РАСГРП1

РАСГРП1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4L9M, 4L9U
Идентификаторы
Псевдонимы	RASGRP1 , CALDAG-GEFI, CALDAG-GEFII, RASGRP, hRasGRP1, RAS-высвобождающий гуанил белок 1, IMD64
Внешние идентификаторы	Опустить : 603962 ; МГИ : 1314635 ; Гомологен : 4195 ; GeneCards : RASGRP1 ; ОМА : RASGRP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	38,565,575 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	117,173,482 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pons; ; cerebellar vermis; ; Brodmann area 23; ; lateral nuclear group of thalamus; ; endothelial cell; ; Brodmann area 46; ; entorhinal cortex; ; cerebellar hemisphere; ; orbitofrontal cortex; ; middle temporal gyrus;
	Top expressed in
	olfactory tubercle; ; lateral geniculate nucleus; ; medial geniculate nucleus; ; medial dorsal nucleus; ; subiculum; ; nucleus accumbens; ; pontine nuclei; ; superior frontal gyrus; ; globus pallidus; ; primary motor cortex;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; protein homodimerization activity; phosphatidylcholine binding; zinc ion binding; phosphatidylserine binding; metal ion binding; diacylglycerol binding; lipid binding; guanyl-nucleotide exchange factor activity; GTPase activator activity;
Cellular component	cytoplasm; Golgi apparatus; endoplasmic reticulum membrane; membrane; mast cell granule; Golgi membrane; endoplasmic reticulum; cytosol; plasma membrane; intracellular anatomical structure;
Biological process	cell differentiation; positive regulation of protein phosphorylation; positive regulation of T cell differentiation in thymus; intracellular signal transduction; regulation of phospholipase C activity; positive regulation of MAP kinase activity; positive regulation of natural killer cell differentiation; inflammatory response to antigenic stimulus; vesicle transport along microtubule; activation of GTPase activity; regulation of GTPase activity; cytokine production; positive regulation of Ras protein signal transduction; positive regulation of natural killer cell activation; positive regulation of JNK cascade; secretory granule localization; MAPK cascade; regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; positive regulation of GTPase activity; positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production; protein complex oligomerization; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; regulation of ERK1 and ERK2 cascade; positive regulation of tumor necrosis factor production; Ras protein signal transduction; mast cell degranulation; regulation of p38MAPK cascade; positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity; signal transduction; small GTPase mediated signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10125
	19419
	ENSG00000172575
	ENSMUSG00000027347
	О95267
	Q9Z1S3
	НМ_001128602 ; НМ_001306086 ; НМ_005739
	НМ_011246
	НП_001122074 ; НП_001293015 ; НП_005730
	НП_035376
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гуанил-высвобождающий белок 1 RAS представляет собой белок , который у человека кодируется RASGRP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, высвобождающий гуанилнуклеотиды RAS (RASGRP), является членом семейства генов, характеризующихся наличием домена фактора обмена гуаниновых нуклеотидов суперсемейства Ras ( GEF ). Он действует как фактор обмена нуклеотидов, регулируемый диацилглицерином ( DAG ), специфически активируя Ras посредством обмена связанного GDP на GTP . Он активирует киназный каскад Erk/MAP и регулирует развитие, гомеостаз и дифференцировку Т- и В-клеток . ^{[ 7 ]}

Ген

Альтернативно были идентифицированы варианты сплайсированных транскриптов, кодирующие разные изоформы. Соответствующий крысиный ген rbc7, в котором отсутствует экзон с 5 штрихами, представляет собой усеченную версию с 5 штрихами и 3 штрихами более крупного нормального крысиного транскрипта, который кодирует предсказанный белок массой 90 кДа. Этот более короткий транскрипт не был обнаружен у людей. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

В ноябре 2016 года 12-летний пациент был госпитализирован с рецидивирующими инфекциями. Ученые предположили, что причиной могла быть генетическая проблема. Более конкретно, генетической причиной является дефект гена RASGRP1, который делает его неактивным. .

