Водорослевой вирус

Водорослевые вирусы — это вирусы, поражающие водоросли , которые являются фотосинтезирующими одноклеточными эукариотами . По состоянию на 2020 год было известно 61 вирус , поражающий водоросли. ^{[ 1 ]} Водоросли являются неотъемлемыми компонентами водных пищевых сетей и управляют круговоротом питательных веществ , поэтому вирусы, заражающие популяции водорослей, также влияют на организмы и системы круговорота питательных веществ, которые от них зависят. Таким образом, эти вирусы могут иметь значительные экономические и экологические последствия во всем мире. ^{[ 2 ]} Их геномы варьировались от 4,4 до 560 тысяч пар оснований (т.п.н.) в длину и использовали двухцепочечную дезоксирибонуклеиновую кислоту (дцДНК), двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (дцРНК), одноцепочечную дезоксирибонуклеиновую кислоту (оцДНК) и одноцепочечную рибонуклеиновую кислоту (оцРНК). ). Вирусы имели диаметр от 20 до 210 нм. ^{[ 1 ]} С момента открытия первого вируса, заражающего водоросли, в 1979 году было использовано несколько различных методов для поиска новых вирусов, заражающих водоросли, и кажется, что еще предстоит открыть много вирусов, заражающих водоросли. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

ДНК-вирусы

Вирусы, которые хранят свою геномную информацию с помощью ДНК, ДНК-вирусы, представляют собой наиболее изученную подгруппу вирусов, инфицирующих водоросли. Это особенно верно для семейства дцДНК-вирусов Phycodnaviridae . ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]} другие группы дцДНК-вирусов, в том числе гигантские вирусы семейства Mimiviridae . Однако водоросли поражают и ^{[ 3 ]} Недавнее исследование 65 геномов водорослей показало, что некоторые вирусы, принадлежащие к большим нуклеоцитоплазматическим ДНК-вирусам (NCLDV), более крупной вирусной группе, включающей как вирусные семейства Phycodnaviridae, так и Mimiviridae, интегрировались в 24 генома хозяина. ^{[ 4 ]} вирусы с оцДНК, подобные группе вирусов, инфицирующих диатомовые водоросли Bacilladnaviridae . Недавно были обнаружены ^{[ 1 ]}

РНК-вирусы

РНК-вирусы также атакуют водорослей-хозяев. Существуют вирусы дцРНК, подобные тем, которые принадлежат к семейству Reoviridae , которые заражают Micromonas pusilla , и вирусы оцРНК, подобные тем, которые принадлежат к роду Bacillarnavirus , которые заражают диатомовую водоросль Chaetoceros tenuissimus . ^{[ 1 ]} Сообщалось также о включении генов РНК-вирусов в геномы водорослей. Гены одноцепочечных вирусов, инфицирующих динофлагелляты, были обнаружены в геномах коралловых эндосимбиотических водорослей Symbiodinium . ^{[ 5 ]}

Диатомовые вирусы

Диатомовые водоросли являются одной из наиболее распространенных групп фитопланктона, встречающихся в морских и пресноводных системах. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} По оценкам, они насчитывают примерно 12 000–13 000 видов, на долю которых приходится 35–70% первичной морской продукции в океане и почти 20% мировой первичной продуктивности. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Диатомовые водоросли, среди других важных производителей, могут быть восприимчивы к вирусной инфекции . ^{[ 9 ]} Диатомовые вирусы представляют собой группу вирусов , которые заражают диатомовые водоросли и потенциально могут существенно влиять на динамику популяций и уровень смертности в популяциях диатомовых водорослей. ^{[ 10 ]} Вирусы диатомовых водорослей весьма разнообразны и могут вступать в разнообразные сложные взаимодействия со своими конкретными клетками-хозяевами; Также известно, что они обладают способностью вызывать лизис клеток и высвобождение питательных веществ, что демонстрирует их значительное экологическое воздействие с точки зрения их способности выделять питательные вещества в экосистему и регулировать популяции диатомей. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Открытие диатомового вируса

