ПТПН13

ПТПН13
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1D5G, 1Q7X, 1WCH, 2M0Z, 2M10, 3LNX, 3LNY, 3PDZ
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPN13 , FAP-1, PNP1, PTP-BAS, PTP-BL, PTP1E, PTPL1, PTPLE, hPTP1E, протеинтирозинфосфатаза, нерецепторный тип 13, протеинтирозинфосфатаза, нерецепторный тип 13
Внешние идентификаторы	Опустить : 600267 ; МГИ : 103293 ; Гомологен : 7909 ; Генные карты : PTPN13 ; OMA : PTPN13 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 4 (human) Band 4q21.3 Start 86,594,315 bp End 86,815,171 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 5 (mouse) Band 5 E5|5 50.43 cM Start 103,573,058 bp End 103,746,169 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in mucosa of paranasal sinus urethra human penis palpebral conjunctiva retinal pigment epithelium skin of arm renal medulla trigeminal ganglion gingival epithelium mucosa of pharynx Top expressed in corneal stroma hair follicle mucosa of urinary bladder transitional epithelium of urinary bladder retinal pigment epithelium medullary collecting duct skin of external ear conjunctival fornix skin of back sciatic nerve More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function protein tyrosine phosphatase activity phosphatase activity phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit binding protein binding phosphoprotein phosphatase activity hydrolase activity Cellular component cytoplasm cell body neuron projection cell projection extracellular exosome cytoskeleton nucleus lamellipodium plasma membrane nucleoplasm Biological process protein dephosphorylation peptidyl-tyrosine dephosphorylation regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling dephosphorylation phosphatidylinositol biosynthetic process negative regulation of protein phosphorylation cellular response to cytokine stimulus bicellular tight junction assembly Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 5783 19249 Вместе ENSG00000163629 ENSMUSG00000034573 ЮниПрот Q12923 Q64512 RefSeq (мРНК) НМ_006264 НМ_080683 НМ_080684 НМ_080685 НМ_011204 RefSeq (белок) НП_006255 НП_542414 НП_542415 НП_542416 НП_035334 Местоположение (UCSC) Chr 4: 86,59 – 86,82 Мб Чр 5: 103,57 – 103,75 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Нерецептор тирозин-протеинфосфатазы 13 типа — это фермент , который у человека кодируется PTPN13 геном .

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами , которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток , дифференцировку , митотический цикл и онкогенную трансформацию. Этот PTP представляет собой большой белок, который имеет домен PTP на С-конце и несколько некаталитических доменов, которые включают домен, сходный с суперсемейством полосы 4.1 белков, ассоциированных с цитоскелетом , область, состоящую из пяти доменов PDZ , и лейциновой молнии. мотив . Было обнаружено, что этот PTP взаимодействует и дефосфорилирует рецептор Fas , а также IkappaBalpha через домены PDZ, что предполагает его роль в Fas-опосредованной запрограммированной гибели клеток. Также было показано, что этот PTP взаимодействует с белком, активирующим GTPase, и, таким образом, может функционировать как регулятор сигнального пути Rho . Сообщалось о четырех альтернативно сплайсированных вариантах транскриптов, которые кодируют разные белки.

Взаимодействия

Было показано, что PTPN13 взаимодействует с PKN2 .