RASGRP1 играет роль в функциях динеинов естественных клеток-киллеров. Поскольку динеины являются моторными белками, их функция заключается в циркуляции элементов внутри клеток. Лабораторные исследования доктора Оранжа установили функциональную связь между дефектами естественных клеток-киллеров и динеинами, что в сочетании с другими наблюдениями побудило врачей попробовать для лечения пациента препарат леналидоммид. Препарат смог обратить вспять некоторые эффекты мутации RASGRP1.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000172575 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027347 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ботторфф Д., Эбину Дж., Стоун Дж.К. (май 1999 г.). «RasGRP, активатор Ras: последовательности кДНК мыши и человека и хромосомные положения». Геном Мамм . 10 (4): 358–61. дои : 10.1007/s003359901001 . ПМИД 10087292 . S2CID 34266456 .
^ Кавасаки Х., Спрингетт Г.М., Токи С., Каналес Дж.Дж., Харлан П., Блюменстил Дж.П., Чен Э.Дж., Бани И.А., Мотидзуки Н., Ашбахер А., Мацуда М., Хаусман Д.Э., Грейбил А.М. (ноябрь 1998 г.). «Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов рэпа, сильно обогащенный базальными ганглиями» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (22): 13278–83. Бибкод : 1998PNAS...9513278K . дои : 10.1073/pnas.95.22.13278 . ПМЦ 23782 . ПМИД 9789079 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: RASGRP1 RAS-высвобождающий гуанил белок 1 (регулируемый кальцием и DAG)» .