Открытие диатомовых вирусов относится к началу 1970-х годов, когда ученые впервые наблюдали вирусоподобные частицы в культурах диатомовых водорослей. ^{[ 13 ]} Более того, только в 1990-х годах было обнаружено, что морские вирусы обладают способностью быть потенциально патогенными для морских организмов. ^{[ 14 ]} Первый вирус диатомовой водоросли был идентифицирован, выделен и охарактеризован в Ариаке в Японском море в 2004 году и был классифицирован как Rhizosolenia setigera (RsRNAV). РНК-вирус ^{[ 15 ]} Было обнаружено, что РНК-вирус Rhizosolenia setigera (RsRNAV) имеет сайт репликации вируса в цитоплазме внутри организма-хозяина. ^{[ 15 ]} Было обнаружено, что вирусная частица РНК-вируса Rhizosolenia setigera (RsRNAV) имеет икосаэдрическую форму без хвоста и имеет структуру одноцепочечной РНК. ^{[ 15 ]} После этого другое исследование обнаружило вирус диатомовой водоросли, выделенный из морской диатомовой водоросли Skeletonema costatum . ^{[ 16 ]} Было обнаружено, что вирус, позже названный ДНК-вирусом Skeletonema costatum (ScDCV), имеет икосаэдрический капсид и двухцепочечный ДНК-геном. ^{[ 16 ]} Впоследствии, после открытия ДНК-вируса Skeletonema costatum (ScDCV), был выделен еще один вирус диатомовой водоросли, охарактеризованный как ДНК-вирус Chaetoceros setoensis (CsetDNAV), который, как было обнаружено, инфицирует диатомовую водоросль Chaetoceros setoensis . ^{[ 17 ]} Штамм вируса (CsetDNAV) был охарактеризован и идентифицирован как присутствующий в составе Diatom Chaetoceros setoensis, который, как было обнаружено, обитает у побережья острова Сето в Японском море. ^{[ 17 ]} Вирусная частица Chaetoceros setoensis была обнаружена в цитоплазме организма-хозяина, а вирусный геном оказался замкнутой кольцевой оцДНК с сегментами неопознанных линейных одноцепочечных нуклеотидов, поскольку структура генома этого конкретного вируса уникальна, поскольку она имеет не был обнаружен ни в одном другом диатомовом вирусе. ^{[ 17 ]} В связи с открытием (CsetDNAV) и его уникальной структуры генома считается, что другие неопознанные диатомовые вирусы могут обладать разнообразными и уникальными вирусными геномными структурами. ^{[ 12 ]}^{[ 17 ]} С момента открытия (CsetDNAV) были изолированы и идентифицированы различные другие диатомовые вирусы, в том числе представители семейств Bacilladnaviridae , Phycodnaviridae и Picornaviridae . ^{[ 12 ]}^{[ 17 ]}

Передача диатомового вируса

Считается, что диатомовые вирусы в основном передаются посредством горизонтальной передачи генов . ^{[ 18 ]} Горизонтальная передача генов внутри диатомовых вирусов происходит, когда диатомовый вирус заражает диатомовую водоросль, а затем распространяется на другие диатомовые водоросли посредством прямого контакта или посредством взаимодействия в толще воды . ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} Вирусы диатомовых водорослей очень заразны и способны быстро распространяться в популяциях диатомовых водорослей, что приводит к значительным изменениям в росте и физиологии организма. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} Передачу диатомовых вирусов потенциально можно объяснить тем фактом, что диатомовые водоросли, как известно, образуют большие колонии или цепочки, что дает диатомовым вирусам широкие возможности для заражения и распространения внутри новых организмов-хозяев. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]} Кроме того, было показано, что некоторые вирусы диатомовых водорослей обладают способностью вертикальной передачи , при которой они могут передаваться от родительской диатомовой водоросли потомству диатомовой водоросли. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} Считается, что форма вертикальной передачи позволяет диатомовым вирусам сохраняться в течение длительных периодов времени и может влиять на эволюцию и генетическое разнообразие популяций диатомовых водорослей. ^{[ 19 ]} Механизмы этого типа передачи до конца не изучены, но считается, что эта форма передачи осуществляется посредством бесполого размножения и деления клеток внутри диатомовых водорослей. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}

Таксономия

Признаны следующие семьи. ^{[ 21 ]}

Приложения

Биодизельное топливо, полученное из водорослей

Вирусы водорослей могут быть использованы для производства альтернативных источников энергии вместо ископаемого топлива. ^{[ 22 ]} В частности, водорослевые вирусы можно использовать в качестве инструмента в процессе производства биодизельного топлива, полученного из зеленых микроводорослей и цианобактерий. ^{[ 23 ]} Это учитывая, что зеленые водоросли и цианобактерии содержат компоненты, необходимые для создания биотоплива. ^{[ 23 ]} В частности, клетки зеленых водорослей и цианобактерии производят клеточные продукты, известные как липиды. ^{[ 23 ]} Липиды содержат триглицериды, которые непосредственно используются для производства биодизельного топлива. ^{[ 23 ]} Однако зеленые микроводоросли и цианобактерии не использовались для стандартного коммерческого производства биодизеля из-за сложности извлечения достаточного количества липидов из этих источников. ^{[ 24 ]}

Использование в производстве биодизеля

Было обнаружено, что использование водорослевых вирусов в качестве предварительной обработки зеленых микроводорослей является эффективным процедурным изменением процесса экстракции липидов. ^{[ 25 ]} Этот конкретный вирус водорослей был использован из-за его характерной способности инфицировать и реплицироваться внутри одноклеточных клеток водорослей хлореллы . ^{[ 26 ]} После того, как литические вирусы водорослей заражают клетку-хозяина, они реплицируются и собирают зрелые вирионы, которые лизуют клетку водоросли-хозяина для высвобождения. ^{[ 27 ]} Разрушение клеточной стенки клетки-хозяина водоросли зрелыми вирусами водорослей внутри клетки является ключевым фактором, обеспечивающим более эффективную экстракцию липидов из клеток водорослей. ^{[ 27 ]}^{[ 26 ]}

Пределы

Исследователи отмечают, что у водорослевого вируса может развиться лизогенный цикл после повторного использования одного конкретного водорослевого вируса. ^{[ нужна ссылка ]} В случае лизогенной вирусной конверсии вирус водорослей не будет выполнять желаемую задачу по лизису клетки-хозяина. ^{[ 28 ]} Вместо этого, когда лизогенный вирус водорослей высвобождает свой генетический материал в клетку-хозяина водоросли, генетический материал прячется внутри генома водоросли-хозяина, а не начинает генетическую репликацию и синтез белка для развития новых зрелых вирионов. ^{[ 28 ]}

