Прохлорококк
Прохлорококк | |
---|---|
![]() | |
ПЭМ- изображение Prochromococcus marinus ( псевдоцветное ) | |
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Цианобактерии |
Сорт: | Цианофицеи |
Заказ: | Синехококки |
Семья: | Прохлоровые |
Род: | Прохлорококк Чисхолм и др., 1992 г. |
Разновидность: | П. Маринус |
Биномиальное имя | |
Прохлорококк морской Чисхолм и др., 1992 г. |
Прохлорококки — род очень мелких (0,6 мкм ) морских цианобактерий с необычной пигментацией ( хлорофилл а2 и b2 ). Эти бактерии относятся к фотосинтезирующему пикопланктону и, вероятно, являются наиболее многочисленным фотосинтезирующим организмом на Земле. Микробы прохлорококки являются одними из основных первичных продуцентов кислорода в океане и отвечают за большую часть фотосинтетического производства кислорода . [1] [2] Штаммы прохлорококка , называемые экотипами, имеют физиологические различия, позволяющие им использовать разные экологические ниши. [3] Анализ последовательностей генома штаммов Prochromococcus показывает, что 1273 [4] гены являются общими для всех штаммов, а средний размер генома составляет около 2000 генов . [1] Напротив, эукариотические водоросли имеют более 10 000 генов. [4]
Открытие [ править ]
Хотя ранее было несколько записей об очень мелких хлорофилл- b -содержащих цианобактериях в океане. [5] [6] Прохлорококк был открыт в 1986 году. [7] Салли В. (Пенни) Чизхолм из Массачусетского технологического института , Роберт Дж. Олсон из Океанографического института Вудс-Хоул и другие сотрудники в Саргассовом море с использованием проточной цитометрии . Чисхолм был удостоен Премии Крафорда в 2019 году. За это открытие [8] Первая культура прохлорококка была выделена в Саргассовом море в 1988 г. ( штамм SS120), а вскоре был получен еще один штамм из Средиземного моря (штамм MED). Название Прохлорококк [9] Первоначально предполагалось, что прохлорококк связан с прохлороном и другими хлорофилл- b -содержащими бактериями, называемыми прохлорофитами, но теперь известно, что прохлорофиты образуют несколько отдельных филогенетических групп внутри подгруппы цианобактерий домена бактерий . Единственный вид в описываемом роде - Prochromococcus marinus , хотя два подвида были названы в честь вариаций ниш, адаптированных к низкой освещенности и высокой освещенности. [10]
Морфология [ править ]
Морские цианобактерии на сегодняшний день являются самыми маленькими из известных фотосинтезирующих организмов; Прохлорококк — самый маленький, его диаметр составляет всего 0,5–0,7 микрометра. [11] [2] Клетки кокковидной формы неподвижны и свободноживущие. Их небольшой размер и большое соотношение площади поверхности к объему дают им преимущество в воде с низким содержанием питательных веществ. Тем не менее предполагается, что прохлорококки нуждаются в очень небольших питательных веществах. [12] Более того, прохлорококки приспособились использовать в своих мембранах сульфолипиды вместо фосфолипидов, чтобы выжить в среде, лишенной фосфатов. [13] Эта адаптация позволяет им избегать конкуренции с гетеротрофами, выживание которых зависит от фосфатов. [13] Обычно прохлорококки размножаются один раз в сутки в приповерхностном слое или олиготрофных водах. [12]
Распространение [ править ]
Прохлорококк распространен в эвфотической зоне тропических океанов мира. [14] Возможно, это самый многочисленный род на Земле: один миллилитр поверхностной морской воды может содержать 100 000 и более клеток. Во всем мире среднегодовая численность составляет (2,8–3,0) × 10. 27 люди [15] (для сравнения, примерно столько атомов содержится в золота ) тонне . Прохлорококк распространен повсеместно между 40° с.ш. и 40° ю.ш. и доминирует в олиготрофных (бедных питательными веществами) регионах океанов. [12] Прохлорококк в основном встречается в диапазоне температур 10–33 °C, а некоторые штаммы могут расти на глубинах с низкой освещенностью (<1% поверхностного света). [1] Эти штаммы известны как экотипы LL (Low Light), а штаммы, занимающие меньшие глубины в толще воды, известны как экотипы HL (High Light). [16] Более того, прохлорококки более многочисленны в присутствии гетеротрофов, обладающих каталазными способностями. [17] У прохлорококков нет механизмов разложения активных форм кислорода, и для их защиты они полагаются на гетеротрофы. [17] На эту бактерию приходится примерно 13–48% глобального фотосинтетического производства кислорода и она составляет часть основы пищевой цепи океана . [18]
Пигменты [ править ]
Прохлорококк тесно связан с Synechococcus , еще одной широко распространенной фотосинтезирующей цианобактерией, которая содержит светособирающие фикобилисомы усиков . Однако Prochromoccus эволюционировал, чтобы использовать уникальный светособирающий комплекс, состоящий преимущественно из дивиниловых производных хлорофилла a (Chl a2) и хлорофилла b (Chl b2) и лишенный моновинилхлорофиллов и фикобилисом. [19] Прохлорококк - единственный известный оксигенный фототроф дикого типа, который не содержит Chl a в качестве основного фотосинтетического пигмента, и единственный известный прокариот с α-каротином. [20]
