FBXO7

FBXO7
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4L9C, 4L9H
Идентификаторы
Псевдонимы	FBXO7 , FBX, FBX07, FBX7, PARK15, PKPS, F-BOX Белок 7
Внешние идентификаторы	Омим : 605648 ; MGI : 1917004 ; Гомологен : 8136 ; GeneCards : FBXO7 ; OMA : FBXO7 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	32,498,829 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	85,887,737 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	trabecular bone; ; blood; ; sperm; ; corpus callosum; ; bone marrow; ; left lobe of thyroid gland; ; right testis; ; middle frontal gyrus; ; C1 segment; ; left testis;
	Top expressed in
	right kidney; ; otolith organ; ; utricle; ; blood; ; spermatocyte; ; proximal tubule; ; human kidney; ; sciatic nerve; ; hand; ; bone marrow;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein kinase binding; ubiquitin protein ligase binding; ubiquitin binding; protein heterodimerization activity;
Cellular component	cytoplasm; ubiquitin ligase complex; mitochondrion; nucleus; cytosol; SCF ubiquitin ligase complex; glial cytoplasmic inclusion; classical Lewy body; Lewy neurite; Lewy body core; Lewy body corona; protein-containing complex;
Biological process	negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; protein targeting to mitochondrion; negative regulation of lymphocyte differentiation; autophagy of mitochondrion; regulation of protein stability; negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; regulation of locomotion; protein polyubiquitination; regulation of neuron projection development; protein ubiquitination; negative regulation of oxidative stress-induced neuron death; negative regulation of neuron death; positive regulation of autophagy of mitochondrion; negative regulation of hydrogen peroxide-induced neuron death; post-translational protein modification; ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	25793
	69754
	ENSG00000100225
	EMSMUSM0000000101786
	Q9y3i1
	Q3U7U3
	NM_001033024 ; NM_001257990 ; NM_012179
	NM_153195 ; NM_001310745 ; NM_001347151
	NP_001028196 ; NP_001244919 ; NP_036311
	NP_001297674 ; NP_001334080 ; NP_694875
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Только F-box белок 7 -это белок , который у людей кодируется FBXO7 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Мутации в FBXO7 были связаны с болезнью Паркинсона. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков F-бокса, который характеризуется приблизительно 40 аминокислотным мотивом, F-box. Белки F-бокса составляют одну из четырех субъединиц белковой лигазы убиквитин-лигазы, называемой SCFS (SKP1-Cullin-Fox), который функционирует в зависимой от фосфолилирования убиквитинирования. Белки F-бокса делятся на 3 класса: FBW, содержащие домены WD-40, FBL, содержащие репутации, богатые лейцином, и FBX, содержащие либо различные модули взаимодействия белка белка, либо без узнаваемых мотивов. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит классу FBXS, и он может играть роль в регуляции гематопоэза. Альтернативно сплайсированные варианты транскрипта этого гена были идентифицированы с полноразмерной природой только некоторых вариантов, определяемых. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что FBXO7 взаимодействует с SKP1A , ^{[ 11 ]} Слуша , ^{[ 5 ]}^{[ 12 ]} Cdk6 , ^{[ 13 ]} P27 , ^{[ 13 ]} PI31 , ^{[ 12 ]} Паркин , ^{[ 14 ]} и розовый1 . ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100225 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000001786 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Cenciarelli C, Chiaur DS, Gudaravaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Текущая биология . 9 (20): 1177–9. Bibcode : 1999cbio .... 9.1177c . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .
^ Уинстон JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (октябрь 1999). «Семейство белков F-бокса млекопитающих» . Текущая биология . 9 (20): 1180–2. Bibcode : 1999cbio .... 9.1180W . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80021-4 . PMID 10531037 .
^ Di Fonzo A, Deck MC, Montagna P, Baruzzi A, Yoonva EH, Correia Guedes L, Zczerbinska A, Zhao T, Dubber-Hulsman LO, WJ, Oyen WJ, Simons EJ, Oystand Bredfield GJ, Oostra B. Hestink, Bonifti V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают автоматические рецессивные, рано-установленные паркинсонские пирамидальные синдромы». Неврология . 72 (3): 240–5. doi : 10,1212/01.wnl, 00003814144,10967.2b . PMID 1903853 . S2CID 25948572 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Fbxo7 F-box белок 7» .
^ Shojaee S, Sina F, Banihosseini SS, Kazemi MH, Kalhor R, Shahidi GA, Fahhrai-Rad H, Ronaghi M, Elahi E (июнь 2008 г.). «Анализ сцепления по всему геному на родословной паркинсонского пирамидального синдрома на 500 К массивов SNP» . Американский журнал человеческой генетики . 82 (6): 1375–84. doi : 10.1016/j.ajhg.2008.05.005 . PMC 2427312 . PMID 18513678 .
^ Di Fonzo A, Deck MC, Montagna P, Baruzzi A, Yoonva EH, Correia Guedes L, Zczerbinska A, Zhao T, Dubber-Hulsman LO, WJ, Oyen WJ, Simons EJ, Oystand Bredfield GJ, Oostra B. Hestink, Bonifti V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают автоматические рецессивные, рано-установленные паркинсонские пирамидальные синдромы». Неврология . 72 (3): 240–5. doi : 10,1212/01.wnl, 00003814144,10967.2b . PMID 1903853 . S2CID 25948572 .
^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Gudaravaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Текущая биология . 9 (20): 1177–9. Bibcode : 1999cbio .... 9.1177c . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Кирк Р., Ламан Х., Ноулз П.П., Мюррей-Руст Дж., Ломоносов М., Мезиан Эль К, Макдональд Н.К. (август 2008 г.). «Структура консервативного домена димеризации в белке F-бокса FBXO7 и ингибитора протеасомы PI31» . Журнал биологической химии . 283 (32): 22325–35. doi : 10.1074/jbc.m709900200 . PMID 18495667 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Laman H, Funes JM, Ye H, Henderson S, Galinanes-Garcia L, Hara E, Knowles P, McDonald N, Boshoff C (сентябрь 2005 г.). «Трансформационная активность FBXO7 опосредуется конкретно посредством регуляции циклина D/CDK6» . Embo Journal . 24 (17): 3104–16. doi : 10.1038/sj.emboj.7600775 . PMC 1201355 . PMID 16096642 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Burchell VS, Nelson DE, Sanchez-Martinez A, Delgado-Camprubi M, Ivatt RM, Pogson JH, Randle SJ, Wray S, Lewis PA, Houlden H, Abramov AY, Hardy J, Wood NW, Whitworth AJ, Laman H, Plun -Favreau H (сентябрь 2013 г.). «Белки, связанные с болезнью Паркинсона, FBXO7 и Паркин взаимодействуют, чтобы опосредовать митофагию» . Nature Neuroscience . 16 (9): 1257–65. doi : 10.1038/nn.3489 . PMC 3827746 . PMID 23933751 .

