ПТПРД

ПТПРД
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1X5Z, 2DLH, 2YD6, 2YD7, 4RCA
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRD , HPTP, HPTPD, HPTPDELTA, PTPD, RPTPDELTA, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа D, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа D, R-PTP-дельта
Внешние идентификаторы	Опустить : 601598 ; МГИ : 97812 ; Гомологен : 88669 ; GeneCards : PTPRD ; ОМА : ПТПРД — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	10,613,002 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	78,211,961 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; C1 segment; ; ganglionic eminence; ; Brodmann area 9; ; prefrontal cortex; ; right frontal lobe; ; anterior cingulate cortex; ; Descending thoracic aorta; ; rectum; ; hypothalamus;
	Top expressed in
	saccule; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; facial motor nucleus; ; anterior horn of spinal cord; ; body of femur; ; barrel cortex; ; lateral geniculate nucleus; ; substantia nigra; ; epithelium of lens;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; phosphoprotein phosphatase activity; protein tyrosine phosphatase activity; hydrolase activity; signaling receptor binding; cell adhesion molecule binding; phosphatase activity; protein binding;
Cellular component	extracellular exosome; membrane; integral component of membrane; integral component of plasma membrane; plasma membrane; glutamatergic synapse;
Biological process	presynaptic membrane assembly; transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway; neuron differentiation; positive regulation of dendrite morphogenesis; protein dephosphorylation; phosphate-containing compound metabolic process; heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; dephosphorylation; peptidyl-tyrosine dephosphorylation; positive regulation of synapse assembly; regulation of postsynaptic density assembly; trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex; synaptic membrane adhesion; regulation of presynapse assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	5789
	19266
	ENSG00000153707 ; ENSG00000282932
	ENSMUSG00000028399
	P23468 ; Q3KPI9
	Q64487
показывать НМ_001040712 ; НМ_001171025 ; НМ_002839 ; НМ_130391 ; НМ_130392 ;
	NM_130393; NM_001377946; NM_001377947; NM_001377958; NM_001378058
показывать НМ_001014288 ; НМ_011211 ; НМ_001352628 ; НМ_001352629 ; НМ_001352630 ;
	NM_001368991; NM_001368992; NM_001368993
показывать НП_001035802 ; НП_001164496 ; НП_002830 ; НП_569075 ; НП_569076 ;
	NP_569077; NP_001364875; NP_001364876; NP_001364887; NP_001364987; NP_569077.2
показывать НП_035341 ; НП_001339557 ; НП_001339558 ; НП_001339559 ; НП_001355920 ;
	NP_001355921; NP_001355922
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза дельта рецепторного типа представляет собой фермент , который у человека кодируется PTPRD геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами, которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференцировку, митотический цикл и онкогенную трансформацию. Этот PTP содержит внеклеточную область, один трансмембранный сегмент и два тандемных внутрицитоплазматических каталитических домена, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. Внеклеточная область этого белка состоит из трех Ig-подобных и восьми фибронектин-подобных доменов III типа. Исследования сходных генов у кур и мух позволяют предположить, что роль этого PTP заключается в стимулировании роста нейритов и регуляции направления аксонов нейронов . Сообщалось о множестве тканеспецифичных альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта этого гена. ^{[ 7 ]}

Связывание лиганда

PTPRD — это орексигенный рецептор аспросина , гормона, который вырабатывается путем С-концевого отщепления профибриллина от гена FBN1 . ^{[ 8 ]} У мышей аспросин действует на обонятельный рецептор Olfr734 в печени, регулируя его глюконеогенные эффекты. ^{[ 9 ]} Однако PTPRD был идентифицирован как нервный рецептор апросина. Генетическая абляция PTPRD приводит к крайней худобе и потере аппетита. Более конкретно, устойчивость к ожирению, вызванному диетой, может возникать за счет потери PTPRD в AgRP нейронах . Когда аспросин связывается с PTPRD, это приводит к дефосфорилированию и дезактивации Stat3 . ^{[ 8 ]}

