Jump to content

Эмили Балскус

Эмили Балскус
Рожденный 1980 (43–44 года)
Гражданство Соединенные Штаты
Альма-матер Уильямс - колледж Гарвардского университета
Научная карьера
Поля Химическая биология, энзимология, микробиология, биохимия
Учреждения Гарвардский университет
Веб-сайт https://www.microbialchemist.com/

Эмили П. Балскас — американский химик-биолог, энзимолог, микробиолог и биохимик, родившаяся в Цинциннати, штат Огайо, в 1980 году. С 2011 года она работает на факультете химии и химической биологии Гарвардского университета и в настоящее время является профессором Морриса Кана. Она опубликовала более 80 рецензируемых статей и три главы книг. С 2012 года ее пригласили прочитать более 170 лекций, она занимала должности в различных редакционных коллегиях, а также работала рецензентом в ACS и Nature журналах , среди других. Бальскус также в настоящее время является консультантом компаний Novartis , Kintai Therapeutics и Merck & Co.

Молодость образование и

Бальскус уже интересовалась потенциальной научной карьерой еще в начальной школе, где она проводила научный эксперимент по разбавлению и сохранению материи. [1] Позже, в старшей школе, она познакомилась с химией и была «очарована азартом манипулирования молекулами в лаборатории». Позже в ее научной карьере это переросло в ее увлечение тем, как образуются молекулы в живых организмах. В интервью для Премии Блаватника для молодых ученых Бальскус размышляет, что, вероятно, ее вдохновило заняться наукой, потому что все ее преподаватели естественных наук были женщинами. [2]

Бальскус получил степень бакалавра химии с отличием с отличием в 2002 году в колледже Уильямс . [3] [4] где она опубликовала свою первую статью о синтезе (-)-хенноксазола А в лаборатории профессора Томаса Э. Смита. [5] Затем она поступила в Кембриджский университет в качестве стипендиата Черчилля , где получила степень магистра философии. по химии в лаборатории Стивена В. Лея . [3] [4] Бальскус получила докторскую степень. с химиком-органиком Эриком Якобсеном в Гарварде в 2008 году. Там она предложила новую идею использования асимметричного катализатора для контроля образования химических связей между большими циклическими молекулами с целью образования предпочтительного стереоизомера . [6] Затем она перешла от органической химии к химической биологии, проходя постдокторскую стажировку с 2008 по 2011 год в Гарвардской медицинской школе вместе с исследователем натуральных продуктов Кристофером Уолшем . Вместе они работали над биосинтезом сцитонемина , «микробного солнцезащитного крема», используемого для защиты микроорганизмов от вредного ультрафиолетового излучения. [4] В 2009 году она стала участницей летних курсов по микробному разнообразию в Лаборатории морской биологии в Вудс-Хоул и прошла обучение в области микробной экологии и микробиологии окружающей среды . [7]

Исследования [ править ]

Исследования лаборатории Бальскаса сосредоточены на микробиоме человека , который представляет собой триллионы комменсальных, симбиотических и патогенных микроорганизмов, живущих в нас и на нас. Эти микроорганизмы включают бактерии , простейшие и вирусы . Из-за обилия генов в микробиоме человека (в 200 раз больше, чем в геноме человека ) многие ферменты и/или их механизмы не охарактеризованы. [8] Таким образом, две цели Бальскаса — выяснить механизмы, с помощью которых эти микробные ферменты выполняют химические процессы, и идентифицировать конкретные микробы, гены и ферменты, ответственные за ключевые метаболические действия. Третья цель — разработать биосовместимые методы контроля, манипулирования и изучения микробной химии in situ . [9]

