Protein-coding gene in humans
ПТПН6 Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB show 1FPR , 1GWZ , 1X6C , 2B3O , 2RMX , 2YU7 , 3PS5 , 4GRY , 4GRZ , 4GS0 , 4HJP , 4HJQ
Идентификаторы Псевдонимы PTPN6 Внешние идентификаторы Опустить : 176883 ; МГИ : 96055 ; Гомологен : 56589 ; Генные карты : PTPN6 ; OMA : PTPN6 — ортологи Викиданные
Нерецептор тирозин-протеинфосфатазы типа 6 , также известный как фосфатаза-1, содержащая домен гомологии Src 2 (SHP-1), представляет собой фермент , который у людей кодируется PTPN6 геном . [ 5 ]
Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами, которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференцировку, митотический цикл и онкогенную трансформацию. N-концевая часть этого PTP содержит два тандемных домена гомолога Src ( SH2 ), которые действуют как домены связывания фосфотирозина белка и опосредуют взаимодействие этого PTP с его субстратами. Этот PTP экспрессируется преимущественно в кроветворных клетках и действует как важный регулятор множества сигнальных путей в кроветворных клетках. Было показано, что этот PTP взаимодействует и дефосфорилирует широкий спектр фосфобелков, участвующих в передаче сигналов гемопоэтических клеток (например, путь LYN - CD22 - SHP-1 ). Сообщалось о множестве альтернативно сплайсированных вариантов этого гена, которые кодируют различные изоформы. [ 6 ]
Ген SHP-1 имеет два промотора : P-1, активный в эпителиальных клетках, и P-2, активный в кроветворных клетках. Кроме того, экспрессия SHP-1 низкая в эпителиальных клетках и высокая в гемопоэтических клетках. При раке уровень SHP-1 в эпителиальных клетках увеличивается, а в гемопоэтических клетках снижается. [ 7 ]
Было показано, что PTPN6 взаимодействует с:
ген BCR , [ 8 ] CD117 , [ 9 ] [ 10 ] CD22 , [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] CD31 , [ 16 ] [ 17 ] CTNND1 , [ 18 ] РЭФР , [ 19 ] [ 20 ] ЭПОР , [ 21 ] ФКРЛ3 , [ 22 ] Грб2 , [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] НОХА10 , [ 26 ] ЯК2 , [ 27 ] [ 28 ] ЛЭИР1 , [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] ЛИЛРБ2 , [ 34 ] [ 35 ] ЛИЛРБ4 , [ 36 ] Лкк , [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ] ЛКП2 , [ 40 ] [ 41 ] ПРКЦД , [ 42 ] ПТК2Б , [ 23 ] [ 43 ] РОС1 , [ 44 ] ЧИРП , [ 29 ] [ 45 ] БОЛЬНОЙ , [ 23 ] [ 46 ] ТИК2 . [ 47 ]
^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000111679 – Ensembl , май 2017 г. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004266 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Плуцки Дж., Нил Б.Г., Розенберг Р.Д., Эдди Р.Л., Байерс М.Г., Яни-Сайт С., Показывает туберкулез (август 1992 г.). «Хромосомная локализация SH2-содержащей тирозинфосфатазы (PTPN6)». Геномика . 13 (3): 869–72. дои : 10.1016/0888-7543(92)90172-О . ПМИД 1639416 . ^ «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPN6, нерецепторный тип 6» . ^ Амин С., Кумар А., Нилчи Л., Райт К., Козловски М. (август 2011 г.). «Пролиферация клеток рака молочной железы регулируется тирозинфосфатазой SHP1 через N-концевую киназу c-jun и совместную индукцию факторов транскрипции RFX-1 и AP-4». Мол. Рак Рез . 9 (8): 1112–25. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-11-0097 . ПМИД 21719561 . S2CID 33833067 . ^ Лидтке М., Панди П., Кумар С., Харбанда С., Куфе Д. (октябрь 1998 г.). «Регуляция активности и трансформации киназы SAP, индуцированной Bcr-Abl, с помощью тирозинфосфатазы белка SHPTP1». Онкоген . 17 (15): 1889–92. дои : 10.1038/sj.onc.1202117 . ПМИД 9788431 . S2CID 42228230 . ^ Козловски М., Лароуз Л., Ли Ф., Ле Д.М., Роттапель Р., Симинович К.А. (апрель 1998 г.). «SHP-1 связывает и отрицательно модулирует рецептор c-Kit путем взаимодействия с тирозином 569 в околомембранном домене c-Kit» . Мол. Клетка. Биол . 18 (4): 2089–99. дои : 10.1128/mcb.18.4.2089 . ПМЦ 121439 ПМИД 9528781 . ^ Йи Т, Илье Дж. Н. (июнь 1993 г.). «Ассоциация фосфатазы гемопоэтических клеток с c-Kit после стимуляции лигандом c-Kit» . Мол. Клетка. Биол . 13 (6): 3350–8. дои : 10.1128/mcb.13.6.3350 . ПМК 359793 ПМИД 7684496 . ^ Блазиоли Дж., Пауст С., Томас М.Л. (январь 1999 г.). «Определение мест взаимодействия протеинтирозинфосфатазы SHP-1 и CD22» . Ж. Биол. Хим . 274 (4): 2303–7. дои : 10.1074/jbc.274.4.2303 ПМИД 9890995 . ^ Отипоби К.Л., Дравс К.Е., Кларк Э.А. (ноябрь 2001 г.). «CD22 регулирует сигналы, опосредованные рецепторами В-клеток, через два домена, которые независимо рекрутируют Grb2 и SHP-1» . Ж. Биол. Хим . 276 (47): 44315–22. дои : 10.1074/jbc.M105446200 ПМИД 11551923 . ^ Грир С.Ф., Джастимент Л.Б. (май 1999 г.). «CD45 регулирует фосфорилирование тирозина CD22 и его связь с протеином тирозинфосфатазой SHP-1» . Дж. Иммунол . 162 (9): 5278–86. дои : 10.4049/jimmunol.162.9.5278 ПМИД 10228003 . ^ Лоу К.Л., Сидоренко С.П., Чандран К.А., Чжао З., Шен Шен, Фишер Э.Х., Кларк Э.А. (февраль 1996 г.). «CD22 связывается с протеинтирозинфосфатазой 1C, Syk и фосфолипазой C-гамма (1) при активации B-клеток» . Дж. Эксп. Мед . 183 (2): 547–60. дои : 10.1084/jem.183.2.547 . ПМК 2192439 ПМИД 8627166 . ^ Адачи Т., Винандс Дж., Вакабаяши С., Якура Х., Рет М., Цубата Т. (июль 2001 г.). «SHP-1 требует ингибирующих корецепторов для подавления фосфорилирования клеточных субстратов, опосредованного рецептором антигена В-клеток» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 26648–55. дои : 10.1074/jbc.M100997200 ПМИД 11356834 . ^ Памфри, Нью-Джерси, Тейлор В., Фриман С., Дуглас М.Р., Брэдфилд П.Ф., Янг С.П., Лорд Дж.М., Уэйкелам М.Дж., Берд И.Н., Салмон М., Бакли К.Д. (апрель 1999 г.). «Дифференциальная ассоциация цитоплазматических сигнальных молекул SHP-1, SHP-2, SHIP и фосфолипазы C-гамма1 с PECAM-1/CD31» . ФЭБС Летт . 450 (1–2): 77–83. дои : 10.1016/s0014-5793(99)00446-9 ПМИД 10350061 . S2CID 31471121 . ^ Хуа К.Т., Гэмбл-младший, Вадас М.А., Джексон Д.Э. (октябрь 1998 г.). «Привлечение и активация протеин-тирозинфосфатазы SHP-1 с помощью молекулы адгезии эндотелиальных клеток тромбоцитов человека-1 (PECAM-1). Идентификация мотивов и субстратов связывания, подобных тирозиновым ингибирующим мотивам иммунорецепторов» . Ж. Биол. Хим . 273 (43): 28332–40. дои : 10.1074/jbc.273.43.28332 ПМИД 9774457 . ^ Кейлхак Х., Хеллман Ю., ван Хенгель Дж., ван Рой Ф., Годовац-Циммерманн Дж., Бёмер Ф.