ПТПРН2

ПТПРН2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2QEP, 4HTI, 4HTJ
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRN2 , IA-2beta, IAR, ICAAR, PTPRP, R-PTP-N2, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа N2, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа N2
Внешние идентификаторы	Опустить : 601698 ; МГИ : 107418 ; Гомологен : 2134 ; Генные карты : PTPRN2 ; OMA : PTPRN2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	158,587,823 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	117,240,469 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	lateral nuclear group of thalamus; ; middle temporal gyrus; ; external globus pallidus; ; Brodmann area 23; ; entorhinal cortex; ; orbitofrontal cortex; ; frontal pole; ; superior frontal gyrus; ; Brodmann area 46; ; postcentral gyrus;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; primordial pancreas; ; neural layer of retina; ; cerebellar cortex; ; endocrine pancreas; ; islet of Langerhans; ; zygote; ; morula;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	phosphoprotein phosphatase activity; phosphatase activity; protein tyrosine phosphatase activity; transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; hydrolase activity;
Cellular component	cytoplasm; integral component of membrane; endoplasmic reticulum lumen; secretory granule membrane; membrane; receptor complex; transport vesicle membrane; synapse; integral component of plasma membrane; synaptic vesicle membrane; secretory granule; cell junction; terminal bouton; cytoplasmic vesicle; plasma membrane; ficolin-1-rich granule membrane; integral component of synaptic vesicle membrane;
Biological process	protein dephosphorylation; negative regulation of GTPase activity; dephosphorylation; insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; peptidyl-tyrosine dephosphorylation; neurotransmitter secretion; lipid metabolism; neutrophil degranulation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5799
	19276
	ENSG00000155093 ; ENSG00000282185
	ENSMUSG00000056553
	Q92932
	P80560
	НМ_001308267 ; НМ_001308268 ; НМ_002847 ; НМ_130842 ; НМ_130843
	НМ_011215
	НП_001295196 ; НП_001295197 ; НП_002838 ; НП_570857 ; НП_570858
	НП_035345
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза N2 рецепторного типа (R-PTP-N2), также известная как белок, родственный аутоантигену островковых клеток (ICAAR), а фогрин представляет собой фермент , который у людей кодируется PTPRN2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} PTPRN и PTPRN2 (этот ген) являются основными аутоантигенами, связанными с инсулинозависимым сахарным диабетом . ^{[ 7 ]}

Функция

Из-за близкого сходства последовательностей генов белок , кодируемый этим геном, традиционно считается членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами , которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток , дифференцировку , митотический цикл и онкогенную трансформацию . Однако недавние исследования показали, что мышиный гомолог PTPRN2 , известный как фогрин, дефосфорилирует липидный фосфатидилинозитол , а не тирозин . В частности, было показано, что фогрин действует на фосфатидилинозитол-3-фосфат и фосфатидилинозитол-4,5-дифосфат , тогда как его действие на тирозин никогда не наблюдалось. ^{[ 8 ]} Таким образом, PTPRN2 следует более точно рассматривать как PIPase, а не PTPase . Фосфорилированные формы фосфатидилинозитола (ФИ) называются фосфоинозитидами и играют важную роль в передаче сигналов липидов , передаче сигналов в клетках и транспортировке через мембраны .

Белок, продуцируемый PTPRN2, имеет внеклеточную область, одну трансмембранную область и один внутриклеточный каталитический домен и, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. Каталитический домен этого PTP наиболее тесно связан с PTPRN , также известным как IA-2. ^{[ 7 ]}

Ген

трех альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта этого гена, которые кодируют разные белки. Сообщалось о ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PTPRN2 взаимодействует с: CKAP5 , ^{[ 9 ]} СПТБН4 , ^{[ 10 ]} и UBQLN4 . ^{[ 11 ]}

