Форминс

Область гомологии формина 1
Область гомологии формина 1
Идентификаторы
Символ	Drf_FH1
Пфам	PF06346
ИнтерПро	ИПР009408
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

форма 1
форма 1
Идентификаторы
Символ	ФМН1
Альт. символы	ЛД, ФМН
ген NCBI	342184
HGNC	3768
МОЙ БОГ	136535
RefSeq	НМ_001103184
ЮниПрот	Q68DA7
Другие данные
Локус	Хр. 15 q13-q14
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Домен гомологии 2 формина

кристаллические структуры домена гомологии формина-2 демонстрируют архитектуру связанных димеров

Идентификаторы

Символ

ФХ2

1ux5 / СКОПе / СУПФАМ

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Прозрачный домен FH3

кристаллическая структура mdia1 gbd-fh3 в комплексе с rhoc-gmppnp

Идентификаторы

Символ

Drf_FH3

Пфам Клан

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Домен авторегуляции DRF

кристаллическая структура n-концевой области повтора броненосца mdia1 и домена димеризации в комплексе с ауторегуляторным доменом mdia1 (dad)

Идентификаторы

Символ

Drf_DAD

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Прозрачный домен, связывающий ГТФазу

кристаллическая структура mdia1 gbd-fh3 в комплексе с rhoc-gmppnp

Идентификаторы

Символ

Drf_GBD

Пфам Клан

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Формины (белки, гомологичные формину) представляют собой группу белков которые участвуют в полимеризации актина , и связываются с быстрорастущим концом (колючим концом) актиновых нитей. ^[2] Большинство форминов представляют собой эффекторные белки Rho-GTPase . Формины регулируют актин и микротрубочек . цитоскелет ^[3]^[4] и участвуют в различных клеточных функциях, таких как полярность клеток , цитокинез , миграция клеток и SRF транскрипционная активность . ^[5] Формины представляют собой мультидоменные белки, которые взаимодействуют с разнообразными сигнальными молекулами и белками цитоскелета , хотя некоторым форминам назначены функции внутри ядра .

Разнообразие

Формины обнаружены у всех изученных эукариот . ^[1] У человека присутствует 15 различных белков-форминов, которые разделены на 7 подгрупп. ^[6] Напротив, дрожжи содержат только 2-3 формина. ^[7]

Структура и взаимодействия

Формины характеризуются наличием трех доменов гомологии формина (FH) (FH1, FH2 и FH3), хотя члены семейства форминов не обязательно содержат все три домена. ^[8]^[9] Кроме того, обычно присутствуют и другие домены, такие как домены PDZ , DAD, WH2 или FHA.

домен Богатый пролином FH1 опосредует взаимодействие с различными белками, включая актин-связывающий белок профилин . ^[10] белки домена SH3 (Src гомология 3), ^[11] и белки домена WW . Активность форминов S. cerevisiae , способствующая нуклеации актина , локализована в домене FH2. ^[4] Домен FH2 необходим для самоассоциации форминовых белков благодаря способности доменов FH2 напрямую связывать друг друга, а также может ингибировать полимеризацию актина. ^[12]^[13] Домен FH3 менее консервативен и необходим для направления форминов в правильное внутриклеточное место, такое как митотическое веретено или кончик проекции во время конъюгации . ^[14]^[15] Кроме того, некоторые формины могут содержать GTPase -связывающий домен (GBD), необходимый для связывания с малыми GTPases Rho , и C-концевой консервативный Dia-ауторегуляторный домен (DAD). GBD представляет собой бифункциональный аутоингибирующий домен, который взаимодействует с активированными членами семейства Rho и регулируется ими. Drf3 млекопитающих содержит CRIB-подобный мотив внутри своего GBD для связывания с Cdc42 , который необходим Cdc42 для активации и направления Drf3 к коре клеток , где он реконструирует актиновый скелет. ^[16] DAD связывает N-концевой GBD; эта связь разрывается, когда Rho, связанный с GTP, связывается с GBD и активирует белок. Добавление DAD к млекопитающих клеткам индуцирует образование актиновых филаментов , стабилизирует микротрубочки и активирует транскрипцию , опосредованную SRF . ^[16] Другим часто встречающимся доменом является область повторов броненосца (ARR), расположенная в домене FH3.

