Артемида (белок)
| DCLRE1C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | DCLRE1C , A-SCID, DCLREC1C, RS-SCID, SCIDA, SNM1C, ДНК-поперечная репарация 1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Омим : 605988 ; MGI : 2441769 ; Гомологен : 32547 ; GeneCards : DCLRE1C ; OMA : DCLRE1C - Ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Артемида- это белок , который у людей кодируется геном ( D Na C Ross - L Ink RE Pare 1C ) DCLRE1C . [ 5 ] [ 6 ]
Функция
[ редактировать ]Артемида - это ядерный белок , который участвует в рекомбинации V (D) J и репарации ДНК . Белок обладает эндонуклеазной активностью на 5 'и 3' свеса и шпильки, когда в комплексе с PRKDC . [ 7 ]
Иммунный ответ
[ редактировать ]Артемида играет важную роль в рекомбинации V (D) J , процесс, посредством которого гены B -клеточных антител и гены T -клеточных рецепторов собираются из отдельных сегментов V (переменная), D (разнообразие) и J (соединение). [ 8 ] Например, при соединении V -сегмента к сегменту D ген тряпичный ген (рекомбинация активирующего) разрезает обе нити ДНК, прилегающие к V -сегменту, так и примыкают к сегменту D. Промежуточная ДНК между сегментами V и D лигируется с образованием круговой молекулы ДНК, которая теряется из хромосомы. На каждом из двух оставшихся концов, называемых кодирующими концами, две пряди ДНК соединяются, чтобы сформировать структуру шпильки. Артемида нуклеаза в комплексе с ДНК-зависимой протеинкиназой (ДНК-ПК) связывается с этими концами ДНК и делает один порез вблизи кончика шпильки. Экспонентные 3 'термини подвергаются делеции и добавлению нуклеотидов различными экзонуклеазами и ДНК -полимеразами, прежде чем сегменты V и D лигируются для восстановления целостности хромосомы. Точное место расщепления шпильки с помощью Artemis является переменным, и эта изменчивость в сочетании со случайным делецией и добавлением нуклеотидов и добавлением чрезвычайного разнообразия на полученные гены антител и рецептора Т-клеток, что позволяет иммунной системе устанавливать иммунный ответ на иммунный ответ на ответ на иммунный ответ на иммунный ответ на иммунный ответ на иммунный ответ на Практически любой иностранный антиген. [ 9 ] У индивидуумов с дефицитом артемиды рекомбинация V (D) J блокируется, потому что концы шпильки не могут быть открыты, и поэтому не продуцируется зрелые B или T-клетки, состояние, известное как тяжелый комбинированный иммунный дефицит (SCID) . Артемида была впервые идентифицирована как дефектный ген у подмножества пациентов с SCID, которые были необычно чувствительны к радиации .
Восстановление разрывов ДНК
[ редактировать ]Дефицитные клетки в артемиде более чувствительны, чем нормальные клетки, к r -rays [ 5 ] и химическим агентам, которые вызывают двойные разрывы (DSBS), [ 10 ] и они показывают более высокую частоту разрыва хромосомы после облучения. [ 11 ] Прямое измерение DSB с помощью электрофореза с импульсным полем указывает на то, что в клетках с дефицитом Artemis 75-90% DSB быстро восстанавливаются, как и в нормальных клетках. Тем не менее, оставшиеся 10-20% DSB, которые восстанавливаются медленнее (2-24 часа) в нормальных клетках, вообще не восстанавливаются в клетках с дефицитом Artemis. [ 12 ] Восстановление этих предположительно трудных разрывов для применения также требует нескольких других белков, включая комплекс MRE11/RAD50/NBS1, мутированную атт-киназу атаксии и 53BP1. Потому что Артемида может удалить поврежденные концы из ДНК, [ 10 ] Было предложено, чтобы эти DSB были теми, чьи поврежденные концы требуют обрезки артемиды. Тем не менее, доказательства того, что как банкомат, так и артемида специально необходимы для восстановления DSB в гетерохроматине, [ 13 ] [ 14 ] назвал эту интерпретацию под сомнение.
Артемида функционирует при восстановлении двойных разрывов ДНК , которые возникают путем индуцированных окислительных реакций, или эндогенными реакциями. [ 15 ] Такое восстановление ДНК происходит в гетерохроматине, а также в эухроматине .
Клиническое значение
[ редактировать ]атабасканского типа Мутации в этом гене вызывают тяжелый комбинированный иммунодефицит (SCIDA). [ 16 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что DCLRE1C взаимодействует с ДНК-PKC . [ 17 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000152457 - ENSEMBL , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000026648 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Jump up to: а беременный Moshous D, Callebaut I, De Chasseval R, Corneo B, Cavazzana-Calvo M, Le Deist F, Tezcan I, Sanal OR, Bertrand Y, Philippe N, Fischer A, De Villartay JP (май 2001 г.). «Артемида, новый рекомбинационный белок с двойным разрывом ДНК/V (D) J, изменяется в тяжелой комбинированной иммунной дефиците человека». Клетка . 105 (2): 177–86. Doi : 10.1016/s0092-8674 (01) 00309-9 . HDL : 11655/13789 . PMID 1133668 . S2CID 12610896 .