Клиническое значение

PTPRD высоко выражен во всем мозге, особенно в мозжечке и полушариях мозжечка. PTPRD также высоко выражен в коронарных артериях, аорте и яичниках. Мутации в гене PTPRD также связаны с аутизмом . ^{[ 10 ]} обсессивно-компульсивное расстройство , ^{[ 11 ]} и рак молочной железы . ^{[ 12 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PTPRD взаимодействует с PTPRS. ^{[ 13 ]} и липрин-альфа-1 . ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000282932 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000153707, ENSG00000282932 — Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028399 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пулидо Р., Крюгер Н.Х., Серра-Пажес К., Сайто Х., Стреули М. (март 1995 г.). «Молекулярная характеристика человеческой трансмембранной протеинтирозинфосфатазы дельта. Доказательства тканеспецифической экспрессии альтернативных человеческих трансмембранных изоформ дельта протеинтирозинфосфатазы» . Журнал биологической химии . 270 (12): 6722–6728. дои : 10.1074/jbc.270.12.6722 . ПМИД 7896816 .
^ Мизуно К., Хасегава К., Катагири Т., Огимото М., Итикава Т., Якура Х. (сентябрь 1993 г.). «MPTP delta, предполагаемый мышиный гомолог HPTP delta, экспрессируется в специализированных областях мозга и в линии B-клеток» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (9): 5513–5523. дои : 10.1128/MCB.13.9.5513 . ПМК 360267 . ПМИД 8355697 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRD, тип рецептора, D» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Мишра И., Се В.Р., Бурнат Дж.К., Хе Ю., Ван С., Сильва Э.С. и др. (апрель 2022 г.). «Протеиновый тирозинфосфатазный рецептор δ служит орексигенным рецептором аспрозина» . Клеточный метаболизм . 34 (4): 549–563.e8. дои : 10.1016/j.cmet.2022.02.012 . ПМЦ 8986618 . ПМИД 35298903 .
^ Ли Э, Шан Х, Чен Л, Лонг А, Чжан Ю, Лю Ю и др. (август 2019 г.). «OLFR734 опосредует метаболизм глюкозы как рецептор апросина» . Клеточный метаболизм . 30 (2): 319–328.e8. doi : 10.1016/j.cmet.2019.05.022 . ПМИД 31230984 . S2CID 195327523 .
^ Лей Н. и др. (2010). «Аутизм связан с наследственными делециями в PTPRD и NCAM2» . ПАС 2010; Аннотация 2320.1 . Педиатрические академические общества. Архивировано из оригинала 7 мая 2010 г. Проверено 9 мая 2010 г.
^ «ОКР: сообщается о новом генетическом маркере» . 07.06.2014 . Проверено 16 августа 2015 г.
^ Кобольдт, округ Колумбия, Фултон Р.С., Маклеллан, доктор медицинских наук, Шмидт Х., Калики-Вейзер Дж. и др. (Сеть атласов генома рака) (октябрь 2012 г.). «Комплексные молекулярные портреты опухолей молочной железы человека» . Природа . 490 (7418): 61–70. Бибкод : 2012Природа.490...61Т . дои : 10.1038/nature11412 . ПМЦ 3465532 . ПМИД 23000897 .
^ Уоллес М.Дж., Фладд С., Батт Дж., Ротин Д. (май 1998 г.). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2608–2616. дои : 10.1128/MCB.18.5.2608 . ПМЦ 110640 . PMID 9566880 .
^ Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство трансмембранных протеин-тирозин-фосфатаз LAR/PTP-дельта/PTP-сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP-дельта и PTP-сигма экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (25): 11686–11690. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .

