Сравнение реализаций силового поля

Это таблица известных компьютерных программ, реализующих молекулярной механики силовые поля .

Программа	ОПЛС	ЯНТАРЬ	ШАРМ	ГАФФ	ММФФ	QVBMM	УФФ	Комментарии
Морское ушко	UA	94, 96, 99SB, 03, GS, ii, автоматический генератор FF	Нет	Нет	Нет	Нет	UFF- Драйдинг- подобное поле	Для белков , ДНК , лигандов
ЯНТАРЬ	Да	Да	С помощью камеры инструмента , начиная с версии 11.	Да	Нет	Нет	Нет
Аскалаф Дизайнер	UA	94, 99СБ, 03	Нет	Нет	Нет	Нет	Нет
Авогадро	Нет	Нет	Нет	Да	94, 94с	Нет	Да
Воздушный шар	Нет	Нет	Нет	Нет	94	Нет	Нет	MMFF94-подобный
БОСС	Да	Нет	Нет	Нет	Нет	Нет	Нет
ШАРМ	Да*	Да*	Да*	Через CHARMM-GUI	Полный MMFF94, но, по слухам, код не поддерживается.	Нет	Нет	* в стандартной дистрибуции
Он засмеялся	Нет	Да	Нет	Да	Да	Нет	Нет
Утилита Гаусса мм	Нет	Да	Нет	Нет	Нет	Нет	Да	дрейдинга Доступно поле
ГРОМАКС	Да	Да*	Да*	Да	Нет	Нет	Нет	* в стандартной поставке начиная с версии 4.5.0
MOE	АА	89, 94, 99, также с расширенной теорией Хюккеля.	22, 27	Нет	94(а)	Нет	Нет
НАМД	Да	Да	Да	Да	Нет	Нет	Нет
вопрос	Да	Да	Да	Нет	Нет	Нет	Нет	Для биополимеров
Тинкер	УА, АА, АА/Л	94, 96, 98, 99	19, 27	Нет	94	Нет	Нет	Для белков органические молекулы
Это осталось	Нет	94, 96, 99, 03	Нет	Нет	Нет	Нет	Нет	Плюс настраиваемые поля для уточнения найма

См. также

• Силовое поле (химия)
• Список программного обеспечения для молекулярного моделирования Монте-Карло
• Молекулярная механика
• Программное обеспечение для молекулярного дизайна
• Редактор молекул
• Сравнение программного обеспечения для моделирования молекулярной механики
• Молекулярное моделирование на GPU