показала, что домен FH2 Рентгеновская кристаллография имеет удлиненную серповидную форму, содержащую три спиральных субдомена. ^[17]^[18]

Формины также напрямую связываются с микротрубочками через свой домен FH2. Это взаимодействие важно для содействия захвату и стабилизации субпопуляции микротрубочек, ориентированных к переднему краю мигрирующих клеток. Формины также способствуют захвату микротрубочек кинетохорой во время митоза и выравниванию микротрубочек вдоль актиновых нитей. ^[19]^[20]

См. также

Формин-2

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Халкия Д., Николаидис Н., Макаловски В., Кляйн Дж., Ней М. (декабрь 2008 г.). «Происхождение и эволюция мультигенного семейства форминов, участвующего в формировании актиновых нитей» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (12): 2717–33. дои : 10.1093/molbev/msn215 . ПМК 2721555 . ПМИД 18840602 .
^ Евангелиста М., Зигмонд С., Бун С. (июль 2003 г.). «Формины: сигнальные эффекторы для сборки и поляризации актиновых нитей» . Журнал клеточной науки . 116 (Часть 13): 2603–11. дои : 10.1242/jcs.00611 . ПМИД 12775772 .
^ Ганнинг П.В., Гошдастидер Ю., Уитакер С., Попп Д., Робинсон Р.К. (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых нитей» . Журнал клеточной науки . 128 (11): 2009–19. дои : 10.1242/jcs.165563 . ПМИД 25788699 .
^ Jump up to: ^а ^б Гуд Б.Л., Эк М.Дж. (2007). «Механизм и функция форминов в контроле сборки актина». Ежегодный обзор биохимии . 76 : 593–627. doi : 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142647 . ПМИД 17373907 .
^ Фэйкс Дж., Гросс Р. (июнь 2006 г.). «Поддержание формы с помощью форминов» . Развивающая клетка . 10 (6): 693–706. дои : 10.1016/j.devcel.2006.05.001 . ПМИД 16740473 .
^ Хиггс Х.Н., Петерсон К.Дж. (январь 2005 г.). «Филогенетический анализ домена гомологии формина 2» . Молекулярная биология клетки . 16 (1): 1–13. doi : 10.1091/mbc.E04-07-0565 . ПМК 539145 . ПМИД 15509653 .
^ Баарлинк С., Брандт Д., Гросс Р. (июль 2010 г.). «Снимок: Форминс» . Клетка . 142 (1): 172–172.e1. дои : 10.1016/j.cell.2010.06.030 . ПМИД 20603022 . S2CID 2914004 .
^ Китаяма С., Уеда TQ (февраль 2003 г.). «ForC, новый тип белка семейства форминов, лишенный домена FH1, участвует в многоклеточном развитии Dictyostelium discoideum» . Журнал клеточной науки . 116 (Часть 4): 711–23. дои : 10.1242/jcs.00265 . ПМИД 12538772 .
^ Валлар Б.Дж., Альбертс А.С. (август 2003 г.). «Формины: активные каркасы, реконструирующие цитоскелет». Тенденции в клеточной биологии . 13 (8): 435–46. дои : 10.1016/S0962-8924(03)00153-3 . ПМИД 12888296 .
^ Уец П. (1997). Биохимические исследования белка деформации конечностей позвоночных: вступительная диссертация на соискание докторской степени на факультете естественных наук и математики Гейдельбергского университета Рупрехта-Карла . Биология развития, Европейская лаборатория молекулярной биологии. Гейдельберг: Европейская лаборатория молекулярной биологии.