- ^ Li L, Drayna D, Hu D, Hayward A, Gahagan S, Pabst H, Cowan MJ (Mar 1998). «Ген для тяжелых комбинированных иммунодефицитных заболеваний у коренных американцев, говорящих на Атабаскане, расположен на хромосоме 10p» . Являюсь. J. Hum. Генет . 62 (1): 136–44. doi : 10.1086/301688 . PMC 1376812 . PMID 9443881 .
- ^ «Белковая база: ген DCLRE1C - ДНК -поперечная репарация 1C белок (белок артемида)» . Получено 2 июня 2011 года .
- ^ De Villartay JP (2009). V (D) J Дефицит рекомбинации . Достижения в области экспериментальной медицины и биологии. Тол. 650. С. 46–58. doi : 10.1007/978-1-4419-0296-2_4 . ISBN 978-1-4419-0295-5 Полем PMID 19731800 .
- ^ Lu H, Schwarz K, Lieber MR (2007). «Степень, в которой открытие шпильки Artemis: DNA-PKCS может способствовать разнообразию соединения в рекомбинации V (D) J» . Нуклеиновые кислоты Res . 35 (20): 6917–23. doi : 10.1093/nar/gkm823 . PMC 2175297 . PMID 17932067 .
- ^ Jump up to: а беременный Povirk LF, Zhou T, Zhou R, Cowan MJ, Yannone SM (февраль 2007 г.). «Обработка 3'-фосфогликолетов Двойной цепи ДНК разрывается с помощью нуклеазы Artemis» . Дж. Биол. Химический 282 (6): 3547–58. doi : 10.1074/jbc.m607745200 . PMID 17121861 .
- ^ Deckbar D, Birraux J, Krempler A, Tchouandong L, Beucher A, Walker S, Stift T, Jeggo P, Löbrich M (март 2007 г.). «Поломка хромосомы после выпуска контрольной точки G2» (PDF) . J. Cell Biol . 176 (6): 749–55. doi : 10.1083/jcb.200612047 . PMC 2064048 . PMID 17353355 .
- ^ Рибалло Е., Кюне М., Риф Н., Доэрти А., Смит Г.К., Рецио М.Дж., Рейс С., Дам К., Фрик А., Кримпер А., Паркер А.Р., Джексон С.П., Геннери А., Джегго П.А., Лёбрич М (декабрь 2004 г.). «Путь двойного разрыва, возвращающегося в зависимости от ATM, Artemis и белков, расположенных в фокусах гамма-H2AX» . Мол Клетка . 16 (5): 715–24. doi : 10.1016/j.molcel.2004.10.029 . PMID 15574327 .
- ^ Гударзи А.А., полдень в, Deckbar D, Ziv Y, Shiloh Y, Löbrich M, Jeggo PA (июль 2008 г.). «Передача сигналов ATM облегчает восстановление двойных разрывов ДНК, связанных с гетерохроматином» . Мол Клетка . 31 (2): 167–77. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.017 . PMID 18657500 .
- ^ Beucher A, Birraux J, Tchouandong L, Barton O, Shibata A, Conrad S, Goodarzi A, Krempler A, Jeggo Pa, Löbrich M (ноябрь 2009 г.). «Атм и артемида способствуют гомологичной рекомбинации радиационных двойных разрывов ДНК в G2» . j Embo 28 (21): 3413–2 Doi : 10.1038/ emboj.2009.2 2752027PMC PMID 19779458
- ^ Woodbine L, Brunton H, Goodarzi AA, Shibata A, Jeggo PA (2011). «Эндогенно индуцированные разрывы двойной цепи ДНК возникают в гетерохроматических областях ДНК и требуют атаксии телеангиэктазии и артемиды для их восстановления» . Нуклеиновые кислоты Res . 39 (16): 6986–97. doi : 10.1093/nar/gkr331 . PMC 3167608 . PMID 21596788 .
- ^ «Ген Entrez: ДНК-поперечная репарация ДНК DCLRE1C 1C (PSO2 Homolog, S. cerevisiae)» .
- ^ Ma Y, Pannicke U, Schwarz K, Lieber MR (март 2002 г.). «Открытие шпильки и обработка свеса с помощью артемиды/ДНК-зависимого комплекса протеинкиназы в нехомологичном конце соединения и рекомбинации V (D) J» . Клетка . 108 (6): 781–94. doi : 10.1016/s0092-8674 (02) 00671-2 . PMID 11955432 . S2CID 7575525 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Dudásová Z, Chovanec M (2003). «Артемида, и роман -опекун генома». Новообразование . 50 (5): 311–8. PMID 14628082 .
- Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Природа . 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098 .
