Гонсалу Абекасис

Гонсалу Абекасис
Гонсалу Абекасис
	Абекасис выступает с программной речью на ISMB
Рожденный	Гонсало Роча Абекасис ; 8 мая 1976 г. (48 лет)
Национальность	португальский
Альма-матер	Университет Лидса ; Оксфордский университет
Супруг	Кристен Виллер
Дети	5
Награды	Премия Овертона (2013)
	Научная карьера
Поля	Биоинформатика ; Вычислительная биология ; Биостатистика
Учреждения	Мичиганский университет
Диссертация	Методы точного картирования сложных признаков в родословных человека (2001)
Докторантура	Уильям Куксон
Докторанты	Мингяо Ли
Веб-сайт	www .sph .умич .edu /csg /абекасис /
Примечания
	Работает в Регенерон

Гонсалу Роша Абекасис (1976 г.р.) — португальско-американский биомедицинский исследователь из Мичиганского университета , занимает должность вице-президента и руководителя отдела геномики. и специалист по науке о данных в Центре генетики Regeneron, ^{[ 4 ]} и был заведующим кафедрой биостатистики Школы общественного здравоохранения . Он возглавляет группу в Центре статистической генетики на кафедре биостатистики, где он также является университетским профессором биостатистики Феликса Э. Мура и директором Мичиганской геномной инициативы. ^{[ 5 ]} Его группа разрабатывает статистические инструменты для анализа генетики заболеваний человека . ^{[ 6 ]}

Образование и молодость

Абекасис - старший из 12 детей в семье, он родился в Моуре в семье Хосе Мануэля и Марии Терезы. ^{[ 3 ]} Он вырос в Португалии и Макао (тогда Португальский Макао ). Изучив компьютерное программирование в школьном клубе, он получил степень бакалавра наук в области генетики в Университете Лидса в 1997 году, работая с Мэри Энн Шоу, и степень доктора философии в области генетики человека. ^{[ 2 ]} из Оксфордского университета в 2001 году, работая с Уильямом Куксоном и Лоном Кардоном. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Исследовать

Абекасис работает над статистическими и вычислительными подходами к генетическим заболеваниям человека, включая псориаз и сердечно-сосудистые заболевания. ^{[ 7 ]} Его группа разрабатывает инструменты для анализа и визуализации биомедицинских данных, часто используя C++ . ^{[ 7 ]} Впервые он применил свои знания в области программирования во время работы над докторской диссертацией. исследования по разработке инструментов для анализа данных о предрасположенности к астме, которые собирал его проект. Он продолжил работу биостатистиком, когда переехал в Мичиган в 2001 году, где его нанял и наставлял Майкл Бёнке . ^{[ 1 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Он является сторонником обмена данными . ^{[ 8 ]} Его работа включала проект «1000 геномов». ^{[ 9 ]} и сотрудничество с исследователями из Оксфорда. ^{[ 5 ]}

Награды и почести

Абекасис получил награду за выдающиеся достижения в исследованиях Школы общественного здравоохранения Мичиганского университета в 2008 году. ^{[ 10 ]} и он стал профессором Мичиганского университета в 2009 году. ^{[ 7 ]} В 2013 году он выиграл премию Овертона от Международного общества вычислительной биологии, выступив с программной речью на ISMB . ^{[ 1 ]} и был назван стипендиатом Pew Благотворительным фондом Pew в 2005 году. ^{[ 11 ]} Его работа была процитирована в 2010 году вице-президентом США Джо Байденом в речи о важности биомедицинских исследований в отношении Отчета об инновациях Закона о восстановлении. ^{[ 8 ]}^{[ 12 ]}

Его опубликованные работы имеют большое влияние: по состоянию на 2018 год его индекс Хирша составлял 145 и 144 018 цитирований. Thomson Reuters отметило, что в 2009 году у него было 10 «горячих» статей (входящих в топ 0,1% по цитируемости). ^{[ 13 ]} Он также был известен своими «горячими статьями» в 2011 и 2012 годах. ^{[ 5 ]}^{[ 14 ]}

В октябре 2014 года он был награжден премией Курта Стерна в области генетики человека Американским обществом генетики человека (совместно с Марком Дж. Дейли ). ^{[ 15 ]}

