СКА2
| СКА2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Генные карты : [1] ; ОМА : - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Субъединица 2 комплекса веретена и кинетохора | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | СКА2 | ||
| Альт. имена | Семейство со сходством последовательностей 33. Член A, FAM33A, веретено и связанный с KT (кинетохором) 2, белок FAM33A. | ||
| ген NCBI | 348235 | ||
| HGNC | 28006 | ||
| МОЙ БОГ | 616674 | ||
| ЮниПрот | Q8WVK7 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | 17 q22 | ||
| |||
Белок 2, ассоциированный с веретеном и кинетохорами, представляет собой белок , который у человека кодируется геном SKA2, обнаруженным в хромосоме 17 . SKA2 является частью комплекса, связанного с веретеном и кинетохорами, также включающим SKA1 и SKA3 , которые отвечают за начало анафазы в митозе путем регуляции хромосомной сегрегации. [ 1 ] [ 2 ]
SKA2 может функционировать как прогностический генный маркер для выявления рака легких [ 3 ] а также предлагаемый биомаркер суицидальных тенденций и посттравматических стрессовых расстройств. [ 4 ] [ 5 ] Ген SKA2 содержит один однонуклеотидный полиморфизм (SNP) rs7208505, расположенный в 3'-UTR . Этот генетический вариант, содержащий цитозин (существующий в менее распространенном аллеле) вместо тимина , наряду с эпигенетическими модификациями (такими как метилирование ДНК ), коррелирует с суицидальными тенденциями и посттравматическим стрессом. [ 4 ]
Открытие
[ редактировать ]Белок SKA2 был впервые документирован как продукт гипотетического гена FAM33A, входящего в состав комплекса, связанного с веретеном и кинетохорой (КТ), необходимого для своевременного наступления анафазы. СКА2 был определен партнером СКА1, отсюда и название в 2006 году. [ 2 ] Позже третий компонент комплекса SKA был масс-спектрометрически идентифицирован как C13Orf3, позже названный SKA3. [ 6 ] Этот комплекс играет важную роль в клетке во время митотического перехода из метафазы в анафазу. [ 2 ]
Структура белка и субклеточная локализация
[ редактировать ]Продукт гена SKA2 представляет собой длинную цепь из 121 аминокислоты и молекулярной массой 14 188 Да, содержащую в основном 3 спирали. [ 7 ] Гомологи белка SKA2, будучи очень маленькими, обнаружены у некоторых позвоночных, но отсутствуют у беспозвоночных. [ 2 ] Этот белок в основном локализуется в конденсированной хромосоме, а также во внешнем веретене и микротрубочках кинетохор во время митоза. [ 2 ] Белки SKA2 локализуются в митотическом веретене и белках, связанных с кинетохорами, таких как SKA1 и SKA3. [ 8 ]
Функция
[ редактировать ]SKA2 является частью более крупного комплекса веретена и кинетохора, который представляет собой подкомплекс внешнего кинетохора и связывается с микротрубочками. [ 2 ] [ 8 ] [ 9 ] Этот комплекс необходим для правильного начала анафазы во время митоза, помогая в хромосомной сегрегации. [ 2 ] и способствует движению микросфер вдоль микротрубочек деполимеризационным образом, поскольку он является непосредственным компонентом интерфейса кинетохора-микротрубочки, а также напрямую связывается с микротрубочками в виде ансамблей. [ 9 ]
Снижение экспрессии SKA2 приводит к потере комплекса из кинетохора , однако эта потеря SKA-комплекса не влияет на общую структуру кинетохора, однако волокна демонстрируют повышенную чувствительность к холоду из-за потери. Клетка проходит длительную задержку в метафазоподобном состоянии. [ 2 ] Был сделан вывод, что SKA2 регулирует поддержание метафазной пластинки и замалчивание контрольной точки веретена, что приводит к началу анафазы во время митоза. [ 2 ] SKA2 также взаимодействует с глюкокортикоидным рецептором, помогая сопровождать рецептор в ядре. [ 10 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Суицидальные тенденции и посттравматическое стрессовое расстройство.
