СРА1

СРА1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2MGX, 4NBO
Идентификаторы
Псевдонимы	SRA1 , SRA, SRAP, STRAA1, pp7684, активатор стероидных рецепторов РНК1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603819 ; МГИ : 1344414 ; Гомологен : 11906 ; Генные карты : SRA1 ; ОМА : SRA1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	140,557,677 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	36,803,868 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; anterior pituitary; ; myocardium of left ventricle; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; stromal cell of endometrium; ; blood;
	Top expressed in
	right kidney; ; yolk sac; ; calvaria; ; duodenum; ; left lobe of liver; ; temporal muscle; ; embryo; ; muscle of thigh; ; lip; ; molar;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transcription coactivator activity; protein binding; nuclear receptor coactivator activity; steroid receptor RNA activator RNA binding; DNA binding;
Cellular component	microtubule cytoskeleton; intercellular bridge; plasma membrane; nucleus; nucleoplasm; cytosol; cytoplasm; ribonucleoprotein complex; transcription regulator complex; cell leading edge;
Biological process	regulation of apoptotic process; cell differentiation; positive regulation of signaling receptor activity; cell population proliferation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; apoptotic process; regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of myoblast differentiation; cellular response to estrogen stimulus; positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10011
	24068
	ENSG00000213523
	ENSMUSG00000006050
	Q9HD15
	Q80VJ2
	НМ_001035235 ; НМ_001253764
	НМ_001164406 ; НМ_025291
	НП_001030312 ; НП_001240693
	НП_001157878 ; НП_079567
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Активатор РНК стероидного рецептора 1, также известный как белок-активатор РНК стероидного рецептора (SRAP), представляет собой белок , который у людей кодируется SRA1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} мРНК, транскрибируемая с гена SRA1, является компонентом рибонуклеопротеинового комплекса, содержащего NCOA1 . Эта функциональная РНК также кодирует белок. ^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген участвует в коактивации транскрипции рецептором стероидным . В настоящее время имеются данные, позволяющие предположить, что этот ген кодирует как некодирующую РНК, которая функционирует как часть рибонуклеопротеинового комплекса, так и белок, кодирующий мРНК. Повышенная экспрессия как транскрипта, так и белка связана с раком. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SRA1 взаимодействует с:

Рецептор эстрогена альфа , ^{[ 8 ]}
ДДХ17 , ^{[ 8 ]}
Коактиватор ядерного рецептора 2 , ^{[ 8 ]} и
ИСПАНИЯ . ^{[ 9 ]}

Было показано, что SRAP взаимодействует со своим аналогом РНК SRA опосредованно с функциональной подструктурой STR7 РНК SRA. ^{[ 10 ]} Первоначально предполагалось, что SRAP содержит RRM, но было продемонстрировано, что он имеет пучок спирали на С-конце, тогда как N-конец этого домена кажется неструктурированным. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000213523 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006050 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ланц РБ, Маккенна, Нью-Джерси, Онате С.А., Альбрехт Ю, Вонг Дж, Цай С.Ю., Цай М.Дж. , О'Мэлли Б.В. (апрель 1999 г.). «Коактиватор стероидных рецепторов, SRA, функционирует как РНК и присутствует в комплексе SRC-1» . Клетка . 97 (1): 17–27. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80711-4 . ПМИД 10199399 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: активатор 1 РНК стероидного рецептора SRA1» .
^ Чунидасс-Котари С., Эмберли Э., Хамедани М.К., Труп С., Ван Х, Чоснек А., Хубе Ф., Мутаве М., Уотсон П.Х., Лейг Е (май 2004 г.). «Активатор РНК стероидного рецептора является первой функциональной РНК, кодирующей белок» . Письма ФЭБС . 566 (1–3): 43–7. дои : 10.1016/j.febslet.2004.03.104 . ПМИД 15147866 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ватанабе М., Янагисава Дж., Китагава Х., Такэяма К., Огава С., Арао Ю., Сузава М., Кобаяши Ю., Яно Т., Ёсикава Х., Масухиро Ю., Като С. (март 2001 г.). «Подсемейство РНК-связывающих белков DEAD-box действует как коактиватор альфа-рецептора эстрогена через N-концевой домен активации (AF-1) с коактиватором РНК, SRA» . Журнал ЭМБО . 20 (6): 1341–52. дои : 10.1093/emboj/20.6.1341 . ПМЦ 145523 . ПМИД 11250900 . (Отозвано, см. два : 10.15252/embj.201470090 , ПМИД 25452582 . Если это намеренная ссылка на отозванную статью, замените {{retracted|...}} с {{retracted|...|intentional=yes}}. )
^ Ши Ю., Даунс М., Се В., Као Х.И., Ордентлих П., Цай CC, Хон М., Эванс Р.М. (май 2001 г.). «Шарп, индуцируемый кофактор, который объединяет репрессию и активацию ядерных рецепторов» . Гены и развитие . 15 (9): 1140–51. дои : 10.1101/gad.871201 . ПМК 312688 . ПМИД 11331609 .
^ Юбе Ф, Веласко Дж, Роллин Дж, Фёрлинг Д, Франкастель К (январь 2011 г.). «Белок-активатор РНК стероидного рецептора связывается и противодействует SRA РНК-опосредованной активации MyoD и мышечной дифференцировки» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (2): 513–25. дои : 10.1093/nar/gkq833 . ПМК 3025577 . ПМИД 20855289 .
^ Билинович С.М., Дэвис К.М., Моррис Д.Л., Рэй Л.А., Прокоп Дж.В., Бьюкен Г.Дж., Липер Т.К. (апрель 2014 г.). «С-концевой домен SRA1p имеет складку, более похожую на PRP18, чем на RRM, и не связывается напрямую с областью STR7 РНК SRA1». Журнал молекулярной биологии . 426 (8): 1753–65. дои : 10.1016/j.jmb.2014.01.007 . ПМИД 24486611 .