Борьба с цветением водорослей

В природе было замечено, что вирусы водорослей играют экологическую роль в прекращении цветения водорослей . ^{[ 29 ]} Учитывая это, ученые предположили, что водорослевые вирусы могут быть использованы в качестве биологических средств борьбы с цветением водорослей. ^{[ 30 ]}^{[ 31 ]}^{[ 29 ]} Например, особый вирус водорослей, известный как цианофаг, можно использовать для борьбы с вредным цветением водорослей цианобактерий. ^{[ 30 ]} Литические цианофаги часто обнаруживаются в присутствии цианобактерий Microcystis . ^{[ 30 ]} В частности, предметом интереса является влияние цианофагов на контроль численности Microcystis aeruginosa, учитывая, что этот вид цианобактерий обычно ответственен за вредоносное цветение водорослей. ^{[ 30 ]} В одном лабораторном исследовании M. aeruginosa в присутствии M. aeruginosa . была собрана и затем обработана цианофагом, который был обнаружен в озере ^{[ 30 ]} Через шесть дней биомасса водорослей M. aeruginosa снизилась на 95 процентов. ^{[ 30 ]} Результаты другого лабораторного исследования показали, что цианофаги сохраняют наблюдаемую функцию прекращения цветения водорослей в контролируемых эвтрофных условиях. ^{[ 31 ]} При этом биомасса M. aeruginosa также сильно снижалась при обработке цианофагами. ^{[ 31 ]} Отрицательная корреляция между M. aeruginosa и цианофагом также была зафиксирована в естественных условиях. ^{[ 29 ]} В пресноводном водоеме , озере Миката, исследователи проанализировали образцы роста водорослей M. aeruginosa и обнаружили, что биомасса уменьшалась M. aeruginosa по мере увеличения плотности популяции цианофагов. ^{[ 29 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Коротко, Стивен М.; Станьевски, Майкл А.; Чабан Юрий В.; Лонг, Эндрю М.; Ван, Дунлинь (2020). «Разнообразие вирусов, поражающих эукариотические водоросли» . Актуальные проблемы молекулярной биологии . 39 : 29–62. дои : 10.21775/cimb.039.029 . ПМИД 32073403 . S2CID 211193770 .
^ Циммер, Карл (15 сентября 2011 г.). Планета вирусов . Издательство Чикагского университета. ISBN 978-0-226-98335-6 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Кой, Саманта Р.; Ганн, Эрик Р.; Паунд, Хелена Л.; Коротко, Стивен М.; Вильгельм, Стивен В. (2018). «Вирусы эукариотических водорослей: разнообразие, методы обнаружения и будущие направления» . Вирусы . 10 (9): 487. дои : 10.3390/v10090487 . ПМК 6165237 . ПМИД 30208617 .
^ Монируззаман, Мохаммед; Вайнхаймер, Алайна Р; Мартинес-Гутьеррес, Каролина А; Эйлуорд, Фрэнк О (2020). «Широко распространенная эндогенизация гигантских вирусов формирует геномы зеленых водорослей» . Природа . 588 (7836): 141–145. Бибкод : 2020Natur.588..141M . дои : 10.1038/s41586-020-2924-2 . ПМИД 33208937 . S2CID 227065267 .
^ Виджил, Алекс Дж.; Бистолас, Калия С.И.; Вулстра, Кристиан Р.; Хьюм, Бенджамин CC; Самолеты, Серж; Аллеманд, Денис; Буассен, Эмили; Винкер, Патрик; Пулен, Жюли; Мулен, Клементина; Бурден, Гийом; Иванкоу, Гийом; Ромак, Сара; Агостини, Сильвен; Банайгс, Бернард; Босс, Эммануэль; Боулер, Крис; де Варгас, Колумбан; Дувиль, Эрик; Флорес, Мишель; Форчоли, Дидье; Фурла, Паола; Галанд, Пьер; Гилсон, Эрик; Ломбард, Фабьен; Пезан, Стефан; Рейно, Стефани; Сунагава, Синъити; Томас, Оливье; Трабле, Ромен; Зоккола, Дидье; Корреа, Адриенн М.С.; Вега Тербер, Ребекка Л. (2022). «Эндогенные вирусные элементы обнаруживают ассоциации между неретровирусным РНК-вирусом и симбиотическими геномами динофлагеллят» . Коммуникационная биология . 6 (1). Лаборатория Колд-Спринг-Харбор: 566. bioRxiv 10.1101/2022.04.11.487905 . дои : 10.1038/s42003-023-04917-9 . hdl : 20.500.11850/616065 . ПМЦ 10235124 . ПМИД 37264063 . S2CID 248151603 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 13 октября 2022 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Амин, Шейди А.; Паркер, Микаэла С.; Армбруст, Э. Вирджиния (сентябрь 2012 г.). «Взаимодействие диатомей и бактерий» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (3): 667–684. дои : 10.1128/MMBR.00007-12 . ISSN 1092-2172 . ПМЦ 3429620 . ПМИД 22933565 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Мальвия, Шрути; Скалько, Элеонора; Аудик, Стефан; Винсент, Флора; Велучами, Алагурадж; Пулен, Жюли; Винкер, Патрик; Иудиконе, Даниэле; де Варгас, Колумбан; Биттнер, Люси; Зингоне, Адриана; Боулер, Крис (15 марта 2016 г.). «Понимание глобального распределения и разнообразия диатомовых водорослей в мировом океане» . Труды Национальной академии наук . 113 (11): Е1516-25. Бибкод : 2016PNAS..113E1516M . дои : 10.1073/pnas.1509523113 . ISSN 0027-8424 . ПМК 4801293 . ПМИД 26929361 .