В октябре 2014 года его избрали в Медицинский институт . ^{[ 16 ]}

Личная жизнь

Гонсало женат на ученом из Мичиганского университета Кристен Уиллер . У них пятеро детей. ^{[ 3 ]}^{[ 17 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Фогг, Китай; Ковац, Д.Э. (2013). «Международное общество вычислительной биологии удостоило Гонсалу Абекасиса высшую награду в области биоинформатики/вычислительной биологии за 2013 год». Биоинформатика . 29 (12): 1586–1587. doi : 10.1093/биоинформатика/btt251 . ПМИД 23661697 .
^ Jump up to: ^а ^б Абекасис, Гонсалу (2002). Методы точного картирования сложных признаков в родословных человека (дипломная работа). Оксфордский университет.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Гонсало Роша Абекасис» . Geneall.net. 2014. Архивировано из оригинала 8 января 2014 г.
^ https://www.regeneron.com/downloads/regn-genetics-center-factsheet.pdf .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гринберг, Уилл (12 июня 2013 г.). «Профессор университета заслужил признание за исследования в области секвенирования генома» . Мичиган Дейли . Проверено 17 декабря 2013 г.
^ Публикации Гонсало Абекасиса, проиндексированные Google Scholar.
Абекасис, публикации Гонсало Р., индексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
- Гонсало Р. Абекасис на DBLP библиографическом сервере
- Абекасис, Греция ; Черный, СС; Куксон, Висконсин; Кардон, ЛР (2001). «Мерлин — быстрый анализ плотных генетических карт с использованием разреженных деревьев потоков генов». Природная генетика . 30 (1): 97–101. дои : 10.1038/ng786 . ПМИД 11731797 . S2CID 12226524 .
- Ли, Х .; Рукосакер, Б.; Высокер, А.; Феннелл, Т.; Руан, Дж.; Гомер, Н.; Март, Г.; Абекасис, Г .; Дурбин, Р. ; Подгруппа обработки данных проекта «1000 геномов» (2009). «Формат Sequence Alignment/Map и SAMtools» . Биоинформатика . 25 (16): 2078–2079. doi : 10.1093/биоинформатика/btp352 . ПМК 2723002 . ПМИД 19505943 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
- Публикации Гонсалу Абекасиса, проиндексированные Microsoft Academic.
- Международный консорциум HapMap; и др. (2003). «Международный проект HapMap» (PDF) . Природа . 426 (6968): 789–796. Бибкод : 2003Natur.426..789G . дои : 10.1038/nature02168 . hdl : 2027.42/62838 . ПМИД 14685227 . S2CID 4387110 .
- Фрейзер, Калифорния; Фрейзер, Д.Г.; Баллинджер, доктор медицинских наук; Кокс, Д.А.; Хиндс, LL; Стув, РА; Гиббс, Дж.В.; Бельмонт, А.; Будро, П.; Харденбол, С.М.; Леал, С.; Пастернак Д.А.; Уиллер, Т.Д.; Уиллис, Ф.; Ю, Х.; Ян, К.; Цзэн, Ю.; Гао, Х.; Ху, В.; Ху, К.; Ли, В.; Лин, С.; Лю, Х.; Пан, X.; Тан, Дж.; Ван, В.; Ван, Дж.; Ю, Б.; Чжан, К.; и др. (2007). «Карта гаплотипов человека второго поколения, состоящая из более чем 3,1 миллиона SNP» . Природа . 449 (7164): 851–861. Бибкод : 2007Natur.449..851F . дои : 10.1038/nature06258 . ПМЦ 2689609 . ПМИД 17943122 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Карлин, Сьюзен (17 сентября 2013 г.). «Профиль: Гонсалу Абекасис добывает геномы для получения биомедицинского золота» . IEEE-спектр . Проверено 17 декабря 2013 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Фогг, Кристин Н. (28 июня 2013 г.). «Поздравляем обладателя премии ISCB Овертона 2013 года: Гонсало Абекасиса» . ИСКБ . Проверено 17 декабря 2013 г.
^ Дурбин, РМ ; и др. (2010). «Карта вариаций генома человека по результатам популяционного секвенирования» . Природа . 467 (7319): 1061–1073. Бибкод : 2010Natur.467.1061T . дои : 10.1038/nature09534 . ПМК 3042601 . ПМИД 20981092 .
^ «Награда факультета за выдающиеся достижения» . Школа общественного здравоохранения Мичиганского университета . Архивировано из оригинала 8 января 2014 года . Проверено 17 декабря 2013 г.
^ «Справочник ученых Пью» . Веб-сайт благотворительного фонда Pew . Архивировано из оригинала 4 марта 2014 г. Проверено 4 марта 2014 г.
^ Сервах, Джо (25 августа 2010 г.). «Байден: UM преобразует экономику посредством инноваций» . Служба новостей Мичиганского университета . Проверено 17 декабря 2013 г.
^ Кинг, Кристофер (март – апрель 2010 г.). «Самое горячее исследование 2009 года» . Sciencewatch.com . Томсон Рейтер . Проверено 17 декабря 2013 г.
^ «Самые горячие научные исследователи 2012 года» . Научные часы . Томсон Рейтер. Июнь 2013 года . Проверено 17 декабря 2013 г.
- Кинг, Кристофер (сентябрь 2012 г.). «Самое горячее исследование 2011 года» . Sciencewatch.com . Томсон Рейтер . Проверено 17 декабря 2013 г.
^ «Предыдущие лауреаты премии» . ashg.org . Американское общество генетики человека. Октябрь 2014 г. Архивировано из оригинала 3 октября 2014 г. Проверено 17 октября 2014 г.
^ «Медицинский институт избирает 70 новых членов, 10 иностранных сотрудников» . Национальная академия наук . 20 октября 2014 года . Проверено 22 октября 2014 г.
^ «Фотоальбом Гонсало и Кристен» . Гонсалу Абекасис . Мичиганский университет . Проверено 17 декабря 2013 .
- «Профиль факультета Кристен Уиллер» . Факультет медицинской школы Мичиганского университета . Мичиганский университет . Проверено 8 февраля 2014 г.