[ редактировать ]Метилирование ДНК гена SKA2 и генотип однонуклеотидного полиморфизма rs7208505 могут оказывать влияние на суицидальное поведение в соответствии с линейной моделью, предложенной в исследовании 2014 года. Генотип rs7208505 содержит однонуклеотидный полиморфизм (SNP), содержащий аллель варианта цитозина вместо тимина. присутствует в общем аллеле. Этот SNP позволяет возникать элементам динуклеотидного повтора (CpG), обеспечивая сегмент гена для метилирования. Таким образом, само по себе метилирование ДНК может быть основным фактором, повышающим риск суицидального поведения. Исследование аллеля rs7208505 в разных этнических группах наряду с многочисленными психиатрическими диагнозами показало, что вариации в SKA2 могут опосредовать риск суицидального поведения, которое прогрессирует до попытки самоубийства. [ 4 ]
Рак легких
[ редактировать ]Ген SKA2 вместе с геном PRR11 в паре необходим для развития рака легких . Пара генов разделена межгенной областью длиной 548 п.н., и, имея классический мотив пары генов «голова к голове», они имеют прототипный двунаправленный промотор, содержащий общий элемент CCAAT. [ 11 ] [ 12 ] Этот промотор регулируется NF-Y, который представляет собой специфичный для последовательности фактор транскрипции и долгое время считался активатором генов, поскольку он обладает особыми свойствами, подходящими для регуляции двунаправленного промотора с последовательностью CCAAT-бокса. Эти двунаправленные промоторы объединяют экспрессию двух генов (кодирующих белок), участвующих в одном и том же биохимическом процессе, что обеспечивает синхронизированный временной или экологический контроль. Два гена SKA2 и PRR11 жизненно важны для ускорения роста и подвижности клеток рака легких и имеют прогностическую ценность для пациентов. Наряду с SKA2 , PRR11 также играет важную роль в регуляции клеточного цикла, но от поздней S-фазы до митоза. [ 2 ] [ 13 ] Таким образом, играя жизненно важную роль в развитии клеточного цикла на разных стадиях, SKA2 и PRR11 могут координировано регулировать пролиферацию рака легких путем дерегуляции прогрессирования клеточного цикла. [ 3 ] Поскольку транскрипция гена SKA2 производит белок, кодирующий мРНК SKA2, вместе с двумя другими интронами miRNA301a и miRNAA454 , следовательно, функция гена не ограничивается продукцией белка. [ 3 ] Эти интроны участвуют в онкогенезе, поскольку миРНК301а регулирует PTEN , NKRF , SMAD4 и PIAS3 , а миРНКА454 нацелена на SMAD4, играющую онкогенную роль при раке толстой кишки человека. [ 14 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]- СКА1
- СКА3
- ГР ( рецептор глюкокортикоида )
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «СКА2» . Энтрез Джин . Проверено 3 августа 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж Ханиш А., Силье Х.Х., Нигг Э.А. (ноябрь 2006 г.). «Своевременное начало анафазы требует нового комплекса веретена и кинетохора, включающего Ska1 и Ska2» . Журнал ЭМБО . 25 (23): 5504–15. дои : 10.1038/sj.emboj.7601426 . ПМЦ 1679759 . ПМИД 17093495 .
- ^ Перейти обратно: а б с Ван Ю, Чжан Ю, Чжан С, Вэн Х, Ли Ю, Цай В, Се М, Лонг Ю, Ай Ц, Лю З, Ду Г, Ван С, Ню Ю, Сун Ф, Одзаки Т, Бу Ю (сентябрь 2015 г.) ). «Пара генов PRR11 и SKA2 имеет двунаправленный промотор, регулируемый NF-Y, и способствует развитию рака легких». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1849 (9): 1133–44. дои : 10.1016/j.bbagrm.2015.07.002 . ПМИД 26162986 .
- ^ Перейти обратно: а б с Гуинтивано Дж., Браун Т., Новичок А., Джонс М., Кокс О., Махер Б.С., Итон В.В., Пейн Дж.Л., Уилкокс ХК, Каминский З.А. (декабрь 2014 г.). «Идентификация и репликация комбинированного эпигенетического и генетического биомаркера, предсказывающего самоубийство и суицидальное поведение» . Американский журнал психиатрии . 171 (12): 1287–96. дои : 10.1176/appi.ajp.2014.14010008 . ПМК 7081376 . ПМИД 25073599 . S2CID 46235766 .
