амелогенин
| амелогенин, Х-связанный | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | АМЕЛКС | ||
| Альт. символы | АМГ,АИХ1 | ||
| ген NCBI | 265 | ||
| HGNC | 461 | ||
| МОЙ БОГ | 300391 | ||
| RefSeq | НМ_001142 | ||
| ЮниПрот | Q99217 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | Х р22.3-р22.1 | ||
| |||
| амелогенин, Y-связанный | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | КОТОРЫЙ | ||
| Альт. символы | АМГЛ | ||
| ген NCBI | 266 | ||
| HGNC | 462 | ||
| МОЙ БОГ | 410000 | ||
| RefSeq | НМ_001143 | ||
| ЮниПрот | Q99218 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | Хр. Да , стр. 11 | ||
| |||
Амелогенины представляют собой группу изоформ белка, получаемых путем альтернативного сплайсинга или протеолиза из гена AMELX на Х-хромосоме , а также гена AMELY у мужчин на Y-хромосоме . [ 1 ] Они участвуют в амелогенезе , развитии эмали . [ 2 ] Амелогенины представляют собой тип белков внеклеточного матрикса , которые вместе с амелобластинами , эмалинами и тафтелинами направляют минерализацию эмали с образованием высокоорганизованного матрикса из палочек , межстержневых кристаллов и белков.
Хотя точная роль амелогенина(ов) в регуляции процесса минерализации неизвестна, известно, что амелогенины присутствуют в изобилии во время амелогенеза. Развивающаяся эмаль человека содержит около 70% белка, 90% из которых составляют амелогенины.
Функция
[ редактировать ]Считается, что амелогенины участвуют в организации эмалевых стержней во время развития зубов . Последние исследования показывают, что эти белки регулируют зарождение и рост кристаллов гидроксиапатита во время минерализации эмали. Кроме того, амелогенины, по-видимому, способствуют развитию цемента , направляя цементобласты к поверхности корня зуба.
Варианты
[ редактировать ]амелогенина Ген наиболее широко изучен у человека, где он представляет собой однокопийный ген, расположенный на X- и Y-хромосомах в местах Xp22.1–Xp22.3 и Yp 11.2 [5]. [ 3 ] Расположение гена амелогенина на половых хромосомах влияет на изменчивость как между формой Х-хромосомы ( AMELX ) и формой Y-хромосомы ( AMELY ), так и между аллелями AMELY среди разных популяций. Это связано с тем, что AMELY существует в нерекомбинирующей области хромосомы Y, эффективно изолируя ее от нормального давления отбора . Другие источники вариаций амелогенина возникают из-за различных изоформ AMELX, полученных в результате альтернативного сплайсинга транскриптов мРНК. Конкретная роль изоформ еще не установлена. Среди других организмов амелогенин хорошо консервативен среди плакучих и имеет гомологи у однопроходных , рептилий и амфибий.
Применение при определении пола
[ редактировать ]Различия между версиями гена амелогенина для Х-хромосомы и Y-хромосомы (AMELX и AMELY соответственно) позволяют использовать его для определения пола неизвестных образцов человека. Интрон 1 AMELX содержит делецию из 6 пар оснований относительно интрона 1 AMELY . Это можно легко обнаружить с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) интрона 1 с последующим гель-электрофорезом . Две полосы ДНК с длиной 555 п.н. и 371 п.н. разрешаются, если присутствуют обе версии гена AMELX и AMELY (т. е. образец взят от мужчины), или одна полоса ДНК с длиной 555 п.н., если только версия AMELX. присутствует (т.е. образец взят от женщины). [ 4 ]
Однако из-за различий AMELY среди отдельных людей и популяций этот метод определения пола не является точным на 100%. Мутация в областях интрона 1 AMELY, обычно используемых в качестве сайтов отжига праймеров, может привести к отключению ПЦР-амплификации. длиной 6 пар оснований Вставка в интрон 1 AMELY приводит к образованию ампликона, идентичного по длине длине AMELX. У некоторых мужчин AMELY может быть полностью удалена. В любом из этих случаев во время гель-электрофореза продуктов ПЦР визуализируется только одна полоса, что приводит к ошибочной идентификации образца как женского. [ 4 ] Уровень ошибочной идентификации может варьироваться в зависимости от группы населения, но в целом он кажется низким. В одном исследовании, проведенном в Испании, тест на определение пола амелогенина с использованием полос AMELX (977 бит в секунду) и AMELY (790 бит в секунду) был проведен для 1224 человек известного пола с точностью 99,84% (1222/1224). [ 5 ] Однако другое исследование, проведенное в Индии, показало, что 5 из 270 обследованных мужчин (1,85%) обладали делецией AMELY, что назвало их «мужчинами с делетированным амелогенином» (DAM). В ответ авторы предположили, что, хотя половой тест на амелогенин в целом может быть точным, другие маркеры Y-хромосомы, такие как SRY , STR или 50f2, могут использоваться для менее двусмысленной идентификации пола. [ 6 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации AMELX могут вызвать несовершенный амелогенез — нарушение развития зубной эмали. [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Бансал, Аджай Кумар; Шетти, Деви Чаран; Биндал, Ручи; Патхак, Апарна (2012). «Амелогенин: новый белок, имеющий разнообразные применения в генетическом и молекулярном профилировании» . Журнал патологии полости рта и челюстно-лицевой области . 16 (3): 395–399. дои : 10.4103/0973-029X.102495 . ISSN 0973-029X . ПМК 3519216 . ПМИД 23248473 .
- ^ Амелогенин в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH).
- ^ Накахори Ю., Такенака О., Накагоме Ю. (1991). «Гомологичная область XY человека кодирует амелогенин » Геномика . 9 (2): 264–9. дои : 10.1016/0888-7543(91) 90251-9 ПМИД 2004775 .
- ^ Перейти обратно: а б Кашьяп В.К., Саху С., Ситалаксими Т., Триведи Р. (2006). «Делеции во фрагменте гена амелогенина, производного от Y, в индийской популяции» . БМК Мед Генет . 7:37 . дои : 10.1186/1471-2350-7-37 . ПМЦ 1458324 . ПМИД 16603093 .
- ^ Франсес Ф, Портолес О, Гонсалес ХИ, Колтель О, Верду Ф, Кастельо А, Корелла Д (2007). «Амелогениновый тест: от криминалистики к контролю качества в клинической и биохимической геномике». Клин Чим Акта . 386 (1–2): 53–6. doi : 10.1016/j.cca.2007.07.020 . ПМИД 17716640 .
- ^ Тангарадж К., Редди А.Г., Сингх Л. (2002). «Надежен ли ген амелогенина для определения пола в судебно-медицинской экспертизе и пренатальной диагностике?». Int J Legal Med . 116 (2): 121–3. дои : 10.1007/s00414-001-0262-y . ПМИД 12056520 . S2CID 33160466 .
- ^ Райт Дж.Т. (декабрь 2006 г.). «Молекулярная этиология и связанные с ней фенотипы несовершенного амелогенеза» . Американский журнал медицинской генетики, часть A. 140 (23): 2547–55. дои : 10.1002/ajmg.a.31358 . ПМК 1847600 . ПМИД 16838342 .