Дальнейшее чтение

Dunham I, Shimizu N, Roe Ba, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscoun , Бизли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджмен А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы человека 22» . Природа . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999natur.402..489d . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 .
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai Ma, Da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Oak AF, Matsukuma A, GS Bay, Simpson DH, Brunstein A, Oliveira PS, Bucher P, Jongenel CV, O'Hare MJ, Soares F, Breantani RR, Reis LF, Souza SJ, Simpson AJ (март 2000 г.). «Секвенирование дробовика человеческого трансциптома с экспрессированными ORF -метками последовательности» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. Bibcode : 2000pnas ... 97.3491d . Doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
Ilyin GP, Rialland M, Pigeon C, Guguen-Guillouzo C (июль 2000 г.). «Клонирование кДНК и анализ экспрессии новых членов семейства белков F-бокса млекопитающих». Геномика . 67 (1): 40–7. doi : 10.1006/geno.2000.6211 . PMID 10945468 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Исследование генома . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Tsou AP, Yang CW, Huang CY, Yu RC, Lee YC, Chang CW, Chen BR, Chung YF, Fann MJ, Chi CW, Chiu JH, Chou CK (январь 2003 г.). «Идентификация нового клеточного цикла, регулируемого геном, топром, сверхэкспрессированным при гепатоцеллюлярной карциноме человека» . Онкоген . 22 (2): 298–307. doi : 10.1038/sj.onc.1206129 . PMID 12527899 .
Коллинз Дж., Говард М.Е., Коул К.Г., Сминк Л.Дж., Гекл Э.Дж., Ноулз С., Бидж Дж. М., Беарн Д.М., Данхэм I (январь 2003 г.). «Переоценка аннотации гена человека: анализ второго поколения хромосомы 22» . Исследование генома . 13 (1): 27–36. doi : 10.1101/gr.695703 . PMC 430954 . PMID 12529303 .
HSU JM, Lee YC, Yu CT, Huang Cy (июль 2004 г.). «FBX7 функционирует в комплексном комплексе SCF, регулирующем CDK1-циклин B-фосфорилированная гепатома, регулируемый белком (HURP) протеолиз, с помощью пролиновой области» . Журнал биологической химии . 279 (31): 32592–602. doi : 10.1074/jbc.m404950200 . PMID 15145941 .
Коллинз Дж., Райт К.Л., Эдвардс К.А., Дэвис М.П., Гринхэм Дж.А., Коул К.Г., Говард М.Е., Агуадо Б., Малли М., Мокраб Ю., Гекл Э.Дж., Беарн Д.М., Данхэм И. (2005). «Подход, основанный на аннотациях генома к клонированию человека Orfeome» . Биология генома . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Whoman S, Art D, Houberg W, WomenRerer R, Skrle A, Beregan H, Plultlus H, Plultcaker H, Postlok A (Octmary 2004). «От Orfeomom до Bioloy: в функциональной Gipomics Pillinine» . Исследование генома . 14 (10b): 2136-44. Doi : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж.С., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смолььяр А., Босак С., Проявление Р, Растяжение примеси L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (Octoo 2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, Del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (январь 2006 г.). «База данных LIFEDB в 2006 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 34 (проблема базы данных): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
Чанг Ю.Ф., Ченг С.М., Чанг Л.К., Чон Й.Дж., Юо Сай (апрель 2006 г.). «FBXO7 FBXO7 FBXO7 взаимодействует с ингибитором человека белка апоптоза CIAP1 и способствует убиквитинированию CIAP1» (PDF) . Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 342 (4): 1022–6. doi : 10.1016/j.bbrc.2006.02.061 . PMID 16510124 .
Liu Y, Hedvat CV, Mao S, Zhu XH, Yao J, Nguyen H, Koff A, Nimer SD (апрель 2006 г.). «MEF белка ETS регулируется фосфорилированием, зависящим от протеолиза через белок-хиквитин лигазу SCFSKP2» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (8): 3114–23. doi : 10.1128/mcb.26.8.3114-3123.2006 . PMC 1446966 . PMID 16581786 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 22 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100225 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000001786 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10531035-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Cenciarelli C, Chiaur DS, Gudaravaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Текущая биология . 9 (20): 1177–9. Bibcode : 1999cbio .... 9.1177c . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .

[pmid10531037-6] Уинстон JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (октябрь 1999). «Семейство белков F-бокса млекопитающих» . Текущая биология . 9 (20): 1180–2. Bibcode : 1999cbio .... 9.1180W . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80021-4 . PMID 10531037 .

[pmid19038853-7] Di Fonzo A, Deck MC, Montagna P, Baruzzi A, Yoonva EH, Correia Guedes L, Zczerbinska A, Zhao T, Dubber-Hulsman LO, WJ, Oyen WJ, Simons EJ, Oystand Bredfield GJ, Oostra B. Hestink, Bonifti V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают автоматические рецессивные, рано-установленные паркинсонские пирамидальные синдромы». Неврология . 72 (3): 240–5. doi : 10,1212/01.wnl, 00003814144,10967.2b . PMID 1903853 . S2CID 25948572 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Fbxo7 F-box белок 7» .

[9] Shojaee S, Sina F, Banihosseini SS, Kazemi MH, Kalhor R, Shahidi GA, Fahhrai-Rad H, Ronaghi M, Elahi E (июнь 2008 г.). «Анализ сцепления по всему геному на родословной паркинсонского пирамидального синдрома на 500 К массивов SNP» . Американский журнал человеческой генетики . 82 (6): 1375–84. doi : 10.1016/j.ajhg.2008.05.005 . PMC 2427312 . PMID 18513678 .

[10] Di Fonzo A, Deck MC, Montagna P, Baruzzi A, Yoonva EH, Correia Guedes L, Zczerbinska A, Zhao T, Dubber-Hulsman LO, WJ, Oyen WJ, Simons EJ, Oystand Bredfield GJ, Oostra B. Hestink, Bonifti V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают автоматические рецессивные, рано-установленные паркинсонские пирамидальные синдромы». Неврология . 72 (3): 240–5. doi : 10,1212/01.wnl, 00003814144,10967.2b . PMID 1903853 . S2CID 25948572 .

[autogenerated1-11] Cenciarelli C, Chiaur DS, Gudaravaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Текущая биология . 9 (20): 1177–9. Bibcode : 1999cbio .... 9.1177c . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .

[Kirk_2008-12] Jump up to: ^а ^{беременный} Кирк Р., Ламан Х., Ноулз П.П., Мюррей-Руст Дж., Ломоносов М., Мезиан Эль К, Макдональд Н.К. (август 2008 г.). «Структура консервативного домена димеризации в белке F-бокса FBXO7 и ингибитора протеасомы PI31» . Журнал биологической химии . 283 (32): 22325–35. doi : 10.1074/jbc.m709900200 . PMID 18495667 .

[:0-13] Jump up to: ^а ^{беременный} Laman H, Funes JM, Ye H, Henderson S, Galinanes-Garcia L, Hara E, Knowles P, McDonald N, Boshoff C (сентябрь 2005 г.). «Трансформационная активность FBXO7 опосредуется конкретно посредством регуляции циклина D/CDK6» . Embo Journal . 24 (17): 3104–16. doi : 10.1038/sj.emboj.7600775 . PMC 1201355 . PMID 16096642 .

[:1-14] Jump up to: ^а ^{беременный} Burchell VS, Nelson DE, Sanchez-Martinez A, Delgado-Camprubi M, Ivatt RM, Pogson JH, Randle SJ, Wray S, Lewis PA, Houlden H, Abramov AY, Hardy J, Wood NW, Whitworth AJ, Laman H, Plun -Favreau H (сентябрь 2013 г.). «Белки, связанные с болезнью Паркинсона, FBXO7 и Паркин взаимодействуют, чтобы опосредовать митофагию» . Nature Neuroscience . 16 (9): 1257–65. doi : 10.1038/nn.3489 . PMC 3827746 . PMID 23933751 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]