^ Сметачек, Виктор (1 марта 1999 г.). «Диатомовые водоросли и углеродный цикл океана» . Протист . 150 (1): 25–32. дои : 10.1016/S1434-4610(99)70006-4 . ISSN 1434-4610 . ПМИД 10724516 . Архивировано из оригинала 7 июля 2022 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Кой, Саманта Р.; Ганн, Эрик Р.; Паунд, Хелена Л.; Коротко, Стивен М.; Вильгельм, Стивен В. (сентябрь 2018 г.). «Вирусы эукариотических водорослей: разнообразие, методы обнаружения и будущие направления» . Вирусы . 10 (9): 487. дои : 10.3390/v10090487 . ISSN 1999-4915 . ПМК 6165237 . ПМИД 30208617 .
^ Вальде, Мари; Камлонг, Сиприен; де Варгас, Колумбан; Боду, Анн-Клер; Саймон, Натали (2023). «Вирусная инфекция влияет на трехмерную субклеточную структуру широко распространенной морской диатомовой водоросли Guinardia delicatula» . Границы морской науки . 9 . дои : 10.3389/fmars.2022.1034235 . ISSN 2296-7745 .
^ Ян, Сяодун; Чипман, Пол Р.; Кастберг, Тонье; Братбак, Гуннар; Бейкер, Тимоти С. (июль 2005 г.). «Вирус морских водорослей PpV01 имеет икосаэдрический капсид с квазисимметрией T = 219» . Журнал вирусологии . 79 (14): 9236–9243. doi : 10.1128/JVI.79.14.9236-9243.2005 . ISSN 0022-538X . ПМЦ 1168743 . ПМИД 15994818 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Арсеньев, Лора; Саймон, Натали; Риго-Жалабер, Фабьен; Ле Галль, Флоренция; Шаффрон, Сэмюэл; Корре, Эрван; Привет, Эммануэль; Бигерд, Эстель; Боду, Анн-Клер (9 января 2019 г.). «Первые вирусы, заражающие морскую диатомовую водоросль Guinardia delicatula» . Границы микробиологии . 9 :3235.дои 10.3389 : /fmicb.2018.03235 . ISSN 1664-302X . ПМК 6334475 . ПМИД 30687251 .
^ ЛИ, Р.Э. (1 мая 1971 г.). «Системный вирусный материал в клетках пресноводной красной водоросли Sirodotia Tenuissima (Holden) Skuja» . Журнал клеточной науки . 8 (3): 623–631. дои : 10.1242/jcs.8.3.623 . ISSN 1477-9137 . ПМИД 4103447 .
^ Саттл, Кертис А.; Чан, Эми М.; Коттрелл, Мэтью Т. (март 1991 г.). «Использование ультрафильтрации для выделения из морской воды вирусов, являющихся возбудителями морского фитопланктона» . Прикладная и экологическая микробиология . 57 (3): 721–726. Бибкод : 1991ApEnM..57..721S . doi : 10.1128/aem.57.3.721-726.1991 . ISSN 0099-2240 . ПМК 182786 . ПМИД 16348439 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Нагасаки, Кейзо; Томару, Юджи; Катанозака, Нориаки; Шираи, Йоко; Нисида, Кенсё; Итакура, Сигэру; Ямагучи, Минео (февраль 2004 г.). «Выделение и характеристика нового одноцепочечного РНК-вируса, инфицирующего цветущую диатомовую водоросль Rhizosolenia setigera» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (2): 704–711. Бибкод : 2004ApEnM..70..704N . дои : 10.1128/АЕМ.70.2.704-711.2004 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 348932 . ПМИД 14766545 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ким, ДжинДжу; Ким, Чан Хун; Юн, Сок-Хён; Чхве, Тэ-Джин (1 июня 2015 г.). «Выделение и физиологическая характеристика нового альгицидного вируса, инфицирующего морскую диатомовую скелетонему костатум» . Журнал патологии растений . 31 (2): 186–191. дои : 10.5423/PPJ.NT.03.2015.0029 . ISSN 1598-2254 . ПМК 4454000 . ПМИД 26060438 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Томару, Юджи; Тойода, Кенсуке; Сузуки, Хидекадзу; Нагумо, Тамоцу; Кимура, Кей; Такао, Ёситаке (26 ноября 2013 г.). «Новый одноцепочечный ДНК-вирус с уникальной геномной структурой, поражающий морскую диатомовую водоросль Chaetoceros setoensis» . Научные отчеты . 3 (1): 3337. Бибкод : 2013NatSR...3E3337T . дои : 10.1038/srep03337 . ISSN 2045-2322 . ПМЦ 3840382 . ПМИД 24275766 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Доля, Валериан В.; Кунин, Евгений В. (15 января 2018 г.). «Метагеномика меняет представления об эволюции РНК-вирусов, обнаруживая обширный горизонтальный перенос вируса» . Вирусные исследования . 244 : 36–52. doi : 10.1016/j.virusres.2017.10.020 . ISSN 0168-1702 . ПМК 5801114 . ПМИД 29103997 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Доля, Валериан В; Кунин, Евгений V (1 ноября 2011 г.). «Общее происхождение и зависящее от хозяина разнообразие виромов растений и животных» . Современное мнение в вирусологии . 1 (5): 322–331. дои : 10.1016/j.coviro.2011.09.007 . ISSN 1879-6257 . ПМК 3293486 . ПМИД 22408703 .