^ Уетц П., Фумагалли С., Джеймс Д., Зеллер Р. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное взаимодействие между белками деформации конечностей (форминами) и киназами семейства Src» . Журнал биологической химии . 271 (52): 33525–30. дои : 10.1074/jbc.271.52.33525 . ПМИД 8969217 .
^ Такея Р., Сумимото Х. (ноябрь 2003 г.). «Fhos, формин млекопитающих, напрямую связывается с F-актином через N-концевую область по отношению к домену FH1 и образует гомотипический комплекс через домен FH2, способствуя образованию актиновых волокон» . Журнал клеточной науки . 116 (Часть 22): 4567–75. дои : 10.1242/jcs.00769 . ПМИД 14576350 .
^ Шимада А., Нитраи М., Веттер И.Р., Кюльманн Д., Буги Б., Нарумия С., Гивз М.А., Виттингхофер А. (февраль 2004 г.). «Основной домен FH2 прозрачных форминов представляет собой удлиненный актин-связывающий белок, который ингибирует полимеризацию» . Молекулярная клетка . 13 (4): 511–22. дои : 10.1016/S1097-2765(04)00059-0 . ПМИД 14992721 .
^ Като Т., Ватанабэ Н., Моришима Ю., Фудзита А., Ишизаки Т., Нарумия С. (февраль 2001 г.). «Локализация гомолога прозрачного белка mDia1 млекопитающих в митотическом веретене клеток HeLa». Журнал клеточной науки . 114 (Часть 4): 775–84. дои : 10.1242/jcs.114.4.775 . hdl : 2433/150544 . ПМИД 11171383 .
^ Петерсен Дж., Нильсен О., Эгель Р., Хаган И.М. (июнь 1998 г.). «FH3, домен, обнаруженный в форминах, нацеливает формин Fus1 делящихся дрожжей на кончик проекции во время конъюгации» . Журнал клеточной биологии . 141 (5): 1217–28. дои : 10.1083/jcb.141.5.1217 . ПМК 2137179 . ПМИД 9606213 .
^ Jump up to: ^а ^б Пэн Дж., Валлар Б.Дж., Фландерс А., Святек П.Дж., Альбертс А.С. (апрель 2003 г.). «Нарушение гена формы Drf1, связанного с диафаном, кодирующего mDia1, раскрывает роль Drf3 как эффектора для Cdc42» . Современная биология . 13 (7): 534–45. Бибкод : 2003CBio...13..534P . дои : 10.1016/S0960-9822(03)00170-2 . ПМИД 12676083 . S2CID 13902104 .
^ Сюй Ю, Мозли Дж.Б., Сагот И., Пой Ф., Пеллман Д., Гуд Б.Л., Эк М.Дж. (март 2004 г.). «Кристаллические структуры домена Formin Homology-2 демонстрируют архитектуру связанного димера» . Клетка . 116 (5): 711–23. дои : 10.1016/S0092-8674(04)00210-7 . ПМИД 15006353 . S2CID 15855545 .
^ Томпсон М.Э., Хеймсат Э.Г., Говен Т.Дж., Хиггс Х.Н., Кулл Ф.Дж. (январь 2013 г.). «Структура FMNL3 FH2-актина дает представление о формин-опосредованном зарождении и элонгации актина» . Структурная и молекулярная биология природы . 20 (1): 111–8. дои : 10.1038/nsmb.2462 . ПМЦ 3876896 . ПМИД 23222643 .
^ Палаццо А.Ф., Кук Т.А., Альбертс А.С., Гундерсен Г.Г. (август 2001 г.). «mDia опосредует Rho-регулируемое образование и ориентацию стабильных микротрубочек». Природная клеточная биология . 3 (8): 723–9. дои : 10.1038/35087035 . ПМИД 11483957 . S2CID 7374170 .
^ Бартолини Ф., Гундерсен Г.Г. (февраль 2010 г.). «Формины и микротрубочки» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1803 (2): 164–73. дои : 10.1016/j.bbamcr.2009.07.006 . ПМЦ 2856479 . ПМИД 19631698 .

