Protein-coding gene in the species Homo sapiens
SKP1 Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB show Список кодов идентификаторов PDB 1FQV , 1FS1 , 1FS2 , 1LDK , 1P22 , 2ASS , 2AST , 2E31 , 2E32 , 2OVP , 2OVQ , 2OVR , 3L2O , 3WSO , 4I6J , 5IBK
Идентификаторы Псевдонимы SKP1 , EMC19, OCP-II, OCP2, SKP1A, TCEB1L, P19A, S-фаза-киназа, ассоциированный белок 1, S-фаза-киназа, белок 1 Внешние идентификаторы Омим : 601434 ; MGI : 103575 ; Гомологен : 38775 ; GeneCards : SKP1 ; OMA : SKP1 - ортологи show РНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog)Top expressed in prefrontal cortex right hemisphere of cerebellum right frontal lobe right testis pons left testis Brodmann area 9 ganglionic eminence right adrenal gland C1 segment
Top expressed in vestibular membrane of cochlear duct primary oocyte olfactory epithelium spermatocyte spermatid medial ganglionic eminence secondary oocyte facial motor nucleus anterior horn of spinal cord embryonic cell
More reference expression data
BioGPS
Викидид
Sphase Kinase-ассоциированный белок 1 является ферментом , который у людей кодируется SKP1 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Этот ген кодирует белок , который является членом SCF убиквитин -лигазы белкового комплекса белка . Он связывается с белками F-боксом (белки, содержащие мотив F-бокса), такие как циклин F, S-фаза-киназа, белок 2 , и другие регуляторные белки, участвующие в убиквитин- зависимых протеолизе. [ 8 ] Кодированный белок также сотрудничает с сетью белков для контроля уровней бета-катенина и влияет на уровень активности бета-катенин-зависимых факторов транскрипции TCF. Исследования также охарактеризовали белок как фактор удлинения РНК -полимеразы II. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта. Связанный псевдоген был идентифицирован на хромосоме 7.
Было показано, что SKP1A взаимодействует :
Btrc , [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]
Cacybp , [ 14 ]
CDCA3 , [ 15 ]
CDK9 , [ 16 ]
Слуша , [ 10 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]
Fbxl3 , [ 9 ]
Fbxo4 , [ 9 ] [ 21 ]
Fbxo5 , [ 9 ]
Fbxo7 , [ 9 ]
FBXW2 , [ 9 ]
FBXW7 , [ 17 ] [ 22 ] и
SKP2 . [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]
^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000113558 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000036309 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Zhang H, Kobayashi R, Galaktionov K, Beach D (октябрь 1995 г.). «P19SKP1 и P45SKP2 являются важными элементами фазовой киназы циклина A-CDK2» . Клетка . 82 (6): 915–25. doi : 10.1016/0092-8674 (95) 90271-6 . PMID 7553852 . S2CID 16325791 .
^ Demetrick DJ, Zhang H, Beach DH (июль 1996 г.). «Хромосомное картирование генов для белков CDK2/циклина A-ассоциированного человека P19 (SKP1A и SKP1B) и P45 (SKP2)». Cytogenet Cltle Genet . 73 (1–2): 104–7. doi : 10.1159/000134318 . PMID 8646875 .
^ «Ген Entrez: SKP1A S-фаза киназа, ассоциированный белок 1A (P19A)» .
^ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (1996). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом убиквитина протеолиза с помощью нового мотива F-box» . Клетка . 86 (2): 263–74. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80098-7 . PMID 8706131 . S2CID 18387009 .
^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин Cenciarelli C, Chiaur DS, Gudaravaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Карт Биол . 9 (20): 1177–9. Bibcode : 1999cbio .... 9.1177c . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 . S2CID 7467493 .
^ Jump up to: а беременный в Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (май 2003). «TIP120A ассоциируется с каллинами и модулирует активность убиквитин лигазы» . Дж. Биол. Химический 278 (18): 15905–10. doi : 10.1074/jbc.m213070200 . PMID 12609982 .
^ Jump up to: а беременный Strack P, Caligiuri M, Pelletier M, Boisclair M, Theodoras A, Beer-Romero P, Glass S, Parsons T, Copeland RA, Auger KR, Benfield P, Brizuela L, Rolfe M (июль 2000 г.). «SCF (бета-TRCP) и фосфорилирование, зависящее от убиквитинирования I Kappa B Alpha, катализируемой UBC3 и UBC4». Онкоген . 19 (31): 3529–36. doi : 10.1038/sj.onc.1203647 . PMID 10918611 . S2CID 24267499 .
^ Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (январь 2000). «Гомодимер двух белков F-бокса BETATRCP1 или BETATRCP2 связывается с ikappabalpha с сигналом-зависимой убиквитинированием» . Дж. Биол. Химический 275 (4): 2877–84. doi : 10.1074/jbc.275.4.2877 . PMID 10644755 .
^ Margottin F, Bour SP, Durand H, Selig L, Benichou S, Richard V, Thomas D, Strebel K, Benarous R (март 1998 г.). «Новый белок WD человека, H-бета TRCP, который взаимодействует с ВПУ ВИЧ-1, соединяет CD4 с путем деградации ER через мотив F-BOX» . Мол Клетка . 1 (4): 565–74. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80056-8 . PMID 9660940 .
^ Matsuzawa Si, Reed JC (май 2001). «SIAH-1, SIP и EBI сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанного с реакциями p53» . Мол Клетка . 7 (5): 915–26. doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00242-8 . PMID 11389839 .
^ Аяд Н.Г., Ранкин С., Мураками М., Джебанатираджа Дж., Гиги С., Киршнер М.В. (апрель 2003 г.). «Tome-1, триггер митотической записи, деградируется во время G1 через APC » Ячейка 113 (1): 101–1 Citeseerx 10.1.1.1.522.1 Doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 0 PMID 12679038 S2CID 14962502
^ Кирнан Р.Е., Эмилиани С., Накаяма К., Кастро А., Лаббе Дж.С., Лорка Т., Накаяма Ки К., Бенкиране М. (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие между Cyclin T1 и SCF (SKP2) нацелено на CDK9 для убиквитинирования и деградации протеасомой» . Мол Клетка. Биол . 21 (23): 7956–70. doi : 10.1128/mcb.21.23.7956-7970.2001 . PMC 99964 . PMID 11689688 .
^ Jump up to: а беременный Staropoli JF, McDermott C, Martinat C, Schulman B, Demireva E, Abeliovich A (март 2003 г.). «Паркин является компонентом комплекса убиквитин-лигазы, подобного SCF, и защищает постмитотические нейроны от экситотоксичности каината» . Нейрон . 37 (5): 735–49. doi : 10.1016/s0896-6273 (03) 00084-9 . PMID 12628165 . S2CID 17024826 .
^ Lisztwan J, Marti A, Sutterlüty H, Gstaiger M, Wirbelauer C, Krek W (январь 1998 г.). «Ассоциация человеческой CUL-1 и убиквитин-конъюгирующего фермента CDC34 с белком F-боксом P45 (SKP2): свидетельство эволюционного сохранения в субъединичном составе пути CDC34-SCF» . Embo j . 17 (2): 368–83. doi : 10.1093/emboj/17.2.368 . PMC 1170388 . PMID 9430629 .
^ Чжэн Н., Шульман Б.А., Сонг Л., Миллер Дж.Дж., Джеффри П.Д., Ван П., Чу С., Кепп Д.М., Элледж С.Дж., Пагано М., Конвей Р.К., Конауэй Дж.В., Харпер Дж.В., Павлетч Н.П. (апрель 2002 г.). «Структура комплекса CUL1-RBX1-SKP1-F BoxSKP2 SCF Ubiquitin Ligase». Природа . 416 (6882): 703–9. Bibcode : 2002natur.416..703Z . doi : 10.1038/416703a . PMID 11961546 . S2CID 4423882 .
^ Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (апрель 1999 г.). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство Cullin партнера с ассоциированной активностью убиквитин лигазы» . Мол Клетка . 3 (4): 535–41. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80482-7 . PMID 10230407 . S2CID 19371828 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Dudewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
^ Wu G, Lyapina S, Das I, Li J, Gurney M, Pauley A, Chui I, Deshaies RJ, Kitajewski J (ноябрь 2001 г.). «SEL-10 является ингибитором передачи сигналов Notch, которая нацелена на Notch для убиквитин-опосредованной деградации белка» . Мол Клетка. Биол . 21 (21): 7403–15. doi : 10.1128/mcb.21.21.7403-7415.2001 . PMC 99913 . PMID 11585921 .
