B3GALT5

B3GALT5
Идентификаторы
Псевдонимы	B3GALT5 , B3GalT-V, B3GalTx, B3T5, GLCT5, beta-1,3-GalTase 5, beta-3-Gx-T5, beta3Gal-T5, beta-1,3-galactosyltransferase 5
Внешние идентификаторы	Опустить : 604066 ; МГИ : 2136878 ; Гомологен : 13230 ; Генные карты : B3GALT5 ; OMA : B3GALT5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 21 (human)
End	39,673,137 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	96,121,059 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	palpebral conjunctiva; ; mucosa of sigmoid colon; ; jejunal mucosa; ; rectum; ; duodenum; ; mucosa of transverse colon; ; amniotic fluid; ; sperm; ; gonad; ; mucosa of ileum;
	Top expressed in
	left colon; ; interventricular septum; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; anterior horn of spinal cord; ; facial motor nucleus; ; visual cortex; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; deep cerebellar nuclei;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; UDP-galactose:beta-N-acetylglucosamine beta-1,3-galactosyltransferase activity; galactosyltransferase activity; glycosyltransferase activity; acetylgalactosaminyltransferase activity;
Cellular component	integral component of membrane; Golgi membrane; Golgi apparatus; endoplasmic reticulum; membrane;
Biological process	protein glycosylation; protein N-linked glycosylation; oligosaccharide biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10317
	93961
	ENSG00000183778
	ENSMUSG00000074892
	Q9Y2C3
	Q9JI67
showНМ_033173 ; НМ_001278650 ; НМ_006057 ; НМ_033170 ; НМ_033171 ;
	NM_033172; NM_001356336; NM_001356338; NM_001356339
	НМ_001122993 ; НМ_033149 ; НМ_001358389 ; НМ_001358390
showНП_001265579 ; НП_006048 ; НП_149360 ; НП_149361 ; НП_149362 ;
	NP_001343265; NP_001343267; NP_001343268
	НП_001116465 ; НП_149161 ; НП_001345318 ; НП_001345319
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бета-1,3-галактозилтрансфераза 5 — это фермент , который у человека кодируется B3GALT5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген является членом семейства генов бета-1,3- галактозилтрансферазы (beta3GalT). Это семейство кодирует мембраносвязанные гликопротеины типа II с разнообразными ферментативными функциями, использующими разные донорные субстраты ( УДФ-галактоза и УДФ-N-ацетилглюкозамин ) и разные акцепторные сахара ( N-ацетилглюкозамин , галактоза , N-ацетилгалактозамин ). Гены beta3GalT отдаленно связаны с геном Drosophila Brainiac и имеют кодирующую белок последовательность, содержащуюся в одном экзоне . Белки beta3GalT также содержат консервативные последовательности, отсутствующие в белках beta4GalT или альфа3GalT. Углеводные цепи, синтезируемые этими ферментами, обозначаются как тип 1, тогда как ферменты beta4GalT синтезируют углеводные цепи типа 2. Соотношение цепей типа 1:типа 2 меняется в ходе эмбриогенеза . По сходству последовательностей гены beta3GalT делятся как минимум на две группы: beta3GalT4 и еще 4 гена beta3GalT (beta3GalT1-3, beta3GalT5). Этот ген кодирует наиболее вероятного кандидата на синтез типа 1. Антигены Льюиса , уровень которых часто обнаруживается при желудочно-кишечного тракта и раке поджелудочной железы . Кодируемый белок неактивен по отношению к N-связанным гликопротеинам и участвует в гликозилировании муцина . Описано пять вариантов транскриптов, различающихся 5'-UTR . Все варианты транскрипта кодируют идентичный белок. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000183778 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074892 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ишики С., Тогаячи А., Кудо Т., Нишихара С., Ватанабэ М., Кубота Т., Китаджима М., Сираиси Н., Сасаки К., Андо Т., Наримацу Х. (июнь 1999 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика новой UDP-галактозы:бета-N-ацетилглюкозамин-бета1,3-галактозилтрансферазы (beta3Gal-T5), ответственной за синтез цепи типа 1 в эпителии колоректального и поджелудочной железы и полученных из них опухолевых клетках» . J Биол Хим . 274 (18): 12499–507. дои : 10.1074/jbc.274.18.12499 . ПМИД 10212226 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: B3GALT5 UDP-Gal:betaGlcNAc бета-1,3-галактозилтрансфераза, полипептид 5» .