Внешние ссылки

MBInfo - Формин-опосредованная нуклеация актина

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR010472.

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR015425.

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR010465.

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR010473.

[Chalkia-1] Jump up to: ^а ^б Халкия Д., Николаидис Н., Макаловски В., Кляйн Дж., Ней М. (декабрь 2008 г.). «Происхождение и эволюция мультигенного семейства форминов, участвующего в формировании актиновых нитей» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (12): 2717–33. дои : 10.1093/molbev/msn215 . ПМК 2721555 . ПМИД 18840602 .

[2] Евангелиста М., Зигмонд С., Бун С. (июль 2003 г.). «Формины: сигнальные эффекторы для сборки и поляризации актиновых нитей» . Журнал клеточной науки . 116 (Часть 13): 2603–11. дои : 10.1242/jcs.00611 . ПМИД 12775772 .

[pmid25788699-3] Ганнинг П.В., Гошдастидер Ю., Уитакер С., Попп Д., Робинсон Р.К. (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых нитей» . Журнал клеточной науки . 128 (11): 2009–19. дои : 10.1242/jcs.165563 . ПМИД 25788699 .

[pmid17373907-4] Jump up to: ^а ^б Гуд Б.Л., Эк М.Дж. (2007). «Механизм и функция форминов в контроле сборки актина». Ежегодный обзор биохимии . 76 : 593–627. doi : 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142647 . ПМИД 17373907 .

[pmid16740473-5] Фэйкс Дж., Гросс Р. (июнь 2006 г.). «Поддержание формы с помощью форминов» . Развивающая клетка . 10 (6): 693–706. дои : 10.1016/j.devcel.2006.05.001 . ПМИД 16740473 .

[6] Хиггс Х.Н., Петерсон К.Дж. (январь 2005 г.). «Филогенетический анализ домена гомологии формина 2» . Молекулярная биология клетки . 16 (1): 1–13. doi : 10.1091/mbc.E04-07-0565 . ПМК 539145 . ПМИД 15509653 .

[Baarlink-7] Баарлинк С., Брандт Д., Гросс Р. (июль 2010 г.). «Снимок: Форминс» . Клетка . 142 (1): 172–172.e1. дои : 10.1016/j.cell.2010.06.030 . ПМИД 20603022 . S2CID 2914004 .

[pmid12538772-8] Китаяма С., Уеда TQ (февраль 2003 г.). «ForC, новый тип белка семейства форминов, лишенный домена FH1, участвует в многоклеточном развитии Dictyostelium discoideum» . Журнал клеточной науки . 116 (Часть 4): 711–23. дои : 10.1242/jcs.00265 . ПМИД 12538772 .

[9] Валлар Б.Дж., Альбертс А.С. (август 2003 г.). «Формины: активные каркасы, реконструирующие цитоскелет». Тенденции в клеточной биологии . 13 (8): 435–46. дои : 10.1016/S0962-8924(03)00153-3 . ПМИД 12888296 .

[10] Уец П. (1997). Биохимические исследования белка деформации конечностей позвоночных: вступительная диссертация на соискание докторской степени на факультете естественных наук и математики Гейдельбергского университета Рупрехта-Карла . Биология развития, Европейская лаборатория молекулярной биологии. Гейдельберг: Европейская лаборатория молекулярной биологии.

[Uetz-11] Уетц П., Фумагалли С., Джеймс Д., Зеллер Р. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное взаимодействие между белками деформации конечностей (форминами) и киназами семейства Src» . Журнал биологической химии . 271 (52): 33525–30. дои : 10.1074/jbc.271.52.33525 . ПМИД 8969217 .

