ПТПРФ

ПТПРФ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1LAR, 2DJU, 2EDX, 2EDY, 2YD5, 2YD8, 4N5U, 2DN7
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRF , LAR, BNAH2, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа F, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа F
Внешние идентификаторы	Опустить : 179590 ; МГИ : 102695 ; Гомологен : 20623 ; GeneCards : ПТПРФ ; ОМА : ПТПРФ - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	43,623,666 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	118,291,405 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; bronchial epithelial cell; ; nipple; ; parotid gland; ; hair follicle; ; germinal epithelium; ; jejunal mucosa; ; skin of arm; ; skin of thigh; ; epithelium of nasopharynx;
	Top expressed in
	medullary collecting duct; ; epithelium of lens; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; hair follicle; ; vestibular sensory epithelium; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; external carotid artery; ; conjunctival fornix; ; left lung; ; left lung lobe;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	chondroitin sulfate proteoglycan binding; heparin binding; phosphoprotein phosphatase activity; phosphatase activity; protein-containing complex binding; protein tyrosine phosphatase activity; transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; hydrolase activity; cell adhesion molecule binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; integral component of plasma membrane; neuronal cell body; neuron projection; extracellular exosome; plasma membrane;
Biological process	neuron projection regeneration; regulation of axon regeneration; negative regulation of receptor binding; regulation of neuron projection development; protein dephosphorylation; transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway; cell adhesion; peptidyl-tyrosine dephosphorylation; cell migration; dephosphorylation; synaptic membrane adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5792
	19268
	ENSG00000142949
	ENSMUSG00000033295
	P10586
	А2А8Л5
showНМ_002840 ; НМ_130440 ; НМ_001329137 ; НМ_001329138 ; НМ_001329139 ;
	NM_001329140
	НМ_011213
showНП_001316066 ; НП_001316067 ; НП_001316068 ; НП_001316069 ; НП_002831 ;
	NP_569707
	НП_035343
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза F рецепторного типа представляет собой фермент , который у человека кодируется PTPRF геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами, которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток , дифференцировку, митотический цикл и онкогенную трансформацию. Этот PTP имеет внеклеточную область, одну трансмембранную область и два тандемных внутрицитоплазматических каталитических домена и, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. Внеклеточная область содержит три Ig-подобных домена и девять неIg-подобных доменов, аналогичных доменам молекулы адгезии нервных клеток . Было показано, что этот PTP участвует в регуляции контактов между эпителиальными клетками в слипчивых соединениях , а также в контроле передачи сигналов бета-катенина . Повышенный уровень экспрессии этого белка был обнаружен в инсулин -чувствительной ткани людей с ожирением и инсулинорезистентностью и может способствовать патогенезу инсулинорезистентности . двух альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта этого гена, которые кодируют разные белки. Сообщалось о ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PTPRF взаимодействует с бета-катенином. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} и липрин-альфа-1 . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000142949 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033295 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хардер К.В., Со Дж., Мики Н., Жирик Ф. (ноябрь 1995 г.). «Сосуществующие амплификации генов хромосомы 1p32 (PTPRF и MYCL1), кодирующих протеинтирозинфосфатазу LAR и L-myc, в линии мелкоклеточного рака легких». Геномика . 27 (3): 552–3. дои : 10.1006/geno.1995.1092 . ПМИД 7558042 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRF, тип рецептора F» .
^ Бонвини П., Ан В.Г., Розолен А., Нгуен П., Трепель Дж., Гарсия де Эррерос А., Дунак М., Некерс Л.М. (февраль 2001 г.). «Гелданамицин отменяет ассоциацию ErbB2 с резистентным к протеасомам бета-катенином в клетках меланомы, увеличивает ассоциацию бета-катенин-Е-кадгерин и снижает транскрипцию, чувствительную к бета-катенину». Рак Рез . 61 (4): 1671–7. ПМИД 11245482 .
^ Айхер Б., Лерх М.М., Мюллер Т., Шиллинг Дж., Ульрих А. (август 1997 г.). «Клеточное перераспределение протеинтирозинфосфатаз LAR и PTPσ посредством индуцируемого протеолитического процессинга» . Дж. Клеточная Биол . 138 (3): 681–96. дои : 10.1083/jcb.138.3.681 . ПМК 2141638 . ПМИД 9245795 .
^ Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Учеб. Натл. акад. наук. США 92 (25): 11686–90. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .
^ Серра-Пажес К., Кедерша Н.Л., Фазикас Л., Медли К., Дебант А., Стреули М. (июнь 1995 г.). «Трансмембранный белок тирозинфосфатаза LAR и белок, взаимодействующий со спиральным LAR, совместно локализуются в фокальных спайках» . ЭМБО Дж . 14 (12): 2827–38. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07282.x . ПМЦ 398401 . ПМИД 7796809 .
^ Серра-Пажес К., Медли К.Г., Тан М., Харт А., Стреули М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . Ж. Биол. Хим . 273 (25): 15611–20. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .

Дальнейшее чтение

Чернофф Дж (1999). «Белковые тирозинфосфатазы как негативные регуляторы митогенной передачи сигналов». Дж. Селл. Физиол . 180 (2): 173–81. doi : 10.1002/(SICI)1097-4652(199908)180:2<173::AID-JCP5>3.0.CO;2-Y . ПМИД 10395287 . S2CID 24952421 .
Хасимото Н., Финер Э.П., Чжан В.Р., Гольдштейн Б.Дж. (1992). «Протеин-тирозинфосфатазы рецептора инсулина. Фосфатаза, связанная с общим антигеном лейкоцитов, быстро деактивирует киназу инсулинового рецептора путем преимущественного дефосфорилирования регуляторного домена рецептора» . Ж. Биол. Хим . 267 (20): 13811–4. дои : 10.1016/S0021-9258(19)49639-7 . ПМИД 1321126 .
Жирик Ф.Р., Хардер К.В., Мельхадо И.Г., Андерсон Л.Л., Дункан А.М. (1993). «Ген тирозинфосфатазы, связанной с лейкоцитарным антигеном (LAR), локализован в хромосоме человека 1p32, области, которая часто удаляется в опухолях нейроэктодермального происхождения». Цитогенет. Клеточная генетика . 61 (4): 266–8. дои : 10.1159/000133418 . ПМИД 1486801 .
Стреули М., Крюгер NX, Тай Т., Тан М., Сайто Х. (1990). «Различные функциональные роли двух внутриклеточных фосфатазоподобных доменов рецептор-связанных протеинтирозинфосфатаз LCA и LAR» . ЭМБО Дж . 9 (8): 2399–407. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07415.x . ПМЦ 552264 . ПМИД 1695146 .
Стреули М, Крюгер NX, Цай А.Ю., Сайто Х (1989). «Семейство рецептор-связанных протеинтирозинфосфатаз у человека и дрозофилы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (22): 8698–702. Бибкод : 1989PNAS...86.8698S . дои : 10.1073/pnas.86.22.8698 . ПМК 298355 . ПМИД 2554325 .
Штрёули М., Крюгер NX, Холл Л.Р., Шлоссман С.Ф., Сайто Х (1988). «Новый член суперсемейства иммуноглобулинов, имеющий цитоплазматическую область, гомологичную общему антигену лейкоцитов» . Дж. Эксп. Мед . 168 (5): 1523–30. дои : 10.1084/jem.168.5.1523 . ПМК 2189122 . ПМИД 2972792 .
Шаапвельд Р.К., ван ден Маагденберг А.М., Шепенс Дж.Т., Вегуис Д.О., Гертс ван Кессель А., Виринга Б., Хендрикс В.Дж. (1995). «Мышиный ген Ptprf, кодирующий молекулу LAR, родственную общему антигену лейкоцитов: клонирование, характеристика и хромосомная локализация». Геномика . 27 (1): 124–30. дои : 10.1006/geno.1995.1014 . hdl : 2066/21329 . ПМИД 7665159 .
Серра-Пажес С, Кедерша Н.Л., Фазикас Л., Медли К., Дебант А., Стреули М. (1995). «Трансмембранный белок тирозинфосфатаза LAR и белок, взаимодействующий со спиральным LAR, совместно локализуются в фокальных спайках» . ЭМБО Дж . 14 (12): 2827–38. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07282.x . ПМЦ 398401 . ПМИД 7796809 .
О'Грейди П., Крюгер NX, Стреули М., Сайто Х (1994). «Геномная организация гена человеческого протеина тирозинфосфатазы LAR и альтернативный сплайсинг во внеклеточных доменах фибронектина типа III» . Ж. Биол. Хим . 269 (40): 25193–9. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31516-8 . ПМИД 7929208 .
Пулидо Р., Серра-Пажес С., Тан М., Стреули М. (1996). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (25): 11686–90. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .
Лю Х, Вега, королевский адвокат, Декер Р.А., Панди А., Уорби К.А., Диксон Дж.Е. (1996). «Онкогенные рецепторы RET обладают различными сайтами аутофосфорилирования и специфичностью связывания субстрата» . Ж. Биол. Хим . 271 (10): 5309–12. дои : 10.1074/jbc.271.10.5309 . ПМИД 8621380 .
Дебант А., Серра-Пажес С., Зайпель К., О'Брайен С., Тан М., Парк Ш., Стреули М. (1996). «Многодоменный белок Trio связывает трансмембранную тирозинфосфатазу LAR, содержит домен протеинкиназы и имеет отдельные домены фактора обмена гуаниновых нуклеотидов, специфичные для rac и rho» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (11): 5466–71. Бибкод : 1996PNAS...93.5466D . дои : 10.1073/pnas.93.11.5466 . ПМК 39269 . ПМИД 8643598 .
Чжан В.Р., Ли П.М., Освальд М.А., Гольдштейн Б.Дж. (1996). «Модуляция передачи сигнала инсулина путем эутопической сверхэкспрессии протеинтирозинфосфатазы LAR рецепторного типа» . Мол. Эндокринол . 10 (5): 575–84. дои : 10.1210/mend.10.5.8732688 . ПМИД 8732688 . S2CID 42128485 .
Табити К., Куи Л., Чхатвал В.Дж., Мочхала С., Нгои С.С., Паллен С.Дж. (1996). «Новый альтернативный сплайсинг предсказывает секретируемую внеклеточную изоформу человеческого рецептор-подобного протеина тирозинфосфатазы LAR». Джин . 175 (1–2): 7–13. дои : 10.1016/0378-1119(96)00113-8 . ПМИД 8917069 .
Ахмад Ф., Гольдштейн Б.Дж. (1997). «Функциональная ассоциация между рецептором инсулина и трансмембранной протеинтирозинфосфатазой LAR в интактных клетках» . Ж. Биол. Хим . 272 (1): 448–57. дои : 10.1074/jbc.272.1.448 . ПМИД 8995282 .
Айхер Б., Лерх М.М., Мюллер Т., Шиллинг Дж., Ульрих А. (1997). «Клеточное перераспределение протеинтирозинфосфатаз LAR и PTPσ посредством индуцируемого протеолитического процессинга» . Дж. Клеточная Биол . 138 (3): 681–96. дои : 10.1083/jcb.138.3.681 . ПМК 2141638 . ПМИД 9245795 .
Серра-Пажес К., Медли К.Г., Тан М., Харт А., Стреули М. (1998). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . Ж. Биол. Хим . 273 (25): 15611–20. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .
О'Грейди П., Тай ТК, Сайто Х (1998). «Комплекс ламинин-нидоген является лигандом специфической сплайсинговой изоформы трансмембранной протеинтирозинфосфатазы LAR» . Дж. Клеточная Биол . 141 (7): 1675–84. дои : 10.1083/jcb.141.7.1675 . ПМК 2133008 . ПМИД 9647658 .
Чиплункар С., Чамблис К., Чва М., Розенберг С., Кенни MC, Браун DJ (1999). «Усиленная экспрессия трансмембранной фосфотирозинфосфатазы (LAR) в культурах кератоконуса и роговице». Эксп. Глазное разрешение . 68 (3): 283–93. дои : 10.1006/exer.1998.0604 . ПМИД 10079136 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000142949 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033295 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7558042-5] Хардер К.В., Со Дж., Мики Н., Жирик Ф. (ноябрь 1995 г.). «Сосуществующие амплификации генов хромосомы 1p32 (PTPRF и MYCL1), кодирующих протеинтирозинфосфатазу LAR и L-myc, в линии мелкоклеточного рака легких». Геномика . 27 (3): 552–3. дои : 10.1006/geno.1995.1092 . ПМИД 7558042 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRF, тип рецептора F» .

