SSH2

SSH2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2NT2
Идентификаторы
Псевдонимы	SSH2 , SSH-2, SSH-2L, протеинфосфатаза 2 из рогатки
Внешние идентификаторы	Опустить : 606779 ; МГИ : 2679255 ; Гомологен : 14116 ; Генные карты : SSH2 ; OMA : SSH2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	29,930,276 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	77,351,046 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibialis anterior muscle; ; deltoid muscle; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; blood; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; gastrocnemius muscle; ; quadriceps femoris muscle; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; vastus lateralis muscle; ; white blood cell;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; extraocular muscle; ; digastric muscle; ; temporal muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; interventricular septum; ; soleus muscle; ; vastus lateralis muscle; ; triceps brachii muscle; ; lymph node;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein tyrosine phosphatase activity; phosphatase activity; actin binding; phosphoprotein phosphatase activity; hydrolase activity; protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity;
Cellular component	cytoplasm; cytoskeleton; extracellular space;
Biological process	regulation of lamellipodium assembly; regulation of axonogenesis; regulation of actin polymerization or depolymerization; protein dephosphorylation; peptidyl-tyrosine dephosphorylation; actin cytoskeleton organization; dephosphorylation; cell morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	85464
	237860
	ENSG00000141298
	ENSMUSG00000037926
	Q76I76
	Q5SW75
	НМ_001282129 ; НМ_001282130 ; НМ_001282131 ; НМ_033389
	НМ_001291190 ; НМ_177710
	НП_001269058 ; НП_001269059 ; НП_001269060 ; НП_203747
	НП_001278119 ; НП_808378
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомолог 2 протеинфосфатазы Slingshot — это фермент , который у человека кодируется SSH2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Семейство ADF (актин-деполимеризующий фактор)/кофилинов (см. MIM 601442) состоит из стимул-зависимых медиаторов динамики актина. Белки ADF/кофилин инактивируются киназами, такими как киназа-1 домена LIM (LIMK1; MIM 601329). Семейство SSH, по-видимому, играет роль в динамике актина путем реактивации белков ADF/кофилина in vivo (Niwa et al., 2002). [предоставлено OMIM] ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000141298 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037926 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нива Р., Нагата-Охаси К., Такеичи М., Мизуно К., Уэмура Т. (февраль 2002 г.). «Контроль реорганизации актина с помощью Slingshot, семейства фосфатаз, которые дефосфорилируют ADF/кофилин» . Клетка . 108 (2): 233–46. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00638-9 . ПМИД 11832213 . S2CID 5576208 .
^ Нагасе Т., Кикуно Р., Хаттори А., Кондо Ю., Окумура К., Охара О. (февраль 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 7 (6): 347–55. дои : 10.1093/dnares/7.6.347 . ПМИД 11214970 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог 2 рогатки SSH2 (дрозофила)» .

Дальнейшее чтение

Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Чан С.Ю., Чан А.К., Чунг Б.П. и др. (2004). «Идентификация генов, экспрессируемых во время развития миокарда». Подбородок. Мед. Дж . 116 (9): 1329–32. ПМИД 14527359 .
Охта Й., Косака К., Нагата-Охаши К. и др. (2004). «Дифференциальная активность, субклеточное распределение и закономерности тканевой экспрессии трех членов фосфатаз семейства Slingshot, которые дефосфорилируют кофилин» . Генные клетки . 8 (10): 811–24. дои : 10.1046/j.1365-2443.2003.00678.x . ПМИД 14531860 . S2CID 24247372 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (11): 1093–101. дои : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . ПМИД 15345747 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Сусайраджа Дж., Маити С., Вигган О. и др. (2005). «Взаимодействие между компонентами нового комплекса LIM-киназа-фосфатаза регулирует кофилин» . ЭМБО Дж . 24 (3): 473–86. дои : 10.1038/sj.emboj.7600543 . ПМК 548651 . ПМИД 15660133 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Клигис К., Клэйборн Дж.Н., ДеБиасе П.Дж. и др. (2007). «Семейство фосфатаз рогатки опосредует регуляцию Rac1 фосфорилирования кофилина, организации ламинина-332 и подвижности кератиноцитов» . Ж. Биол. Хим . 282 (44): 32520–8. дои : 10.1074/jbc.M707041200 . ПМК 2754063 . ПМИД 17848544 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q76I76 (гомолог протеинфосфатазы Slingshot 2) на PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000141298 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037926 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11832213-5] Нива Р., Нагата-Охаси К., Такеичи М., Мизуно К., Уэмура Т. (февраль 2002 г.). «Контроль реорганизации актина с помощью Slingshot, семейства фосфатаз, которые дефосфорилируют ADF/кофилин» . Клетка . 108 (2): 233–46. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00638-9 . ПМИД 11832213 . S2CID 5576208 .

[pmid11214970-6] Нагасе Т., Кикуно Р., Хаттори А., Кондо Ю., Окумура К., Охара О. (февраль 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 7 (6): 347–55. дои : 10.1093/dnares/7.6.347 . ПМИД 11214970 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог 2 рогатки SSH2 (дрозофила)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]