YopH, N-концевой
| Концевой белковый домен YopH_N | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура системы-шаперона секреции Yersinia pestis типа III в комплексе со стабильным фрагментом YSCM2 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ЙопХ_Н | ||
| Пфам | PF09013 | ||
| ИнтерПро | ИПР015103 | ||
| |||
В молекулярной биологии N -концевой YopH относится к эволюционно консервативному белковому домену . Эта запись представляет собой N-концевой домен YopH протеинтирозинфосфатазы (PTP).
Функция
[ редактировать ]белка тирозина (pTyr) Фосфорилирование является распространенной посттрансляционной модификацией , которая может создавать новые мотивы распознавания белковых взаимодействий и клеточной локализации, влиять на стабильность белков и регулировать активность ферментов . Следовательно, поддержание соответствующего уровня фосфорилирования тирозина белка имеет важное значение для многих клеточных функций. Тирозин-специфические протеинфосфатазы ( PTPase; EC ) катализируют удаление фосфатной цистеинилфосфата фермента группы, присоединенной к остатку тирозина, с использованием промежуточного продукта . Эти ферменты являются ключевыми регуляторными компонентами путей передачи сигнала (таких как путь киназы MAP ) и контроля клеточного цикла , а также играют важную роль в контроле и трансформации клеток роста, пролиферации, дифференцировки . [ 1 ] [ 2 ]
Классификация
[ редактировать ]PTP Надсемейство можно разделить на четыре подсемейства: [ 3 ]
- pTyr-специфические фосфатазы
- Фосфатазы двойной специфичности (dTyr и dSer/dThr)
- Cdc25- фосфатазы (dTyr и/или dThr)
- НМ (низкомолекулярные) фосфатазы
В зависимости от клеточной локализации ПТФазы также классифицируются на:
- Рецептоподобные, представляющие собой трансмембранные рецепторы , содержащие домены ПТФазы. [ 4 ]
- Нерецепторные (внутриклеточные) ПТФазы [ 5 ]
Структура
[ редактировать ]Этот домен имеет компактную структуру, состоящую из четырех альфа-спиралей и двух бета-шпильок. Спирали альфа-1 и альфа-3 параллельны друг другу и антипараллельны спиралям альфа-2 и альфа-4. Этот домен нацелен на YopH для секреции бактериями клетки, а также и транслокации в эукариотические обладает активностью связывания фосфотирозильного пептида, что позволяет распознавать p130Cas и паксиллин . [ 6 ] YopH из Yersinia sp. имеет важное значение для патогенеза , поскольку позволяет бактериям противостоять фагоцитозу хозяина макрофагов благодаря своей способности дефосфорилировать белки хозяина, тем самым вмешиваясь в процесс передачи сигналов хозяина . Иерсиния содержит один из самых активных известных ферментов PTP. YopH содержит петлю из десяти аминокислот (петля WPD), которая закрывает вход в активный центр фермента во время субстрата связывания . [ 7 ]
Все ПТФазы несут высококонсервативный активного сайта мотив C(X)5R (сигнатурный мотив PTP), используют общий каталитический механизм и имеют схожую основную структуру , состоящую из центрального параллельного бета-листа с фланкирующими альфа-спиралями , содержащими бета-петлю. -альфа-петля, которая включает в себя мотив подписи PTP. [ 8 ] Функциональное разнообразие ПТФаз обеспечивается регуляторными доменами и субъединицами .
Гомология
[ редактировать ]домен Гомологичный обнаружен в YscM (белок M секреции Yop), который действует как белок транслокации белка Yop . несколько белков участвуют В патогенезе Yop . YscM вырабатывается вирулентности опероном virC, который кодирует тринадцать генов yscA-M. [ 9 ] Транскрипция оперона virC подвергалась той же регуляции yop , что и гены .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дену Дж. М., Диксон Дж. Э. (октябрь 1998 г.). «Белковые тирозинфосфатазы: механизмы катализа и регуляции». Curr Opin Chem Biol . 2 (5): 633–41. дои : 10.1016/S1367-5931(98)80095-1 . ПМИД 9818190 .
- ^ Пол С., Ломброзо П.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Рецепторные и нерецепторные протеинтирозинфосфатазы в нервной системе» . Клетка. Мол. Наука о жизни . 60 (11): 2465–82. дои : 10.1007/s00018-003-3123-7 . ПМЦ 11138652 . ПМИД 14625689 . S2CID 10827975 .
- ^ Ван WQ, Сунь Дж. П., Чжан Цзы (2003). «Обзор суперсемейства протеинтирозинфосфатаз». Curr Top Med Chem . 3 (7): 739–48. дои : 10.2174/1568026033452302 . ПМИД 12678841 .
- ^ Эсваран Дж., Дебрецени Дж.Э., Лонгман Э., Барр А.Дж., Кнапп С. (июнь 2006 г.). «Кристаллическая структура домена 1 белка тирозинфосфатазы каппа фосфатазы человека» . Белковая наука . 15 (6): 1500–5. дои : 10.1110/ps.062128706 . ПМК 2242534 . ПМИД 16672235 .
- ^ Перкинс Л.А., Джонсон М.Р., Мельник М.Б., Перримон Н. (ноябрь 1996 г.). «Нерецепторный штопор протеинтирозинфосфатазы функционирует в множественных путях рецепторной тирозинкиназы у дрозофилы» . Дев. Биол . 180 (1): 63–81. дои : 10.1006/dbio.1996.0285 . ПМИД 8948575 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Евдокимов А.Г., Тропеа Дж.Е., Рутзан К.М., Коупленд Т.Д., Во Д.С. (июнь 2001 г.). «Структура N-концевого домена Yersinia pestis YopH при разрешении 2,0 А». Акта Кристаллогр. Д. 57 (Часть 6): 793–9. дои : 10.1107/s0907444901004875 . ПМИД 11375498 .
- ^ Хаджепур М., Ву Л., Лю С., Жадин Н., Чжан З.Ю., Каллендер Р. (апрель 2007 г.). «Динамика петли и кинетика связывания лиганда в реакции, катализируемой протеинтирозинфосфатазой Yersinia». Биохимия . 46 (14): 4370–8. дои : 10.1021/bi602335x . ПМИД 17352459 .
- ^ Барфорд Д., Дас А.К., член парламента Эглофф (1998). «Структура и механизм протеинфосфатаз: понимание катализа и регуляции». Annu Rev Biophys Biomol Struct . 27 : 133–64. doi : 10.1146/annurev.biophys.27.1.133 . ПМИД 9646865 .
- ^ Михилс Т., Ванотегем Х.К., Ламбер де Рувруа С., Чайна Б., Гастин А., Будри П., Корнелис Г.Р. (август 1991 г.). «Анализ virC, оперона, участвующего в секреции белков Yop Yersinia enterocolitica» . Дж. Бактериол . 173 (16): 4994–5009. дои : 10.1128/jb.173.16.4994-5009.1991 . ПМК 208188 . ПМИД 1860816 .