[pmid14576350-12] Такея Р., Сумимото Х. (ноябрь 2003 г.). «Fhos, формин млекопитающих, напрямую связывается с F-актином через N-концевую область по отношению к домену FH1 и образует гомотипический комплекс через домен FH2, способствуя образованию актиновых волокон» . Журнал клеточной науки . 116 (Часть 22): 4567–75. дои : 10.1242/jcs.00769 . ПМИД 14576350 .

[pmid14992721-13] Шимада А., Нитраи М., Веттер И.Р., Кюльманн Д., Буги Б., Нарумия С., Гивз М.А., Виттингхофер А. (февраль 2004 г.). «Основной домен FH2 прозрачных форминов представляет собой удлиненный актин-связывающий белок, который ингибирует полимеризацию» . Молекулярная клетка . 13 (4): 511–22. дои : 10.1016/S1097-2765(04)00059-0 . ПМИД 14992721 .

[pmid11171383-14] Като Т., Ватанабэ Н., Моришима Ю., Фудзита А., Ишизаки Т., Нарумия С. (февраль 2001 г.). «Локализация гомолога прозрачного белка mDia1 млекопитающих в митотическом веретене клеток HeLa». Журнал клеточной науки . 114 (Часть 4): 775–84. дои : 10.1242/jcs.114.4.775 . hdl : 2433/150544 . ПМИД 11171383 .

[pmid9606213-15] Петерсен Дж., Нильсен О., Эгель Р., Хаган И.М. (июнь 1998 г.). «FH3, домен, обнаруженный в форминах, нацеливает формин Fus1 делящихся дрожжей на кончик проекции во время конъюгации» . Журнал клеточной биологии . 141 (5): 1217–28. дои : 10.1083/jcb.141.5.1217 . ПМК 2137179 . ПМИД 9606213 .

[pmid12676083-16] Jump up to: ^а ^б Пэн Дж., Валлар Б.Дж., Фландерс А., Святек П.Дж., Альбертс А.С. (апрель 2003 г.). «Нарушение гена формы Drf1, связанного с диафаном, кодирующего mDia1, раскрывает роль Drf3 как эффектора для Cdc42» . Современная биология . 13 (7): 534–45. Бибкод : 2003CBio...13..534P . дои : 10.1016/S0960-9822(03)00170-2 . ПМИД 12676083 . S2CID 13902104 .

[pmid15006353-17] Сюй Ю, Мозли Дж.Б., Сагот И., Пой Ф., Пеллман Д., Гуд Б.Л., Эк М.Дж. (март 2004 г.). «Кристаллические структуры домена Formin Homology-2 демонстрируют архитектуру связанного димера» . Клетка . 116 (5): 711–23. дои : 10.1016/S0092-8674(04)00210-7 . ПМИД 15006353 . S2CID 15855545 .

[18] Томпсон М.Э., Хеймсат Э.Г., Говен Т.Дж., Хиггс Х.Н., Кулл Ф.Дж. (январь 2013 г.). «Структура FMNL3 FH2-актина дает представление о формин-опосредованном зарождении и элонгации актина» . Структурная и молекулярная биология природы . 20 (1): 111–8. дои : 10.1038/nsmb.2462 . ПМЦ 3876896 . ПМИД 23222643 .

[PMID11483957-19] Палаццо А.Ф., Кук Т.А., Альбертс А.С., Гундерсен Г.Г. (август 2001 г.). «mDia опосредует Rho-регулируемое образование и ориентацию стабильных микротрубочек». Природная клеточная биология . 3 (8): 723–9. дои : 10.1038/35087035 . ПМИД 11483957 . S2CID 7374170 .

[PMID19631698-20] Бартолини Ф., Гундерсен Г.Г. (февраль 2010 г.). «Формины и микротрубочки» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1803 (2): 164–73. дои : 10.1016/j.bbamcr.2009.07.006 . ПМЦ 2856479 . ПМИД 19631698 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]