КДЕЛР1

КДЕЛР1
Идентификаторы
Псевдонимы	KDELR1 , ERD2, ERD2.1, HDEL, PM23, KDEL рецептор удержания белка эндоплазматической сети 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 131235 ; МГИ : 1915387 ; Гомологен : 38236 ; Генные карты : KDELR1 ; OMA : KDELR1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	48,391,551 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	45,533,156 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	parotid gland; ; stromal cell of endometrium; ; left ovary; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; pylorus; ; right lobe of thyroid gland; ; minor salivary glands; ; mucosa of transverse colon; ; tendon of biceps brachii;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; lacrimal gland; ; submandibular gland; ; molar; ; calvaria; ; ankle; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; parotid gland; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; lactiferous gland;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ER retention sequence binding; KDEL sequence binding;
Cellular component	integral component of membrane; Golgi apparatus; membrane; Golgi membrane; cis-Golgi network; COPI-coated vesicle membrane; transport vesicle; endoplasmic reticulum; endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; cytoplasmic vesicle; endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; endoplasmic reticulum membrane;
Biological process	endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; protein retention in ER lumen; protein transport; intracellular protein transport; vesicle-mediated transport; retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; T cell cytokine production; T cell differentiation; T cell apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10945
	68137
	ENSG00000105438
	ENSMUSG00000002778
	P24390
	Q99JH8
	НМ_006801
	НМ_133950
	НП_006792
	НП_598711
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рецептор 1 задержки белка эндоплазматической сети KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) , также известный как KDELR1 , представляет собой белок , который у человека кодируется KDELR1 геном . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Функция

Сохранение резидентных растворимых белков в просвете эндоплазматического ретикулума (ЭР) достигается как в дрожжевых, так и в животных клетках путем их постоянного извлечения из цис- Гольджи или пре-Гольджи компартмента. Сортировка этих белков зависит от сигнала С-концевого тетрапептида, обычно lys - asp - glu - leu ( KDEL ) в клетках животных и his -asp-glu-leu ( HDEL ) у S. cerevisiae . Этот процесс опосредован рецептором , который распознает и связывает содержащий тетрапептид белок, а затем возвращает его в ЭР. У дрожжей сортирующий рецептор кодируется одним геном ERD2, который представляет собой семитрансмембранный белок. В отличие от дрожжей, описано несколько человеческих гомологов гена ERD2, составляющих семейство генов рецептора KDEL. Белок, кодируемый этим геном, был первым идентифицированным членом семейства, и он кодирует белок, структурно и функционально сходный с продуктом дрожжевого гена ERD2. ^{[ 2 ]} Рецептор KDEL опосредует поиск неправильно свернутых белков между ЭР и аппаратом Гольджи. ^{[ 7 ]} Рецептор KDEL функционирует путем связывания с шаперонами эндоплазматического ретикулума. ^{[ 7 ]} Эти шапероны распознаются рецептором KDEL в нижних отделах ER. После связывания они упаковываются в везикулы комплекса белков оболочки I для ретроградного транспорта в ЭР. ^{[ 8 ]} Исследования in vitro на дрожжах показали, что этот рецептор регулирует мембранный транспорт на ранних стадиях секреторного пути от ЭР к Гольджи. ^{[ 8 ]} Ошибка или мутация рецептора KDEL нарушает контроль качества ER, и наблюдаются заболевания, связанные со стрессом ER. ^{[ 9 ]}

