H2AFY

МАКРОХ2А1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1U35, 1ZR3, 1ZR5, 2F8N, 2FXK, 3HQH, 3HSV, 3IID, 3IIF, 3IVB, 5IIT
Идентификаторы
Псевдонимы	MACROH2A1 , H2A.y, H2A/y, H2AF12M, H2AFJ, MACROH2A1.1, mH2A1, macroH2A1.2, член семейства гистонов H2A Y, H2AFY, гистон macroH2A.1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 610054 ; МГИ : 1349392 ; Гомологен : 3598 ; GeneCards : MACROH2A1 ; OMA : MACROH2A1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 5 (human) Band 5q31.1 Start 135,334,381 bp End 135,399,914 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 13 (mouse) Band 13|13 B1 Start 56,221,432 bp End 56,284,174 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in epithelium of nasopharynx monocyte mucosa of pharynx human penis trabecular bone ganglionic eminence buccal mucosa cell amniotic fluid palpebral conjunctiva lower lobe of lung Top expressed in saccule otic vesicle Rostral migratory stream otic placode internal carotid artery somite ventricular zone ganglionic eminence mandibular prominence maxillary prominence More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein kinase binding rDNA binding protein serine/threonine kinase inhibitor activity RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding chromatin binding double-stranded methylated DNA binding protein heterodimerization activity RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding core promoter sequence-specific DNA binding DNA binding chromatin DNA binding enzyme binding protein binding nucleosomal DNA binding promoter-specific chromatin binding Cellular component extracellular exosome ESC/E(Z) complex nucleolus condensed chromosome chromosome pericentric heterochromatin nucleosome nucleus nuclear chromosome sex chromatin Barr body chromatin Biological process negative regulation of histone H3-K4 methylation regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly dosage compensation negative regulation of cell cycle G2/M phase transition epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation regulation of cell growth positive regulation of keratinocyte differentiation negative regulation of protein serine/threonine kinase activity negative regulation of transcription by RNA polymerase II nucleosome assembly negative regulation of protein localization to chromosome, telomeric region negative regulation of gene expression, epigenetic negative regulation of histone H3-K27 methylation regulation of gene expression, epigenetic positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion establishment of protein localization to chromatin negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I regulation of lipid metabolic process regulation of response to oxidative stress negative regulation of response to oxidative stress positive regulation of response to oxidative stress chromatin organization Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 9555 26914 Вместе ENSG00000113648 ENSMUSG00000015937 ЮниПрот О75367 Q9QZQ8 RefSeq (мРНК) НМ_001040158 НМ_004893 НМ_138609 НМ_138610 НМ_001159513 НМ_001159514 НМ_001159515 НМ_012015 RefSeq (белок) НП_001035248 НП_004884 НП_613075 НП_613258 НП_001152985 НП_001152986 НП_001152987 НП_036145 Местоположение (UCSC) Chr 5: 135,33 – 135,4 Мб Чр 13: 56,22 – 56,28 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Коровый гистон макро-H2A.1 представляет собой белок , который у человека кодируется H2AFY геном .

Функция

Гистоны — основные ядерные белки , отвечающие за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот . Нуклеосомы состоят примерно из 146 пар оснований ДНК, обернутых вокруг октамера гистонов, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Хроматиновое . волокно дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка Этот ген кодирует члена семейства гистонов H2A. Он заменяет обычные гистоны H2A в подмножестве нуклеосом, где подавляет транскрипцию и участвует в стабильной инактивации Х-хромосомы . Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. Экспрессия этих изоформ связана с некоторыми видами рака, такими как гепатоцеллюлярная карцинома.

