Fhod1

Fhod1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3DAD
Идентификаторы
Псевдонимы	Food1 , Food, Formin Homology 2 Domain Stress 1
Внешние идентификаторы	Омим : 606881 ; MGI : 2679008 ; Гомологен : 40860 ; GeneCards : Fhod1 ; OMA : FHOD1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	67,247,481 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	106,074,585 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	spleen; ; gastrocnemius muscle; ; upper lobe of left lung; ; muscle of thigh; ; right lung; ; apex of heart; ; granulocyte; ; right lobe of thyroid gland; ; glutes; ; right adrenal cortex;
	Top expressed in
	granulocyte; ; inner renal medulla; ; glomerulus; ; left lung lobe; ; muscle of thigh; ; neural layer of retina; ; upper arm; ; knee joint; ; body of femur; ; skeletal muscle tissue;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	actin binding; protein binding; identical protein binding; protein domain specific binding; protein self-association;
Cellular component	cell projection; bleb; membrane; nucleus; cytoskeleton; stress fiber; cytoplasm; cytosol; intercalated disc;
Biological process	positive regulation of stress fiber assembly; nuclear migration; establishment of centrosome localization; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of stress fiber assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	29109
	234686
	ENSG00000135723
	Ensmusg00000014778
	Q9Y613
	Q6P9Q4
	NM_013241 ; NM_001318202
	NM_177699
	NP_001305131 ; NP_037373
	NP_808367
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Домен FH1/FH2-содержащий белок 1 является белком , который у людей кодируется FHOD1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует белок, который является членом форман семейства белков /диафан. Ген повсеместно экспрессируется, но находится в изобилии в селезенке. Кодированный белок имеет гомологию последовательности с диафанными и формами белков в доменах гомологии формина (FH) 1 и FH2. Он также содержит домен с спиральной катушкой, коллагеновый домен, два сигнала ядерной локализации и несколько потенциальных сайтов фосфорилирования PKC и PKA . Это преимущественно цитоплазматический белок и экспрессируется в различных клеточных линиях человека . ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что FHOD1 взаимодействует с Rac1 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000135723 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000014778 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Westendorf JJ, Mernaugh R, Hiebert SW (май 1999). «Идентификация и характеристика белка, содержащего домены гомологии формана (FH1/FH2)». Ген . 232 (2): 173–82. doi : 10.1016/s0378-1119 (99) 00127-4 . PMID 10352228 .
^ Boehm MB, Milius TJ, Zhou Y, Westendorf JJ, Koka S (октябрь 2005 г.). «Формин млекопитающего Fhod1 взаимодействует с киназой ERK Map Pathway». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 335 (4): 1090–4. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.07.191 . PMID 16112087 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Fhod1 Formin Homology 2 домен, содержащий 1» .
^ Westendorf JJ (декабрь 2001 г.). «FHOS FHOS, связанный с формами/диафунистом, взаимодействует с RAC1 и активирует транскрипцию из элемента ответа сыворотки» . Журнал биологической химии . 276 (49): 46453–9. doi : 10.1074/jbc.m105162200 . PMID 11590143 .