Дилатационная кардиомиопатия

Рецепторы KDEL вовлечены в развитие дилатационной кардиомиопатии (ДКМП). Для определения связи между рецептором KDEL и дилатационной кардиомиопатией были созданы трансгенные мыши с точечной мутацией (D193N). ^{[ 7 ]} Мыши, экспрессирующие транспортный мутантный ген D193N, росли нормально, пока не достигли взрослого возраста. Мутантный рецептор KDEL не функционировал после 14-недельного возраста, и у этих мышей развился DCM. У них наблюдались расширенные камеры сердца, а также более высокое соотношение сердца к телу с увеличенным сердцем, а сердечные миоциты были больше по размеру. ^{[ 7 ]} Никакой разницы в артериальном давлении между мышами дикого типа и мутантными мышами не наблюдалось, поэтому кардиомегалия не была связана с гипертонией. ^{[ 7 ]} При анализе было обнаружено, что у мутантных мышей KDEL наблюдалась пролиферация саркоплазматического ретикулума (SR) и сужение поперечных канальцев по сравнению с диким типом и контролем. Кроме того, в расширенном СР наблюдались агрегации дегенеративных мембранных белков. Это указывает на то, что мутантный рецептор KDEL приводит к нарушению рециркуляции и контроля качества ЭР, что приводит к агрегации неправильно свернутых белков в ЭР. Кроме того, у трансгенных мышей KDEL D193N наблюдались дефекты тока Са++-канала L-типа в миоцитах желудочков. ^{[ 7 ]} Базальный ток этих каналов был значительно ниже, чем в контроле. Экспрессия каналов L-типа была ниже в плазматической мембране клеток сердца KDEL D193N из-за сужения поперечных канальцев. ^{[ 7 ]} BiP, белок-шаперон, был неравномерно распределен и синтезирован в большей пропорции у трансгенных мутантных мышей, что позволяет предположить увеличение концентрации неправильно свернутых белков. ^{[ 7 ]} Они также наблюдали агрегаты системы убиквитин-протеасома (система деградации); это предполагает, что произошло насыщение системы из-за высоких уровней неправильно свернутых белков, что приводит к нарушению контроля качества ER. ^{[ 7 ]} Исследователи пришли к выводу, что гиперубиквитинирование и насыщение протеасомной системы происходят из-за накопления неправильно свернутого белка, что вызывает стресс. ^{[ 7 ]} Накопление неправильно свернутых белков, индуцированное стрессом ER, также наблюдалось в DCM человека. ^{[ 10 ]} Исследование DCM на мышах выявило усиление апоптоза из-за высокого уровня экспрессии CHOP. CHOP представляет собой фактор транскрипции, уровень которого повышается во время стресса ER и вызывает апоптоз клеток в процессе развернутого белкового ответа. ^{[ 11 ]} Увеличение нагрузки давлением/механического стресса у мышей KDEL D193N вызвало еще больший синтез BiP, CHOP и других белков, которые являются биомаркерами клеточного стресса и стресса ЭР, поскольку способность ЭР справляться с этим очень ограничена. ^{[ 7 ]}

Лимфопения

KDELR1 также имеет решающее значение для развития лимфоцитов . Мыши с миссенс-мутацией Y158C в Kdelr1 имеют пониженное количество В- и Т-лимфоцитов и более восприимчивы к вирусной инфекции. ^{[ 12 ]}

Взаимодействия

Было показано, что KDELR1 взаимодействует с ARFGAP1 . ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

Структура

Структура Gallus Gallus KDELR2 (Uniprot Q5ZKX9 ) была расшифрована в состоянии Apo, состоянии, связанном с пептидом KDEL, и связанном с синтетическим нанотелом. ^{[ 15 ]} Идентичность последовательностей KDELR1 человека и KDELR2 курицы составляет 84,4%.