^ NG RW, Arooz T, Yam CH, Chan IW, Lau AW, Poon Ry (ноябрь 1998). «Характеристика партнера по белке Cullin и F-box SKP1» . Фебс Летт . 438 (3): 183–9. doi : 10.1016/s0014-5793 (98) 01299-x . PMID 9827542 . S2CID 40950881 .
^ Шульман Б.А., Каррано А.С., Джеффри П.Д., Боуэн З., Киннукан Э.Р., Финнин М.С., Элледж С.Дж., Харпер Дж.В., Пагано М., Павлич Н.П. (ноябрь 2000 г.). «Понимание убиквитиновых лигаз SCF из структуры комплекса SKP1-SKP2». Природа . 408 (6810): 381–6. Bibcode : 2000natur.408..381S . doi : 10.1038/35042620 . PMID 11099048 . S2CID 4300503 .
^ Marti A, Wirbelauer C, Scheffner M, Krek W (май 1999). «Взаимодействие между убиквитин-белковой лигазой SCFSKP2 и E2F-1 лежит в основе регуляции деградации E2F-1». НАТ Клеточная биол . 1 (1): 14–9. doi : 10.1038/8984 . PMID 10559858 . S2CID 8884226 .
Чен Х., Талманн I, Адамс Дж.С., Авраам К.Б., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А., Биер Д.П., Кори Д.П., Талманн Р., Дуйк Г.М. (1995). «Клонирование кДНК, распределение тканей и хромосомная локализация OCP2, ген, кодирующий предполагаемый фактор, ассоциированный транскрипцией, преобладающий экспрессируемый в слуховых органах». Геномика . 27 (3): 389–98. doi : 10.1006/geno.1995.1068 . PMID 7558018 .
Sowden J, Morrison K, Schofield J, Putt W, Edwards Y (1996). «Новая кДНК с гомологией с фактором удлинения РНК -полимеразы II отображает карты хромосомы человека 5Q31 (TCEB1L) и хромосоме мыши 11 (TCEB1L)». Геномика . 29 (1): 145–51. doi : 10.1006/geno.1995.1225 . PMID 8530064 .
Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (1996). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом убиквитина протеолиза с помощью нового мотива F-box» . Клетка . 86 (2): 263–74. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80098-7 . PMID 8706131 . S2CID 18387009 .
Браун К.А., Лук Дж.П., Ленч Н.Дж., Мойнихан Л.М., Маркхэм А.Ф., Мюллер Р.Ф. (1996). «Человеческие последовательности, гомологичные гену для кохлеарного белка OCP-II, не сопоставляются с известными в настоящее время не синдромическими локусами потери слуха». Энн. Гул Генет . 60 (Pt 5): 385–9. doi : 10.1111/j.1469-1809.1996.tb00436.x . PMID 8912791 . S2CID 7687393 .
Liang Y, Chen H, Asher JH, Chang CC, Friedman TB (1997). «Человеческое внутреннее ушное ушное уховое OCP2 карты до 5q22-5Q35.2 с родственными последовательностями на хромосомах 4p16.2-4p14, 5p13-5q22, 7pter-q22, 10 и 12p13-12qter». Ген . 184 (2): 163–7. doi : 10.1016/s0378-1119 (96) 00590-2 . PMID 9031623 .
Lisztwan J, Marti A, Sutterlüty H, Gstaiger M, Wirbelauer C, Krek W (1998). «Ассоциация человеческой CUL-1 и убиквитин-конъюгирующего фермента CDC34 с белком F-боксом P45 (SKP2): свидетельство эволюционного сохранения в субъединичном составе пути CDC34-SCF» . Embo j . 17 (2): 368–83. doi : 10.1093/emboj/17.2.368 . PMC 1170388 . PMID 9430629 .
NG RW, Arooz T, Yam CH, Chan IW, Lau AW, Poon Ry (1998). «Характеристика партнера по белке Cullin и F-box SKP1» . Фебс Летт . 438 (3): 183–9. doi : 10.1016/s0014-5793 (98) 01299-x . PMID 9827542 . S2CID 40950881 .
Yam CH, NG RW, Siu WY, Lau AW, Poon Ry (1999). «Регуляция циклина A-CDK2 компонентом SCF SKP1 и белка F-бокса SKP2» . Мол Клетка. Биол . 19 (1): 635–45. doi : 10.1128/mcb.19.1.635 . PMC 83921 . PMID 9858587 .
