рпоН
| Фактор РНК-полимеразы сигма-54 | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Организм | ? | ||
| Символ | РпоН | ||
| ЮниПрот | P24255 | ||
| |||
Ген rpoN ( РНК - полимераза , азотограничивающий N ) кодирует сигма-фактор сигма-54 (σ54, сигма N или RpoN), белок Escherichia coli и других видов бактерий. RpoN противодействует сигма-факторам RpoS. [ 1 ]
Биологическая роль
[ редактировать ]Первоначально идентифицирован как регулятор генов, участвующих в метаболизме и ассимиляции азота в условиях ограничения азота. [ 2 ] С тех пор было показано, что E. coli σ54 играет важную регуляторную роль во множестве других клеточных процессов. Аналогичным образом гомологи σ54 у других видов регулируют широкий спектр процессов, включая синтез жгутиков и вирулентность. [ 3 ]
Специфичность последовательности и механизм действия
[ редактировать ]| Фактор Сигма-54, домен, взаимодействующий с активатором | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Сигма54_AID | ||
| Пфам | PF00309 | ||
| ИнтерПро | IPR000394 | ||
| PROSITE | PS50044 | ||
| |||
Элементы промотора σ54 состоят из консервативных нуклеотидов, расположенных в положениях -12 и -24 относительно сайта начала транскрипции. [ 4 ] Это контрастирует с членами семейства σ70, которые распознают консервативные промоторные элементы, расположенные примерно в -10 и -35 относительно сайта начала транскрипции. [ 5 ] В отличие от членов семейства σ70, белки σ54, как было показано, связывают промоторную ДНК независимо от коровой РНКП in vitro . [ 6 ] Другой отличительной характеристикой белков σ54 является их абсолютная потребность в белках-активаторах, известных как белки, связывающие бактериальные энхансеры (bEBP), для инициации транскрипции. [ 4 ] [ 7 ] Таким образом, как активная, так и неактивная форма RNAP:σ54 связываются с промоторами. [ 8 ]
Элементы промотора, регулируемые RpoN, имеют следующую консенсусную последовательность: TTGGCACGGTTTTTGCT. [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Донг Т., Ю Р., Шеллхорн Х. (январь 2011 г.). «Антагонистическая регуляция подвижности и экспрессии транскриптома с помощью RpoN и RpoS в Escherichia coli» . Молекулярная микробиология . 79 (2): 375–86. дои : 10.1111/j.1365-2958.2010.07449.x . ПМИД 21219458 .
- ^ Хант Т.П., Магасаник Б. (декабрь 1985 г.). «Транскрипция glnA очищенными компонентами Escherichia coli: коровой РНК-полимеразой и продуктами glnF, glnG и glnL» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (24): 8453–7. Бибкод : 1985PNAS...82.8453H . дои : 10.1073/pnas.82.24.8453 . ПМЦ 390934 . ПМИД 2867543 .
- ^ Цанг Дж., Гувер Т.Р. (2014). «Темы и вариации: регуляция RpoN-зависимых жгутиковых генов у различных видов бактерий» . Научка . 2014 : 681754. doi : 10.1155/2014/681754 . ПМЦ 3930126 . ПМИД 24672734 .
- ^ Jump up to: а б Винешверарай С., Бозе Д., Берроуз П.С., Джоли Н., Шумахер Дж., Раппас М., Папе Т., Чжан Х., Стокли П., Северинов К., Бак М. (май 2008 г.). «Методы работы бактериальной РНК-полимеразы, содержащей фактор специфичности промотора сигма54» . Молекулярная микробиология . 68 (3): 538–46. дои : 10.1111/j.1365-2958.2008.06181.x . ПМИД 18331472 . S2CID 33750977 .
- ^ Грубер Т.М., Гросс, Калифорния (2003). «Множественные сигма-субъединицы и разделение бактериального транскрипционного пространства». Ежегодный обзор микробиологии . 57 : 441–66. дои : 10.1146/annurev.micro.57.030502.090913 . ПМИД 14527287 .
- ^ Бак М., Кэннон В. (июль 1992 г.). «Специфическое связывание фактора транскрипции сигма-54 с промоторной ДНК» . Природа . 358 (6385): 422–4. Бибкод : 1992Natur.358..422B . дои : 10.1038/358422a0 . ПМИД 1641025 .
- ^ Шинглер В. (май 2011 г.). «Сигнальные сенсорные системы, влияющие на σ⁵⁴-зависимую транскрипцию» . Обзоры микробиологии FEMS . 35 (3): 425–40. дои : 10.1111/j.1574-6976.2010.00255.x . ПМИД 21054445 .
- ^ Бонокора Р.П., Смит С., Лапьер П., Уэйд Дж.Т. (октябрь 2015 г.). «Картирование генома Escherichia coli σ54 показывает широко распространенное консервативное внутригенное связывание» . ПЛОС Генетика . 11 (10): е1005552. дои : 10.1371/journal.pgen.1005552 . ПМЦ 4591121 . ПМИД 26425847 .
- ^ Леанг С, Крушкал Дж, Уэки Т, Пульич М, Сан Дж, Хуарес К, Нуньес С, Регера Г, ДиДонато Р, Постиер Б, Адкинс Р.М., Ловли Д.Р. (июль 2009 г.). «Полногеномный анализ регулона RpoN у Geobacter serreducens» . БМК Геномика . 10 :331. дои : 10.1186/1471-2164-10-331 . ПМЦ 2725144 . ПМИД 19624843 .
 | Эта о генах статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |