Субблок микропроцессорного комплекса ДГЦР8

ДГКР8
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1X47, 2YT4, 3LE4, 5B16
Идентификаторы
Псевдонимы	DGCR8 , C22orf12, DGCRK6, Gy1, паша, Паша, субблок микропроцессорного комплекса DGCR8, субблок микропроцессорного комплекса
Внешние идентификаторы	Опустить : 609030 ; МГИ : 2151114 ; Гомологен : 11223 ; Генные карты : DGCR8 ; ОМА : DGCR8 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	20,111,877 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; sural nerve; ; right testis; ; left testis; ; body of uterus; ; right ovary; ; right lobe of thyroid gland; ; body of pancreas; ; left ovary; ; apex of heart;
	n/a
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	primary miRNA binding; ribonuclease III activity; double-stranded RNA binding; protein binding; heme binding; protein homodimerization activity; metal ion binding; RNA binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; microprocessor complex; nucleolus; nucleus; nucleoplasm; postsynaptic density;
Biological process	regulation of stem cell proliferation; primary miRNA processing; RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; RNA phosphodiester bond hydrolysis; miRNA metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	54487
	94223
	ENSG00000128191
	ENSMUSG00000022718
	Q8WYQ5
	Q9EQM6
	НМ_001190326 ; НМ_022720
	НМ_033324
	НП_001177255 ; НП_073557
	НП_201581
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица микропроцессорного комплекса DGCR8 ( критическая область 8 синдрома ДиДжорджа ) представляет собой белок , который у человека кодируется DGCR8 геном . ^[4] У других животных, особенно у распространенных модельных организмов Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans , белок известен как Паша (партнер Дроши ). ^[5] Это необходимый компонент пути РНК-интерференции .

Функция

Субъединица DGCR8 локализована в ядре клетки и необходима для процессинга микроРНК (миРНК). Он связывается с другой субъединицей Дроша , РНКазы III ферментом , с образованием микропроцессорного комплекса , который расщепляет первичный транскрипт, известный как при-миРНК, до характерной структуры «стебель-петля» , известной как пре-миРНК, которая затем подвергается дальнейшему процессингу до фрагментов микроРНК. ферментом Dicer . DGCR8 содержит РНК -связывающий домен и, как полагают, связывает pri-миРНК, чтобы стабилизировать ее для обработки Drosha. ^[6]

DGCR8 также необходим для некоторых типов репарации ДНК. Удаление УФ-индуцированных фотопродуктов ДНК во время эксцизионной репарации нуклеотидов, связанных с транскрипцией (TC-NER) , зависит от JNK-фосфорилирования DGCR8 на серине 153. ^[7] Хотя известно, что DGCR8 участвует в биогенезе микроРНК, эта активность не требуется для DGCR8-зависимого удаления фотопродуктов, индуцированных УФ-излучением. ^[7] Эксцизионная репарация нуклеотидов также необходима для восстановления окислительных повреждений ДНК, вызванных перекисью водорода ( H ₂ O ₂ ), а клетки, обедненные DGCR8, чувствительны к H ₂ O ₂ . ^[7]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000128191 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтреза: ген 8 критической области синдрома ДиДжорджа DGCR8» .
^ Денли А.М., Топс Б.Б., Пластерк Р.Х., Кеттинг Р.Ф., Хэннон Г.Дж. (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК Микропроцессорным комплексом». Природа . 432 (7014): 231–5. Бибкод : 2004Natur.432..231D . дои : 10.1038/nature03049 . ПМИД 15531879 . S2CID 4425505 .
^ Йом К.Х., Ли Ю., Хан Дж., Су М.Р., Ким В.Н. (2006). «Характеристика DGCR8/Pasha, важного кофактора Drosha в первичной обработке микроРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (16): 4622–9. дои : 10.1093/нар/gkl458 . ПМЦ 1636349 . ПМИД 16963499 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Кальсес ПК, Диллон К.К., Такер Н., Чи Й., Хуанг Дж.В., Кавасуми М., Нгием П., Ван Й., Клерман Б.Е., Жакмон С., Гафкен П.Р., Сугасава К., Сайджо М., Танигучи Т. (2017). «DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных УФ-излучением, независимо от процессинга РНК» . Представитель ячейки . 19 (1): 162–174. дои : 10.1016/j.celrep.2017.03.021 . ПМЦ 5423785 . ПМИД 28380355 .

