ТМЛХЭ

ТМЛХЭ
Идентификаторы
Псевдонимы	TMLHE , AUTSX6, BBOX2, TMLD, TMLH, TMLHED, XAP130, D430017M14Rik, триметиллизингидроксилаза, эпсилон
Внешние идентификаторы	Опустить : 300777 ; МГИ : 2180203 ; Гомологен : 21853 ; GeneCards : TMLHE ; ОМА : TMLHE — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	155,719,098 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skeletal muscle tissue; ; muscle of thigh; ; gastrocnemius muscle; ; blood; ; left ventricle; ; monocyte; ; islet of Langerhans; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; smooth muscle tissue;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	iron ion binding; oxidoreductase activity; oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen; metal ion binding; dioxygenase activity; trimethyllysine dioxygenase activity; protein binding;
Cellular component	mitochondrial matrix; mitochondrion;
Biological process	negative regulation of oxidoreductase activity; carnitine biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55217
	192289
	ENSG00000185973
	ENSMUSG00000079834
	Q9NVH6
	Q91ZE0
	НМ_001184797 ; НМ_018196
	НМ_138758
	НП_001171726 ; НП_060666
	НП_620097
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Триметиллизиндиоксигеназа, митохондриальная, представляет собой фермент , который у человека кодируется TMLHE геном в хромосоме X. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Мутации в гене TMLHE , приводящие к нарушению биосинтеза карнитина , связаны с симптомами аутизма. ^{[ 7 ]}

Структура

Ген TMHLE расположен на крайнем конце региона Xq28 с высокой геномной нестабильностью. ^{[ 8 ]} и кодирует протеин триметиллизиндиоксигеназу, альфа-, Fe2+ и 2-оксоглитарат-зависимую гидролазу негемового железа, локализованную в митохондриальном матриксе . ^{[ 9 ]}

Функция

Фермент триметиллизиндиоксигеназа катализирует первый этап пути биосинтеза карнитина . ^{[ 9 ]} который участвует в биосинтезе аминов. Карнитин — это молекула, которая играет важную роль в транспортировке активированных жирных кислот через внутреннюю мембрану митохондрий , где они метаболизируются. Кодируемый белок превращает триметиллизин в гидрокситриметиллизин по реакции (EC 1.14.11.8):

N ₆ ,N ₆ ,N(6)-триметил-L-лизин + 2-оксоглутарат + O ₂ = 3-гидрокси-N ₆ ,N ₆ ,N(6)-триметил-L-лизин + сукцинат + CO ₂ .

и требует железа и L- аскорбата в качестве сопутствующих факторов .