См. также

Ссылки

^ Льюис MJ, Pelham HR (ноябрь 1990 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого рецептора HDEL». Природа . 348 (6297): 162–3. Бибкод : 1990Natur.348..162L . дои : 10.1038/348162a0 . ПМИД 2172835 . S2CID 4356283 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: KDELR1 KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) рецептор удержания белка эндоплазматической сети 1» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105438 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002778 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Хамада Х, Сузуки М, Юаса С, Мимура Н, Шинозука Н, Такада Ю, Сузуки М, Нишино Т, Накая Х, Косеки Х, Аоэ Т (сентябрь 2004 г.). «Дилятационная кардиомиопатия, вызванная аберрантным контролем качества эндоплазматического ретикулума у трансгенных мышей с мутантным рецептором KDEL» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (18): 8007–17. дои : 10.1128/MCB.24.18.8007-8017.2004 . ПМК 515036 . ПМИД 15340063 .
^ Jump up to: ^а ^б Семенза Дж.С., Хардвик К.Г., Дин Н., Пелхэм Х.Р. (июнь 1990 г.). «ERD2, дрожжевой ген, необходимый для рецептор-опосредованного извлечения люминальных белков ER из секреторного пути». Клетка . 61 (7): 1349–57. дои : 10.1016/0092-8674(90)90698-е . ПМИД 2194670 . S2CID 37455066 .
^ Таунсли FM, Уилсон Д.В., Пелхэм HR (июль 1993 г.). «Мутационный анализ человеческого рецептора KDEL: различные структурные требования для удержания Гольджи, связывания лигандов и ретроградного транспорта» . Журнал ЭМБО . 12 (7): 2821–9. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05943.x . ПМК 413532 . ПМИД 8392934 .
^ Уикс Дж., Моррисон К., Маллен А., Уэйт Р., Бартон П., Данн М.Дж. (февраль 2003 г.). «Гиперубиквитинирование белков при дилатационной кардиомиопатии». Протеомика . 3 (2): 208–16. дои : 10.1002/pmic.200390029 . ПМИД 12601813 . S2CID 19874662 .
^ Зинзнер Х., Курода М., Ван Х., Бачварова Н., Лайтфут Р.Т., Ремотти Х., Стивенс Дж.Л., Рон Д. (апрель 1998 г.). «CHOP участвует в запрограммированной гибели клеток в ответ на нарушение функции эндоплазматического ретикулума» . Гены и развитие . 12 (7): 982–95. дои : 10.1101/gad.12.7.982 . ПМК 316680 . ПМИД 9531536 .
^ Сиггс О.М., Попкин Д.Л., Кребс П., Ли Х, Тан М., Чжан Х, Цзэн М., Линь П., Ся Ю., Олдстоун М.Б., Корнелл Р.Дж., Бейтлер Б. (октябрь 2015 г.). «Мутация рецептора задержки ЭР KDELR1 приводит к клеточной лимфопении и неспособности контролировать хроническую вирусную инфекцию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (42): Е5706-14. Бибкод : 2015PNAS..112E5706S . дои : 10.1073/pnas.1515619112 . ПМК 4620900 . ПМИД 26438836 .
^ Аоэ Т., Кукерман Э., Ли А., Кассель Д., Питерс П.Дж., Сюй В.В. (декабрь 1997 г.). «Рецептор KDEL, ERD2, регулирует внутриклеточный трафик, рекрутируя белок, активирующий ГТФазу для ARF1» . Журнал ЭМБО . 16 (24): 7305–16. дои : 10.1093/emboj/16.24.7305 . ПМК 1170331 . ПМИД 9405360 .
^ Маджуль И., Штрауб М., Хелл С.В., Дуден Р., Селинг Х.Д. (июль 2001 г.). «KDEL-cargo регулирует взаимодействия между белками, участвующими в движении везикул COPI: измерения в живых клетках с использованием FRET» . Развивающая клетка . 1 (1): 139–53. дои : 10.1016/S1534-5807(01)00004-1 . ПМИД 11703931 .
^ Бройер П., Паркер Дж.Л., Герондопулос А., Циммерманн И., Сигер М.А., Барр Ф.А., Ньюстед С. (март 2019 г.). «Структурная основа pH-зависимого извлечения белков ER из аппарата Гольджи рецептором KDEL» . Наука . 363 (6431): 1103–1107. Бибкод : 2019Sci...363.1103B . дои : 10.1126/science.aaw2859 . ПМИД 30846601 . S2CID 72336061 .

