NCI-60
Группа линии NCI-60 раковой клеточной линии представляет собой группу из 60 клеточных линий рака человека , используемых Национальным институтом рака (NCI) для скрининга соединений для обнаружения потенциальной противоопухолевой активности. [ 1 ]
Цель
[ редактировать ]Процедура скрининга называется экраном NCI-60 опухолевых клеточных линий человека , и это одна из служб обнаружения и развития NCI программы терапии по развитию (DTP). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Скорости скрининга для каждой клеточной линии цитостатическое и цитотоксическое воздействие тестируемых веществ. [ 2 ]
Из -за разнообразия клеточных линий можно сравнить протестированные соединения по их схемам эффекта, высокая корреляция потенциально соответствует аналогичным механизмам эффекта. [ 2 ] Автоматизированное сравнение с базой данных из более чем 88 000 чистых соединений и более 34 000 неочищенных экстрактов (по состоянию на 6 января 2017 года [update]) предоставлен инструментом Compare , который показывает список веществ, ранжированных по коэффициентам корреляции Пирсона для данного тестового вещества. [ 5 ]
Та же панель используется в программе молекулярной мишени для характеристики молекулярных мишеней. Измерения включают уровни белка, измерения РНК, статус мутации и активности ферментов . уровни [ 6 ]
Клеточные линии
[ редактировать ]Панель содержит клеточные линии, представляющие лейкемию , меланому , немелкоклеточную карциному легкого и рак мозга , яичника , молочной железы , толстой кишки , почки и простаты . [ 1 ] [ 2 ]
13 дополнительных клеточных линий оцениваются для использования в программе скрининга, Среди них две линии, полученные до сих пор, не представляли мелкоклеточного карциномы легких . [ 1 ]
Все линии клеток, но одна (по состоянию на 6 января 2017 года [update]) доступны для других лабораторий, включая дополнительные клеточные линии. [ 1 ]
Неправильная идентификация и неправильная классификация
[ редактировать ]Начиная с хода тысячелетия, было обнаружено, что несколько клеточных линий неверно идентифицированы или неверно классифицированы во время расследования или ранее: [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
MDA-MB-435 , первоначально классифицированный как клеточная линия рака молочной железы, был идентифицирован как клеточная линия меланомы. [ 7 ] При дальнейшем исследовании текущий MDA-MB-435, по-видимому, был получен из того же человека, что и клеточная линия M14 . [ 7 ] Исследование клонов ясно показало, что смешивание с M14 произошла очень рано в истории MDA-MB-435, до создания программы терапии развития. [ 7 ]
NCI/ADR-RES , первоначально классифицированный как клеточная линия рака молочной железы, была идентифицирована как линия клеток опухоли яичника. [ 8 ] NCI/ADR-RES, по-видимому, был получен в какой-то момент времени из клеточной линии OVCAR-8 . [ 8 ] Первоначально линия ячейки была названа MCF-7/ADR-RES ; Он был переименован вместе с изменением классификации. [ 8 ]
Было обнаружено, что две линии рака мозга, SNB-19 и U251 , были получены от одного и того же человека. [ 9 ] Это делает смешан вероятным.