Клиническое значение

Мутации в гене TMLHE вызывают дефицит эпсилон-триметиллизингидроксилазы (TMLHED). ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} врожденная ошибка метаболизма при биосинтезе карнитина , которая может увеличить риск развития нарушений нервного развития , поведения, связанного с аутизмом , и расстройств аутистического спектра . ^{[ 12 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TMLHE имеет 14 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 12 кокомплексных взаимодействий. TMLHE, по-видимому, взаимодействует с SUGCT. ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185973 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Рогнер Калифорнийский университет, Хейсс Н.С., Киошис П., Виманн С., Корн Б., Пустка А. (октябрь 1996 г.). «Транскрипционный анализ области-кандидата пигментного недержания (IP2) в Xq28» . Геномные исследования . 6 (10): 922–34. дои : 10.1101/гр.6.10.922 . ПМИД 8908511 .
^ Ваз FM, Офман Р., Вестинга К., Бэк Дж.В., Вандерс Р.Дж. (сентябрь 2001 г.). «Молекулярная и биохимическая характеристика крысиной эпсилон-N-триметиллизингидроксилазы, первого фермента биосинтеза карнитина» . Журнал биологической химии . 276 (36): 33512–7. дои : 10.1074/jbc.M105929200 . ПМИД 11431483 .
^ «Ген Энтрез: триметиллизингидроксилаза TMLHE, эпсилон» .
^ Jump up to: ^а ^б Зиатс М.Н., Комо М.С., Ян Й., Скалья Ф., Элси Ш., Сан К., Боде А.Л., Шааф К.П. (сентябрь 2015 г.). «Улучшение симптомов регрессивного аутизма у ребенка с дефицитом TMLHE после приема карнитина». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 167А (9): 2162–7. дои : 10.1002/ajmg.a.37144 . ПМИД 25943046 . S2CID 205320608 .
^ Монфрегола Дж., Наполитано Дж., Конте I, Чевенини А., Мильяччо С., Д'Урсо М., Урсини М.В. (2007). «Функциональная характеристика гена TMLH: анализ промотора, гибридизация in situ, идентификация и картирование альтернативных вариантов сплайсинга». Джин . 395 (1–2): 86–97. дои : 10.1016/j.gene.2007.02.012 . ПМИД 17408883 .
^ Jump up to: ^а ^б Монфрегола Дж., Чевенини А., Терраччано А., ван Влис Н., Арбуччи С., Вандерс Р.Дж., Д'Урсо М., Ваз FM, Урсини М.В. (2005). «Функциональный анализ вариантов TMLH и определение доменов, необходимых для каталитической активности и нацеливания на митохондрии». Дж. Селл. Физиол . 204 (3): 839–47. дои : 10.1002/jcp.20332 . ПМИД 15754339 . S2CID 25224767 .
^ Селестино-Сопер П.Б., Шоу К.А., Сандерс С.Дж., Ли Дж., Мурта М.Т., Эркан-Сенчичек А.Г., Дэвис Л., Томсон С., Гамбин Т., Чайно АС, Оу З., Герман Дж.Р., Милосавлевич А., Сатклифф Дж.С., Кук Э.Х., Станкевич П., Государственный МВт, Боде А.Л. (2011). «Использование массива CGH для обнаружения вариантов количества экзонных копий по всему геному в семьях с аутизмом обнаруживает новую делецию в TMLHE» . Хм. Мол. Жене . 20 (22): 4360–70. дои : 10.1093/hmg/ddr363 . ПМК 3196886 . ПМИД 21865298 .
^ Нава С, Ламари Ф, Эрон Д, Миньо С, Растеттер А, Керен Б, Коэн Д, Фоде А, Бутейллер Д, Жилерон М, Жакетт А, Уэлен С, Афенжар А, Перисс Д, Лоран С, Дюпюи С, Готье С , Жерар М, Юге Ж, Кайе С, Лехеп Б, Лебуайе М, Гиллберг С, Делорм Р, Бургерон Т., Брайс А., Депьен С. (2012). «Анализ экзома X-хромосомы у пациентов с расстройствами аутистического спектра выявил новые гены-кандидаты, включая TMLHE» . Перевод Психиатрия . 2 (10): е179. дои : 10.1038/tp.2012.102 . ПМК 3565810 . ПМИД 23092983 .
^ «Запись OMIM — # 300872 — АУТИЗМ, Восприимчивость к X-LINKED 6; AUTSX6» .
^ «По поисковому запросу TMLHE найдено 14 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

Дальнейшее чтение

Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Отчеты ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Монфрегола Дж., Чевенини А., Терраччано А., ван Влис Н., Арбуччи С., Вандерс Р.Дж., Д'Урсо М., Ваз FM, Урсини М.В. (сентябрь 2005 г.). «Функциональный анализ вариантов TMLH и определение доменов, необходимых для каталитической активности и нацеливания на митохондрии». Журнал клеточной физиологии . 204 (3): 839–47. дои : 10.1002/jcp.20332 . ПМИД 15754339 . S2CID 25224767 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., Дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Монфрегола Дж., Наполитано Дж., Конте I, Чевенини А., Мильяччо С., Д'Урсо М., Урсини М.В. (июнь 2007 г.). «Функциональная характеристика гена TMLH: анализ промотора, гибридизация in situ, идентификация и картирование альтернативных вариантов сплайсинга». Джин . 395 (1–2): 86–97. дои : 10.1016/j.gene.2007.02.012 . ПМИД 17408883 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185973 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8908511-4] Рогнер Калифорнийский университет, Хейсс Н.С., Киошис П., Виманн С., Корн Б., Пустка А. (октябрь 1996 г.). «Транскрипционный анализ области-кандидата пигментного недержания (IP2) в Xq28» . Геномные исследования . 6 (10): 922–34. дои : 10.1101/гр.6.10.922 . ПМИД 8908511 .