Дальнейшее чтение

Пелхэм HR (октябрь 1996 г.). «Динамическая организация секреторного пути» . Структура и функции клеток . 21 (5): 413–9. дои : 10.1247/csf.21.413 . ПМИД 9118249 .
Льюис М.Дж., Пелхэм Х.Р. (январь 1992 г.). «Индуцированное лигандом перераспределение человеческого рецептора KDEL из комплекса Гольджи в эндоплазматический ретикулум». Клетка . 68 (2): 353–64. дои : 10.1016/0092-8674(92)90476-S . ПМИД 1310258 . S2CID 43356178 .
Льюис MJ, Pelham HR (ноябрь 1990 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого рецептора HDEL». Природа . 348 (6297): 162–3. Бибкод : 1990Natur.348..162L . дои : 10.1038/348162a0 . ПМИД 2172835 . S2CID 4356283 .
Аоэ Т., Кукерман Э., Ли А., Кассель Д., Питерс П.Дж., Сюй В.В. (декабрь 1997 г.). «Рецептор KDEL, ERD2, регулирует внутриклеточный трафик, рекрутируя белок, активирующий ГТФазу для ARF1» . Журнал ЭМБО . 16 (24): 7305–16. дои : 10.1093/emboj/16.24.7305 . ПМК 1170331 . ПМИД 9405360 .
Смит Дж.С., Татибана И., Пол У., Ли Х.К., Танараджасингам У., Портье Б.П., Уеки К., Рамасвами С., Биллингс С.Дж., Моренвейзер Х.В., Луис Д.Н., Дженкинс Р.Б. (февраль 2000 г.). «Карта транскриптов области супрессора опухоли глиомы на плече хромосомы 19q». Геномика . 64 (1): 44–50. дои : 10.1006/geno.1999.6101 . ПМИД 10708517 .
Мацуда А, Сузуки Й, Хонда Г, Мурамацу С, Мацузаки О, Нагано Й, Дой Т, Симотоно К, Харада Т, Нисида Е, Хаяси Х, Сугано С (май 2003 г.). «Крупномасштабная идентификация и характеристика генов человека, которые активируют сигнальные пути NF-kappaB и MAPK» . Онкоген . 22 (21): 3307–18. дои : 10.1038/sj.onc.1206406 . ПМИД 12761501 .
Ямамото К., Хамада Х., Синкай Х., Коно Ю., Косеки Х., Аоэ Т. (сентябрь 2003 г.). «Рецептор KDEL модулирует стрессовую реакцию эндоплазматического ретикулума посредством митоген-активируемых сигнальных каскадов протеинкиназы» . Журнал биологической химии . 278 (36): 34525–32. дои : 10.1074/jbc.M304188200 . ПМИД 12821650 .
Бард Ф., Мазелен Л., Пешу-Лонжен С., Мальхотра В., Юрдич П. (ноябрь 2003 г.). «Src регулирует структуру Гольджи и зависимый от рецептора KDEL ретроградный транспорт в эндоплазматический ретикулум» . Журнал биологической химии . 278 (47): 46601–6. дои : 10.1074/jbc.M302221200 . ПМИД 12975382 .
Бреуза Л., Хальбайзен Р., Джено П., Отте С., Барлоу С., Хонг В., Хаури Х.П. (ноябрь 2004 г.). «Протеомика мембран эндоплазматического ретикулума-промежуточного отсека Гольджи (ERGIC) из обработанных брефельдином А клеток HepG2 идентифицирует ERGIC-32, новый циклический белок, который взаимодействует с человеческим Erv46» . Журнал биологической химии . 279 (45): 47242–53. дои : 10.1074/jbc.M406644200 . ПМИД 15308636 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid2172835-1] Льюис MJ, Pelham HR (ноябрь 1990 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого рецептора HDEL». Природа . 348 (6297): 162–3. Бибкод : 1990Natur.348..162L . дои : 10.1038/348162a0 . ПМИД 2172835 . S2CID 4356283 .

[entrez-2] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: KDELR1 KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) рецептор удержания белка эндоплазматической сети 1» .

[refGRCh38Ensembl-3] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105438 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-4] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002778 – Ensembl , май 2017 г.