^ Кунин Евгений Владимирович; Вольф, Юрий И.; Нагасаки, Кейзо; Доля, Валериан В. (декабрь 2008 г.). «Большой взрыв эволюции пикорноподобных вирусов предшествовал появлению супергрупп эукариот» . Обзоры природы Микробиология . 6 (12): 925–939. дои : 10.1038/nrmicro2030 . ISSN 1740-1526 . ПМИД 18997823 . S2CID 205497478 .
^ «Текущий выпуск таксономии ICTV | ICTV» . ictv.global . Архивировано из оригинала 20 марта 2020 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Питтман, Джон К.; Дин, Эндрю П.; Осундеко, Олумайова (январь 2011 г.). «Потенциал устойчивого производства биотоплива из водорослей с использованием ресурсов сточных вод» . Биоресурсные технологии . 102 (1): 17–25. Бибкод : 2011BiTec.102...17P . doi : 10.1016/j.biortech.2010.06.035 . ISSN 0960-8524 . ПМИД 20594826 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Иллман, AM; Скрэгг, АХ; Шейлс, Юго-Запад (1 ноября 2000 г.). «Увеличение теплотворной способности штаммов хлореллы при выращивании в среде с низким содержанием азота» . Ферментные и микробные технологии . 27 (8): 631–635. дои : 10.1016/s0141-0229(00)00266-0 . ISSN 0141-0229 . ПМИД 11024528 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Сьерра, Э.; Асьен, ФГ; Фернандес, Х.М.; Гарсия, JL; Гонсалес, К.; Молина, Э. (май 2008 г.). «Характеристика плоского фотобиореактора для производства микроводорослей» . Химико-технологический журнал . 138 (1–3): 136–147. Бибкод : 2008ЧЭнЖ.138..136С . doi : 10.1016/j.cej.2007.06.004 . ISSN 1385-8947 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Чиу, Шэн-И; Као, Чиен-Я; Чен, Чиун-Сюнь; Куан, Тан-Цзин; Онг, Соу-Чин; Линь, Чи-Шэн (июнь 2008 г.). «Снижение выбросов CO2 с помощью высокоплотной культуры Chlorella sp. в фотобиореакторе полунепрерывного действия» . Биоресурсные технологии . 99 (9): 3389–3396. doi : 10.1016/j.biortech.2007.08.013 . ISSN 0960-8524 . ПМИД 17904359 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Ямада, Такаши; Ониматсу, Хидеки; Ван Эттен, Джеймс Л. (2006), Вирусы хлореллы , Достижения в области исследований вирусов, том. 66, Academic Press, стр. 293–336, номер документа : 10.1016/S0065-3527(06)66006-5 , ISBN. 978-0-12-039869-0 , ЧВК 1955756 , ПМИД 16877063
^ Перейти обратно: ^а ^б Ван Эттен, JL; Лейн, ЖК; Мейнц, Р.Х. (1 декабря 1991 г.). «Вирусы и вирусоподобные частицы эукариотических водорослей» . Микробиологические обзоры . 55 (4): 586–620. дои : 10.1128/мр.55.4.586-620.1991 . ISSN 0146-0749 . ПМЦ 372839 . ПМИД 1779928 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Ховард-Варона, Кристина; Харгривз, Кэтрин Р.; Абедон, Стивен Т; Салливан, Мэтью Б. (14 марта 2017 г.). «Лизогения в природе: механизмы, влияние и экология умеренных фагов» . Журнал ISME . 11 (7): 1511–1520. Бибкод : 2017ISMEJ..11.1511H . дои : 10.1038/ismej.2017.16 . ISSN 1751-7362 . ПМК 5520141 . ПМИД 28291233 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Ёсида, Мицухиро; Ёсида, Такаши; Касима, Аки; Такашима, Юкари; Хосода, Наахико; Нагасаки, Кейзо; Хироиси, Синго (15 мая 2008 г.). «Экологическая динамика токсичной цветущей цианобактерии Microcystis aeruginosa и ее цианофагов в пресной воде» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (10): 3269–3273. Бибкод : 2008ApEnM..74.3269Y . дои : 10.1128/aem.02240-07 . ISSN 0099-2240 . ПМК 2394914 . ПМИД 18344338 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ДЭН, ЛИ; ХЕЙС, ПОЛ К. (июнь 2008 г.). «Доказательства активности цианофагов в отношении пресноводных цианобактерий, образующих цветение» . Пресноводная биология . 53 (6): 1240–1252. Бибкод : 2008FrBio..53.1240D . дои : 10.1111/j.1365-2427.2007.01947.x . ISSN 0046-5070 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Хондзё, Миэ; Мацуи, Кадзуаки; Уэки, Масая; Накамура, Рёта; Фурман, Джед А.; Кавабата, Зеньитиро (апрель 2006 г.). «Разнообразие вирусоподобных агентов, убивающих Microcystis aeruginosa в гиперэвтрофном пруду» . Журнал исследований планктона . 28 (4): 407–412. дои : 10.1093/plankt/fbi128 . ISSN 1464-3774 .