Д. (август 2000 г.). «Протеин-тирозинфосфатаза SHP-1 связывается с катенином p120 и дефосфорилирует его» . Ж. Биол. Хим . 275 (34): 26376–84. дои : 10.1074/jbc.M001315200 ПМИД 10835420 . ^ Томич С., Грейзер У., Ламмерс Р., Харитоненков А., Имянитов Е., Ульрих А., Бёмер Ф.Д. (сентябрь 1995 г.). «Ассоциация протеинтирозинфосфатаз домена SH2 с рецептором эпидермального фактора роста в опухолевых клетках человека. Фосфатидная кислота активирует дефосфорилирование рецептора с помощью PTP1C» . Ж. Биол. Хим . 270 (36): 21277–84. дои : 10.1074/jbc.270.36.21277 ПМИД 7673163 . ^ Кейлхак Х., Тенев Т., Ньякатура Э., Годовац-Циммерманн Дж., Нильсен Л., Зеедорф К., Бёмер Ф.Д. (сентябрь 1998 г.). «Фосфотирозин 1173 опосредует связывание протеин-тирозинфосфатазы SHP-1 с рецептором эпидермального фактора роста и ослабление передачи сигналов рецептора» . Ж. Биол. Хим . 273 (38): 24839–46. дои : 10.1074/jbc.273.38.24839 ПМИД 9733788 . ^ Клингмюллер У., Лоренц У., Кэнтли Л.К., Нил Б.Г., Лодиш Х.Ф. (март 1995 г.). «Специфическое привлечение SH-PTP1 к рецептору эритропоэтина вызывает инактивацию JAK2 и прекращение пролиферативных сигналов» . Клетка . 80 (5): 729–38. дои : 10.1016/0092-8674(95)90351-8 ПМИД 7889566 . S2CID 16866005 . ^ Сюй MJ, Чжао Р., Цао Х, Чжао ZJ (май 2002 г.). «SPAP2, рецептор семейства Ig, содержащий как ITIM, так и ITAM». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (3): 1037–46. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00332-7 . ПМИД 12051764 . ^ Jump up to: а б с Ганджу Р.К., Брубейкер С.А., Чернок Р.Д., Авраам С., Групман Дж.Э. (июнь 2000 г.). «Бета-хемокиновый рецептор CCR5 передает сигналы через SHP1, SHP2 и Syk» . Ж. Биол. Хим . 275 (23): 17263–8. дои : 10.1074/jbc.M000689200 ПМИД 10747947 . ^ Кон-Козловски М., Пани Г., Поусон Т., Симинович К.А. (февраль 1996 г.). «Тирозинфосфатаза PTP1C связывается с Vav, Grb2 и mSos1 в гемопоэтических клетках» . Ж. Биол. Хим . 271 (7): 3856–62. дои : 10.1074/jbc.271.7.3856 ПМИД 8632004 . ^ Сачи А., Лю В.К., Видал М., Гарбай С., Ренду Ф., Бачело-Лоза С. (май 2002 г.). «Дифференциальный эффект ингибирования взаимодействий Grb2-SH3 при активации тромбоцитов, индуцированной тромбином и взаимодействием рецептора Fc» . Биохим. Дж . 363 (Часть 3): 717–25. дои : 10.1042/0264-6021:3630717 . ПМЦ 1222524 ПМИД 11964172 . ^ Эклунд Э.А., Гольденберг И., Лу Ю., Андреич Дж., Какар Р. (сентябрь 2002 г.). «Протеин-тирозинфосфатаза SHP1 регулирует связывание ДНК HoxA10 и активность репрессии транскрипции в недифференцированных миелоидных клетках» . Ж. Биол. Хим . 277 (39): 36878–88. дои : 10.1074/jbc.M203917200 ПМИД 12145285 . ^ Цзяо Х., Беррада К., Ян В., Тебризи М., Платаниас Л.К., Йи Т (декабрь 1996 г.). «Прямая ассоциация и дефосфорилирование киназы Jak2 с помощью SH2-доменсодержащей протеинтирозинфосфатазы SHP-1» . Мол. Клетка. Биол . 16 (12): 6985–92. дои : 10.1128/mcb.16.12.6985 . ПМК 231702 ПМИД 8943354 . ^ Ву Д.В., Старк К.К., Даннингтон Д., Диллон С.Б., Йи Т., Джонс С., Пелус Л.М. (февраль 2000 г.). «Ассоциация SH2-содержащего протеина тирозинфосфатазы-1 (SHP-1) с Jak2 в клетках UT-7/Epo». Клетки крови Мол. Дис . 