Дальнейшее чтение

Улвелинг Д., Франкастель К., Хубе Ф. (апрель 2011 г.). «Когда один лучше двух: РНК с двойными функциями» (PDF) . Биохимия . 93 (4): 633–44. дои : 10.1016/j.biochi.2010.11.004 . ПМИД 21111023 . S2CID 22165949 .
Юбе Ф, Веласко Дж, Роллин Дж, Фёрлинг Д, Франкастель К (январь 2011 г.). «Белок-активатор РНК стероидного рецептора связывается и противодействует SRA РНК-опосредованной активации MyoD и мышечной дифференцировки» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (2): 513–25. дои : 10.1093/nar/gkq833 . ПМК 3025577 . ПМИД 20855289 .
Купер С, Го Дж, Ян Й, Чунидасс-Котари С, Хубе Ф, Хамедани МК, Мерфи LC, Миал Й, Лейг Е (июль 2009 г.). «Повышение относительной экспрессии эндогенного некодирующего РНК-активатора стероидных рецепторов (SRA) в клетках рака молочной железы человека с использованием модифицированных олигонуклеотидов» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (13): 4518–31. дои : 10.1093/nar/gkp441 . ПМЦ 2715257 . ПМИД 19483093 .
Хубе Ф., Го Дж., Чунидасс-Котари С., Купер С., Хамедани М.К., Дибров А.А., Бланшар А.А., Ван Х, Дэн Г., Миал Ю., Лейг Е (июль 2006 г.). «Альтернативный сплайсинг первого интрона активатора РНК стероидного рецептора (SRA) участвует в генерации кодирующих и некодирующих изоформ РНК в клеточных линиях рака молочной железы». ДНК и клеточная биология . 25 (7): 418–28. дои : 10.1089/dna.2006.25.418 . hdl : 1807.1/831 . ПМИД 16848684 .
Лейг Э., Доцлав Х., Уотсон П.Х., Мерфи Л.С. (сентябрь 1999 г.). «Экспрессия активатора РНК стероидных рецепторов в опухолях молочной железы человека». Исследования рака . 59 (17): 4190–3. ПМИД 10485452 .
Мерфи Л.К., Саймон С.Л., Паркс А., Лейг Э., Доцлав Х., Снелл Л., Труппа С., Адейинка А., Уотсон П.Х. (ноябрь 2000 г.). «Измененная экспрессия корегуляторов рецепторов эстрогена во время онкогенеза молочной железы человека». Исследования рака . 60 (22): 6266–71. ПМИД 11103781 .
Каварретта И.Т., Мукопадьяй Р., Лонард Д.М., Каусерт Л.М., Беннетт К.Ф., О'Мэлли Б.В., Смит К.Л. (февраль 2002 г.). «Снижение экспрессии коактиватора антисмысловыми олигодезоксинуклеотидами ингибирует транскрипционную активность ERalpha и пролиферацию MCF-7» . Молекулярная эндокринология . 16 (2): 253–70. дои : 10.1210/mend.16.2.0770 . ПМИД 11818499 .
Кучера Т., Уолтнер-Лоу М., Скотт Д.К., Прасад Р., Граннер Д.К. (июль 2002 г.). «Точечная мутация домена трансактивации AF2 глюкокортикоидного рецептора нарушает его взаимодействие с коактиватором 1 стероидного рецептора» . Журнал биологической химии . 277 (29): 26098–102. дои : 10.1074/jbc.M204013200 . ПМИД 12118039 .
Уеда Т., Мауджи Н.Р., Бруховский Н., Садар М.Д. (октябрь 2002 г.). «Лиганд-независимая активация андрогенного рецептора интерлейкином-6 и роль коактиватора стероидного рецептора-1 в клетках рака простаты» . Журнал биологической химии . 277 (41): 38087–94. дои : 10.1074/jbc.M203313200 . ПМИД 12163482 .