Дальнейшее чтение

• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (май 1998 г.). «Транскрипционная активация встроенного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2535–44. дои : 10.1128/mcb.18.5.2535 . ПМК   110633 . ПМИД   9566873 .
• Костанци С., Персон-младший (июнь 1998 г.). «Гистон макроH2A1 сконцентрирован в неактивной Х-хромосоме самок млекопитающих». Природа . 393 (6685): 599–601. Бибкод : 1998Natur.393..599C . дои : 10.1038/31275 . ПМИД   9634239 . S2CID   205001095 .
• Чжан QH, Е М, Ву XY, Рен SX, Чжао М, Чжао CJ, Фу Г, Шен Ю, Фань ХИ, Лу Г, Чжун М, Сюй XR, Хань ZG, Чжан JW, Тао Дж, Хуан QH, Чжоу Дж , Ху GX, Гу J, Чен SJ, Чен Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК   310934 . ПМИД   11042152 .
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П., Ван Л., Доннелли Р., Уэйд Дж.Д., Ламберт П., Ли Х., Ли К.Г., Кашанчи Ф. (ноябрь 2000 г.). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP/P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с основными гистонами» . Вирусология . 277 (2): 278–95. дои : 10.1006/виро.2000.0593 . ПМИД   11080476 .
• Чедвик Б.П., Уиллард Х.Ф. (май 2001 г.). «Варианты гистонов H2A и неактивная Х-хромосома: идентификация второго варианта макроH2A» . Молекулярная генетика человека . 10 (10): 1101–13. дои : 10.1093/hmg/10.10.1101 . ПМИД   11331621 .
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С., Ван Л., Ли Х., Ли К.Г., Доннелли Р., Уэйд Дж.Д., Ламберт П., Кашанчи Ф (октябрь 2001 г.). «Усиление активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина» . Вирусология . 289 (2): 312–26. дои : 10.1006/виро.2001.1129 . ПМИД   11689053 .
• Чедвик BP, Уиллард HF (июнь 2002 г.). «Зависимая от клеточного цикла локализация макроH2A в хроматине неактивной Х-хромосомы» . Журнал клеточной биологии . 157 (7): 1113–23. дои : 10.1083/jcb.200112074 . ПМК   2173542 . ПМИД   12082075 .
• Такахаши И., Камеока Ю., Хасимото К. (август 2002 г.). «MacroH2A1.2 связывает ядерный белок Spop». Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1591 (1–3): 63–8. дои : 10.1016/S0167-4889(02) 00249-5 ПМИД   12183056 .
• Ганесан С, Сильвер Д.П., Гринберг Р.А., Авни Д., Драпкин Р., Мирон А., Мок СК, Рандрианарисон В., Броди С., Салстром Дж., Расмуссен Т.П., Климке А., Маррезе К., Мараренс Ю., Денг С.Х., Фойнтеун Дж., Ливингстон Д.М. (ноябрь 2002 г.). «BRCA1 поддерживает концентрацию РНК XIST на неактивной Х-хромосоме» . Клетка . 111 (3): 393–405. дои : 10.1016/S0092-8674(02)01052-8 . ПМИД   12419249 . S2CID   372211 .
• Ангелов Д., Молла А., Перш П.Ю., Ханс Ф., Коте Ж., Хохбин С., Буве П., Димитров С. (апрель 2003 г.). «Вариант гистона macroH2A препятствует связыванию транскрипционных факторов и ремоделированию нуклеосом SWI/SNF» . Молекулярная клетка . 11 (4): 1033–41. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00100-X . ПМИД   12718888 .
• Берендс У, Шнайдер И, Рёсслер С, Фрауенкнехт Х, Гольбек А, Лехнер Б, Эйгенштеттер Г, Зобивальски С, Мюллер-Вайхрих С, Граубнер У, Шмид И, Сакерер Д, Шпет М, Гетц С, Прантл Ф, Асмусс Х.П., Бисе К., Маутнер Дж. (август 2003 г.). «Новые опухолевые антигены, выявленные с помощью скрининга аутологичных антител в библиотеках кДНК детской медуллобластомы» . Международный журнал рака . 106 (2): 244–51. дои : 10.1002/ijc.11208 . ПМИД   12800201 . S2CID   36836051 .
• Лусич М., Марчелло А., Серезето А., Джакка М. (декабрь 2003 г.). «Регуляция экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования факторов на промоторе LTR» . Журнал ЭМБО . 22 (24): 6550–61. дои : 10.1093/emboj/cdg631 . ПМК   291826 . ПМИД   14657027 .
• Асин-Перес Р., Байона-Бафалуй М.П., ​​Фернандес-Сильва П., Морено-Лошуэртос Р., Перес-Мартос А., Бруно С., Мораес К.Т., Энрикес Х.А. (март 2004 г.). «Дыхательный комплекс III необходим для поддержания комплекса I в митохондриях млекопитающих» . Молекулярная клетка . 13 (6): 805–15. дои : 10.1016/S1097-2765(04)00124-8 . ПМК   3164363 . ПМИД   15053874 .
• Чжан Р., Пустовойтов М.В., Йе Х, Сантос Х.А., Чен В., Даганзо С.М., Эрцбергер Дж.П., Серебрянский И.Г., Канутеску А.А., Данбрек Р.Л., Персон Дж.Р., Бергер Дж.М., Кауфман П.Д., Адамс П.Д. (январь 2005 г.). «Формирование MacroH2A-содержащих фокусов гетерохроматина, связанных со старением, и старение, управляемое ASF1a и HIRA» . Развивающая клетка . 8 (1): 19–30. дои : 10.1016/j.devcel.2004.10.019 . ПМИД   15621527 .
• Эрнандес-Муньос И., Лунд А.Х., ван дер Ступ П., Бутсма Э., Мюйрерс И., Верховен Е., Нусинов Д.А., Паннинг Б., Мараренс Ю., ван Лохуизен М. (май 2005 г.). «Стабильная инактивация Х-хромосомы включает комплекс PRC1 Polycomb и требует гистона MACROH2A1 и лигазы убиквитина E3 CULLIN3/SPOP» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (21): 7635–40. дои : 10.1073/pnas.0408918102 . ПМК   1140410 . ПМИД   15897469 .
• Юдинкова Е.С., Барат А, Пичугин А, Маркова Е, Скляр И, Пирожкова И, Робин С, Липинский М, Огрызко В, Васецкий ЮС, Разин СВ (2012). «Четкое распределение эктопически экспрессируемых вариантов гистонов H2A.Bbd и MacroH2A в открытых и закрытых доменах хроматина» . ПЛОС ОДИН . 7 (10): е47157. Бибкод : 2012PLoSO...747157I . дои : 10.1371/journal.pone.0047157 . ПМК   3484066 . ПМИД   23118866 .

Внешние ссылки

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для макроса гистона ядра человека H2A.1.