Биоинформатика активно применяется в лаборатории Бальскаса для изучения огромного количества генов микробиома человека. Биоинформатика — это «наука о хранении, извлечении и анализе больших объемов биологической информации». [10] Примерами биоинформатического анализа, используемого в лаборатории Бальскаса, являются: филогенетика , выравнивание последовательностей , моделирование гомологии и аннотация ДНК . Ключевым достижением лаборатории Бальскаса стало выяснение фермента, ответственного за уже известное превращение холина в триметиламин — холинтриметиламин-лиазу. Они определили кластер генов, необходимый для расщепления связи CN холина, и предположили, что он кодирует фермент глицилового радикала (GRE), класс ферментов, о которых ранее не сообщалось, чтобы выполнять химические процессы такого типа. Выравнивание последовательностей кластера генов и ранее функционально охарактеризованных ферментов глицильного радикала, а также модели гомологии подозреваемого фермента выявили наличие консервативных ключевых остатков глицина и цистеина в активном центре, что подтверждает гипотезу о том, что фермент является членом семейства GRE. ферментов. Это исследование важно, поскольку метаболизм холина может быть связан с синдромом неприятного запаха рыбы, неалкогольной жировой болезнью печени, атеросклерозом и сердечно-сосудистыми заболеваниями. [11]

Еще одна ключевая публикация: «Выдающийся глициловый радикальный фермент в микробиомах кишечника человека метаболизирует транс-4-гидрокси-L-пролин». [12] описывает важный исследовательский подход, используемый Балскус и ее командой; химически управляемое функциональное профилирование. Сначала идентифицируется интересующее семейство ферментов (в данном случае семейство GRE) и сравниваются аминокислотные последовательности всех его членов. Зная структуры и функции уже охарактеризованных членов семейства ферментов и ответственных за них аминокислотных остатков, создается сеть сходства последовательностей (SSN) для группировки последовательностей ферментов в кластеры, которые имеют общие биологические функции. SSN используется для интерпретации данных, полученных с помощью Short-BRED, инструмента количественного метагеномного анализа, который использует в качестве входных данных аминокислотные последовательности семейства ферментов. Short-BRED идентифицирует уникальные маркеры последовательности каждой группы схожих членов и последовательно определяет их распространенность в микробиоме человека. Этот инструмент можно использовать для выявления нехарактерных представителей и определения приоритетности их изучения на основе их численности.

Биосовместимая химия – еще одна неотъемлемая стратегия лаборатории Бальскаса. Эти трансформации определяются как «неферментативные химические реакции, которые взаимодействуют с метаболизмом живых организмов таким образом, что изменяют биологические функции». [13] Им удалось разработать биосовместимые реакции циклопропанирования и гидрирования для изменения реакционной способности микробов с использованием неферментативных катализаторов, фталоцианина железа (III) и палладия соответственно. [14] [15] Другое применение этого подхода, использованное Бальскусом, - это спасение активности ауксотрофных микробов с использованием реакций, катализируемых переходными металлами. При таком подходе основные питательные вещества, необходимые для роста и выживания микробов, производятся ненативным путем. [13] Им удалось спасти ауксотрофа, лишенного способности производить п -аминобензойную кислоту ( ПАБК ), предшественник фолиевой кислоты , с помощью рутениевого катализатора. [16] Успех этих вышеупомянутых подходов предполагает, что рост и активность микроорганизмов можно контролировать и использовать для различных применений в химическом производстве. [13]

Недавним достижением (2019 г.) лаборатории Бальскаса стало выяснение механизма, с помощью которого генотоксин колибактин повреждает ДНК. Они обнаружили, что циклопропановая «боеголовка» разрывает нити ДНК посредством реакции алкилирования. [17] Другой областью исследований, проводимой лабораторией Балкуса, является метаболизм микробных лекарств. В интервью журналу The Scientist Бальскус отметил, что многие препараты, такие как дигоксин, [6] а побочные продукты метаболизма человека могут разлагаться кишечными бактериями, что приводит к снижению воздействия этих молекул, чем можно было бы ожидать. В целом работа, проделанная лабораторией Бальскаса, представляет собой основополагающие стратегии, необходимые для исследования микробиома человека и понимания того, как он влияет на наше здоровье. Их надежда состоит в том, чтобы повлиять на разработку терапевтических стратегий, которые воздействуют не на человека-хозяина, а на его микробиом. [18]

Волонтерство [ править ]

Бальскус был соорганизатором симпозиума Keystone Symposium 2019. [19] по химическим и биологическим аспектам микробиоты кишечника. Основной задачей этой конференции было «...принятие других дисциплин», таких как ксенобиология, экология и межвидовая коммуникация. [20] улучшить область исследований микробиома.

