SRG1 РНК
| СРГ1 | |
|---|---|
 Консервативная вторичная структура РНК SRG1 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СРГ1 |
| Рфам | RF01765 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; Цис-рег ; |
| Домен(ы) | Сахаромицеты |
| PDB Структуры | ПДБе |
РНК SRG1 ( SER3 регуляторный ген 1 ) представляет собой некодирующую РНК , которая подавляет экспрессию SER3 (YER081W). [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] SER3 — это ген , который кодирует фосфоглицератдегидрогеназу , в биосинтезе серина участвующую . [ 4 ] SRG1 репрессирует экспрессию SER3 посредством интерференции транскрипции и в этом отношении является первым межгенным транскриптом такого типа. [ 1 ]
SRG1 был идентифицирован, когда анализы иммунопреципитации хроматина (ChIP) показали, что у Saccharomyces cerevisiae , даже когда SER3 подавлялся, ТАТА-связывающий белок и РНК-полимераза II все еще связывались с SER3 ДНК таким образом, что это должно было вызвать активную транскрипцию . [ 1 ] Дальнейший анализ обнаружил второй TATA-бокс на 558 п.н. выше SER3 . Биоинформатическое сканирование выявило тот же самый элемент ТАТА-бокса у родственных Saccharomyces . [ 5 ] Было обнаружено, что SRG1 обладает цис-действием , он не оказывает репрессивного эффекта в транс . [ 1 ]
РНК SRG1 не связана с геном, связанным со старением (SRG1), геном, кодирующим белок , обнаруженным у Arabidopsis thaliana . [ 6 ] а также отличается от гена реакции на стресс 1 (SRG1), обнаруженного у Medicago sativa . [ 7 ] [ 8 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д Мартенс Дж. А., Лапрад Л., Уинстон Ф. (июнь 2004 г.). «Межгенная транскрипция необходима для подавления гена SER3 Saccharomyces cerevisiae». Природа . 429 (6991): 571–574. Бибкод : 2004Natur.429..571M . дои : 10.1038/nature02538 . ПМИД 15175754 . S2CID 809550 .
- ^ «Энтрез Ген SRG1» . 3 июля 2010 г. Проверено 2 августа 2010 г.
- ^ «Геном дрожжей SRG1» . Проверено 2 августа 2010 г.
- ^ Альберс Э., Лайзе В., Бломберг А., Хоманн С., Густафссон Л. (март 2003 г.). «Ser3p (Yer081wp) и Ser33p (Yil074cp) представляют собой фосфоглицератдегидрогеназы в Saccharomyces cerevisiae» . Журнал биологической химии . 278 (12): 10264–10272. дои : 10.1074/jbc.M211692200 . ПМИД 12525494 .
- ^ Клифтен П., Сударсанам П., Десикан А., Фултон Л., Фултон Б., Мейджорс Дж., Уотерстон Р., Коэн Б.А., Джонстон М. (июль 2003 г.). «Обнаружение функциональных особенностей геномов Saccharomyces с помощью филогенетического следа» . Наука . 301 (5629): 71–76. Бибкод : 2003Sci...301...71C . дои : 10.1126/science.1084337 . ПМИД 12775844 . S2CID 1305166 .
- ^ «База знаний Uniprot — Белок SRG1» . Проверено 2 августа 2010 г.
- ^ Трусделл GM, Дикман MB (март 1997 г.). «Выделение патогенных/индуцируемых стрессом кДНК из люцерны методом дифференциального отображения мРНК» (PDF) . Молекулярная биология растений . 33 (4): 737–743. дои : 10.1023/А:1005728420374 . ПМИД 9132065 . S2CID 35519690 .
- ^ «Акции Генбанка: U42752.1» . 27 мая 1997 года . Проверено 2 августа 2010 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Каллен Б.Р., Ломедико П.Т., Джу Г. (1984). «Транкрипционная интерференция в птичьих ретровирусах - значение модели вставки промотора лейкемогенеза». Природа . 307 (5948): 241–245. Бибкод : 1984Natur.307..241C . дои : 10.1038/307241a0 . ПМИД 6363938 . S2CID 4277058 .
- Коули С., Бекиранов С., Нг Х.Х., Капранов П., Секингер Е.А., Кампа Д., Пикколбони А., Семенченко В., Ченг Дж., Уильямс А.Дж., Уилер Р., Вонг Б., Дренкоу Дж., Яманака М., Патель С., Брубейкер С., Таммана Х. , Хелт Г., Струл К., Гингерас Т.Р. (февраль 2004 г.). «Непредвзятое картирование сайтов связывания транскрипционных факторов вдоль хромосом 21 и 22 человека указывает на широко распространенную регуляцию некодирующих РНК» . Клетка . 116 (4): 499–509. дои : 10.1016/S0092-8674(04)00127-8 . ПМИД 14980218 .
- Валериус О, Брендель С, Дювель К, Браус Г.Х. (июнь 2002 г.). «Множество факторов предотвращают транскрипционную интерференцию в дрожжевом локусе ARO4-HIS7» . Журнал биологической химии . 277 (24): 21440–21445. дои : 10.1074/jbc.M201841200 . ПМИД 11937506 .
- Адхья С., Готтесман М. (июль 1982 г.). «Окклюзия промотора: транскрипция через промотор может ингибировать его активность». Клетка . 29 (3): 939–944. дои : 10.1016/0092-8674(82)90456-1 . ПМИД 6217898 . S2CID 24587523 .
- Гуровиц Э.Х., Браун П.О. (2003). «Полногеномный анализ длин мРНК у Saccharomyces cerevisiae» . Геномная биология . 5 (1): Р2. дои : 10.1186/gb-2003-5-1-r2 . ПМЦ 395734 . ПМИД 14709174 .