ПТПРС

ПТПРС
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2FH7, 2YD2, 2YD3, 2YD9, 4BPC, 4PBX
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRS , PTPSIGMA, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа S, R-PTP-S, R-PTP-сигма, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа S
Внешние идентификаторы	Опустить : 601576 ; МГИ : 97815 ; Гомологен : 20626 ; GeneCards : PTPRS ; ОМА : PTPRS - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	5,340,812 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	56,783,483 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; sural nerve; ; ventricular zone; ; gastric mucosa; ; stromal cell of endometrium; ; left uterine tube; ; right hemisphere of cerebellum; ; right ovary; ; right lung; ; right coronary artery;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; renal corpuscle; ; superior frontal gyrus; ; Rostral migratory stream; ; primary visual cortex; ; genital tubercle; ; subiculum; ; CA3 field;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	phosphatase activity; protein binding; hydrolase activity; phosphoprotein phosphatase activity; protein tyrosine phosphatase activity; heparin binding; chondroitin sulfate binding; heparan sulfate proteoglycan binding;
Cellular component	integral component of membrane; integral component of plasma membrane; extracellular exosome; membrane; plasma membrane; integral component of synaptic vesicle membrane; integral component of postsynaptic density membrane; postsynaptic density; cell junction; axon; synaptic vesicle membrane; cytoplasmic vesicle; cell projection; neuron projection; perikaryon; synapse; postsynaptic membrane; Schaffer collateral - CA1 synapse; glutamatergic synapse; integral component of presynaptic membrane;
Biological process	cell adhesion; dephosphorylation; protein dephosphorylation; negative regulation of interferon-alpha production; negative regulation of interferon-beta production; negative regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway; negative regulation of neuron projection development; spinal cord development; cerebellum development; hippocampus development; cerebral cortex development; corpus callosum development; negative regulation of axon extension; peptidyl-tyrosine dephosphorylation; negative regulation of collateral sprouting; negative regulation of axon regeneration; negative regulation of dendritic spine development; establishment of endothelial intestinal barrier; modulation of chemical synaptic transmission; synapse organization; regulation of postsynaptic density assembly; synaptic membrane adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5802
	19280
	ENSG00000105426
	ENSMUSG00000013236
	Q13332
	Б0В2Н1
showНМ_002850 ; НМ_130853 ; НМ_130854 ; НМ_130855 ; НМ_001394011 ;
	NM_001394012; NM_001394013
	НМ_001252453 ; НМ_001252455 ; НМ_001252456 ; НМ_011218
	НП_002841 ; НП_570923 ; НП_570924 ; НП_570925
	НП_001239382 ; НП_001239384 ; НП_001239385 ; НП_035348
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза S рецепторного типа , также известная как R-PTP-S , R-PTP-сигма или PTPσ , представляет собой фермент , который у человека кодируется PTPRS геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами, которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференцировку , митотический цикл и онкогенную трансформацию. Этот PTP содержит внеклеточную область, один трансмембранный сегмент и два тандемных внутрицитоплазматических каталитических домена (D1 и D2) и, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. D1 каталитически активен, а D2 каталитически неактивен. Внеклеточная область этого белка состоит из множества Ig-подобных доменов и доменов, подобных фибронектину III типа. Передача сигналов Rem2 влияет на структуру и функцию нейронов частично за счет регуляции экспрессии генов. Молекулярная и клеточная нейробиология. Исследования аналогичного гена на мышах показали, что этот PTP может участвовать во межклеточном взаимодействии , первичном аксоногенезе и наведении аксонов во время эмбриогенеза . Этот PTP также участвует в молекулярном контроле восстановления нервов у взрослых. Четыре альтернативно сплайсированных вариантах транскриптов, которые кодируют разные белки. Сообщалось об ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

PTPRS Белок-миметик может улучшить контроль мышц и мочевого пузыря у крыс с травмами спинного мозга. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PTPRS взаимодействует с:

