DDX19B

DDX19B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3EWS, 3FHC, 3FHT, 3FMO, 3FMP, 3G0H
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX19B , DBP5, DDX19, RNAh, геликаза DEAD-бокса 19B
Внешние идентификаторы	Опустить : 605812 ; МГИ : 2148251 ; Гомологен : 56032 ; Генные карты : DDX19B ; ОМА : DDX19B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	70,335,305 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	111,758,383 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; Achilles tendon; ; skin of leg; ; ganglionic eminence; ; gastric mucosa; ; granulocyte; ; bone marrow cells; ; ventricular zone; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; Ileal epithelium; ; spermatid; ; secondary oocyte; ; lesser wing of sphenoid bone; ; lumbar spinal ganglion; ; seminiferous tubule; ; zygote; ; neural layer of retina; ; epiblast;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; protein binding; hydrolase activity; ATP binding; helicase activity; RNA binding; nucleic acid binding;
Cellular component	nuclear envelope; nuclear pore; nuclear membrane; extracellular exosome; membrane; nucleus; catalytic step 2 spliceosome; nucleolus; cytoplasm;
Biological process	protein transport; mRNA transport; RNA secondary structure unwinding; mRNA export from nucleus; RNA splicing; regulation of gene expression; transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11269
	234733
	ENSG00000157349
	ENSMUSG00000033658
	Q9UMR2
	н/д
showНМ_001014449 ; НМ_001014451 ; НМ_001257172 ; НМ_001257173 ; НМ_001257174 ;
	NM_001257175; NM_007242; NM_001363938
	НМ_001190786 ; НМ_001190800 ; НМ_172284
showНП_001014449 ; НП_001014451 ; НП_001244101 ; НП_001244102 ; НП_001244103 ;
	NP_001244104; NP_009173; NP_001350867
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX19B — фермент , который у человека кодируется DDX19B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Белки DEAD-бокса , характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), представляют собой предполагаемые РНК- хеликазы . Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК , таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом . Судя по характеру распределения, некоторые члены этого семейства, как полагают, участвуют в эмбриогенезе , сперматогенезе , а также росте и делении клеток . Этот ген кодирует белок DEAD-бокс, который проявляет РНК-зависимую АТФазную активность и АТФ-зависимую активность по раскручиванию РНК. Этот белок рекрутируется в цитоплазматические фибриллы комплекса ядерных пор , где он участвует в экспорте мРНК из ядра . множество альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы . Для этого гена было обнаружено ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000157349 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033658 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шмитт С, фон Коббе С, Бачи А, Панте Н, Родригес ЖП, Бошерон С, Риго Г, Вильм М, Серафин Б, Кармо-Фонсека М, Изаурральде Е (сентябрь 1999 г.). «Dbp5, белок DEAD-box, необходимый для экспорта мРНК, рекрутируется в цитоплазматические фибриллы комплекса ядерных пор посредством консервативного взаимодействия с CAN/Nup159p» . ЭМБО Дж . 18 (15): 4332–47. дои : 10.1093/emboj/18.15.4332 . ПМЦ 1171509 . ПМИД 10428971 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: DDX19B DEAD (Asp-Glu-Ala-As) боксерский полипептид 19B» .

Дальнейшее чтение

Маттиони Т., Хьюм С.Р., Конигорски С. и др. (1992). «Клон кДНК нового ядерного белка с ДНК-связывающей активностью». Хромосома . 101 (10): 618–24. дои : 10.1007/BF00360539 . ПМИД 1424986 . S2CID 23195894 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Инь Л., Ли Дж., Чжу Х. и др. (2003). «Идентификация и характеристика гена, кодирующего новую изоформу белка DEAD-бокса». Репродукция. Плодородный. Дев . 14 (3–4): 185–9. дои : 10.1071/RD01028 . ПМИД 12219940 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000157349 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033658 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10428971-5] Шмитт С, фон Коббе С, Бачи А, Панте Н, Родригес ЖП, Бошерон С, Риго Г, Вильм М, Серафин Б, Кармо-Фонсека М, Изаурральде Е (сентябрь 1999 г.). «Dbp5, белок DEAD-box, необходимый для экспорта мРНК, рекрутируется в цитоплазматические фибриллы комплекса ядерных пор посредством консервативного взаимодействия с CAN/Nup159p» . ЭМБО Дж . 18 (15): 4332–47. дои : 10.1093/emboj/18.15.4332 . ПМЦ 1171509 . ПМИД 10428971 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: DDX19B DEAD (Asp-Glu-Ala-As) боксерский полипептид 19B» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]