Хенцл М.Т., Талманн I, Талманн Р. (1999). «OCP2 существует как димер в органе Корти». Слышать. Резерв 126 (1–2): 37–46. doi : 10.1016/s0378-5955 (98) 00148-8 . PMID 9872132 . S2CID 20953392 .
Уинстон Дж. Т., Страк П., Беер-Ромеро П., Чу Сай, Элледж С.Дж., Харпер Дж.В. (1999). «Комплекс Scfbeta-TRCP-абиквитин лигазы связан, особенно с фосфорилированными мотивами разрушения в икаппабальфе и бета-катенине и стимулирует убиквитинирование Ikappabalpha in vitro» . Гены Дев . 13 (3): 270–83. doi : 10.1101/gad.13.3.270 . PMC 316433 . PMID 9990852 .
Илин Г.П., Риалленд М., Глайз Д., Гуген-Гуилузо С. (1999). «Идентификация нового SKP2-подобного белка млекопитающего, содержащего F-бокс и богатые лейцином» . Фебс Летт . 459 (1): 75–9. doi : 10.1016/s0014-5793 (99) 01211-9 . PMID 10508920 . S2CID 22945082 .
Cenciarelli C, Chiaur DS, Gudaravaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Карт Биол . 9 (20): 1177–9. Bibcode : 1999cbio .... 9.1177c . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 . S2CID 7467493 .
Уинстон JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (1999). «Семейство белков F-бокса млекопитающих» . Карт Биол . 9 (20): 1180–2. Bibcode : 1999cbio .... 9.1180W . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80021-4 . PMID 10531037 . S2CID 14341845 .
Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (2000). «Гомодимер двух белков F-бокса BETATRCP1 или BETATRCP2 связывается с ikappabalpha с сигналом-зависимой убиквитинированием» . Дж. Биол. Химический 275 (4): 2877–84. doi : 10.1074/jbc.275.4.2877 . PMID 10644755 .
Читайте MA, Brownell JE, Gladysheva TB, Hottelet M, Parent LA, Coggins MB, Pierce JW, Podust VN, Luo RS, Chau V, Palombella VJ (2000). «Модификация NEDD8 CUL-1 активирует SCF (бета (TRCP))-зависимое убиквитинирование Ikappabalpha» . Мол Клетка. Биол . 20 (7): 2326–33. doi : 10.1128/mcb.20.7.2326-2333.2000 . PMC 85397 . PMID 10713156 .
Шульман Б.А., Каррано А.С., Джеффри П.Д., Боуэн З., Киннукан Э.Р., Финнин М.С., Элледж С.Дж., Харпер Дж.В., Пагано М., Павлич Н.П. (2000). «Понимание убиквитиновых лигаз SCF из структуры комплекса SKP1-SKP2». Природа . 408 (6810): 381–6. Bibcode : 2000natur.408..381S . doi : 10.1038/35042620 . PMID 11099048 . S2CID 4300503 .
Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, Wolf Da, Wei N, Shevchenko A, Deshaies RJ (2001). «Продвижение конъюгатного расщепления NEDD-CUL1 по сигнале COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. Bibcode : 2001sci ... 292.1382L . doi : 10.1126/science.1059780 . PMID 11337588 . S2CID 14224920 .
Фукучи М., Имамура Т., Чиба Т., Эбисава Т., Кавабата М., Танака К., Миязоно К. (2001). «Лиганд-зависимая деградация SMAD3 с помощью убиквитин-лигазного комплекса ROC1 и связанных белков» . Мол Биол. Клетка . 12 (5): 1431–43. doi : 10.1091/mbc.12.5.1431 . PMC 34595 . PMID 11359933 .
показывать PDB Галерея
1fs1 : INSIGHTS INTO SCF UBIQUITIN LIGASES FROM THE STRUCTURE OF THE SKP1-SKP2 COMPLEX
1fs2 : INSIGHTS INTO SCF UBIQUITIN LIGASES FROM THE STRUCTURE OF THE SKP1-SKP2 COMPLEX
1ldk : Structure of the Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF Ubiquitin Ligase Complex
2ass : Crystal structure of the Skp1-Skp2-Cks1 complex
2ast : Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide
2e31 : Structural basis for selection of glycosylated substrate by SCFFbs1 ubiquitin ligase
2e32 : Structural basis for selection of glycosylated substrate by SCFFbs1 ubiquitin ligase