Дальнейшее чтение

Крюгер NX, Штрёули М, Сайто Х (октябрь 1990 г.). «Структурное разнообразие и эволюция человеческих рецептороподобных протеинтирозинфосфатаз» . Журнал ЭМБО . 9 (10): 3241–3252. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07523.x . ПМК 552056 . ПМИД 2170109 .
Шаапвельд Р.К., ван ден Маагденберг А.М., Шепенс Дж.Т., Вегуис Д.О., Гертс ван Кессель А., Виринга Б., Хендрикс В.Дж. (май 1995 г.). «Мышиный ген Ptprf, кодирующий молекулу LAR, родственную общему антигену лейкоцитов: клонирование, характеристика и хромосомная локализация». Геномика . 27 (1): 124–130. дои : 10.1006/geno.1995.1014 . hdl : 2066/21329 . ПМИД 7665159 .
Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство трансмембранных протеин-тирозин-фосфатаз LAR/PTP-дельта/PTP-сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP-дельта и PTP-сигма экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (25): 11686–11690. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .
Вагнер Дж., Гордон Л.А., Хенг Х.Х., Трембле М.Л., Олсен А.С. (ноябрь 1996 г.). «Физическое картирование сигма протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа (PTPRS) на хромосоме человека 19p13.3». Геномика . 38 (1): 76–78. дои : 10.1006/geno.1996.0594 . ПМИД 8954782 .
Уоллес М.Дж., Фладд С., Батт Дж., Ротин Д. (май 1998 г.). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2608–2616. дои : 10.1128/MCB.18.5.2608 . ПМЦ 110640 . PMID 9566880 .
Серра-Пажес К., Медли К.Г., Тан М., Харт А., Стреули М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой» . Журнал биологической химии . 273 (25): 15611–15620. дои : 10.1074/jbc.273.25.15611 . ПМИД 9624153 .
Бланшето К., ден Хертог Дж. (апрель 2000 г.). «Множественные взаимодействия между рецептором протеин-тирозинфосфатазы (RPTP) альфа и мембранно-дистальными доменами протеин-тирозинфосфатазы различных RPTP» . Журнал биологической химии . 275 (17): 12446–12452. дои : 10.1074/jbc.275.17.12446 . ПМИД 10777529 .
Бланшто С., Тертулен Л.Г., Оверворде Дж., ден Хертог Дж. (декабрь 2002 г.). «Внутри- и межмолекулярные взаимодействия между внутриклеточными доменами рецепторных протеин-тирозинфосфатаз» . Журнал биологической химии . 277 (49): 47263–47269. дои : 10.1074/jbc.M205810200 . ПМИД 12376545 .
Вудингс Дж.А., Шарп С.Дж., Мачески Л.М. (апрель 2003 г.). «MIM-B, предполагаемый белок-супрессор метастазирования, связывается с актином и протеинтирозинфосфатазой дельта» . Биохимический журнал . 371 (Часть 2): 463–471. дои : 10.1042/BJ20021962 . ПМЦ 1223315 . ПМИД 12570871 .
Хиллман Р.Т., Грин Р.Э., Бреннер С.Е. (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК» . Геномная биология . 5 (2): С8. дои : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . ПМЦ 395752 . ПМИД 14759258 .
Сато М., Такахаши К., Нагаяма К., Арай Ю., Ито Н., Окада М. и др. (декабрь 2005 г.). «Идентификация плеча хромосомы 9p как наиболее частой мишени гомозиготных делеций при раке легких». Гены, хромосомы и рак . 44 (4): 405–414. дои : 10.1002/gcc.20253 . ПМИД 16114034 . S2CID 25616464 .
Перди К.Дж., Ламберт С.Р., Тех М.Т., Чаплин Т., Моллой Г., Рагхаван М. и др. (июль 2007 г.). «Аллельный дисбаланс и микроделеции, влияющие на ген PTPRD при плоскоклеточном раке кожи, обнаруженные с помощью микрочипового анализа однонуклеотидного полиморфизма» . Гены, хромосомы и рак . 46 (7): 661–669. дои : 10.1002/gcc.20447 . ПМК 2426828 . ПМИД 17420988 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 9 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000282932 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000153707, ENSG00000282932 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028399 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7896816-5] Пулидо Р., Крюгер Н.Х., Серра-Пажес К., Сайто Х., Стреули М. (март 1995 г.). «Молекулярная характеристика человеческой трансмембранной протеинтирозинфосфатазы дельта. Доказательства тканеспецифической экспрессии альтернативных человеческих трансмембранных изоформ дельта протеинтирозинфосфатазы» . Журнал биологической химии . 270 (12): 6722–6728. дои : 10.1074/jbc.270.12.6722 . ПМИД 7896816 .