Дальнейшее чтение

Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Отчеты ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Сиохама А., Сасаки Т., Нода С., Миношима С., Симидзу Н. (апрель 2003 г.). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии нового гена DGCR8, расположенного в хромосомной области синдрома ДиДжорджа». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 304 (1): 184–90. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00554-0 . ПМИД 12705904 .
Грегори Р.И., Ян К.П., Амутхан Г., Чендримада Т., Доратотай Б., Куч Н., Шихаттар Р. (ноябрь 2004 г.). «Микропроцессорный комплекс опосредует генезис микроРНК». Природа 432 (7014): 235–40. Бибкод : 2004Nature.432..235G . дои : 10.1038/nature03120 . ПМИД 15531877 . S2CID 4389261 .
Хан Дж., Ли Ю, Ём К.Х., Ким Ю.К., Джин Х., Ким В.Н. (декабрь 2004 г.). «Комплекс Дроша-DGCR8 в первичном процессинге микроРНК» . Гены и развитие . 18 (24): 3016–27. дои : 10.1101/gad.1262504 . ПМК 535913 . ПМИД 15574589 .
Ландталер М., Ялчин А., Тушль Т. (декабрь 2004 г.). «Ген 8 критической области синдрома ДиДжорджа человека и его гомолог D. melanogaster необходимы для биогенеза микроРНК». Современная биология . 14 (23): 2162–7. Бибкод : 2004CBio...14.2162L . дои : 10.1016/j.cub.2004.11.001 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB83-3 . ПМИД 15589161 . S2CID 13266269 .
Хан Дж., Ли Ю, Ём К.Х., Нам Дж.В., Хо И, Ри Дж.К., Сон С.И., Чо Ю., Чжан Б.Т., Ким В.Н. (июнь 2006 г.). «Молекулярные основы распознавания первичных микроРНК комплексом Дроша-DGCR8» . Клетка . 125 (5): 887–901. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.043 . ПМИД 16751099 .
Фаллер М., Мацунага М., Инь С., Лу Дж.А., Го Ф. (январь 2007 г.). «Гем участвует в процессинге микроРНК». Структурная и молекулярная биология природы . 14 (1): 23–9. дои : 10.1038/nsmb1182 . ПМИД 17159994 . S2CID 17463646 .
Сон С.Ю., Бэ В.Дж., Ким Дж.Дж., Йом К.Х., Ким В.Н., Чо Ю (сентябрь 2007 г.). «Кристаллическая структура ядра DGCR8 человека». Структурная и молекулярная биология природы . 14 (9): 847–53. дои : 10.1038/nsmb1294 . ПМИД 17704815 . S2CID 18561478 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 22 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000128191 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-4] «Ген Энтреза: ген 8 критической области синдрома ДиДжорджа DGCR8» .

[5] Денли А.М., Топс Б.Б., Пластерк Р.Х., Кеттинг Р.Ф., Хэннон Г.Дж. (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК Микропроцессорным комплексом». Природа . 432 (7014): 231–5. Бибкод : 2004Natur.432..231D . дои : 10.1038/nature03049 . ПМИД 15531879 . S2CID 4425505 .

[6] Йом К.Х., Ли Ю., Хан Дж., Су М.Р., Ким В.Н. (2006). «Характеристика DGCR8/Pasha, важного кофактора Drosha в первичной обработке микроРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (16): 4622–9. дои : 10.1093/нар/gkl458 . ПМЦ 1636349 . ПМИД 16963499 .

[Calses-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с Кальсес ПК, Диллон К.К., Такер Н., Чи Й., Хуанг Дж.В., Кавасуми М., Нгием П., Ван Й., Клерман Б.Е., Жакмон С., Гафкен П.Р., Сугасава К., Сайджо М., Танигучи Т. (2017). «DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных УФ-излучением, независимо от процессинга РНК» . Представитель ячейки . 19 (1): 162–174. дои : 10.1016/j.celrep.2017.03.021 . ПМЦ 5423785 . ПМИД 28380355 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]