хондроитинсульфат, протеогликаны , ^{[ 8 ]}
ПТПРД , ^{[ 10 ]} глиального происхождения и
липин-альфа-1 . ^{[ 6 ]}^{[ 11 ]}
НМЕ2 . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105426 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013236 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Вагнер Дж., Гордон Л.А., Хенг Х.Х., Трембле М.Л., Олсен А.С. (март 1997 г.). «Физическое картирование сигма протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа (PTPRS) на хромосоме человека 19p13.3». Геномика . 38 (1): 76–8. дои : 10.1006/geno.1996.0594 . ПМИД 8954782 .
^ Jump up to: ^а ^б Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (январь 1996 г.). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Proc Natl Acad Sci США . 92 (25): 11686–90. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRS, тип рецептора S» .
^ Jump up to: ^а ^б Ланг Б.Т., Крегг Дж.М., ДеПол М.А., Тран А.П., Сюй К., Дайк С.М., Мадалена К.М., Браун Б.П., Венг Ю, Ли С., Карими-Абдолрезаи С., Буш С.А., Шен Ю., Сильвер Дж. (2014). «Модуляция протеогликанового рецептора PTPσ способствует восстановлению после травмы спинного мозга» . Природа . 518 (7539): 404–8. дои : 10.1038/nature13974 . ПМЦ 4336236 . ПМИД 25470046 .
^ Мэгги Фокс (3 декабря 2014 г.). « Беспрецедентное: лекарство может помочь вылечить поврежденный позвоночник» . НБК . Проверено 8 декабря 2014 г.
^ Уоллес М.Дж., Фладд С., Батт Дж., Ротин Д. (май 1998 г.). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2608–16. дои : 10.1128/MCB.18.5.2608 . ПМЦ 110640 . PMID 9566880 .
^ Серра-Пажес К., Медли К.Г., Тан М., Харт А., Стреули М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . Ж. Биол. Хим . 273 (25): 15611–20. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .
^ Хамасаки Х., Фудзитани М., Ямасита Т. (март 2016 г.). «NME2 связывается с PTPσ для передачи сигналов от протеогликанов хондроитинсульфата». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 471 (4): 522–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2016.02.042 . ПМИД 26896769 .