61-я клеточная линия, MDA-N , была подтверждена из-за неправильной классифицированной линии клеток MDA-MB-435. [ 7 ] Таким образом, это также неправильно классифицируется, действительно является линейкой клеток меланомы, но по состоянию на 6 января 2018 года [update] Официальный сайт по -прежнему перечисляет его как линию клеток рака молочной железы. [ 1 ] Эта клеточная линия не доступна по состоянию на 6 января 2018 года [update]. [ 1 ]
Международный комитет по аутентификации сотовой линии содержит список загрязненных клеточных линий . [ 10 ] Он включает в себя клеточные линии, сообщаемые выше, хотя обычно с датами отчетности и статьями значительно позже, чем первые даты и статьи, поднимающиеся особое озабоченность относительно соответствующей клеточной линии. [ 10 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
Постоянное использование неправильной классификации
[ редактировать ]По состоянию на 2014 год [update] Сотни исследований по-прежнему используют MDA-MB-435 в качестве модели рака молочной железы, даже после того, как она была официально объявлена линейкой клеток меланомы в 2007 году и даже в международных рецензируемых журналах с самым высоким рейтингом. [ 11 ] Аналогично верно для других неправильно идентифицированных клеточных линий. [ 11 ]
Список клеточных линий NCI-60
[ редактировать ]| Клеточная линия | Классификация опухолей | (Потенциально) неправильно идентифицировано | Оригинальная классификация | Недоступен | Время удвоения (часы) | Плотность инокуляции | Идентификатор и ссылки на виолон |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CCRF-CEM | Лейкемия | 26.7 | 40000 | CCRF-CEM (я хочу: CVCL_0207) | |||
| HL-60 (TB) | Лейкемия | 28.6 | 40000 | HL-60 (TB) (я хочу: CVCL_A794) | |||
| K-562 | Лейкемия | 19.6 | 5000 | K-562 (я хочу: cvcl_0004) | |||
| Очень-4 | Лейкемия | 27.9 | 30000 | MOLT-4 (я хочу: CVCL_0013) | |||
| RPMI-8226 | Лейкемия | 33.5 | 20000 | RPMI-8226 (я хочу: CVCL_0014) | |||
| SR-786 | Лейкемия | 28.7 | 20000 | SR (я хочу: cvcl_1711) | |||
| A549 | Немашетная клеточная легкая | 22.9 | 7500 | A-549 (я хочу: CVCL_0023) | |||
| Ekvx | Немашетная клеточная легкая | 43.6 | 20000 | Ekvx (я хочу: cvcl_1195) | |||
| Хоп-62 | Немашетная клеточная легкая | 39 | 10000 | Hop-62 (я хочу: cvcl_1285) | |||
| HOP-92 | Немашетная клеточная легкая | 79.5 | 20000 | Hop-92 (я хочу: cvcl_1286) | |||
| NCI-H226 | Немашетная клеточная легкая | 61 | 20000 | NCI-H226 (я хочу: CVCL_1544) | |||
| NCI-H23 | Немашетная клеточная легкая | 33.4 | 20000 | NCI-H23 (я хочу: CVCL_1547) | |||
| NCI-H322M | Немашетная клеточная легкая | 35.3 | 20000 | NCI-H322M (я хочу: CVCL_1557) | |||
| NCI-H460 | Немашетная клеточная легкая | 17.8 | 7500 | NCI-H460 (я хочу: CVCL_0459) | |||
| NCI-H522 | Немашетная клеточная легкая | 38.2 | 20000 | NCI-H522 (я хочу: CVCL_1567) | |||
| Коло 205 | Толстой кишки | 23.8 | 15000 | Colo 205 (я хочу: cvcl_0218) | |||
| HCC-2998 | Толстой кишки | 31.5 | 15000 | HCC2998 (я хочу: CVCL_1266) | |||
| HCT116 | Толстой кишки | 17.4 | 5000 | HCT 116 (я хочу: CVCL_0291) | |||
| HCT-15 | Толстой кишки | 20.6 | 10000 | HCT 15 (я хочу: CVCL_0292) | |||
| HT-29 | Толстой кишки | 19.5 | 5000 | HT-29 (я хочу: CVCL_0320) | |||
| KM12 | Толстой кишки | 23.7 | 15000 | KM12 (я хочу: CVCL_1331) | |||
| SW-620 | Толстой кишки | 20.4 | 10000 | SW620 (я хочу: CVCL_0547) | |||
