ПТПРР

ПТПРР
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2A8B
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRR , EC-PTP, PCPTP1, PTP-SL, PTPBR7, PTPRQ, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа R, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа R
Внешние идентификаторы	Опустить : 602853 ; МГИ : 109559 ; Гомологен : 2135 ; GeneCards : PTPRR ; ОМА : PTPRR — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	70,920,738 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	116,110,837 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; right hemisphere of cerebellum; ; prefrontal cortex; ; entorhinal cortex; ; jejunal mucosa; ; mucosa of transverse colon; ; Brodmann area 46; ; testicle; ; orbitofrontal cortex; ; cerebellar vermis;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; zygote; ; secondary oocyte; ; entorhinal cortex; ; perirhinal cortex; ; lobe of cerebellum; ; CA3 field; ; jejunum; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; lumbar spinal ganglion;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	phosphoprotein phosphatase activity; phosphatase activity; protein binding; protein tyrosine phosphatase activity; transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; protein kinase binding; hydrolase activity;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; plasma membrane; cell junction; perinuclear region of cytoplasm; extracellular space; cytoplasm; cytosol;
Biological process	protein dephosphorylation; in utero embryonic development; ERBB2 signaling pathway; regulation of homophilic cell adhesion; negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; peptidyl-tyrosine dephosphorylation; negative regulation of epithelial cell migration; dephosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	5801
	19279
	ENSG00000153233
	ENSMUSG00000020151
	Q15256
	Q62132
	НМ_001207015 ; НМ_001207016 ; НМ_002849 ; НМ_130846
показывать НМ_001161837 ; НМ_001161838 ; НМ_001161839 ; НМ_001161840 ; НМ_011217 ;
	NM_001358484
	НП_001193944 ; НП_001193945 ; НП_002840 ; НП_570897
показывать НП_001155309 ; НП_001155310 ; НП_001155311 ; НП_001155312 ; НП_035347 ;
	NP_001345413
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рецептор протеинтирозинфосфатазы типа R представляет собой фермент , который у человека кодируется PTPRR геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами, которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференцировку, митотический цикл и онкогенную трансформацию. Этот PTP имеет внеклеточную область, одну трансмембранную область и один внутриклеточный каталитический домен и, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. Было обнаружено, что аналогичный ген, преимущественно экспрессируемый в мозге мышей , связывается с активностью и клеточной локализацией MAP-киназ и, таким образом, регулирует их. Сообщалось, что крысиный аналог этого гена регулируется фактором роста нервов, что предполагает функцию этого гена в росте и дифференцировке нейронов. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PTPRR взаимодействует с MAPK7 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000153233 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020151 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шиодзука К., Ватанабэ Ю., Икеда Т., Хасимото С., Кавасима Х. (ноябрь 1995 г.). «Клонирование и экспрессия PCPTP1, кодирующего протеин тирозинфосфатазу». Джин . 162 (2): 279–84. дои : 10.1016/0378-1119(95)00306-Q . ПМИД 7557444 .
^ ван ден Маагденберг А.М., Шепенс Дж.Т., Шепенс М.Т., Мерккс Г.Ф., Дарруди Ф., Виринга Б., Гертс ван Кессель А., Хендрикс В.Дж. (июль 1999 г.). «Присвоение1 гена PTP-SL/PTPBR7 (Ptprr/PTPRR) области 8A2 хромосомы мыши путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (3–4): 243–4. дои : 10.1159/000015268 . ПМИД 10393441 . S2CID 35964382 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRR, тип рецептора, R» .
^ Бушбек М., Эйкхофф Дж., Зоммер М.Н., Ульрих А. (август 2002 г.). «Фосфотирозин-специфическая фосфатаза PTP-SL регулирует сигнальный путь ERK5» . Ж. Биол. Хим . 277 (33): 29503–9. дои : 10.1074/jbc.M202149200 . ПМИД 12042304 .