Дальнейшее чтение

Адачи М, Секия М, Аримура Й, Такекава М, Ито Ф, Хинода Й, Имаи К, Ячи А (1992). «Экспрессия протеин-тирозинфосфатазы в пре-В-клетках NALM-6». Рак Рез . 52 (3): 737–40. ПМИД 1370651 .
Эндо Н., Ратледж С.Дж., Опас Э.Э., Фогель Р., Родан Г.А., Шмидт А. (1997). «Человеческая протеинтирозинфосфатаза-сигма: альтернативный сплайсинг и ингибирование бисфосфонатами». Дж. Боун Майнер. Рез . 11 (4): 535–43. дои : 10.1002/jbmr.5650110415 . ПМИД 8992885 . S2CID 84496716 .
Норрис К., Норрис Ф., Коно Д.Х., Вестергаард Х., Педерсен О., Теофилопулос А.Н., Мёллер Н.П. (1997). «Экспрессия протеин-тирозинфосфатаз в основных тканях-мишенях инсулина». ФЭБС Летт . 415 (3): 243–8. дои : 10.1016/S0014-5793(97) 01133-2 ПМИД 9357975 . S2CID 9414519 .
Уоллес М.Дж., Фладд С., Батт Дж., Ротин Д. (1998). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2608–16. дои : 10.1128/MCB.18.5.2608 . ПМЦ 110640 . PMID 9566880 .
Серра-Пажес К., Медли К.Г., Тан М., Харт А., Стреули М. (1998). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . Ж. Биол. Хим . 273 (25): 15611–20. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .
Хауорт К., Шу К.К., Стоукс А., Моррис Р., Стокер А. (1998). «Экспрессия рецепторных тирозинфосфатаз реагирует на повреждение седалищного нерва». Мол. Клетка. Нейроски . 12 (3): 93–104. дои : 10.1006/mcne.1998.0707 . ПМИД 9790732 . S2CID 41195720 .
Эльчебли М., Вагнер Дж., Кеннеди Т.Э., Ланкто С., Михалишин Э., Итье А., Друэн Дж., Трембле М.Л. (1999). «Нейроэндокринная дисплазия у мышей, у которых отсутствует сигма-тирозинфосфатаза». Нат. Жене . 21 (3): 330–3. дои : 10.1038/6859 . ПМИД 10080191 . S2CID 19356972 .
Уоллес М.Дж., Батт Дж., Фладд К.А., Хендерсон Дж.Т., Скарнес В., Ротин Д. (1999). «Дефекты нейронов и гипоплазия задней доли гипофиза у мышей, у которых отсутствует рецептор тирозинфосфатазы PTPsigma». Нат. Жене . 21 (3): 334–8. дои : 10.1038/6866 . ПМИД 10080192 . S2CID 7889181 .
Суарес Пестана Е, Тенев Т, Гросс С, Стоянов Б, Огата М, Бёмер Ф.Д. (1999). «Трансмембранная протеинтирозинфосфатаза RPTPsigma модулирует передачу сигналов рецептора эпидермального фактора роста в клетках A431» . Онкоген . 18 (28): 4069–79. дои : 10.1038/sj.onc.1202794 . ПМИД 10435588 .
Бланшето С., Тертулен Л.Г., Оверворде Дж., ден Хертог Дж. (2003). «Внутри- и межмолекулярные взаимодействия между внутриклеточными доменами рецепторных протеин-тирозинфосфатаз» . Ж. Биол. Хим . 277 (49): 47263–9. дои : 10.1074/jbc.M205810200 . ПМИД 12376545 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мураж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( 2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Ху Ю.Ф., Чжан Х.Л., Цай Т., Харашима С., Ноткинс А.Л. (2006). «Интерактом IA-2» (PDF) . Диабетология . 48 (12): 2576–81. дои : 10.1007/s00125-005-0037-y . ПМИД 16273344 . S2CID 9765497 .
Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А., Кэмп Д.Г., Монро М.Э., Мур Р.Дж., Смит Р.Д. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . J. Протеом Рез . 4 (6): 2070–80. дои : 10.1021/pr0502065 . ПМК 1850943 . ПМИД 16335952 .
Ладжус С., Ланг Дж. (2006). «Вариант сплайсинга 3, но не 2 сигма-рецептора протеинтирозинфосфатазы может опосредовать стимуляцию секреции инсулина альфа-латротоксином». Дж. Селл. Биохим . 98 (6): 1552–9. дои : 10.1002/jcb.20871 . ПМИД 16552719 . S2CID 84223719 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105426 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013236 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8954782-5] Вагнер Дж., Гордон Л.А., Хенг Х.Х., Трембле М.Л., Олсен А.С. (март 1997 г.). «Физическое картирование сигма протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа (PTPRS) на хромосоме человека 19p13.3». Геномика . 38 (1): 76–8. дои : 10.1006/geno.1996.0594 . ПМИД 8954782 .

[pmid8524829-6] Jump up to: ^а ^б Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (январь 1996 г.). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Proc Natl Acad Sci США . 92 (25): 11686–90. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRS, тип рецептора S» .

[Lang_2014-8] Jump up to: ^а ^б Ланг Б.Т., Крегг Дж.М., ДеПол М.А., Тран А.П., Сюй К., Дайк С.М., Мадалена К.М., Браун Б.П., Венг Ю, Ли С., Карими-Абдолрезаи С., Буш С.А., Шен Ю., Сильвер Дж. (2014). «Модуляция протеогликанового рецептора PTPσ способствует восстановлению после травмы спинного мозга» . Природа . 518 (7539): 404–8. дои : 10.1038/nature13974 . ПМЦ 4336236 . ПМИД 25470046 .

[9] Мэгги Фокс (3 декабря 2014 г.). « Беспрецедентное: лекарство может помочь вылечить поврежденный позвоночник» . НБК . Проверено 8 декабря 2014 г.

[pmid9566880-10] Уоллес М.Дж., Фладд С., Батт Дж., Ротин Д. (май 1998 г.). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2608–16. дои : 10.1128/MCB.18.5.2608 . ПМЦ 110640 . PMID 9566880 .

[pmid9624153-11] Серра-Пажес К., Медли К.Г., Тан М., Харт А., Стреули М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . Ж. Биол. Хим . 273 (25): 15611–20. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .

[12] Хамасаки Х., Фудзитани М., Ямасита Т. (март 2016 г.). «NME2 связывается с PTPσ для передачи сигналов от протеогликанов хондроитинсульфата». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 471 (4): 522–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2016.02.042 . ПМИД 26896769 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]