Награды и почести [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Эренберг, Рэйчел (28 сентября 2018 г.). «Эмили Бальскас использует химическую логику для изучения микробиома» . Новости науки . Проверено 29 октября 2018 г.
  2. ^ Эмили Бальскус, национальный лауреат премии Блаватника 2019 года в области химии.
  3. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с «Стипендия Артура К. Коупа: Эмили П. Балскас | 15 января 2018 г., выпуск - том 96, выпуск 3 | Новости химии и техники» . cen.acs.org . Проверено 19 октября 2018 г.
  4. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с «Лаборатория Балскас — Люди — Эмили» . Сайт лаборатории Balskus . Проверено 26 октября 2018 г.
  5. ^ Смит, Томас Э.; Куо, Вэнь-Синь; Бок, Виктория Д.; Ройзен, Дженнифер Л.; Балскус, Эмили П.; Теберг, Эшли Б. (15 марта 2007 г.). «Тотальный синтез (-)-хенноксазола А» . Органические письма . 9 (6): 1153–1155. дои : 10.1021/ol070244p . ISSN   1523-7060 . ПМИД   17316014 .
  6. Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Эмили Бальскас раскрывает химию и метаболизм микробиомов человека» . Журнал «Ученый»® . Проверено 19 октября 2018 г.
  7. ^ Эмили https://www.microbialchemist.com/people/emily
  8. ^ Мэрилин Хэйр и Джон Шарп. Центр экогенетики и гигиены окружающей среды Вашингтонского университета, 1/2014.
  9. ^ Эмили Бальскус, национальный лауреат премии Блаватника 2019 года в области химии. https://www.youtube.com/watch?v=c_qFNuVJw8Q&feature=emb_logo
  10. ^ Что такое биоинформатика? https://www.ebi.ac.uk/training/online/course/bioinformatics-terrified/what-bioinformatics-0
  11. ^ Крачун, Смаранда; Бальскас, Эмили П. «Микробное преобразование холина в триметиламин требует фермента глицильного радикала». Proceedings of the National Academy of Sciences USA 2012, 109, 21307–21312. doi:10.1073/pnas.1215689109
  12. ^ Левин, Бенджамин Дж. *; Хуанг, Иоланда Ю.*; Пек, Спенсер К.; Вэй, Ифэн; Мартинес-дель Кампо, Ана; Маркс, Джонатан А.; Францоза, Эрик А.; Хаттенхауэр, Кертис; Бальскас, Эмили П. «Выдающийся глицил-радикальный фермент в микробиомах кишечника человека метаболизирует транс-4-гидрокси-L-пролин». Наука 2017, 355, aai8386. doi:10.1126/science.aai8386
  13. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Манипулирование микробами с помощью биосовместимой химии https://www.microbialchemist.com/bioсовместимой-химии
  14. ^ Уоллес, Стивен; Балскус, Эмили П. «Сопряжение микробного производства стирола с биосовместимой реакцией циклопропанирования». Энджью. хим. Межд. Эд. 2015, 54, 7106–7109. doi:10.1002/anie.201502185
  15. ^ Сирасани, Гопал; Тонг, Лючуань; Балскус, Эмили П. «Биосовместимое гидрирование алкенов объединяет органический синтез с микробным метаболизмом». Angewandte Chemie International Edition 2014, 53, 7785–7786. Выбран в качестве объекта исследования в журнале Nature 2014, 510, 447. doi:10.1002/anie.201403148.
  16. ^ Ли, Юнми; Умеано, Афома; Балскус, Эмили П. «Спасение ауксотрофных микроорганизмов с помощью неферментативной химии». Angewandte Chemie International Edition 2013, 53, 11800–11803. Выбран как очень важный документ (VIP). doi:10.1002/anie.201307033