- ^ «Прототип анализа крови позволит оценить риск самоубийства у солдат» . «Индепендент» (Великобритания). 3 августа 2014 г. Проверено 3 августа 2014 г.
- ^ Гайтанос Т.Н., Сантамария А., Джеяпракаш А.А., Ван Б., Конти Э., Нигг Э.А. (май 2009 г.). «Стабильные взаимодействия кинетохор-микротрубочки зависят от комплекса Ska и его нового компонента Ska3/C13Orf3» . Журнал ЭМБО . 28 (10): 1442–52. дои : 10.1038/emboj.2009.96 . ПМК 2669960 . ПМИД 19360002 .
- ^ Джеяпракаш А.А., Сантамария А, Джаячандран У, Чан Ю.В., Бенда С., Нигг Э.А., Конти Е (май 2012 г.). «Структурная и функциональная организация комплекса Ска, ключевого компонента интерфейса кинетохор-микротрубочки» . Молекулярная клетка . 46 (3): 274–86. doi : 10.1016/j.molcel.2012.03.005 . ПМИД 22483620 .
- ^ Перейти обратно: а б Велберн Дж. П., Грищук Е. Л., Бэкер С. Б., Уилсон-Кубалек Е. М., Йейтс Дж. Р., Чизмен И. М. (март 2009 г.). «Человеческий кинетохорный комплекс Ska1 облегчает подвижность микротрубочек, связанную с деполимеризацией» . Развивающая клетка . 16 (3): 374–85. дои : 10.1016/j.devcel.2009.01.011 . ПМЦ 2746561 . ПМИД 19289083 .
- ^ Перейти обратно: а б Шмидт Дж.К., Артханари Х., Боэсоерменьи А., Дашкевич Н.М., Уилсон-Кубалек Э.М., Моннье Н., Маркус М., Оберер М., Миллиган Р.А., Бате М., Вагнер Г., Грищук Е.Л., Чизмен И.М. (ноябрь 2012 г.). «Комплекс Ska1, связанный с кинетохорами, отслеживает деполимеризацию микротрубочек и связывается с изогнутыми протофиламентами» . Развивающая клетка . 23 (5): 968–80. дои : 10.1016/j.devcel.2012.09.012 . ПМК 3500403 . ПМИД 23085020 .
- ^ Райс Л., Уотерс С.Э., Экклс Дж., Гарсайд Х., Соммер П., Кей П., Блэкхолл Ф.Х., Зиф Л., Телфер Б., Стратфорд И., Кларк Р., Сингх Д., Стивенс А., Уайт А., Рэй Д.В. (сентябрь 2008 г.). «Идентификация и функциональный анализ взаимодействия SKA2 с глюкокортикоидным рецептором» . Журнал эндокринологии . 198 (3): 499–509. дои : 10.1677/joe-08-0019 . ПМК 2518725 . ПМИД 18583474 .
- ^ Вакано С., Бюн Дж.С., Ди Л.Дж., Гарднер К. (июль 2012 г.). «Двойная жизнь двунаправленных промоутеров» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1819 (7): 688–93. дои : 10.1016/j.bbagrm.2012.02.006 . ПМЦ 3371153 . ПМИД 22366276 .
- ^ Орехова А.С., Рубцов П.М. (апрель 2013). «Двунаправленные промоторы в транскрипции геномов млекопитающих». Биохимия. Биохимия . 78 (4): 335–41. дои : 10.1134/S0006297913040020 . ПМИД 23590436 . S2CID 18378130 .
- ^ Чжан С, Чжан Ю, Ли Ю, Чжу Х, Ван Ю, Цай В, Чжу Дж, Одзаки Т, Бу Ю (март 2015 г.). «PRR11 регулирует переход фазы от поздней S к G2/M и индуцирует преждевременную конденсацию хроматина (PCC)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 458 (3): 501–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2015.01.139 . ПМИД 25666944 .
- ^ Лю Л, Не Дж, Чен Л, Донг Г, Ду С, Ву Икс, Тан Ю, Хан В (5 февраля 2013 г.). «Онкогенная роль микроРНК-130a/301a/454 при колоректальном раке человека посредством воздействия на экспрессию Smad4» . ПЛОС ОДИН . 8 (2): e55532. Бибкод : 2013PLoSO...855532L . дои : 10.1371/journal.pone.0055532 . ПМЦ 3564758 . ПМИД 23393589 .