| SF-268 | CNS | 33.1 | 15000 | SF268 (я хочу: CVCL_1689) | |||
| SF-295 | CNS | 29.5 | 10000 | SF295 (я хочу: CVCL_1690) | |||
| SF-539 | CNS | 35.4 | 15000 | SF539 (я хочу: CVCL_1691) | |||
| SNB-19 | CNS | да | CNS | 34.6 | 15000 | SNB-19 (я хочу: CVCL_0535) | |
| SNB-75 | CNS | 62.8 | 20000 | SNB-75 (я хочу: CVCL_1706) | |||
| U251 | CNS | да | CNS | 23.8 | 7500 | U-251 мг (я хочу: cvcl_0021) | |
| Lox MVI | Меланома | 20.5 | 7500 | LAX IMVI (я хочу: CVCL_1381) | |||
| Малме-3м | Меланома | 46.2 | 20000 | Malme-3M (RRID: CVCL_1438) | |||
| M14 | Меланома | 26.3 | 15000 | M14 (я хочу: CVCL_1395) | |||
| MDA-MB-435 | Меланома | да | Грудь | 25.8 | 15000 | MDA-MB-435 (я хочу: CVCL_0417) | |
| SK-MEL-2 | Меланома | 45.5 | 20000 | SK-Mo-2 (я хочу: CVCL_0069) | |||
| SK-MEL-28 | Меланома | 35.1 | 10000 | SK-Mo-28 (я хочу: CVCL_0526) | |||
| SK-MEL-5 | Меланома | 25.2 | 10000 | SK-Mo-5 (я хочу: CVCL_0527) | |||
| UUC-257 | Меланома | 38.5 | 20000 | UACC-257 (я хочу: CVCL_1779) | |||
| WHACAC-62 | Меланома | 31.3 | 10000 | UACC-62 (я хочу: CVCL_1780) | |||
| Игры-1 | Яичник | 31 | 10000 | IGROV-1 (я хочу: CVCL_1304) | |||
| OVCAR-3 | Яичник | 34.7 | 10000 | OVCAR-3 (я хочу: CVCL_0465) | |||
| OVCAR-4 | Яичник | 41.4 | 15000 | OVCAR-4 (я хочу: CVCL_1627) | |||
| OVCAR-5 | Яичник | 48.8 | 20000 | OVCAR-5 (я хочу: CVCL_1628) | |||
| OVCAR-8 | Яичник | 26.1 | 10000 | OVCAR-8 (я хочу: CVCL_1629) | |||
| NCI/ADR-RES (первоначально MCF-7/ADR-RES) | Яичник | да | Грудь | 34 | 15000 | Nci-adr-res (я хочу: cvcl_1452) | |
| SK-OV-3 | Яичник | 48.7 | 20000 | SK-OV-3 (я хочу: CVCL_0532) | |||
| 786-O | Почечный | 22.4 | 10000 | 786-O (я хочу: CVCL_1051) | |||
| A498 | Почечный | 66.8 | 25000 | A-498 (я хочу: CVCL_1056) | |||
| Ахн | Почечный | 27.5 | 10000 | ACHN (я хочу: cvcl_1067) | |||
| Caki-1 | Почечный | 39 | 10000 | CAKI-1 (я хочу: CVCL_0234) | |||
| RXF 393 | Почечный | 62.9 | 15000 | RXF 393L (я хочу: CVCL_1673) | |||
| SN12C | Почечный | 29.5 | 15000 | Sn12c (я хочу: cvcl_1705) | |||
| TK-10 | Почечный | 51.3 | 15000 | TK-10 (я хочу: CVCL_1773) | |||
| Друзья-31 | Почечный | 41.7 | 15000 | UO-31 (я хочу: CVCL_1911) | |||
| ПК-3 | Простата | 27.1 | 7500 | ПК-3 (я хочу: CVCL_0035) | |||
| DU-145 | Простата | 32.3 | 10000 | DU145 (я хочу: CVCL_0105) | |||
| MCF7 | Грудь | 25.4 | 10000 | MCF-7 (я хочу: CVCL_0031) | |||
| MDA-MB-231 | Грудь | 41.9 | 20000 | MDA-MB-231 (я хочу: CVCL_0062) | |||
| MDA-MB-468 | Грудь | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (я хочу: CVCL_0419) | |||
| HS 578t | Грудь | 53.8 | 20000 | HS 578T (я хочу: CVCL_0332) | |||
| MDA-N | Меланома | да | Грудь | недоступен | 22.5 | 15000 | MDA-N (я хочу: CVCL_1910) |
| BT-549 | Грудь | 53.9 | 20000 | BT-549 (я хочу: CVCL_1092) | |||
| T-47d | Грудь | 45.5 | 20000 | T-47D (я хочу: CVCL_0553) |
Список дополнительных клеточных линий
[ редактировать ]| Клеточная линия | Классификация опухолей | Разновидность | Плотность инокуляции | Идентификатор и ссылки на виолон |
|---|---|---|---|---|
| LXFL 529 | Немашетная клеточная легкая | человек | 10000 | LXFL 529L (я хочу: CVCL_D085) |
| DMS 114 | Небольшое клеточное легкое | человек | 20000 | DMS 114 (я хочу: CVCL_1174) |
| SHP-77 | Небольшое клеточное легкое | человек | 40000 | SHP-77 (я хочу: CVCL_1693) |
| DLD-1 | Толстой кишки | человек | 50000 | DLD-1 (я хочу: CVCL_0248) |