  17. ^ Уилсон, Мэтью Р. *; Цзян, Инди*; Вильялта, Питер В.; Сторнетта, Алессия; Будро, Поль Д.; Карра, Андреа; Бреннан, Кейтлин А.; Чун, Ынён; Нго, Лиззи; Самсон, Леона Д.; Энгельвард, Бевин П.; Гарретт, Венди С.; Бальбо, Сильвия; Бальскас, Эмили П. «Бактериальный генотоксин кишечника человека колибактин алкилирует ДНК» Science 2019, 363, eaar7785. doi:10.1126/science.aar7785
  18. ^ Понимание микробиома человека https://www.microbialchemist.com/microbiome
  19. ^ Балскус, Эмили П.; Тернбо, Питер Дж.; Волан, Деннис В. (24 июля 2018 г.). «Анонс конференции Keystone Symposia 2019: «Микробиом: химические механизмы и биологические последствия» » . mSystems . 3 (4). дои : 10.1128/mSystems.00115-18 . ISSN   2379-5077 . ПМК   6060284 . ПМИД   30057942 .
  20. ^ Кенни, Дуглас Дж.; Балскус, Эмили П. (2018). «Инженерия химических взаимодействий в микробных сообществах». Обзоры химического общества . 47 (5): 1705–1729. дои : 10.1039/C7CS00664K . ISSN   0306-0012 . ПМИД   29210396 .
  21. ^ «Премия Алана Т. Уотермана Национального научного фонда» .
  22. ^ «Эмили Балскус получает премию Блаватника для молодых ученых» . c&en . Проверено 21 апреля 2020 г.
  23. ^ «Металлы в биологии: открытие, анализ, эксплуатация и имитация неорганической химии природы для обеспечения будущего» . Гордонские исследовательские конференции . Проверено 21 апреля 2020 г.
  24. ^ «12-я премия Хираты» . Институт трансформирующих биомолекул Нагойского университета . Институт трансформирующих биомолекул . Проверено 21 апреля 2020 г.
  25. ^ «12 талантливых: Эмили Бальскас, взломщик кода микробиома» . c&en . 20 мая 2015 года . Проверено 21 апреля 2020 г.
  26. ^ «Премия Cottrell Scholar Awards — 2015» . Исследовательская корпорация по развитию науки. Архивировано из оригинала 19 октября 2018 года . Проверено 26 октября 2018 г.
  27. ^ «Резюме премии № 1454007» . Национальный научный фонд . Проверено 21 апреля 2020 г.
  28. ^ «12 талантливых людей C&EN» . Талантливый 12 . 20 мая 2015 г. Проверено 19 октября 2018 г.
  29. ^ Бурзак, Кэтрин. «Обзор технологий MIT» . Обзор технологий . Проверено 21 апреля 2020 г.
  30. ^ «Победители лекций для новых исследователей по отчетам о натуральных продуктах» . Королевское химическое общество . Проверено 21 апреля 2020 г.
  31. ^ «Исследовательские стипендии Альфреда П. Слоана, 2014 г.» (PDF) . Массачусетский технологический институт . Проверено 21 апреля 2020 г.
  32. ^ «Предыдущие победители» . Тиме Химия . Проверено 21 апреля 2020 г.
  33. ^ «Новые открытия и награды в области исследований рака» . Фонд исследования рака Дэймона Раньона . Проверено 21 апреля 2020 г.
  34. ^ «Источники-учредители — Balskus Lab» . Химик-микробиолог .
  35. ^ «Получатели премии нового новатора директора НИЗ» . Национальные институты здравоохранения . 18 сентября 2018 года . Проверено 21 апреля 2020 г.
  36. ^ «Профиль ученого Эмили П. Бальскас» . Программа стипендий Сирла . Архивировано из оригинала 5 сентября 2015 года . Проверено 2 июня 2023 г.

Внешние ссылки [ править ]

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 1159843eb4eb6d7c5992d489e6c59a0e__1712361180
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/11/0e/1159843eb4eb6d7c5992d489e6c59a0e.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Emily Balskus - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)