- Wood RD, Mitchell M, Sgouros J, Lindahl T (2001). «Гены восстановления ДНК человека». Наука . 291 (5507): 1284–9. Bibcode : 2001sci ... 291.1284W . doi : 10.1126/science.1056154 . PMID 11181991 . S2CID 17375001 .
- Ma Y, Pannicke U, Schwarz K, Lieber MR (2002). «Открытие шпильки и обработка свеса с помощью артемиды/ДНК-зависимого комплекса протеинкиназы в нехомологичном конце соединения и рекомбинации V (D) J» . Клетка . 108 (6): 781–94. doi : 10.1016/s0092-8674 (02) 00671-2 . PMID 11955432 . S2CID 7575525 .
- Li L, Moshous D, Zhou Y, Wang J, Xie G, Salido E, Hu D, De Villartay JP, Cowan MJ (2002). «Мутация основателя в Artemis, SNM1-подобном белке, вызывает SCID у атабасканских коренных американцев» . J. Immunol . 168 (12): 6323–9. doi : 10.4049/jimmunol.168.12.6323 . PMID 12055248 .
- Callebaut I, Moshous D, Mornon JP, De Villartay JP (2002). «Металло-бета-лактамаза сгиба в рамках я нуклеиновых кислот, обрабатывающих ферменты: семейство бета-кассов» . Нуклеиновые кислоты Res . 30 (16): 3592–601. doi : 10.1093/nar/gkf470 . PMC 134238 . PMID 12177301 .
- Северный JG, Safe NS, из Burg M, Velen LR, Brown-Source S, Wissen JM, Weemae CM, Великий R, Zdzenicka MZ, Gent Dun JJ (2003). «Радисенсивные патенты SCID Белые мутации артемиды показывают полную B-клеточную диффузность на контрольно-пропускной пункте до B-клеток в бобах костного мозга» . Кровь . 101 (4): 1446–52. doi : 10 1182/Blood-2002-0187 . HDL : 1765/8235 . PMID 12406895 .
- Moshous D, Pannetier C, De Chasseval R, Le Deist F, Cavazzana-Calvo M, Roman S, Macingyre E, Canions D, Brouusse N, Fischer A, Casanova JL, De Villartay JP (2003). «Частичный иммунодефицит лимфоцитов T и B и предрасположенность к лимфоме у пациентов с гипоморфными мутациями в артемиде» . J. Clin. Инвестировать 111 (3): 381–7. Doi : 10.1172/jci16774 . PMC 151863 . PMID 12569164 .
- Kobayashi N, Agematsu K, Sugita K, Sako M, Nonoyama S, Yachie A, Kumaki S, Tsuchiya S, Ochs HD, Sugita K, Fukushima Y, Komiyama A (2003). «Новые мутации гена артемида радиосиментива тяжелых комбинированных иммунодефицита в японских семьях». Гул Генет . 112 (4): 348–52. doi : 10.1007/s00439-002-0897-x . PMID 12592555 . S2CID 11582061 .
- Kobayashi N, Agematsu K, Nagumo H, Yasui K, Katsuyama Y, Yoshizawa K, Ota M, Yachie A, Komiyama A (2003). «Расширение HLA-идентичных HLA-идентичных HLA-идентичных CD4+ T-клеток у пациента с тяжелым комбинированным иммунодефицитом и гомозиготной мутации в гене артемиды». Клин Иммунол . 108 (2): 159–66. doi : 10.1016/s1521-6616 (03) 00095-0 . PMID 12921762 .
- Поинсиньон C, Moshous D, Callebaut I, De Chasseval R, Villey I, De Villartay JP (2004). «Металло-бета-лактамаза/бета-Casp домен Artemis составляет каталитическое ядро для рекомбинации V (D) J» . J. Exp. Медик 199 (3): 315–21. doi : 10.1084/jem.20031142 . PMC 2211804 . PMID 14744996 .
- Pannicke U, Ma Y, Hopfner KP, Newolik D, Lieber MR, Schwarz K (2004). «Функциональный и биохимический рассечение структуры-специфической нуклеазы Artemis» . Embo j . 23 (9): 1987–97. doi : 10.1038/sj.emboj.7600206 . PMC 404326 . PMID 15071507 .
- Zhang X, Succi J, Feng Z, Prithivirajsingh S, Story MD, Legerski RJ (2004). «Артемида является целью фосфорилирования ATM и ATR и участвует в реакции контрольно -пропускного пункта ДНК ДНК G2/M» . Мол Клетка. Биол . 24 (20): 9207–20. doi : 10.1128/mcb.24.20.9207-9220.2004 . PMC 517881 . PMID 15456891 .
- Poinsignon C, De Chasseval R, Soubeyrand S, Moshous D, Fischer A, Hache RJ, De Villartay JP (2004). «Фосфорилирование артемиды после облучения, вызванного повреждением ДНК» . Евро. J. Immunol . 34 (11): 3146–55. doi : 10.1002/eji.200425455 . PMID 15468306 .