[Short-2020-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Коротко, Стивен М.; Станьевски, Майкл А.; Чабан Юрий В.; Лонг, Эндрю М.; Ван, Дунлинь (2020). «Разнообразие вирусов, поражающих эукариотические водоросли» . Актуальные проблемы молекулярной биологии . 39 : 29–62. дои : 10.21775/cimb.039.029 . ПМИД 32073403 . S2CID 211193770 .

[2] Циммер, Карл (15 сентября 2011 г.). Планета вирусов . Издательство Чикагского университета. ISBN 978-0-226-98335-6 .

[Coy-2018-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с Кой, Саманта Р.; Ганн, Эрик Р.; Паунд, Хелена Л.; Коротко, Стивен М.; Вильгельм, Стивен В. (2018). «Вирусы эукариотических водорослей: разнообразие, методы обнаружения и будущие направления» . Вирусы . 10 (9): 487. дои : 10.3390/v10090487 . ПМК 6165237 . ПМИД 30208617 .

[4] Монируззаман, Мохаммед; Вайнхаймер, Алайна Р; Мартинес-Гутьеррес, Каролина А; Эйлуорд, Фрэнк О (2020). «Широко распространенная эндогенизация гигантских вирусов формирует геномы зеленых водорослей» . Природа . 588 (7836): 141–145. Бибкод : 2020Natur.588..141M . дои : 10.1038/s41586-020-2924-2 . ПМИД 33208937 . S2CID 227065267 .

[5] Виджил, Алекс Дж.; Бистолас, Калия С.И.; Вулстра, Кристиан Р.; Хьюм, Бенджамин CC; Самолеты, Серж; Аллеманд, Денис; Буассен, Эмили; Винкер, Патрик; Пулен, Жюли; Мулен, Клементина; Бурден, Гийом; Иванкоу, Гийом; Ромак, Сара; Агостини, Сильвен; Банайгс, Бернард; Босс, Эммануэль; Боулер, Крис; де Варгас, Колумбан; Дувиль, Эрик; Флорес, Мишель; Форчоли, Дидье; Фурла, Паола; Галанд, Пьер; Гилсон, Эрик; Ломбард, Фабьен; Пезан, Стефан; Рейно, Стефани; Сунагава, Синъити; Томас, Оливье; Трабле, Ромен; Зоккола, Дидье; Корреа, Адриенн М.С.; Вега Тербер, Ребекка Л. (2022). «Эндогенные вирусные элементы обнаруживают ассоциации между неретровирусным РНК-вирусом и симбиотическими геномами динофлагеллят» . Коммуникационная биология . 6 (1). Лаборатория Колд-Спринг-Харбор: 566. bioRxiv 10.1101/2022.04.11.487905 . дои : 10.1038/s42003-023-04917-9 . hdl : 20.500.11850/616065 . ПМЦ 10235124 . ПМИД 37264063 . S2CID 248151603 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 13 октября 2022 г.

[Amin-2012-6] Перейти обратно: ^а ^б Амин, Шейди А.; Паркер, Микаэла С.; Армбруст, Э. Вирджиния (сентябрь 2012 г.). «Взаимодействие диатомей и бактерий» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (3): 667–684. дои : 10.1128/MMBR.00007-12 . ISSN 1092-2172 . ПМЦ 3429620 . ПМИД 22933565 .

[Malviya-2016-7] Перейти обратно: ^а ^б Мальвия, Шрути; Скалько, Элеонора; Аудик, Стефан; Винсент, Флора; Велучами, Алагурадж; Пулен, Жюли; Винкер, Патрик; Иудиконе, Даниэле; де Варгас, Колумбан; Биттнер, Люси; Зингоне, Адриана; Боулер, Крис (15 марта 2016 г.). «Понимание глобального распределения и разнообразия диатомовых водорослей в мировом океане» . Труды Национальной академии наук . 113 (11): Е1516-25. Бибкод : 2016PNAS..113E1516M . дои : 10.1073/pnas.1509523113 . ISSN 0027-8424 . ПМК 4801293 . ПМИД 26929361 .

[8] Сметачек, Виктор (1 марта 1999 г.). «Диатомовые водоросли и углеродный цикл океана» . Протист . 150 (1): 25–32. дои : 10.1016/S1434-4610(99)70006-4 . ISSN 1434-4610 . ПМИД 10724516 . Архивировано из оригинала 7 июля 2022 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[9] Кой, Саманта Р.; Ганн, Эрик Р.; Паунд, Хелена Л.; Коротко, Стивен М.; Вильгельм, Стивен В. (сентябрь 2018 г.). «Вирусы эукариотических водорослей: разнообразие, методы обнаружения и будущие направления» . Вирусы . 10 (9): 487. дои : 10.3390/v10090487 . ISSN 1999-4915 . ПМК 6165237 . ПМИД 30208617 .