26 (1): 15–24. дои : 10.1006/bcmd.2000.0273 . ПМИД 10772872 . ^ Jump up to: а б Муссо Д.Д., Банвиль Д., Л'Аббе Д., Бушар П., Шен Шен (февраль 2000 г.). «PILRalpha, новый иммунорецепторный белок, несущий ингибирующий мотив на основе тирозина, рекрутирует SHP-1 при фосфорилировании тирозина и соединяется с усеченным аналогом PILRbeta» . Ж. Биол. Хим . 275 (6): 4467–74. дои : 10.1074/jbc.275.6.4467 ПМИД 10660620 . ^ Сатиш Дж.Г., Джонсон К.Г., Фуллер К.Дж., Лерой Ф.Г., Мейяард Л., Симс М.Дж., Мэтьюз Р.Дж. (февраль 2001 г.). «Конститутивная ассоциация SHP-1 с лейкоцитарно-ассоциированным Ig-подобным рецептором-1 в Т-клетках человека» . Дж. Иммунол . 166 (3): 1763–70. doi : 10.4049/jimmunol.166.3.1763 ПМИД 11160222 . ^ Фурнье Н., Шалюс Л., Дюран И., Гарсия Э., Пин Дж.Дж., Чуракова Т., Патель С., Злот С., Горман Д., Журавски С., Абрамс Дж., Бейтс Э.Э., Гарроне П. (август 2000 г.). «FDF03, новый ингибирующий рецептор суперсемейства иммуноглобулинов, экспрессируется дендритными и миелоидными клетками человека» . Дж. Иммунол . 165 (3): 1197–209. дои : 10.4049/jimmunol.165.3.1197 ПМИД 10903717 . ^ Мейяард Л., Адема Г.Дж., Чанг С., Вуллатт Э., Сазерленд Г.Р. , Ланье Л.Л., Филлипс Дж.Х. (август 1997 г.). «LAIR-1, новый ингибирующий рецептор, экспрессируемый на мононуклеарных лейкоцитах человека» . Иммунитет . 7 (2): 283–90. дои : 10.1016/s1074-7613(00)80530-0 hdl : 2066/26173 ПМИД 9285412 . ^ Сюй Mj, Чжао Р., Чжао ZJ (июнь 2000 г.). «Идентификация и характеристика ассоциированного с лейкоцитами Ig-подобного рецептора-1 как основного якорного белка тирозинфосфатазы SHP-1 в гемопоэтических клетках» . Ж. Биол. Хим . 275 (23): 17440–6. дои : 10.1074/jbc.M001313200 ПМИД 10764762 . ^ Фангер Н.А., Косман Д., Петерсон Л., Брэдди С.К., Малишевски Ч.Р., Борхес Л. (ноябрь 1998 г.). «Белки, связывающие MHC класса I LIR-1 и LIR-2, ингибируют передачу сигналов, опосредованную рецептором Fc, в моноцитах» . Евро. Дж. Иммунол . 28 (11): 3423–34. doi : 10.1002/(SICI)1521-4141(199811)28:11<3423::AID-IMMU3423>3.0.CO;2-2 ПМИД 9842885 . ^ Колонна М., Самаридис Дж., Селла М., Ангман Л., Аллен Р.Л., О'Каллаган К.А., Данбар Р., Огг Г.С., Серундоло В., Ролинк А. (апрель 1998 г.). «Человеческие миеломоноцитарные клетки экспрессируют ингибирующий рецептор для классических и неклассических молекул MHC класса I» . Дж. Иммунол . 160 (7): 3096–100. дои : 10.4049/jimmunol.160.7.3096 ПМИД 9531263 . ^ Ван Л.Л., Блазиоли Дж., Плас Д.Р., Томас М.Л., Ёкояма В.М. (февраль 1999 г.). «Специфичность SH2-доменов SHP-1 во взаимодействии с иммунорецепторным тирозиновым ингибирующим мотивом рецептора gp49B» . Дж. Иммунол . 162 (3): 1318–23. дои : 10.4049/jimmunol.162.3.1318 ПМИД 9973385 . ^ Ю CL, Джин YJ, Буракофф SJ (январь 2000 г.). «Цитозольное дефосфорилирование тирозина STAT5. Потенциальная роль SHP-2 в регуляции STAT5» . Ж. Биол. Хим . 275 (1): 599–604. дои : 10.1074/jbc.275.1.599 ПМИД 10617656 . ^ Чан Г.Г., Сефтон Б.М. (июнь 2001 г.). «Специфическое дефосфорилирование тирозиновой протеинкиназы Lck по адресу Tyr-394 с помощью протеинтирозинфосфатазы SHP-1» . Ж. Биол. Хим . 276 (25): 23173–8. дои : 10.1074/jbc.M101219200 ПМИД 11294838 . ^ Лоренц У., Равичандран К.