[5] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[6] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[Hamada_8007–17-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Хамада Х, Сузуки М, Юаса С, Мимура Н, Шинозука Н, Такада Ю, Сузуки М, Нишино Т, Накая Х, Косеки Х, Аоэ Т (сентябрь 2004 г.). «Дилятационная кардиомиопатия, вызванная аберрантным контролем качества эндоплазматического ретикулума у трансгенных мышей с мутантным рецептором KDEL» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (18): 8007–17. дои : 10.1128/MCB.24.18.8007-8017.2004 . ПМК 515036 . ПМИД 15340063 .

[pmid2194670-8] Jump up to: ^а ^б Семенза Дж.С., Хардвик К.Г., Дин Н., Пелхэм Х.Р. (июнь 1990 г.). «ERD2, дрожжевой ген, необходимый для рецептор-опосредованного извлечения люминальных белков ER из секреторного пути». Клетка . 61 (7): 1349–57. дои : 10.1016/0092-8674(90)90698-е . ПМИД 2194670 . S2CID 37455066 .

[pmid8392934-9] Таунсли FM, Уилсон Д.В., Пелхэм HR (июль 1993 г.). «Мутационный анализ человеческого рецептора KDEL: различные структурные требования для удержания Гольджи, связывания лигандов и ретроградного транспорта» . Журнал ЭМБО . 12 (7): 2821–9. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05943.x . ПМК 413532 . ПМИД 8392934 .

[pmid12601813-10] Уикс Дж., Моррисон К., Маллен А., Уэйт Р., Бартон П., Данн М.Дж. (февраль 2003 г.). «Гиперубиквитинирование белков при дилатационной кардиомиопатии». Протеомика . 3 (2): 208–16. дои : 10.1002/pmic.200390029 . ПМИД 12601813 . S2CID 19874662 .

[pmid9531536-11] Зинзнер Х., Курода М., Ван Х., Бачварова Н., Лайтфут Р.Т., Ремотти Х., Стивенс Дж.Л., Рон Д. (апрель 1998 г.). «CHOP участвует в запрограммированной гибели клеток в ответ на нарушение функции эндоплазматического ретикулума» . Гены и развитие . 12 (7): 982–95. дои : 10.1101/gad.12.7.982 . ПМК 316680 . ПМИД 9531536 .

[pmid26438836-12] Сиггс О.М., Попкин Д.Л., Кребс П., Ли Х, Тан М., Чжан Х, Цзэн М., Линь П., Ся Ю., Олдстоун М.Б., Корнелл Р.Дж., Бейтлер Б. (октябрь 2015 г.). «Мутация рецептора задержки ЭР KDELR1 приводит к клеточной лимфопении и неспособности контролировать хроническую вирусную инфекцию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (42): Е5706-14. Бибкод : 2015PNAS..112E5706S . дои : 10.1073/pnas.1515619112 . ПМК 4620900 . ПМИД 26438836 .

[pmid9405360-13] Аоэ Т., Кукерман Э., Ли А., Кассель Д., Питерс П.Дж., Сюй В.В. (декабрь 1997 г.). «Рецептор KDEL, ERD2, регулирует внутриклеточный трафик, рекрутируя белок, активирующий ГТФазу для ARF1» . Журнал ЭМБО . 16 (24): 7305–16. дои : 10.1093/emboj/16.24.7305 . ПМК 1170331 . ПМИД 9405360 .

[pmid11703931-14] Маджуль И., Штрауб М., Хелл С.В., Дуден Р., Селинг Х.Д. (июль 2001 г.). «KDEL-cargo регулирует взаимодействия между белками, участвующими в движении везикул COPI: измерения в живых клетках с использованием FRET» . Развивающая клетка . 1 (1): 139–53. дои : 10.1016/S1534-5807(01)00004-1 . ПМИД 11703931 .

[15] Бройер П., Паркер Дж.Л., Герондопулос А., Циммерманн И., Сигер М.А., Барр Ф.А., Ньюстед С. (март 2019 г.). «Структурная основа pH-зависимого извлечения белков ER из аппарата Гольджи рецептором KDEL» . Наука . 363 (6431): 1103–1107. Бибкод : 2019Sci...363.1103B . дои : 10.1126/science.aaw2859 . ПМИД 30846601 . S2CID 72336061 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[3]

[4]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]