Дальнейшее чтение

Шарма Э., Ломброзо П.Дж. (1995). «Нейрональный протеин тирозинфосфатаза, индуцируемый фактором роста нервов» . Ж. Биол. Хим . 270 (1): 49–53. дои : 10.1074/jbc.270.1.49 . ПМИД 7814416 .
Огата М., Савада М., Фуджино Ю., Хамаока Т. (1995). «Клонирование кДНК и характеристика нового протеина тирозинфосфатазы рецепторного типа, экспрессируемого преимущественно в мозге» . Ж. Биол. Хим . 270 (5): 2337–43. дои : 10.1074/jbc.270.5.2337 . ПМИД 7836467 .
Пулидо Р., Суньига А., Ульрих А. (1999). «Протеиновые тирозинфосфатазы PTP-SL и STEP регулируют активацию киназ ERK1 и ERK2, регулируемых внеклеточными сигналами, путем ассоциации через мотив взаимодействия киназ» . ЭМБО Дж . 17 (24): 7337–50. дои : 10.1093/emboj/17.24.7337 . ПМК 1171079 . ПМИД 9857190 .
Огата М., Охора М., Косуги А., Хамаока Т. (1999). «Инактивация митоген-активируемых протеинкиназ тирозин-специфической фосфатазой млекопитающих, PTPBR7». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 256 (1): 52–6. дои : 10.1006/bbrc.1999.0278 . ПМИД 10066421 .
Суньига А., Торрес Дж., Убеда Дж., Пулидо Р. (1999). «Взаимодействие митоген-активируемых протеинкиназ с мотивом киназного взаимодействия тирозинфосфатазы PTP-SL обеспечивает субстратную специфичность и сохраняет ERK2 в цитоплазме» . Ж. Биол. Хим . 274 (31): 21900–7. дои : 10.1074/jbc.274.31.21900 . hdl : 10550/84237 . ПМИД 10419510 .
Бланко-Апарисио С., Торрес Дж., Пулидо Р. (2000). «Новый регуляторный механизм активации MAP-киназ и ядерной транслокации, опосредованный PKA и тирозинфосфатазой PTP-SL» . Дж. Клеточная Биол . 147 (6): 1129–36. дои : 10.1083/jcb.147.6.1129 . ПМК 2168101 . ПМИД 10601328 .
Августин К.А., Силбигер С.М., Букай Н., Улиас Л., Бойнтон А., Требаски Л.Д., Медлок Э.С. (2000). «Семейство протеинтирозинфосфатаз (PC12, Br7,S1): характеристика экспрессии у взрослого человека и мыши» . Анат. Рек . 258 (3): 221–34. doi : 10.1002/(SICI)1097-0185(20000301)258:3<221::AID-AR1>3.0.CO;2-W . ПМИД 10705342 .
Бектас А., Хьюз Дж. Н., Варрам Дж. Х., Кролевски А. С., Дориа А. (2001). «Локус диабета 2 типа на 12q15. Дальнейшее картирование и скрининг мутаций двух генов-кандидатов» . Диабет . 50 (1): 204–8. дои : 10.2337/диабет.50.1.204 . ПМИД 11147789 .
Седлачек С.Е., Арическу А.Р., Фулга Т.А., Рено Л., Шайдиг А.Дж. (2001). «Кристаллическая структура каталитического домена PTP-SL/PTPBR7: значение для регуляции киназы MAP». Дж. Мол. Биол . 311 (3): 557–68. дои : 10.1006/jmbi.2001.4890 . ПМИД 11493009 .
Бушбек М., Эйкхофф Дж., Зоммер М.Н., Ульрих А. (2002). «Фосфотирозин-специфическая фосфатаза PTP-SL регулирует сигнальный путь ERK5» . Ж. Биол. Хим . 277 (33): 29503–9. дои : 10.1074/jbc.M202149200 . ПМИД 12042304 .
Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М., Ле Наур Ф., Бричори Ф., Чжан Дж.Х., Чжао Р., Пуравс Э., Тра Дж., Майкл К.В., Мисек Д.Е., Ханаш С.М. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток выявило множество белков с функцией шаперона» . Ж. Биол. Хим . 278 (9): 7607–16. дои : 10.1074/jbc.M210455200 . ПМИД 12493773 .
Таррега К, Риос П, Сехудо-Марин Р, Бланко-Апарисио К, ван ден Берк Л, Шепенс Дж, Хендрикс В, Табернеро Л, Пулидо Р (2006). «ERK2 демонстрирует рестриктивный и локально селективный механизм узнавания своими инактиваторами тирозинфосфатазы, не присущий его активатору MEK1» . Ж. Биол. Хим . 280 (45): 37885–94. дои : 10.1074/jbc.M504366200 . hdl : 2066/48764 . ПМИД 16148006 .
Эсваран Дж., фон Крис Дж.П., Марсден Б., Лонгман Э., Дебрецени Дж.Э., Угочукву Э., Тернбулл А., Ли В.Х., Кнапп С., Барр А.Дж. (2006). «Кристаллические структуры и идентификация ингибиторов PTPN5, PTPRR и PTPN7: семейство человеческих MAPK-специфичных протеинтирозинфосфатаз» . Биохим. Дж . 395 (3): 483–91. дои : 10.1042/BJ20051931 . ПМЦ 1462698 . ПМИД 16441242 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000153233 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020151 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7557444-5] Шиодзука К., Ватанабэ Ю., Икеда Т., Хасимото С., Кавасима Х. (ноябрь 1995 г.). «Клонирование и экспрессия PCPTP1, кодирующего протеин тирозинфосфатазу». Джин . 162 (2): 279–84. дои : 10.1016/0378-1119(95)00306-Q . ПМИД 7557444 .

[pmid10393441-6] ван ден Маагденберг А.М., Шепенс Дж.Т., Шепенс М.Т., Мерккс Г.Ф., Дарруди Ф., Виринга Б., Гертс ван Кессель А., Хендрикс В.Дж. (июль 1999 г.). «Присвоение1 гена PTP-SL/PTPBR7 (Ptprr/PTPRR) области 8A2 хромосомы мыши путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (3–4): 243–4. дои : 10.1159/000015268 . ПМИД 10393441 . S2CID 35964382 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRR, тип рецептора, R» .

[pmid12042304-8] Бушбек М., Эйкхофф Дж., Зоммер М.Н., Ульрих А. (август 2002 г.). «Фосфотирозин-специфическая фосфатаза PTP-SL регулирует сигнальный путь ERK5» . Ж. Биол. Хим . 277 (33): 29503–9. дои : 10.1074/jbc.M202149200 . ПМИД 12042304 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]