[overton-1] Jump up to: ^а ^б ^с Фогг, Китай; Ковац, Д.Э. (2013). «Международное общество вычислительной биологии удостоило Гонсалу Абекасиса высшую награду в области биоинформатики/вычислительной биологии за 2013 год». Биоинформатика . 29 (12): 1586–1587. doi : 10.1093/биоинформатика/btt251 . ПМИД 23661697 .

[abecasisphd-2] Jump up to: ^а ^б Абекасис, Гонсалу (2002). Методы точного картирования сложных признаков в родословных человека (дипломная работа). Оксфордский университет.

[geneall-3] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Гонсало Роша Абекасис» . Geneall.net. 2014. Архивировано из оригинала 8 января 2014 г.

[4] ttps://www.regeneron.com/downloads/regn-genetics-center-factsheet.pdf .

[accolades-5] Jump up to: ^а ^б ^с Гринберг, Уилл (12 июня 2013 г.). «Профессор университета заслужил признание за исследования в области секвенирования генома» . Мичиган Дейли . Проверено 17 декабря 2013 г.

[6] Публикации Гонсало Абекасиса, проиндексированные Google Scholar.
Абекасис, публикации Гонсало Р., индексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
- Гонсало Р. Абекасис на DBLP библиографическом сервере
- Абекасис, Греция ; Черный, СС; Куксон, Висконсин; Кардон, ЛР (2001). «Мерлин — быстрый анализ плотных генетических карт с использованием разреженных деревьев потоков генов». Природная генетика . 30 (1): 97–101. дои : 10.1038/ng786 . ПМИД 11731797 . S2CID 12226524 .
- Ли, Х .; Рукосакер, Б.; Высокер, А.; Феннелл, Т.; Руан, Дж.; Гомер, Н.; Март, Г.; Абекасис, Г .; Дурбин, Р. ; Подгруппа обработки данных проекта «1000 геномов» (2009). «Формат Sequence Alignment/Map и SAMtools» . Биоинформатика . 25 (16): 2078–2079. doi : 10.1093/биоинформатика/btp352 . ПМК 2723002 . ПМИД 19505943 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
- Публикации Гонсалу Абекасиса, проиндексированные Microsoft Academic.
- Международный консорциум HapMap; и др. (2003). «Международный проект HapMap» (PDF) . Природа . 426 (6968): 789–796. Бибкод : 2003Natur.426..789G . дои : 10.1038/nature02168 . hdl : 2027.42/62838 . ПМИД 14685227 . S2CID 4387110 .
- Фрейзер, Калифорния; Фрейзер, Д.Г.; Баллинджер, доктор медицинских наук; Кокс, Д.А.; Хиндс, LL; Стув, РА; Гиббс, Дж.В.; Бельмонт, А.; Будро, П.; Харденбол, С.М.; Леал, С.; Пастернак Д.А.; Уиллер, Т.Д.; Уиллис, Ф.; Ю, Х.; Ян, К.; Цзэн, Ю.; Гао, Х.; Ху, В.; Ху, К.; Ли, В.; Лин, С.; Лю, Х.; Пан, X.; Тан, Дж.; Ван, В.; Ван, Дж.; Ю, Б.; Чжан, К.; и др. (2007). «Карта гаплотипов человека второго поколения, состоящая из более чем 3,1 миллиона SNP» . Природа . 449 (7164): 851–861. Бибкод : 2007Natur.449..851F . дои : 10.1038/nature06258 . ПМЦ 2689609 . ПМИД 17943122 .