Дальнейшее чтение

Амадо М., Алмейда Р., Швинтек Т., Клаузен Х. (2000). «Идентификация и характеристика больших семейств генов галактозилтрансфераз: галактозилтрансферазы для всех функций». Биохим. Биофиз. Акта . 1473 (1): 35–53. дои : 10.1016/S0304-4165(99)00168-3 . ПМИД 10580128 .
Кальянараман В.С., Родригес В., Веронезе Ф. и др. (1990). «Характеристика секретируемых нативных gp120 и gp160 вируса иммунодефицита человека типа 1» . СПИД рез. Хм. Ретровирусы . 6 (3): 371–80. дои : 10.1089/aid.1990.6.371 . ПМИД 2187500 .
Пал Р., Хок ГМ, Сарнгадхаран МГ (1989). «Роль олигосахаридов в процессинге и созревании гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека 1 типа» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (9): 3384–8. Бибкод : 1989PNAS...86.3384P . дои : 10.1073/pnas.86.9.3384 . ПМК 287137 . ПМИД 2541446 .
Дьюар Р.Л., Васудевачари М.Б., Натараджан В., Зальцман Н.П. (1989). «Биосинтез и обработка гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека типа 1: влияние монензина на гликозилирование и транспорт» . Дж. Вирол . 63 (6): 2452–6. дои : 10.1128/jvi.63.6.2452-2456.1989 . ПМК 250699 . ПМИД 2542563 .
Козарский К., Пенман М., Базирипур Л. и др. (1989). «Гликозилирование и процессинг оболочечного белка вируса иммунодефицита человека типа 1». Дж. Приобретение. Иммунный дефицит. Синдр . 2 (2): 163–9. ПМИД 2649653 .
Робинсон В.Е., Монтефиори, округ Колумбия, Митчелл В.М. (1988). «Доказательства того, что маннозильные остатки участвуют в патогенезе вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1)». СПИД рез. Хм. Ретровирусы . 3 (3): 265–82. дои : 10.1089/aid.1987.3.265 . ПМИД 2829950 .
Чжоу Д., Бергер Э.Г., Хеннет Т. (1999). «Молекулярное клонирование гена UDP-галактозы человека: GlcNAcbeta1,3GalNAc бета1,3-галактозилтрансферазы, кодирующего O-связанный фермент удлинения core3» . Евро. Дж. Биохим . 263 (2): 571–6. дои : 10.1046/j.1432-1327.1999.00541.x . ПМИД 10406968 .
Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК 21 хромосомы человека» . Природа . 405 (6784): 311–9. Бибкод : 2000Natur.405..311H . дои : 10.1038/35012518 . ПМИД 10830953 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Данн К.А., Медстранд П., Магер Д.Л. (2004). «Эндогенный ретровирусный длинный концевой повтор является доминантным промотором человеческой β1,3-галактозилтрансферазы 5 в толстой кишке» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (22): 12841–6. дои : 10.1073/pnas.2134464100 . ПМК 240706 . ПМИД 14534330 .
Сато Т., Фурукава К. (2004). «Регуляция транскрипции гена бета-1,4-галактозилтрансферазы V человека в раковых клетках: важная роль транскрипционного фактора Sp1» . Ж. Биол. Хим . 279 (38): 39574–83. дои : 10.1074/jbc.M405805200 . ПМИД 15263012 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Данн К.А., ван де Лагемаат Л.Н., Бэйли Г.Дж., Магер Д.Л. (2006). «Длинные концевые повторы эндогенного ретровируса как готовые к использованию мобильные промоторы: случай бета3GAL-T5 примата». Джин . 364 : 2–12. дои : 10.1016/j.gene.2005.05.045 . ПМИД 16112824 .
Ху Ю.Х., Варнац Х.Дж., Ванхеке Д. и др. (2006). «Скрининг внутриклеточной локализации на основе клеточных массивов выявляет новые функциональные особенности белков 21 хромосомы человека» . БМК Геномика . 7 :155. дои : 10.1186/1471-2164-7-155 . ПМК 1526728 . ПМИД 16780588 .

Внешние ссылки

B3GALT5 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности гена человека B3GALT5 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 21 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000183778 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074892 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10212226-5] Ишики С., Тогаячи А., Кудо Т., Нишихара С., Ватанабэ М., Кубота Т., Китаджима М., Сираиси Н., Сасаки К., Андо Т., Наримацу Х. (июнь 1999 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика новой UDP-галактозы:бета-N-ацетилглюкозамин-бета1,3-галактозилтрансферазы (beta3Gal-T5), ответственной за синтез цепи типа 1 в эпителии колоректального и поджелудочной железы и полученных из них опухолевых клетках» . J Биол Хим . 274 (18): 12499–507. дои : 10.1074/jbc.274.18.12499 . ПМИД 10212226 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: B3GALT5 UDP-Gal:betaGlcNAc бета-1,3-галактозилтрансфераза, полипептид 5» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]