[pmid8355697-6] Мизуно К., Хасегава К., Катагири Т., Огимото М., Итикава Т., Якура Х. (сентябрь 1993 г.). «MPTP delta, предполагаемый мышиный гомолог HPTP delta, экспрессируется в специализированных областях мозга и в линии B-клеток» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (9): 5513–5523. дои : 10.1128/MCB.13.9.5513 . ПМК 360267 . ПМИД 8355697 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: протеин тирозинфосфатаза PTPRD, тип рецептора, D» .

[Mishra_2022-8] Перейти обратно: ^а ^б Мишра И., Се В.Р., Бурнат Дж.К., Хе Ю., Ван С., Сильва Э.С. и др. (апрель 2022 г.). «Протеиновый тирозинфосфатазный рецептор δ служит орексигенным рецептором аспрозина» . Клеточный метаболизм . 34 (4): 549–563.e8. дои : 10.1016/j.cmet.2022.02.012 . ПМЦ 8986618 . ПМИД 35298903 .

[9] Ли Э, Шан Х, Чен Л, Лонг А, Чжан Ю, Лю Ю и др. (август 2019 г.). «OLFR734 опосредует метаболизм глюкозы как рецептор апросина» . Клеточный метаболизм . 30 (2): 319–328.e8. doi : 10.1016/j.cmet.2019.05.022 . ПМИД 31230984 . S2CID 195327523 .

[urlResult_Content_View-10] Лей Н. и др. (2010). «Аутизм связан с наследственными делециями в PTPRD и NCAM2» . ПАС 2010; Аннотация 2320.1 . Педиатрические академические общества. Архивировано из оригинала 7 мая 2010 г. Проверено 9 мая 2010 г.

[11] «ОКР: сообщается о новом генетическом маркере» . 07.06.2014 . Проверено 16 августа 2015 г.

[nature11412-12] Кобольдт, округ Колумбия, Фултон Р.С., Маклеллан, доктор медицинских наук, Шмидт Х., Калики-Вейзер Дж. и др. (Сеть атласов генома рака) (октябрь 2012 г.). «Комплексные молекулярные портреты опухолей молочной железы человека» . Природа . 490 (7418): 61–70. Бибкод : 2012Природа.490...61Т . дои : 10.1038/nature11412 . ПМЦ 3465532 . ПМИД 23000897 .

[pmid9566880-13] Уоллес М.Дж., Фладд С., Батт Дж., Ротин Д. (май 1998 г.). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2608–2616. дои : 10.1128/MCB.18.5.2608 . ПМЦ 110640 . PMID 9566880 .

[pmid8524829-14] Пулидо Р., Серра-Пажес К., Тан М., Стреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство трансмембранных протеин-тирозин-фосфатаз LAR/PTP-дельта/PTP-сигма: многочисленные изоформы LAR человека, PTP-дельта и PTP-сигма экспрессируются тканеспецифичным образом и связаны с LAR-взаимодействующим белком LIP.1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (25): 11686–11690. Бибкод : 1995PNAS...9211686P . дои : 10.1073/pnas.92.25.11686 . ПМК 40467 . ПМИД 8524829 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]