[spectrum-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Карлин, Сьюзен (17 сентября 2013 г.). «Профиль: Гонсалу Абекасис добывает геномы для получения биомедицинского золота» . IEEE-спектр . Проверено 17 декабря 2013 г.

[congrats-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Фогг, Кристин Н. (28 июня 2013 г.). «Поздравляем обладателя премии ISCB Овертона 2013 года: Гонсало Абекасиса» . ИСКБ . Проверено 17 декабря 2013 г.

[1000genomes-9] Дурбин, РМ ; и др. (2010). «Карта вариаций генома человека по результатам популяционного секвенирования» . Природа . 467 (7319): 1061–1073. Бибкод : 2010Natur.467.1061T . дои : 10.1038/nature09534 . ПМК 3042601 . ПМИД 20981092 .

[10] «Награда факультета за выдающиеся достижения» . Школа общественного здравоохранения Мичиганского университета . Архивировано из оригинала 8 января 2014 года . Проверено 17 декабря 2013 г.

[11] «Справочник ученых Пью» . Веб-сайт благотворительного фонда Pew . Архивировано из оригинала 4 марта 2014 г. Проверено 4 марта 2014 г.

[12] Сервах, Джо (25 августа 2010 г.). «Байден: UM преобразует экономику посредством инноваций» . Служба новостей Мичиганского университета . Проверено 17 декабря 2013 г.

[13] Кинг, Кристофер (март – апрель 2010 г.). «Самое горячее исследование 2009 года» . Sciencewatch.com . Томсон Рейтер . Проверено 17 декабря 2013 г.

[14] «Самые горячие научные исследователи 2012 года» . Научные часы . Томсон Рейтер. Июнь 2013 года . Проверено 17 декабря 2013 г.
- Кинг, Кристофер (сентябрь 2012 г.). «Самое горячее исследование 2011 года» . Sciencewatch.com . Томсон Рейтер . Проверено 17 декабря 2013 г.

[15] «Предыдущие лауреаты премии» . ashg.org . Американское общество генетики человека. Октябрь 2014 г. Архивировано из оригинала 3 октября 2014 г. Проверено 17 октября 2014 г.

[16] «Медицинский институт избирает 70 новых членов, 10 иностранных сотрудников» . Национальная академия наук . 20 октября 2014 года . Проверено 22 октября 2014 г.

[17] «Фотоальбом Гонсало и Кристен» . Гонсалу Абекасис . Мичиганский университет . Проверено 17 декабря 2013 .
- «Профиль факультета Кристен Уиллер» . Факультет медицинской школы Мичиганского университета . Мичиганский университет . Проверено 8 февраля 2014 г.

[ 3 ]

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

Базы данных авторитетного контроля
International	ISNI
National	United States
Academics	Association for Computing Machinery DBLP Google Scholar Mathematics Genealogy Project ORCID