[10] Вальде, Мари; Камлонг, Сиприен; де Варгас, Колумбан; Боду, Анн-Клер; Саймон, Натали (2023). «Вирусная инфекция влияет на трехмерную субклеточную структуру широко распространенной морской диатомовой водоросли Guinardia delicatula» . Границы морской науки . 9 . дои : 10.3389/fmars.2022.1034235 . ISSN 2296-7745 .

[11] Ян, Сяодун; Чипман, Пол Р.; Кастберг, Тонье; Братбак, Гуннар; Бейкер, Тимоти С. (июль 2005 г.). «Вирус морских водорослей PpV01 имеет икосаэдрический капсид с квазисимметрией T = 219» . Журнал вирусологии . 79 (14): 9236–9243. doi : 10.1128/JVI.79.14.9236-9243.2005 . ISSN 0022-538X . ПМЦ 1168743 . ПМИД 15994818 .

[Arsenieff-2019-12] Перейти обратно: ^а ^б ^с Арсеньев, Лора; Саймон, Натали; Риго-Жалабер, Фабьен; Ле Галль, Флоренция; Шаффрон, Сэмюэл; Корре, Эрван; Привет, Эммануэль; Бигерд, Эстель; Боду, Анн-Клер (9 января 2019 г.). «Первые вирусы, заражающие морскую диатомовую водоросль Guinardia delicatula» . Границы микробиологии . 9 :3235.дои 10.3389 : /fmicb.2018.03235 . ISSN 1664-302X . ПМК 6334475 . ПМИД 30687251 .

[13] ЛИ, Р.Э. (1 мая 1971 г.). «Системный вирусный материал в клетках пресноводной красной водоросли Sirodotia Tenuissima (Holden) Skuja» . Журнал клеточной науки . 8 (3): 623–631. дои : 10.1242/jcs.8.3.623 . ISSN 1477-9137 . ПМИД 4103447 .

[14] Саттл, Кертис А.; Чан, Эми М.; Коттрелл, Мэтью Т. (март 1991 г.). «Использование ультрафильтрации для выделения из морской воды вирусов, являющихся возбудителями морского фитопланктона» . Прикладная и экологическая микробиология . 57 (3): 721–726. Бибкод : 1991ApEnM..57..721S . doi : 10.1128/aem.57.3.721-726.1991 . ISSN 0099-2240 . ПМК 182786 . ПМИД 16348439 .

[Nagasaki-2004-15] Перейти обратно: ^а ^б ^с Нагасаки, Кейзо; Томару, Юджи; Катанозака, Нориаки; Шираи, Йоко; Нисида, Кенсё; Итакура, Сигэру; Ямагучи, Минео (февраль 2004 г.). «Выделение и характеристика нового одноцепочечного РНК-вируса, инфицирующего цветущую диатомовую водоросль Rhizosolenia setigera» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (2): 704–711. Бибкод : 2004ApEnM..70..704N . дои : 10.1128/АЕМ.70.2.704-711.2004 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 348932 . ПМИД 14766545 .

[Kim-2015-16] Перейти обратно: ^а ^б Ким, ДжинДжу; Ким, Чан Хун; Юн, Сок-Хён; Чхве, Тэ-Джин (1 июня 2015 г.). «Выделение и физиологическая характеристика нового альгицидного вируса, инфицирующего морскую диатомовую скелетонему костатум» . Журнал патологии растений . 31 (2): 186–191. дои : 10.5423/PPJ.NT.03.2015.0029 . ISSN 1598-2254 . ПМК 4454000 . ПМИД 26060438 .

[Tomaru-2013-17] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Томару, Юджи; Тойода, Кенсуке; Сузуки, Хидекадзу; Нагумо, Тамоцу; Кимура, Кей; Такао, Ёситаке (26 ноября 2013 г.). «Новый одноцепочечный ДНК-вирус с уникальной геномной структурой, поражающий морскую диатомовую водоросль Chaetoceros setoensis» . Научные отчеты . 3 (1): 3337. Бибкод : 2013NatSR...3E3337T . дои : 10.1038/srep03337 . ISSN 2045-2322 . ПМЦ 3840382 . ПМИД 24275766 .

[Dolja-2018-18] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Доля, Валериан В.; Кунин, Евгений В. (15 января 2018 г.). «Метагеномика меняет представления об эволюции РНК-вирусов, обнаруживая обширный горизонтальный перенос вируса» . Вирусные исследования . 244 : 36–52. doi : 10.1016/j.virusres.2017.10.020 . ISSN 0168-1702 . ПМК 5801114 . ПМИД 29103997 .

[Dolja-2011-19] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Доля, Валериан В; Кунин, Евгений V (1 ноября 2011 г.). «Общее происхождение и зависящее от хозяина разнообразие виромов растений и животных» . Современное мнение в вирусологии . 1 (5): 322–331. дои : 10.1016/j.coviro.2011.09.007 . ISSN 1879-6257 . ПМК 3293486 . ПМИД 22408703 .