[pmid11245482-7] Бонвини П., Ан В.Г., Розолен А., Нгуен П., Трепель Дж., Гарсия де Эррерос А., Дунак М., Некерс Л.М. (февраль 2001 г.). «Гелданамицин отменяет ассоциацию ErbB2 с резистентным к протеасомам бета-катенином в клетках меланомы, увеличивает ассоциацию бета-катенин-Е-кадгерин и снижает транскрипцию, чувствительную к бета-катенину». Рак Рез . 61 (4): 1671–7. ПМИД 11245482 .

[pmid9245795-8] Айхер Б., Лерх М.М., Мюллер Т., Шиллинг Дж., Ульрих А. (август 1997 г.). «Клеточное перераспределение протеинтирозинфосфатаз LAR и PTPσ посредством индуцируемого протеолитического процессинга» . Дж. Клеточная Биол . 138 (3): 681–96. дои : 10.1083/jcb.138.3.681 . ПМК 2141638 . ПМИД 9245795 .

[pmid8524829-9] Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство трансмембранных протеинтирозинфосфатаз LAR/PTP дельта/PTP сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP дельта и сигма PTP экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Учеб. Натл. акад. наук. США 92 (25): 11686–90. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .

[pmid7796809-10] Серра-Пажес К., Кедерша Н.Л., Фазикас Л., Медли К., Дебант А., Стреули М. (июнь 1995 г.). «Трансмембранный белок тирозинфосфатаза LAR и белок, взаимодействующий со спиральным LAR, совместно локализуются в фокальных спайках» . ЭМБО Дж . 14 (12): 2827–38. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07282.x . ПМЦ 398401 . ПМИД 7796809 .

[pmid9624153-11] Серра-Пажес К., Медли К.Г., Тан М., Харт А., Стреули М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . Ж. Биол. Хим . 273 (25): 15611–20. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]