Дальнейшее чтение

Westendorf JJ (декабрь 2001 г.). «FHOS FHOS, связанный с формами/диафунистом, взаимодействует с RAC1 и активирует транскрипцию из элемента ответа сыворотки» . Журнал биологической химии . 276 (49): 46453–9. doi : 10.1074/jbc.m105162200 . PMID 11590143 .
Koka S, Neudauer CL, Li X, Lewis RE, McCarthy JB, Westendorf JJ (май 2003 г.). «Белок, содержащий домен, содержащий форман FMOLOGIONG FHOD1 усиливает клеточную миграцию» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 9): 1745–55. doi : 10.1242/jcs.00386 . PMID 12665555 .
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белка с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nature Biotechnology . 21 (5): 566–9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
Tojo H, Kaieda I, Thief H, Katayama N, Yhimura K, Kakimoto S, et al. (Июль 2003 г.). «Семейный белок Form, образующий гомолог, сверхэкспрессированный в Spley, взаимодействует с инсулино-чувствительной аминопептидазой и профилин IIA» Молекулярная эндокринология 17 (7): 1216–2 Doi : 10.1210/ me.2003-0 12677009PMID
Takeya R, Sumimoto H (ноябрь 2003 г.). «FHOS, форман млекопитающего, напрямую связывается с F-актином через регион N-терминал с доменом FH1 и образует гомотипический комплекс через домен FH2, чтобы способствовать формированию актиновых волокон». Журнал сотовой науки . 116 (Pt 22): 4567–75. doi : 10.1242/jcs.00769 . PMID 14576350 . S2CID 25675089 .
Lehner B, Semple Ji, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двухгибридной системы дрожжей и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области MHC класса III человека». Геномика . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/s0888-7543 (03) 00235-0 . PMID 14667819 .
Като М, Като М (апрель 2004 г.). «Идентификация и характеристика гена FHOD3 человека в Silico». Международный журнал молекулярной медицины . 13 (4): 615–20. doi : 10.3892/ijmm.13.4.615 . PMID 15010865 .
Wang Y, El-Zaru MR, Surks HK, Mendelsohn Me (июнь 2004 г.). «Белок домена гомологии формана (FHOD1) является циклическим GMP-зависимым белком протеинкиназы I и субстратом в клетках гладких мышц сосудов» . Журнал биологической химии . 279 (23): 24420–6. doi : 10.1074/jbc.m313823200 . PMID 15051728 .
Westendorf JJ, Koka S (май 2004 г.). «Идентификация FHOD1-связывающих белков и механизмов динамики актина, регулируемой FHOD1». Журнал сотовой биохимии . 92 (1): 29–41. doi : 10.1002/jcb.20031 . PMID 15095401 . S2CID 40202935 .
Gill MB, Roecklein-Canfield J, Sage DR, Zambela-Soediono M, Longtine N, Uknis M, Fingeroth JD (июнь 2004 г.). «Прикрепление EBV стимулирует перераспределение FHOS/FHOD1 и коаггрегацию с CD21: формамин взаимодействия с цитоплазматическим доменом человеческого CD21» . Журнал сотовой науки . 117 (Pt 13): 2709–20. doi : 10.1242/jcs.01113 . PMID 15138285 .
Бранденбергер Р., Вей Х, Чжан С., Лей С., Мураж Дж., Фиск Г.Дж. и др. (Июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома выясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку человеческих клеток». Nature Biotechnology . 22 (6): 707–16. doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
Lehner B, Sanderson CM (июль 2004 г.). «Структура взаимодействия белка для деградации мРНК человека» . Исследование генома . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, et al. (Август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Мадрид Р., Гастиер Дж., Бушт Дж., Шредер С., Гейер М., Беничо С., Факлер ОТ (январь 2005 г.). «Олигомеризация диафанового Fmin Fhod1 требует мотива с спиральной катушкой, критическим для его цитоскелетной и транскрипционной активности». Письма Febs . 579 (2): 441–8. doi : 10.1016/j.febslet.2004.12.009 . PMID 15642356 . S2CID 23740212 .
Gasteer JE, Schroeder S, Muranyi W, Madrid R, Benichou S, Fackler OT (май 2005 г.). «FHOD1 координирует актиновую нить и выравнивание микротрубочек, чтобы опосредовать удлинение клеток». Экспериментальные исследования клеток . 306 (1): 192–202. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.02.006 . PMID 15878344 .
Schönichen A, Alexander M, Gastier JE, Cuesta FE, Fackler OT, Geyer M (февраль 2006 г.). «Биохимическая характеристика диафанозного ауторегуляторного взаимодействия в белке гомологии формана Fhod1» . Журнал биологической химии . 281 (8): 5084–93. doi : 10.1074/jbc.m509226200 . PMID 16361249 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 16 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000135723 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000014778 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10352228-5] Westendorf JJ, Mernaugh R, Hiebert SW (май 1999). «Идентификация и характеристика белка, содержащего домены гомологии формана (FH1/FH2)». Ген . 232 (2): 173–82. doi : 10.1016/s0378-1119 (99) 00127-4 . PMID 10352228 .

[pmid16112087-6] Boehm MB, Milius TJ, Zhou Y, Westendorf JJ, Koka S (октябрь 2005 г.). «Формин млекопитающего Fhod1 взаимодействует с киназой ERK Map Pathway». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 335 (4): 1090–4. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.07.191 . PMID 16112087 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Fhod1 Formin Homology 2 домен, содержащий 1» .

[pmid11590143-8] Westendorf JJ (декабрь 2001 г.). «FHOS FHOS, связанный с формами/диафунистом, взаимодействует с RAC1 и активирует транскрипцию из элемента ответа сыворотки» . Журнал биологической химии . 276 (49): 46453–9. doi : 10.1074/jbc.m105162200 . PMID 11590143 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]