[20] Кунин Евгений Владимирович; Вольф, Юрий И.; Нагасаки, Кейзо; Доля, Валериан В. (декабрь 2008 г.). «Большой взрыв эволюции пикорноподобных вирусов предшествовал появлению супергрупп эукариот» . Обзоры природы Микробиология . 6 (12): 925–939. дои : 10.1038/nrmicro2030 . ISSN 1740-1526 . ПМИД 18997823 . S2CID 205497478 .

[21] «Текущий выпуск таксономии ICTV | ICTV» . ictv.global . Архивировано из оригинала 20 марта 2020 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[22] Питтман, Джон К.; Дин, Эндрю П.; Осундеко, Олумайова (январь 2011 г.). «Потенциал устойчивого производства биотоплива из водорослей с использованием ресурсов сточных вод» . Биоресурсные технологии . 102 (1): 17–25. Бибкод : 2011BiTec.102...17P . doi : 10.1016/j.biortech.2010.06.035 . ISSN 0960-8524 . ПМИД 20594826 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[Illman-2000-23] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Иллман, AM; Скрэгг, АХ; Шейлс, Юго-Запад (1 ноября 2000 г.). «Увеличение теплотворной способности штаммов хлореллы при выращивании в среде с низким содержанием азота» . Ферментные и микробные технологии . 27 (8): 631–635. дои : 10.1016/s0141-0229(00)00266-0 . ISSN 0141-0229 . ПМИД 11024528 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[24] Сьерра, Э.; Асьен, ФГ; Фернандес, Х.М.; Гарсия, JL; Гонсалес, К.; Молина, Э. (май 2008 г.). «Характеристика плоского фотобиореактора для производства микроводорослей» . Химико-технологический журнал . 138 (1–3): 136–147. Бибкод : 2008ЧЭнЖ.138..136С . doi : 10.1016/j.cej.2007.06.004 . ISSN 1385-8947 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[25] Чиу, Шэн-И; Као, Чиен-Я; Чен, Чиун-Сюнь; Куан, Тан-Цзин; Онг, Соу-Чин; Линь, Чи-Шэн (июнь 2008 г.). «Снижение выбросов CO2 с помощью высокоплотной культуры Chlorella sp. в фотобиореакторе полунепрерывного действия» . Биоресурсные технологии . 99 (9): 3389–3396. doi : 10.1016/j.biortech.2007.08.013 . ISSN 0960-8524 . ПМИД 17904359 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[Yamada-2006-26] Перейти обратно: ^а ^б Ямада, Такаши; Ониматсу, Хидеки; Ван Эттен, Джеймс Л. (2006), Вирусы хлореллы , Достижения в области исследований вирусов, том. 66, Academic Press, стр. 293–336, номер документа : 10.1016/S0065-3527(06)66006-5 , ISBN. 978-0-12-039869-0 , ЧВК 1955756 , ПМИД 16877063

[Van_Etten-1991-27] Перейти обратно: ^а ^б Ван Эттен, JL; Лейн, ЖК; Мейнц, Р.Х. (1 декабря 1991 г.). «Вирусы и вирусоподобные частицы эукариотических водорослей» . Микробиологические обзоры . 55 (4): 586–620. дои : 10.1128/мр.55.4.586-620.1991 . ISSN 0146-0749 . ПМЦ 372839 . ПМИД 1779928 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[Howard-Varona-2017-28] Перейти обратно: ^а ^б Ховард-Варона, Кристина; Харгривз, Кэтрин Р.; Абедон, Стивен Т; Салливан, Мэтью Б. (14 марта 2017 г.). «Лизогения в природе: механизмы, влияние и экология умеренных фагов» . Журнал ISME . 11 (7): 1511–1520. Бибкод : 2017ISMEJ..11.1511H . дои : 10.1038/ismej.2017.16 . ISSN 1751-7362 . ПМК 5520141 . ПМИД 28291233 .

[Yoshida-2008-29] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Ёсида, Мицухиро; Ёсида, Такаши; Касима, Аки; Такашима, Юкари; Хосода, Наахико; Нагасаки, Кейзо; Хироиси, Синго (15 мая 2008 г.). «Экологическая динамика токсичной цветущей цианобактерии Microcystis aeruginosa и ее цианофагов в пресной воде» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (10): 3269–3273. Бибкод : 2008ApEnM..74.3269Y . дои : 10.1128/aem.02240-07 . ISSN 0099-2240 . ПМК 2394914 . ПМИД 18344338 . Архивировано из оригинала 3 сентября 2024 года . Проверено 9 мая 2023 г.

[DENG-2008-30] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ДЭН, ЛИ; ХЕЙС, ПОЛ К. (июнь 2008 г.). «Доказательства активности цианофагов в отношении пресноводных цианобактерий, образующих цветение» . Пресноводная биология . 53 (6): 1240–1252. Бибкод : 2008FrBio..53.1240D . дои : 10.1111/j.1365-2427.2007.01947.x . ISSN 0046-5070 .

[Honjo-2006-31] Перейти обратно: ^а ^б ^с Хондзё, Миэ; Мацуи, Кадзуаки; Уэки, Масая; Накамура, Рёта; Фурман, Джед А.; Кавабата, Зеньитиро (апрель 2006 г.). «Разнообразие вирусоподобных агентов, убивающих Microcystis aeruginosa в гиперэвтрофном пруду» . Журнал исследований планктона . 28 (4): 407–412. дои : 10.1093/plankt/fbi128 . ISSN 1464-3774 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]