Клиническое значение

R-PTP-N2 действует как аутоантиген при сахарном диабете 1 типа . ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000282185 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000155093, ENSG00000282185 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056553 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Смит П.Д., Баркер К.Т., Ван Дж., Лу Ю.Дж., Шипли Дж., Кромптон М.Р. (январь 1997 г.). «ICAAR, новый член нового семейства трансмембранных белков, подобных тирозинфосфатазе». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 229 (2): 402–11. дои : 10.1006/bbrc.1996.1817 . ПМИД 8954911 .
^ Ли Кью, Боровицкая А.Е., ДеСильва М.Г., Вассерфаль С., Макларен Н.К., Ноткинс А.Л., Лан М.С. (сентябрь 1997 г.). «Аутоантигены при инсулинозависимом сахарном диабете: молекулярное клонирование и характеристика человеческого IA-2 бета». Proc Assoc Am Врачи . 109 (4): 429–39. ПМИД 9220540 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRN2, тип рецептора, N-полипептид 2» .
^ Каромил Л.А., Оганесян А., Коутс С.А., Зейферт Р.А., Боуэн-Поуп Д.Ф. (апрель 2010 г.). «Нейросекреторный везикулярный белок фогрин действует как фосфатидилинозитолфосфатаза и регулирует секрецию инсулина» . Ж. Биол. Хим . 285 (14): 10487–96. дои : 10.1074/jbc.M109.066563 . ПМЦ 2856256 . ПМИД 20097759 .
^ Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (ноябрь 2002 г.). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геном Рез . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
^ Бергс С., Аггухаро Д., Дирккс Р., Максимова Е., Стабах П., Хермель Дж.М., Чжан Дж.П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (ноябрь 2000 г.). «бетаIV-спектрин, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе» . Дж. Клеточная Биол . 151 (5): 985–1002. дои : 10.1083/jcb.151.5.985 . ПМЦ 2174349 . ПМИД 11086001 .
^ Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.И. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
^ Лу Дж., Ли Кью, Се Х, Чен З.Дж., Боровицкая А.Е., Макларен Н.К., Ноткинс А.Л., Лан М.С. (март 1996 г.). «Идентификация второй трансмембранной протеинтирозинфосфатазы, IA-2beta, как аутоантигена при инсулинозависимом сахарном диабете: предшественника триптического фрагмента массой 37 кДа» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (6): 2307–11. Бибкод : 1996PNAS...93.2307L . дои : 10.1073/pnas.93.6.2307 . ПМК 39791 . ПМИД 8637868 .
^ Пьетропаоло М., Хаттон Дж.К., Эйзенбарт Г.С. (февраль 1997 г.). «Белки, подобные тирозинфосфатазе: связь с IDDM». Уход при диабете . 20 (2): 208–14. дои : 10.2337/diacare.20.2.208 . ПМИД 9118776 . S2CID 5392803 .