Дальнейшее чтение

• Сато Т., Ири С., Китада С., Рид Дж.К. (1995). «FAP-1: протеинтирозинфосфатаза, которая связывается с Fas». Наука . 268 (5209): 411–415. Бибкод : 1995Sci...268..411S . дои : 10.1126/science.7536343 . ПМИД   7536343 .
• Сарас Дж., Клаессон-Уэлш Л., Хелдин Ч., Гонез Л.Дж. (1994). «Клонирование и характеристика PTPL1, протеинтирозинфосфатазы, сходной с белками, связанными с цитоскелетом» . Ж. Биол. Хим . 269 ​​(39): 24082–9. дои : 10.1016/S0021-9258(19)51050-X . ПМИД   7929060 .
• Банвиль Д., Ахмад С., Стокко Р., Шен Ш. (1994). «Новая протеин-тирозинфосфатаза, гомологичная как цитоскелетным белкам семейства полосы 4.1, так и гуанилаткиназам, связанным с соединениями» . Ж. Биол. Хим . 269 ​​(35): 22320–7. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31792-1 . ПМИД   8071359 .
• Инадзава Дж., Арияма Т., Абэ Т., Драк Т., Охта М., Хюбнер К., Янагисава Дж., Рид Дж.С., Сато Т. (1997). «PTPN13, fas-ассоциированная протеинтирозинфосфатаза, расположена на длинном плече хромосомы 4 в зоне q21.3» . Геномика . 31 (2): 240–242. дои : 10.1006/geno.1996.0039 . ПМИД   8824809 .
• Янагисава Дж., Такахаси М., Канки Х., Яно-Янагисава Х., Тадзуноки Т., Сава Э., Ниситоба Т., Камишохара М., Кобаяши Э. (1997). «Молекулярное взаимодействие Fas и FAP-1. Трипептидный блокатор взаимодействия Fas человека с FAP-1 способствует Fas-индуцированному апоптозу» . Ж. Биол. Хим . 272 (13): 8539–8545. дои : 10.1074/jbc.272.13.8539 . ПМИД   9079683 .
• Сарас Дж., Энгстрём Ю., Гоньес Л.Дж., Хелдин Ч.Х. (1997). «Характеристика взаимодействий между PDZ-доменами протеин-тирозинфосфатазы PTPL1 и карбоксильным концевым хвостом Fas» . Ж. Биол. Хим . 272 (34): 20979–20981. дои : 10.1074/jbc.272.34.20979 . ПМИД   9261095 .
• Сарас Дж., Франзен П., Аспенстрем П., Хеллман У., Гонез Л.Дж., Хелдин CH (1997). «Новый белок, активирующий ГТФазу для Rho, взаимодействует с доменом PDZ протеинтирозинфосфатазы PTPL1» . Ж. Биол. Хим . 272 (39): 24333–24338. дои : 10.1074/jbc.272.39.24333 . ПМИД   9305890 .
• Экиэль И., Банвиль Д., Шен Ш., Слон-Усакевич Дж.Дж., Коши А., Геринг К. (1999). «Назначение сигнала главной цепи домена PDZ2 человеческой протеинтирозинфосфатазы hPTP1E и ее комплекса с C-концевым пептидом рецептора Fas». Дж. Биомол. ЯМР . 12 (3): 455–456. дои : 10.1023/А:1008267807859 . ПМИД   9835052 . S2CID   19976473 .
• Маэкава К., Имагава Н., Наито А., Харада С., Ёси О., Такаги С. (1999). «Ассоциация протеин-тирозинфосфатазы PTP-BAS с белком, ингибирующим фактор транскрипции IkappaBalpha, посредством взаимодействия между доменом PDZ1 и анкириновыми повторами» . Биохим. Дж . 337 (2): 179–84. дои : 10.1042/0264-6021:3370179 . ПМК   1219950 . ПМИД   9882613 .
• Лин Д., Гиш Г.Д., Сонгян З., Поусон Т. (1999). «Карбоксильный конец эфринов класса B представляет собой мотив связывания домена PDZ» . Ж. Биол. Хим . 274 (6): 3726–3733. дои : 10.1074/jbc.274.6.3726 . ПМИД   9920925 .
• Мурти К.К., Кларк К., Фортин Ю., Шен Шен, Банвиль Д. (1999). «ZRP-1, родственный зиксину белок, взаимодействует со вторым доменом PDZ цитозольной протеинтирозинфосфатазы hPTP1E» . Ж. Биол. Хим . 274 (29): 20679–20687. дои : 10.1074/jbc.274.29.20679 . ПМИД   10400701 .
• Куппен Э., ван Хэм М., Пепперс Б., Виринга Б., Хендрикс В. (1999). «Идентификация и молекулярная характеристика BP75, нового белка, содержащего бромодомен». ФЭБС Летт . 459 (3): 291–298. дои : 10.1016/S0014-5793(99) 01191-6 ПМИД   10526152 . S2CID   41216030 .
• Ири С., Хачия Т., Рабизаде С., Маруяма В., Мукаи Дж., Ли Ю., Рид Дж. К., Бредесен Д. Е., Сато Т. А. (1999). «Функциональное взаимодействие Fas-ассоциированной фосфатазы-1 (FAP-1) с p75 (NTR) и их влияние на активацию NF-kappaB». ФЭБС Летт . 460 (2): 191–198. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01324-1 . ПМИД   10544233 . S2CID   25143664 .
• Ли Шин, Шин М.С., Пак В.С., Ким С.И., Ким Х.С., Ли Дж.Х., Хан С.И., Ли Х.К., Пак Дж.И. (2000). «Иммуногистохимическая локализация FAP-1, ингибитора Fas-опосредованного апоптоза, в нормальных и неопластических тканях человека». АПМИС . 107 (12): 1101–1108. дои : 10.1111/j.1699-0463.1999.tb01515.x . ПМИД   10660140 . S2CID   24672576 .
• Козлов Г., Геринг К., Экиль И. (2000). «Структура раствора домена PDZ2 фосфатазы человека hPTP1E и его взаимодействие с С-концевыми пептидами рецептора Fas». Биохимия . 39 (10): 2572–2580. дои : 10.1021/bi991913c . ПМИД   10704206 .
• Куппен Э., ван Хэм М., Вансинк Д.Г., Де Леу А., Виринга Б., Хендрикс В. (2000). «Родственный зиксину белок TRIP6 взаимодействует с мотивами PDZ в адапторном белке RIL и протеинтирозинфосфатазе PTP-BL». Евро. Дж. Клеточная Биол . 79 (4): 283–293. doi : 10.1078/S0171-9335(04)70031-X . ПМИД   10826496 .
• Эрдманн К.С., Кульманн Дж., Лессманн В., Херрманн Л., Эйленбург В., Мюллер О., Хойманн Р. (2000). «Белок аденоматозного полипоза Coli (APC) взаимодействует с протеинтирозинфосфатазой PTP-BL через альтернативно сплайсированный домен PDZ» . Онкоген . 19 (34): 3894–3901. дои : 10.1038/sj.onc.1203725 . ПМИД   10951583 .
• Накаи Ю., Ири С., Сато Т.А. (2001). «Идентификация IkappaBalpha как субстрата Fas-ассоциированной фосфатазы-1» . Евро. Дж. Биохим . 267 (24): 7170–7175. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01818.x . ПМИД   11106428 .
• Гросс С., Хойманн Р., Эрдманн К.С. (2001). «Киназа PRK2, связанная с протеинкиназой C, взаимодействует с протеинтирозинфосфатазой PTP-BL через новый мотив связывания домена PDZ». ФЭБС Летт . 496 (2–3): 101–104. дои : 10.1016/S0014-5793(01)02401-2 . ПМИД   11356191 . S2CID   205880882 .