| KM20L2 | Толстой кишки | человек | 10000 | KM20L2 (я хочу: CVCL_D889) |
| SNB-78 | CNS | человек | 20000 | SNB-78 (я хочу: CVCL_B321) |
| XF 498 | CNS | человек | 20000 | XF 498 (я хочу: CVCL_8928) |
| RPMI-7951 | Меланома | человек | 20000 | RPMI-7951 (я хочу: CVCL_1666) |
| M19-мел | Меланома | человек | 10000 | M19-mel (я хочу: cvcl_b415) |
| RXF-631 | Почечный | человек | 10000 | RXF 631L (я хочу: CVCL_A780) |
| SN12K1 | Почечный | человек | 10000 | Sn12k1 (я хочу: cvcl_d106) |
| P388 | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 (я хочу: cvcl_7222) |
| P388/ADR | Лейкемия | мышь | 50000 | P388/ADR (я хочу: cvcl_iz75) |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час «Клеточные линии на экране in vitro» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Получено 6 января 2018 года .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый «NCI-60 Человеческие опухолевые клеточные линии экрана» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . 26 августа 2015 года . Получено 6 января 2018 года .
- ^ «Обнаружение и услуги по развитию» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . 26 августа 2015 года . Получено 6 января 2018 года .
- ^ «Добро пожаловать в программу лечения развития» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . Получено 6 января 2018 года .
- ^ «Сравните анализ» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . 11 августа 2015 года . Получено 6 января 2018 года .
- ^ «Молекулярные мишени» . Программа развития терапии . Национальный институт рака. 12 мая 2015 года . Получено 7 января 2018 года .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон «MDA-MB-435 и его вывод MDA-N представляют собой клеточные линии меланомы, а не клеточные линии рака молочной железы» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Получено 6 января 2018 года .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и «Cell Line NCI/ADR-RES-это линия клеток яичника, а не линия молочной железы» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Получено 6 января 2018 года .
- ^ Jump up to: а беременный в «CNS Cell Lines SNB-19 и U251 получены из одного и того же человека» . Программа развития терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Получено 6 января 2018 года .
- ^ Jump up to: а беременный База данных с перекрестными или неправильно идентифицированными клеточными линиями (PDF) , 8.0, Международный комитет по аутентификации сотовой линии (ICLAC), 1 декабря 2016 года , получен 6 января 2018 года
- ^ Jump up to: а беременный Прасад, Vidudala VTS; Гопалан, Рампрасад Ог (2 июня 2015 г.). «Продолжающееся использование MDA-MB-435, клеточной линии меланомы, в качестве модели для рака молочной железы человека, даже в 2014 году» . NPJ Рак молочной железы . 1 : 15002 -. doi : 10.1038/npjbcancer.2015.2 . PMC 5515196 . PMID 28721362 .
- ^ Jump up to: а беременный «Результат поиска Cellosaurus: 61 хиты для" NCI60 Cancel Cell Line Panel " . Виолонавр . Швейцарский институт биоинформатики . Получено 7 января 2018 года . Ссылка включает в себя список связанных страниц в результате поиска.
- ^ «Cellosaurus - ресурс знаний на клеточных линиях» . Виолонавр . Швейцарский институт биоинформатики . Получено 17 января 2018 года . Ссылка включает в себя страницы, найденные в поисках с соответствующими именами ячеек, указанных в списке дополнительных ячеек .