С., Пей Д., Уолш К.Т., Буракофф С.Дж., Нил Б.Г. (март 1994 г.). «Lck-зависимое тирозильное фосфорилирование фосфотирозинфосфатазы SH-PTP1 в мышиных Т-клетках» . Мол. Клетка. Биол . 14 (3): 1824–34. дои : 10.1128/mcb.14.3.1824 . ПМК 358540 ПМИД 8114715 . ^ Бинштадт Б.А., Билладо Д.Д., Евремович Д., Уильямс Б.Л., Фанг Н., Йи Т, Корецкий Г.А., Абрахам Р.Т., Лейбсон П.Дж. (октябрь 1998 г.). «SLP-76 является прямым субстратом SHP-1, рекрутируемым на ингибирующие рецепторы клеток-киллеров» . Ж. Биол. Хим . 273 (42): 27518–23. дои : 10.1074/jbc.273.42.27518 ПМИД 9765283 . ^ Мизуно К., Катагири Т., Хасегава К., Огимото М., Якура Х. (август 1996 г.). «Фосфатаза гемопоэтических клеток, SHP-1, конститутивно связана с лейкоцитарным белком, содержащим домен SH2, SLP-76, в В-клетках» . Дж. Эксп. Мед . 184 (2): 457–63. дои : 10.1084/jem.184.2.457 . ПМК 2192711 ПМИД 8760799 . ^ Ёсида К., Куфе Д. (декабрь 2001 г.). «Негативная регуляция протеинтирозинфосфатазы SHPTP1 протеинкиназой C дельта в ответ на повреждение ДНК». Мол. Фармакол . 60 (6): 1431–8. дои : 10.1124/моль.60.6.1431 . ПМИД 11723252 . ^ Кумар С., Авраам С., Бхарти А., Гоял Дж., Пандей П., Харбанда С. (октябрь 1999 г.). «Негативная регуляция PYK2/связанной с адгезией передачи сигнала фокальной тирозинкиназы с помощью гемопоэтической тирозинфосфатазы SHPTP1» . Ж. Биол. Хим . 274 (43): 30657–63. дои : 10.1074/jbc.274.43.30657 ПМИД 10521452 . ^ Кейлхак Х., Мюллер М., Бёмер С.А., Франк С., Вейднер К.М., Бирхмайер В., Лигенса Т., Берндт А., Космель Х., Гюнтер Б., Мюллер Т., Бирхмайер С., Бёмер Ф.Д. (январь 2001 г.). «Негативная регуляция передачи сигналов тирозинкиназы рецептора Ros. Эпителиальная функция протеинтирозинфосфатазы SHP-1 домена SH2» . Дж. Клеточная Биол . 152 (2): 325–34. дои : 10.1083/jcb.152.2.325 . ПМК 2199605 ПМИД 11266449 . ^ Ян Дж., Ченг З., Ню Т., Лян Икс, Чжао З.Дж., Чжоу Г.В. (февраль 2000 г.). «Структурные основы субстратной специфичности протеинтирозинфосфатазы SHP-1» . Ж. Биол. Хим . 275 (6): 4066–71. дои : 10.1074/jbc.275.6.4066 ПМИД 10660565 . ^ Дастин Л.Б., Плас Д.Р., Вонг Дж., Ху Ю.Т., Сото С., Чан А.С., Томас М.Л. (март 1999 г.). «Экспрессия домена 2 доминантно-негативной src-гомологии, содержащего протеин тирозинфосфатазу-1, приводит к увеличению активности тирозинкиназы Syk и активации B-клеток» . Дж. Иммунол . 162 (5): 2717–24. дои : 10.4049/jimmunol.162.5.2717 ПМИД 10072516 . ^ Йеттер А., Уддин С., Кролевски Дж.Дж., Цзяо Х., Йи Т., Платаниас Л.К. (август 1995 г.). «Ассоциация интерферонзависимой тирозинкиназы Tyk-2 с фосфатазой гемопоэтических клеток» . Ж. Биол. Хим . 270 (31): 18179–82. дои : 10.1074/jbc.270.31.18179 ПМИД 7629131 .
показывать галерея PDB
1fpr : CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN THE CATALYTIC DOMAIN OF SHP-1 AND AN IN VITRO PEPTIDE SUBSTRATE PY469 DERIVED FROM SHPS-1.
1gwz : CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF THE PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE SHP-1
1x6c : Solution structures of the SH2 domain of human protein-tyrosine phosphatase SHP-1
2b3o : Crystal structure of human tyrosine phosphatase SHP-1
