Семейство генов рецепторов липопротеинов низкой плотности
| Домен рецептора липопротеинов низкой плотности класса A | |||
|---|---|---|---|
 Структура богатого цистеином повтора рецептора липопротеинов низкой плотности. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Ldl_recept_a | ||
| Пфам | PF00057 | ||
| ИнтерПро | ИПР002172 | ||
| УМНЫЙ | SM00192 | ||
| PROSITE | PS50068 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1лдл / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Мембраном | 5 | ||
| |||
| Домен рецептора липопротеинов низкой плотности класса B | |||
|---|---|---|---|
 Структура внеклеточного домена рецептора ЛПНП при эндосомальном pH. [ 2 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Ldl_recept_b | ||
| Пфам | PF00058 | ||
| Пфам Клан | 6CL0186 | ||
| ИнтерПро | IPR000033 | ||
| УМНЫЙ | SM00135 | ||
| PROSITE | ПС51120 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1lrx / SCOPe / СУПФАМ | ||
| |||
Семейство генов рецепторов липопротеинов низкой плотности кодирует класс структурно родственных рецепторов клеточной поверхности , которые выполняют разнообразные биологические функции в разных органах, тканях и типах клеток. [ 3 ] Роль, которая чаще всего ассоциируется с этим эволюционно древним семейством, — это холестерина гомеостаз (поддержание соответствующей концентрации холестерина). У людей избыток холестерина в крови захватывается липопротеинами низкой плотности (ЛПНП) и удаляется печенью посредством эндоцитоза рецептора ЛПНП . [ 4 ] Недавние данные показывают, что члены семейства генов рецепторов ЛПНП активны в клеточных сигнальных путях между специализированными клетками во многих, если не во всех, многоклеточных организмах. [ 5 ] [ 6 ]
У млекопитающих семь членов семейства LDLR, а именно:
- ЛДЛР
- Рецептор ЛПОНП ( VLDLR )
- АпоER2 или LRP8
- Белок 4, родственный рецептору липопротеинов низкой плотности
- также известный как белок, содержащий повторы множественного эпидермального фактора роста (EGF) (MEGF7)
- Белок 1, родственный LDLR
- Белок 1b, родственный LDLR
- Мегалин .
Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]Ниже перечислены человеческие белки, содержащие домены рецепторов липопротеинов низкой плотности:
Класс А
[ редактировать ]С6 ; С7 ; 8А ; 8Б ; С9 ; CD320 ; CFI; КОРИН ; ДГКР2 ; ХСПГ2 ; ЛДЛР ; ЛДЛРАД2 ; ЛДЛРАД3 ; ЛРП1 ; ЛРП10 ; ЛРП11 ; ЛРП12 ; ЛРП1Б ; ЛРП2 ; ЛРП3 ; ЛРП4 ; ЛРП5 ; ЛРП6 ; ЛРП8 ; МАМДК4 ; МФПР ; ПРСС7 ; РХФП1 ; РХФП2 ; СОРЛ1 ; СПИНТ1 ; ССПО ; СТ14 ; ТМПРСС4 ; ТМПРСС6 ; ТМПРСС7 ; TMPRSS9 ( сераза-1B ); ВЛДЛР ;
Класс Б
[ редактировать ]ЭФР ; ЛДЛР ; ЛРП1 ; ЛРП10 ; ЛРП1Б ; ЛРП2 ; ЛРП4 ; ЛРП5 ; ЛРП5Л ; ЛРП6 ; ЛРП8 ; НИД1 ; НИД2 ; СОРЛ1 ; ВЛДЛР ;
См. также
[ редактировать ]- Растворимый белок, родственный рецептору липопротеинов низкой плотности (sLRP), нарушение функции которого связано с болезнью Альцгеймера .
Структура
[ редактировать ]
Члены семейства LDLR характеризуются отдельными функциональными доменами, представленными в характерном количестве. Эти модули:
- Рецептор ЛПНП типа А (LA) повторяет по 40 остатков каждый, демонстрируя отрицательно заряженную поверхность, стабилизированную тройной дисульфидной связью; Считается, что определенные комбинации этих повторов «голова-хвост» определяют лигандные взаимодействия;
- Повторы рецептора ЛПНП типа B , также известные как области гомологии предшественника EGF, содержащие EGF-подобные повторы и бета-пропеллерные домены YWTD ;
- трансмембранный домен и
- цитоплазматическая область с сигналом (а) интернализации рецептора через покрытые ямки, содержащим консенсусный тетрапептид Asn-Pro-Xaa-Tyr (NPxY). Этот цитоплазматический хвост контролирует как эндоцитоз, так и передачу сигналов путем взаимодействия с белками, содержащими фосфотирозинсвязывающий домен (PTB).
В дополнение к этим доменам, которые можно найти во всех рецепторах семейства генов, рецептор ЛПНП и некоторые изоформы ApoER2 и VLDLR содержат короткую область, которая может подвергаться O-связанному гликозилированию , известную как O-связанный сахарный домен. Более того, ApoER2 может содержать сайт расщепления протеазы фурином между повторами типа A и типа B, что позволяет производить растворимый фрагмент рецептора путем процессинга, опосредованного фурином.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дейли Н.Л., Скэнлон М.Дж., Джорджевич Дж.Т., Крун П.А., Смит Р. (июль 1995 г.). «Трехмерная структура богатого цистеином повтора рецептора липопротеина низкой плотности» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (14): 6334–8. Бибкод : 1995PNAS...92.6334D . дои : 10.1073/pnas.92.14.6334 . ПМК 41512 . ПМИД 7603991 .
- ^ Руденко Г., Генри Л., Хендерсон К. и др. (декабрь 2002 г.). «Структура внеклеточного домена рецептора ЛПНП при эндосомальном pH» (PDF) . Наука . 298 (5602): 2353–8. Бибкод : 2002Sci...298.2353R . дои : 10.1126/science.1078124 . ПМИД 12459547 . S2CID 17712211 .
- ^ Никьяер А., Уиллноу Т.Е. (июнь 2002 г.). «Семейство генов рецепторов липопротеинов низкой плотности: клеточный швейцарский армейский нож?». Тенденции клеточной биологии . 12 (6): 273–80. дои : 10.1016/S0962-8924(02)02282-1 . ПМИД 12074887 .
- ^ Ли Ю, Лу В, Марзоло М.П., Бу Г (май 2001 г.). «Дифференциальные функции членов семейства рецепторов липопротеинов низкой плотности, предполагаемые их различной скоростью эндоцитоза» . Ж. Биол. Хим . 276 (21): 18000–6. дои : 10.1074/jbc.M101589200 . ПМИД 11279214 .
- ^ Готхардт М., Троммсдорф М., Невитт М.Ф., Шелтон Дж., Ричардсон Дж.А., Стокингер В., Нимпф Дж., Герц Дж. (август 2000 г.). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольными адаптерными и каркасными белками предполагает разнообразные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигналов» . Ж. Биол. Хим . 275 (33): 25616–24. дои : 10.1074/jbc.M000955200 . ПМИД 10827173 .
- ^ Бефферт У., Столт ПК, Герц Дж. (март 2004 г.). «Функции липопротеиновых рецепторов в нейронах» . Дж. Липид Рес . 45 (3): 403–9. doi : 10.1194/jlr.R300017-JLR200 . ПМИД 14657206 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Схематическое изображение семи членов семейства рецепторов ЛПНП (ЛПНП) млекопитающих.
- Члены семейства рецепторов ЛПНП
- Рецепторы ЛПНП + Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)