Липрин-альфа-1

ППФИА1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1N7F
Идентификаторы
Псевдонимы	PPFIA1 , LIP.1, LIP1, LIPRIN, PTPRF, взаимодействующий белок альфа 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 611054 ; МГИ : 1924750 ; Гомологен : 20802 ; GeneCards : PPFIA1 ; OMA : PPFIA1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	70,385,312 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	144,107,466 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; oocyte; ; secondary oocyte; ; buccal mucosa cell; ; sperm; ; Achilles tendon; ; endothelial cell; ; Epithelium of choroid plexus; ; tibia; ; visceral pleura;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; primary oocyte; ; ventricular zone; ; superior cervical ganglion; ; lip; ; esophagus; ; hair follicle;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; signal transducer activity;
Cellular component	presynaptic active zone; focal adhesion; cytoplasm; cytosol; axon; dendrite; protein-containing complex;
Biological process	cell-matrix adhesion; negative regulation of stress fiber assembly; signal transduction; negative regulation of protein localization to plasma membrane; neurotransmitter secretion; glutamate secretion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8500
	233977
	ENSG00000131626 ; ENSG00000288198
	ENSMUSG00000037519
	Q13136
	н/д
	НМ_003626 ; НМ_177423 ; НМ_001378006
	НМ_001033319 ; НМ_001195086
	НП_003617 ; НП_803172 ; НП_001364935
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Липрин-альфа-1 — это белок , который у человека кодируется PPFIA1 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков LAR, взаимодействующих с тирозинфосфатазой (липрин). Липрины взаимодействуют с членами семейства LAR трансмембранных протеинтирозинфосфатаз, которые, как известно, важны для направления аксонов и развития молочных желез. Этот белок связывается с внутриклеточным мембрано-дистальным фосфатазным доменом тирозинфосфатазы LAR и, по-видимому, локализует LAR на клеточных фокальных спайках. Это взаимодействие может регулировать разборку фокальной адгезии и, таким образом, помогать организовывать взаимодействия клетка-матрикс. Альтернативно были описаны варианты сплайсированных транскриптов, кодирующие различные изоформы. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что белок тирозинфосфатаза, тип рецептора, полипептид f (PTPRF), взаимодействующий белок (липрин), альфа 1, взаимодействует с :

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000288198 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000131626, ENSG00000288198 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037519 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Серра-Пажес К., Кедерша Н.Л., Фазикас Л., Медли К., Дебант А., Стреули М. (август 1995 г.). «Трансмембранный белок тирозинфосфатаза LAR и белок, взаимодействующий со спиральным LAR, совместно локализуются в фокальных спайках» . ЭМБО Дж . 14 (12): 2827–2838. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07282.x . ПМЦ 398401 . ПМИД 7796809 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Серра-Пажес К., Медли QG, Тан М., Харт А., Стреули М. (июль 1998 г.). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . J Биол Хим . 273 (25): 15611–15620. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок тирозинфосфатаза PPFIA1, тип рецептора, полипептид f (PTPRF), взаимодействующий белок (липрин), альфа 1» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ко Дж, На М, Ким С, Ли-младший, Ким Э (октябрь 2003 г.). «Взаимодействие семейства ERC RIM-связывающих белков с семейством мультидоменных белков липрин-альфа» . Ж. Биол. Хим . 278 (43): 42377–85. дои : 10.1074/jbc.M307561200 . ПМИД 12923177 .
^ Jump up to: ^а ^б Ко Дж., Ким С., Вальшанов Дж.Г., Шин Х., Ли Дж.Р., Шэн М., Премонт РТ, Вайнберг Р.Дж., Ким Э. (март 2003 г.). «Взаимодействие между липрином-альфа и GIT1 необходимо для нацеливания на рецептор AMPA» . Дж. Нейроски . 23 (5): 1667–77. doi : 10.1523/JNEUROSCI.23-05-01667.2003 . ПМК 6741975 . ПМИД 12629171 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (25): 11686–90. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .

Дальнейшее чтение

Пулидо Р., Серра-Пажес С., Тан М., Стреули М. (1996). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (25): 11686–11690. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .
Вышински М., Ким Э., Дуна А.В., Пассафаро М., Вальшанофф Дж.Г., Серра-Пажес С., Стреули М., Вайнберг Р.Дж., Шэн М. (2002). «Взаимодействие между GRIP и липрином-альфа/SYD2 необходимо для нацеливания на рецептор AMPA» . Нейрон . 34 (1): 39–52. дои : 10.1016/S0896-6273(02)00640-2 . ПМИД 11931740 .
Ко Дж., Ким С., Вальшанов Дж.Г., Шин Х., Ли Дж.Р., Шэн М., Премонт РТ, Вайнберг Р.Дж., Ким Э (2003). «Взаимодействие между липрином-альфа и GIT1 необходимо для нацеливания на рецептор AMPA» . Дж. Нейроски . 23 (5): 1667–1677. doi : 10.1523/JNEUROSCI.23-05-01667.2003 . ПМК 6741975 . ПМИД 12629171 .
Ко Дж, На М, Ким С, Ли-младший, Ким Э (2004). «Взаимодействие семейства ERC RIM-связывающих белков с семейством мультидоменных белков липрин-альфа» . Ж. Биол. Хим . 278 (43): 42377–42385. дои : 10.1074/jbc.M307561200 . ПМИД 12923177 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С., Уэллс К.Д., Фосетт Дж.П., Кулкарни С., Металников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вуджетт Дж.Р., Лангеберг Л.К., Скотт Дж.Д., Поусон Т. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–1450. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Серра-Пажес К., Стреули М., Медли К.Г. (2006). «Фосфорилирование липрина регулирует связывание с LAR: доказательства аутофосфорилирования липрина» . Биохимия . 44 (48): 15715–15724. дои : 10.1021/bi051434f . ПМК 2529169 . ПМИД 16313174 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.И. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–814. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–648. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 .
Хугенраад CC , Фелиу-Мойер М.И., Спенглер С.А., Мильштейн А.Д., Дуна А.В., Хунг А.Ю., Шэн М. (2007). «Расщепление липринальфа1 кальций/кальмодулин-зависимой протеинкиназой II регулирует распределение тирозинфосфатазы рецептора LAR и развитие дендритов» . Дев. Клетка . 12 (4): 587–602. дои : 10.1016/j.devcel.2007.02.006 . ПМИД 17419996 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q13136 (Liprin-alpha-1) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000288198 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000131626, ENSG00000288198 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037519 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7796809-5] Jump up to: ^а ^б Серра-Пажес К., Кедерша Н.Л., Фазикас Л., Медли К., Дебант А., Стреули М. (август 1995 г.). «Трансмембранный белок тирозинфосфатаза LAR и белок, взаимодействующий со спиральным LAR, совместно локализуются в фокальных спайках» . ЭМБО Дж . 14 (12): 2827–2838. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07282.x . ПМЦ 398401 . ПМИД 7796809 .

[pmid9624153-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Серра-Пажес К., Медли QG, Тан М., Харт А., Стреули М. (июль 1998 г.). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . J Биол Хим . 273 (25): 15611–15620. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок тирозинфосфатаза PPFIA1, тип рецептора, полипептид f (PTPRF), взаимодействующий белок (липрин), альфа 1» .

[pmid12923177-8] Jump up to: ^а ^б ^с Ко Дж, На М, Ким С, Ли-младший, Ким Э (октябрь 2003 г.). «Взаимодействие семейства ERC RIM-связывающих белков с семейством мультидоменных белков липрин-альфа» . Ж. Биол. Хим . 278 (43): 42377–85. дои : 10.1074/jbc.M307561200 . ПМИД 12923177 .

[pmid12629171-9] Jump up to: ^а ^б Ко Дж., Ким С., Вальшанов Дж.Г., Шин Х., Ли Дж.Р., Шэн М., Премонт РТ, Вайнберг Р.Дж., Ким Э. (март 2003 г.). «Взаимодействие между липрином-альфа и GIT1 необходимо для нацеливания на рецептор AMPA» . Дж. Нейроски . 23 (5): 1667–77. doi : 10.1523/JNEUROSCI.23-05-01667.2003 . ПМК 6741975 . ПМИД 12629171 .

[pmid16189514-10] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid8524829-11] Jump up to: ^а ^б ^с Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (25): 11686–90. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]