Дальнейшее чтение

Дауэр Н.А., Стэнг С.Л., Ботторфф Д.А., Эбину Дж.О., Дики П., Остергаард Х.Дж., Стоун Дж.К. (2000). «RasGRP необходим для дифференцировки тимоцитов мыши и передачи сигналов TCR». Природная иммунология . 1 (4): 317–21. дои : 10.1038/79766 . ПМИД 11017103 . S2CID 7724240 .
Приатель Дж.Дж., Тех С.Дж., Дауэр Н.А., Стоун Дж.К. и др. (2002). «RasGRP1 преобразует низкокачественные сигналы TCR, которые имеют решающее значение для развития Т-клеток, гомеостаза и дифференцировки» . Иммунитет . 17 (5): 617–27. дои : 10.1016/S1074-7613(02)00451-X . ПМИД 12433368 .
Приатель Дж.Дж., Чен Х., Зеневиц Л.А., Шен Х., Хардер К.В., Хорвиц М.С. и др. (2007). «Хронический иммунодефицит у мышей, лишенных RasGRP1, приводит к активации и истощению CD4 Т-клеток» . Дж. Иммунол . 179 (4): 2143–52. doi : 10.4049/jimmunol.179.4.2143 . ПМИД 17675473 .
Приатель Дж. Дж., Чен X, Дханджи С., Абрахам Н. и др. (2006). «RasGRP1 передает сигнал TCR продифференцировки, который имеет решающее значение для развития Т-клеток CD4» . Дж. Иммунол . 177 (3): 1470–80. дои : 10.4049/jimmunol.177.3.1470 . ПМИД 16849453 .
Приатель Дж.Дж., Чен Х., Хуан Ю.Х., Чоу М.Т., Зеневиц Л.А., Кофлин Дж.Дж., Шен Х., Стоун Дж.К., Тан Р. и др. (2010). «RasGRP1 регулирует индуцированное антигеном программирование развития наивными Т-клетками CD8» . Дж. Иммунол . 184 (2): 666–76. doi : 10.4049/jimmunol.0803521 . ПМИД 20007535 .
Эбину Д.О., Ботторфф Д.А., Чан Э.Ю. и др. (1998). «RasGRP, белок, высвобождающий гуанилнуклеотиды Ras, с мотивами, связывающими кальций и диацилглицерин». Наука . 280 (5366): 1082–6. Бибкод : 1998Sci...280.1082E . дои : 10.1126/science.280.5366.1082 . ПМИД 9582122 .
Топхэм МК, Прескотт С.М. (2001). «Диацилглицерилкиназа-дзета регулирует активацию Ras с помощью нового механизма» . Дж. Клеточная Биол . 152 (6): 1135–43. дои : 10.1083/jcb.152.6.1135 . ПМК 2199204 . ПМИД 11257115 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Бивона Т.Г., Перес Де Кастро I, Ахерн И.М. и др. (2003). «Фосфолипаза Cgamma активирует Ras в аппарате Гольджи посредством RasGRP1». Природа . 424 (6949): 694–8. Бибкод : 2003Natur.424..694B . дои : 10.1038/nature01806 . ПМИД 12845332 . S2CID 4403046 .
Мадани С., Хишами А., Черкауи-Малки М. и др. (2004). «Диацилглицерины, содержащие жирные кислоты Омега-3 и Омега-6, связываются с RasGRP и модулируют активацию киназы MAP» . Ж. Биол. Хим . 279 (2): 1176–83. дои : 10.1074/jbc.M306252200 . ПМИД 14583629 .
Клингер М.Б., Гильбо Б., Гулдинг Р.Э., Кей Р.Дж. (2005). «Дерегулированная экспрессия RasGRP1 инициирует лимфомогенез тимуса независимо от Т-клеточных рецепторов». Онкоген . 24 (16): 2695–704. дои : 10.1038/sj.onc.1208334 . ПМИД 15829980 . S2CID 23262099 .
Лю Ю, Чжу М, Нисида К и др. (2007). «Важная роль RasGRP1 в функции тучных клеток и IgE-опосредованном аллергическом ответе» . Дж. Эксп. Мед . 204 (1): 93–103. дои : 10.1084/jem.20061598 . ПМК 2118421 . ПМИД 17190838 .
Руз Дж.П., Молленауэр М., Хо М. и др. (2007). «Необычное взаимодействие двух типов активаторов Ras, RasGRP и SOS, обеспечивает чувствительную и надежную активацию Ras в лимфоцитах» . Мол. Клетка. Биол . 27 (7): 2732–45. дои : 10.1128/MCB.01882-06 . ЧВК 1899892 . ПМИД 17283063 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Пасвольский Р., Фейгельсон С.В., Килич С.С. и др. (2007). «Синдром LAD-III связан с дефектной экспрессией активатора Rap-1 CalDAG-GEFI в лимфоцитах, нейтрофилах и тромбоцитах» . Дж. Эксп. Мед . 204 (7): 1571–82. дои : 10.1084/jem.20070058 . ПМК 2118641 . ПМИД 17576779 .
Коско К.А., Чериньоли Ф., Уильямс С. и др. (2007). «SKAP55 модулирует индуцированную рецептором Т-клеточного антигена активацию пути Ras-Erk-AP1 путем связывания RasGRP1». Мол. Иммунол . 45 (2): 510–22. дои : 10.1016/j.molimm.2007.05.024 . ПМИД 17658605 .
Ясуда С., Стивенс Р.Л., Терада Т. и др. (2007). «Дефектная экспрессия белка 1, высвобождающего Ras-гуанилнуклеотид, у части пациентов с системной красной волчанкой» . Дж. Иммунол . 179 (7): 4890–900. дои : 10.4049/jimmunol.179.7.4890 . ПМИД 17878389 .

Внешние ссылки

RASGRP1 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека RASGRP1 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 15 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000172575 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027347 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10087292-5] Ботторфф Д., Эбину Дж., Стоун Дж.К. (май 1999 г.). «RasGRP, активатор Ras: последовательности кДНК мыши и человека и хромосомные положения». Геном Мамм . 10 (4): 358–61. дои : 10.1007/s003359901001 . ПМИД 10087292 . S2CID 34266456 .

[pmid9789079-6] Кавасаки Х., Спрингетт Г.М., Токи С., Каналес Дж.Дж., Харлан П., Блюменстил Дж.П., Чен Э.Дж., Бани И.А., Мотидзуки Н., Ашбахер А., Мацуда М., Хаусман Д.Э., Грейбил А.М. (ноябрь 1998 г.). «Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов рэпа, сильно обогащенный базальными ганглиями» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (22): 13278–83. Бибкод : 1998PNAS...9513278K . дои : 10.1073/pnas.95.22.13278 . ПМЦ 23782 . ПМИД 9789079 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: RASGRP1 RAS-высвобождающий гуанил белок 1 (регулируемый кальцием и DAG)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]