 10.1006/bbrc.1998.9876 . PMID   9920726 .
  6. ^ Weir ML, Klip A, Trimble WS (июль 1998 г.). «Идентификация человеческого гомолога мембранного белка, ассоциированного с пузырьком (VAMP) белка 33 кДа (VAP-33): широко экспрессированный белок, который связывается с вампиром» . Биохимический журнал . 333 (Pt 2) (2): 247–51. doi : 10.1042/bj3330247 . PMC   1219579 . PMID   9657962 .
  7. ^ «Ген Entrez: Vapa Vamp (ассоциированный с пузырьком мембранного белка), ассоциированный белок A, 33 кДа» .
  8. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый Lev S, Ben Halevy D, Peretti D, Dahan N (июнь 2008 г.). «Семейство белков VAP: от клеточных функций до заболевания двигательных нейронов». Тенденции в клеточной биологии . 18 (6): 282–90. doi : 10.1016/j.tcb.2008.03.006 . PMID   18468439 .
  9. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в Weir ML, Xie H, Klip A, Trimble WS (август 2001 г.). «VAP-A не беспорядочно связывается как с V-, так и с TSNares». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 286 (3): 616–21. doi : 10.1006/bbrc.2001.5437 . PMID   11511104 .
  10. ^ Weimbs T, Low SH, Chapin SJ, Mostov Ke, Bucher P, Hofmann K (апрель 1997 г.). «Консервативный домен присутствует в разных семействах везикулярных слитых белков: новая суперсемейство» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (7): 3046–51. Bibcode : 1997pnas ... 94.3046W . doi : 10.1073/pnas.94.7.3046 . PMC   20319 . PMID   9096343 .
  11. ^ SkeHel PA, Fabian-Fine R, Kandel ER (февраль 2000 г.). «Мышиный VAP33 связан с эндоплазматической ретикулумом и микротрубочками» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (3): 1101–6. Bibcode : 2000pnas ... 97.1101S . doi : 10.1073/pnas.97.3.1101 . PMC   15535 . PMID   10655491 .
  12. ^ Appenzeller-Herzog C, Hauri HP (июнь 2006 г.). «Промежуточное отделение ER-Golgi (ERGIC): в поисках его идентичности и функции» . Журнал сотовой науки . 119 (Pt 11): 2173–83. doi : 10.1242/jcs.03019 . PMID   16723730 .
  13. ^ Подпрыгнуть до: а беременный Ettayebi K, Hardy Me (ноябрь 2003 г.). «Норвонный вирус Неструктурный белок P48 образует комплекс с регулятором SNARE VAP-A и предотвращает экспрессию клеточной поверхности вируса везикулярного вируса стоматита» . Журнал вирусологии . 77 (21): 11790–7. doi : 10.1128/jvi.77.21.11790-11797.2003 . PMC   229264 . PMID   14557663 .
  14. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в McCune BT, Tang W, Lu J, Eaglesham JB, Thorne L, Mayer AE, Condiff E, NICE TJ, Goodfellow I, Krezel AM, Virgin HW (июль 2017 г.). «Норовирусы кооптируют функцию белков-хозяев VAPA и VAPB для репликации с помощью фенилаланино-фенилаланино-ацидического мотифа-мотифа в НС1/2 вирусного белка . Мбио . 8 (4): E00668–17. doi : 10.1128/mbio.00668-17 . PMC   5513711 . PMID   28698274 .
  15. ^ Ишикава-Сасаки К., Нагасима С., Танигучи К., Сасаки Дж (апрель 2018 г.). «Модель OSBP-опосредованного поставок холестерина к сайтам репликации РНК вируса AICHI с участием белковых взаимодействий между вирусными белками, ACBD3, OSBP, VAP-A/B и SAC1» . Журнал вирусологии . 92 (8): E01952–17. doi : 10.1128/JVI.01952-17 . PMC   5874406 . PMID   29367253 .
  16. ^ Gao L, Aizaki H, He JW, Lai MM (апрель 2004 г.). «Взаимодействие между вирусными неинтруктурными белками и белком-хозяином HVAP-33 опосредуют образование комплекса репликации РНК вируса гепатита С на липидном плоту» . Журнал вирусологии . 78 (7): 3480–8. doi : 10.1128/JVI.78.7.3480-3488.2004 . PMC   371042 . PMID   15016871 .
  17. ^ Wyles JP, McMaster CR, Ridgway ND (август 2002 г.). «Связанный с пузырьком мембранного белка белка-A (VAP-A) взаимодействует с оксистерол-связывающим белком для модификации экспорта из эндоплазматической ретикулумы» . Журнал биологической химии . 277 (33): 29908–18. doi : 10.1074/jbc.m201191200 . PMID   12023275 .
  18. ^ Wyles JP, Ridgway ND (июль 2004 г.). «Вамп-ассоциированный белок-А регулирует разделение оксистерол-связывающего белка белка-9 между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи». Экспериментальные исследования клеток . 297 (2): 533–47. doi : 10.1016/j.yexcr.2004.03.052 . PMID   15212954 .
  19. ^ Подпрыгнуть до: а беременный Ernst WL, Shome K, Wu CC, Gong X, Frizzell RA, Aridor M (март 2016 г.). «Вамп-ассоциированные белки (VAP) в качестве рецепторов, которые пара муковисцидозого трансмембранного регулятора проводимости (CFTR) с гомеостазом липидов» . Журнал биологической химии . 291 (10): 5206–20. doi : 10.1074/jbc.m115.692749 . PMC   4777854 . PMID   26740627 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: fc1ec9ca934acce3bc2694b8a56fd658__1703887860
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/fc/58/fc1ec9ca934acce3bc2694b8a56fd658.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
VAPA - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)