Дальнейшее чтение

Лан М.С., Лу Дж., Гото Ю., Ноткинс А.Л. (1994). «Молекулярное клонирование и идентификация белка тирозинфосфатазы рецепторного типа, IA-2, из инсулиномы человека» . ДНК Клеточная Биол . 13 (5): 505–14. дои : 10.1089/dna.1994.13.505 . ПМИД 8024693 .
Цуй Л., Ю В.П., ДеАизпуруа Х.Дж. и др. (1996). «Клонирование и характеристика протеинтирозинфосфатазы (ПТР), связанной с антигеном островковых клеток, нового рецептороподобного ПТР и аутоантигена при инсулинозависимом диабете» . Ж. Биол. Хим . 271 (40): 24817–23. дои : 10.1074/jbc.271.40.24817 . ПМИД 8798755 .
Кавасаки Э., Хаттон Дж.К., Эйзенбарт Г.С. (1996). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческого трансмембранного гомолога тирозинфосфатазы человека, фогрин, аутоантигена диабета 1 типа». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 227 (2): 440–7. дои : 10.1006/bbrc.1996.1526 . ПМИД 8878534 .
Шмидли Р.С., Колман П.Г., Кюи Л. и др. (1998). «Антитела к протеинтирозинфосфатазам IAR и IA-2 связаны с прогрессированием инсулинозависимого диабета (ИЗСД) у родственников первой степени родства, подверженных риску ИЗСД». Аутоиммунитет . 28 (1): 15–23. дои : 10.3109/08916939808993841 . ПМИД 9754810 .
ван ден Маагденберг А.М., Шепенс Дж.Т., Шепенс М.Т. и др. (1999). «Присвоение Ptprn2, гена, кодирующего протеинтирозинфосфатазу IA-2beta рецепторного типа, основного аутоантигена при инсулинозависимом сахарном диабете, к области 12F хромосомы мыши». Цитогенет. Клеточная генетика . 82 (3–4): 153–5. дои : 10.1159/000015090 . ПМИД 9858807 . S2CID 46872092 .
Бергс С., Аггухаро Д., Дирккс Р. и др. (2001). «бетаIV-спектрин, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе» . Дж. Клеточная Биол . 151 (5): 985–1002. дои : 10.1083/jcb.151.5.985 . ПМЦ 2174349 . ПМИД 11086001 .
Кубосаки А., Гросс С., Миура Дж. и др. (2004). «Направленное нарушение гена IA-2beta вызывает непереносимость глюкозы и ухудшает секрецию инсулина, но не предотвращает развитие диабета у мышей NOD» . Диабет . 53 (7): 1684–91. дои : 10.2337/диабет.53.7.1684 . ПМИД 15220191 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000282185 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000155093, ENSG00000282185 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056553 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8954911-5] Смит П.Д., Баркер К.Т., Ван Дж., Лу Ю.Дж., Шипли Дж., Кромптон М.Р. (январь 1997 г.). «ICAAR, новый член нового семейства трансмембранных белков, подобных тирозинфосфатазе». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 229 (2): 402–11. дои : 10.1006/bbrc.1996.1817 . ПМИД 8954911 .

[pmid9220540-6] Ли Кью, Боровицкая А.Е., ДеСильва М.Г., Вассерфаль С., Макларен Н.К., Ноткинс А.Л., Лан М.С. (сентябрь 1997 г.). «Аутоантигены при инсулинозависимом сахарном диабете: молекулярное клонирование и характеристика человеческого IA-2 бета». Proc Assoc Am Врачи . 109 (4): 429–39. ПМИД 9220540 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRN2, тип рецептора, N-полипептид 2» .

[pmid20097759-8] Каромил Л.А., Оганесян А., Коутс С.А., Зейферт Р.А., Боуэн-Поуп Д.Ф. (апрель 2010 г.). «Нейросекреторный везикулярный белок фогрин действует как фосфатидилинозитолфосфатаза и регулирует секрецию инсулина» . Ж. Биол. Хим . 285 (14): 10487–96. дои : 10.1074/jbc.M109.066563 . ПМЦ 2856256 . ПМИД 20097759 .

[pmid12421765-9] Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (ноябрь 2002 г.). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геном Рез . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .

[pmid11086001-10] Бергс С., Аггухаро Д., Дирккс Р., Максимова Е., Стабах П., Хермель Дж.М., Чжан Дж.П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (ноябрь 2000 г.). «бетаIV-спектрин, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе» . Дж. Клеточная Биол . 151 (5): 985–1002. дои : 10.1083/jcb.151.5.985 . ПМЦ 2174349 . ПМИД 11086001 .

[pmid16713569-11] Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.И. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .

[pmid8637868-12] Лу Дж., Ли Кью, Се Х, Чен З.Дж., Боровицкая А.Е., Макларен Н.К., Ноткинс А.Л., Лан М.С. (март 1996 г.). «Идентификация второй трансмембранной протеинтирозинфосфатазы, IA-2beta, как аутоантигена при инсулинозависимом сахарном диабете: предшественника триптического фрагмента массой 37 кДа» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (6): 2307–11. Бибкод : 1996PNAS...93.2307L . дои : 10.1073/pnas.93.6.2307 . ПМК 39791 . ПМИД 8637868 .

[pmid9118776-13] Пьетропаоло М., Хаттон Дж.К., Эйзенбарт Г.С. (февраль 1997 г.). «Белки, подобные тирозинфосфатазе: связь с IDDM». Уход при диабете . 20 (2): 208–14. дои : 10.2337/diacare.20.2.208 . ПМИД 9118776 . S2CID 5392803 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]