[pmid11431483-5] Ваз FM, Офман Р., Вестинга К., Бэк Дж.В., Вандерс Р.Дж. (сентябрь 2001 г.). «Молекулярная и биохимическая характеристика крысиной эпсилон-N-триметиллизингидроксилазы, первого фермента биосинтеза карнитина» . Журнал биологической химии . 276 (36): 33512–7. дои : 10.1074/jbc.M105929200 . ПМИД 11431483 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: триметиллизингидроксилаза TMLHE, эпсилон» .

[:0-7] Jump up to: ^а ^б Зиатс М.Н., Комо М.С., Ян Й., Скалья Ф., Элси Ш., Сан К., Боде А.Л., Шааф К.П. (сентябрь 2015 г.). «Улучшение симптомов регрессивного аутизма у ребенка с дефицитом TMLHE после приема карнитина». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 167А (9): 2162–7. дои : 10.1002/ajmg.a.37144 . ПМИД 25943046 . S2CID 205320608 .

[8] Монфрегола Дж., Наполитано Дж., Конте I, Чевенини А., Мильяччо С., Д'Урсо М., Урсини М.В. (2007). «Функциональная характеристика гена TMLH: анализ промотора, гибридизация in situ, идентификация и картирование альтернативных вариантов сплайсинга». Джин . 395 (1–2): 86–97. дои : 10.1016/j.gene.2007.02.012 . ПМИД 17408883 .

[ReferenceA-9] Jump up to: ^а ^б Монфрегола Дж., Чевенини А., Терраччано А., ван Влис Н., Арбуччи С., Вандерс Р.Дж., Д'Урсо М., Ваз FM, Урсини М.В. (2005). «Функциональный анализ вариантов TMLH и определение доменов, необходимых для каталитической активности и нацеливания на митохондрии». Дж. Селл. Физиол . 204 (3): 839–47. дои : 10.1002/jcp.20332 . ПМИД 15754339 . S2CID 25224767 .

[10] Селестино-Сопер П.Б., Шоу К.А., Сандерс С.Дж., Ли Дж., Мурта М.Т., Эркан-Сенчичек А.Г., Дэвис Л., Томсон С., Гамбин Т., Чайно АС, Оу З., Герман Дж.Р., Милосавлевич А., Сатклифф Дж.С., Кук Э.Х., Станкевич П., Государственный МВт, Боде А.Л. (2011). «Использование массива CGH для обнаружения вариантов количества экзонных копий по всему геному в семьях с аутизмом обнаруживает новую делецию в TMLHE» . Хм. Мол. Жене . 20 (22): 4360–70. дои : 10.1093/hmg/ddr363 . ПМК 3196886 . ПМИД 21865298 .

[11] Нава С, Ламари Ф, Эрон Д, Миньо С, Растеттер А, Керен Б, Коэн Д, Фоде А, Бутейллер Д, Жилерон М, Жакетт А, Уэлен С, Афенжар А, Перисс Д, Лоран С, Дюпюи С, Готье С , Жерар М, Юге Ж, Кайе С, Лехеп Б, Лебуайе М, Гиллберг С, Делорм Р, Бургерон Т., Брайс А., Депьен С. (2012). «Анализ экзома X-хромосомы у пациентов с расстройствами аутистического спектра выявил новые гены-кандидаты, включая TMLHE» . Перевод Психиатрия . 2 (10): е179. дои : 10.1038/tp.2012.102 . ПМК 3565810 . ПМИД 23092983 .

[12] «Запись OMIM — # 300872 — АУТИЗМ, Восприимчивость к X-LINKED 6; AUTSX6» .

[13] «По поисковому запросу TMLHE найдено 14 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]