Ланц Р.Б., Разани Б., Голдберг А.Д., О'Мэлли Б.В. (декабрь 2002 г.). «Различные мотивы РНК важны для совместной активации рецепторов стероидных гормонов активатором РНК стероидных рецепторов (SRA)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (25): 16081–6. Бибкод : 2002PNAS...9916081L . дои : 10.1073/pnas.192571399 . ПМК 138568 . ПМИД 12444263 .
Эмберли Э., Хуанг Г.Дж., Хамедани М.К., Чоснек А., Али Д., Гролла А., Лу Б., Уотсон П.Х., Мерфи Л.К., Лейг Е (февраль 2003 г.). «Идентификация новых изоформ активатора РНК стероидных рецепторов человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 301 (2): 509–15. дои : 10.1016/S0006-291X(02)03070-X . ПМИД 12565891 .
Уоткинс Р.Э., Дэвис-Сирлз П.Р., Ламберт М.Х., Рединбо М.Р. (август 2003 г.). «Связывание коактиватора способствует специфическому взаимодействию между лигандом и рецептором прегнана X». Журнал молекулярной биологии . 331 (4): 815–28. дои : 10.1016/S0022-2836(03)00795-2 . ПМИД 12909012 .
Деблуа Ж, Жигер В (июнь 2003 г.). «Лиганд-независимая коактивация ERalpha AF-1 активатором РНК стероидного рецептора (SRA) посредством активации MAPK». Журнал биохимии стероидов и молекулярной биологии . 85 (2–5): 123–31. дои : 10.1016/S0960-0760(03)00225-5 . ПМИД 12943696 . S2CID 34194523 .
Ланц Р.Б., Чуа С.С., Бэррон Н., Седер Б.М., ДеМайо Ф., О'Мэлли Б.В. (октябрь 2003 г.). «Активатор РНК стероидного рецептора стимулирует пролиферацию, а также апоптоз in vivo» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (20): 7163–76. дои : 10.1128/MCB.23.20.7163-7176.2003 . ПМК 230309 . ПМИД 14517287 .
Флеминг Ф.Дж., Хилл А.Д., Макдермотт Э.В., О'Хиггинс, Нью-Джерси, Янг Л.С. (январь 2004 г.). «Дифференциальное привлечение белков-корегуляторов, коактиватора стероидных рецепторов-1 и медиатора молчания ретиноидных и тиреоидных рецепторов к элементу ответа эстрогенового рецептора на эстроген с помощью бета-эстрадиола и 4-гидрокситамоксифена при раке молочной железы человека» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 89 (1): 375–83. дои : 10.1210/jc.2003-031048 . ПМИД 14715875 .
Сюй Б, Кениг Р.Дж. (август 2004 г.). «РНК-связывающий домен в рецепторе гормона щитовидной железы усиливает активацию транскрипции» . Журнал биологической химии . 279 (32): 33051–6. дои : 10.1074/jbc.M404930200 . ПМИД 15180993 .
Чжао X, Паттон-младший, Дэвис С.Л., Флоренс Б., Эймс С.Дж., Спанджаард Р.А. (август 2004 г.). «Регуляция активности ядерных рецепторов псевдоуридинсинтазой посредством посттранскрипционной модификации РНК-активатора стероидных рецепторов» . Молекулярная клетка . 15 (4): 549–58. doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.044 . ПМИД 15327771 .
Коулман К.М., Лам В., Джабер Б.М., Ланц Р.Б., Смит К.Л. (октябрь 2004 г.). «Коактивация SRA альфа-рецептора эстрогена не зависит от фосфорилирования и усиливает активность агониста 4-гидрокситамоксифена». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 323 (1): 332–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.08.090 . ПМИД 15351741 .

Внешние ссылки

SRA1 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека SRA1 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9HD15 (активатор РНК 1 стероидного рецептора человека) на PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q80VJ2 (активатор РНК стероидного рецептора мыши 1) на PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000213523 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006050 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10199399-5] Ланц РБ, Маккенна, Нью-Джерси, Онате С.А., Альбрехт Ю, Вонг Дж, Цай С.Ю., Цай М.Дж. , О'Мэлли Б.В. (апрель 1999 г.). «Коактиватор стероидных рецепторов, SRA, функционирует как РНК и присутствует в комплексе SRC-1» . Клетка . 97 (1): 17–27. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80711-4 . ПМИД 10199399 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: активатор 1 РНК стероидного рецептора SRA1» .

[pmid15147866-7] Чунидасс-Котари С., Эмберли Э., Хамедани М.К., Труп С., Ван Х, Чоснек А., Хубе Ф., Мутаве М., Уотсон П.Х., Лейг Е (май 2004 г.). «Активатор РНК стероидного рецептора является первой функциональной РНК, кодирующей белок» . Письма ФЭБС . 566 (1–3): 43–7. дои : 10.1016/j.febslet.2004.03.104 . ПМИД 15147866 .

[pmid11250900-8] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ватанабе М., Янагисава Дж., Китагава Х., Такэяма К., Огава С., Арао Ю., Сузава М., Кобаяши Ю., Яно Т., Ёсикава Х., Масухиро Ю., Като С. (март 2001 г.). «Подсемейство РНК-связывающих белков DEAD-box действует как коактиватор альфа-рецептора эстрогена через N-концевой домен активации (AF-1) с коактиватором РНК, SRA» . Журнал ЭМБО . 20 (6): 1341–52. дои : 10.1093/emboj/20.6.1341 . ПМЦ 145523 . ПМИД 11250900 . (Отозвано, см. два : 10.15252/embj.201470090 , ПМИД 25452582 . Если это намеренная ссылка на отозванную статью, замените {{retracted|...}} с {{retracted|...|intentional=yes}}. )

[pmid11331609-9] Ши Ю., Даунс М., Се В., Као Х.И., Ордентлих П., Цай CC, Хон М., Эванс Р.М. (май 2001 г.). «Шарп, индуцируемый кофактор, который объединяет репрессию и активацию ядерных рецепторов» . Гены и развитие . 15 (9): 1140–51. дои : 10.1101/gad.871201 . ПМК 312688 . ПМИД 11331609 .

[pmid20855289-10] Юбе Ф, Веласко Дж, Роллин Дж, Фёрлинг Д, Франкастель К (январь 2011 г.). «Белок-активатор РНК стероидного рецептора связывается и противодействует SRA РНК-опосредованной активации MyoD и мышечной дифференцировки» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (2): 513–25. дои : 10.1093/nar/gkq833 . ПМК 3025577 . ПМИД 20855289 .

[11] Билинович С.М., Дэвис К.М., Моррис Д.Л., Рэй Л.А., Прокоп Дж.В., Бьюкен Г.Дж., Липер Т.К. (апрель 2014 г.). «С-концевой домен SRA1p имеет складку, более похожую на PRP18, чем на RRM, и не связывается напрямую с областью STR7 РНК SRA1». Журнал молекулярной биологии . 426 (8): 1753–65. дои : 10.1016/j.jmb.2014.01.007 . ПМИД 24486611 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]