Геном [ править ]
геномы нескольких штаммов прохлорококка . Секвенированы [21] [22] Было секвенировано двенадцать полных геномов, которые выявили физиологически и генетически различные линии Prochromococcus marinus , которые на 97% сходны по гену 16S рРНК. [23] Исследования показали, что во время неопротерозойской Земли-снежка произошла массовая редукция генома , за которой последовали узкие места в популяциях . [24]
Экотип с высоким освещением имеет самый маленький геном (1 657 990 пар оснований, 1716 генов) среди всех известных оксигенных фототрофов, но геном типа с низким освещением намного больше (2 410 873 пары оснований, 2275 генов). [21]
, репарация и ДНК репликация Рекомбинация
Морские Prochromococcus цианобактерии имеют несколько генов, которые участвуют в рекомбинации , репарации и репликации ДНК . К ним относятся комплекс генов RecBCD , продукт которого, экзонуклеаза V, участвует в рекомбинационной репарации ДНК, и комплекс генов umuCD , продукт которого, ДНК-полимераза V , участвует в подверженной ошибкам репликации ДНК. [25] Эти цианобактерии также имеют ген lexA , который регулирует систему SOS-ответа , вероятно, систему, подобную хорошо изученной SOS-системе E. coli , которая используется в ответ на повреждение ДНК . [25]
Экология [ править ]
Предки прохлорококка внесли свой вклад в производство раннего атмосферного кислорода. [26] Несмотря на то, что прохлорококк является одним из самых маленьких типов морского фитопланктона в мировом океане, его значительная численность делает его ответственным за большую часть океанского, мирового фотосинтеза и производства кислорода. [2] Размер прохлорококка (0,5–0,7 мкм) [12] а адаптации различных экотипов позволяют организму обильно расти в водах с низким содержанием питательных веществ, таких как воды тропиков и субтропиков (от 40 ° с.ш. до 40 ° ю.ш.); [27] однако их можно найти в более высоких широтах, вплоть до 60 ° северной широты, но в довольно минимальных концентрациях, а распространение бактерий по океанам позволяет предположить, что более холодные воды могут быть смертельными. Такой широкий диапазон широт наряду со способностью бактерий выживать до глубин от 100 до 150 метров, то есть средней глубины слоя смешения поверхностного океана, позволяет им размножаться до огромных цифр, до 3×10 27 индивидуумов по всему миру. [28] [ не удалось пройти проверку ] Такое огромное количество заставляет прохлорококков играть важную роль в глобальном углеродном цикле и производстве кислорода. Наряду с Synechococcus (другой род цианобактерий, который встречается вместе с Prochromococcus ) эти цианобактерии ответственны примерно за 50% фиксации углерода в морской воде, что делает их важным поглотителем углерода посредством биологического углеродного насоса (т.е. переноса органического углерода с поверхности океана). на глубину посредством ряда биологических, физических и химических процессов). [29] Численность, распространение и все другие характеристики прохлорококка делают его ключевым организмом в олиготрофных водах, выступающим в качестве важного первичного производителя в пищевых сетях открытого океана.
Экотипы [ править ]
Прохлорококк имеет разные «экотипы», занимающие разные ниши, и могут различаться в зависимости от пигментов, требований к освещению, использования азота и фосфора, меди и чувствительности к вирусам. [30] [11] [31] Считается, что прохлорококк потенциально может занимать 35 различных экотипов и субэкотипов в мировом океане. Их можно дифференцировать по последовательности гена рибосомальной РНК . [11] [30] разделила его Таксономия NCBI на два разных подвида: адаптированный к слабому освещению (LL) и адаптированный к яркому освещению (HL). [10] В каждом подвиде шесть клад. [11]
слабого для Адаптировано освещения
Prochromococcus marinus subsp. marinus относится к типам, адаптированным к слабому освещению. [10] Он также дополнительно классифицируется по субэкотипам LLI-LLVII, где LLII/III еще не был филогенетически разделен. [11] [32] Виды LV встречаются в местах с высоким дефицитом железа вокруг экватора и в результате потеряли несколько белков железа. [33] Известно, что подвиды, адаптированные к слабому освещению, имеют более высокое соотношение хлорофилла b2 к хлорофиллу а2. [30] что способствует его способности поглощать синий свет. [34] Синий свет способен проникать в океанские воды глубже, чем остальная часть видимого спектра, и может достигать глубины более 200 м, в зависимости от мутности воды. Их способность фотосинтезировать на глубине, куда проникает синий свет, позволяет им обитать на глубинах от 80 до 200 м. [23] [35] Их геномы могут иметь размер от 1 650 000 до 2 600 000 пар оснований. [32]
Адаптированный к освещению [ править ]
Prochromococcus marinus subsp. пасторис относится к типам, адаптированным к яркому свету. [10] Его можно дополнительно классифицировать по субэкотипам HLI-HLVI. [32] [11] HLIII, как и LV, также расположен в среде с ограниченным содержанием железа вблизи экватора и имеет аналогичную адаптацию для железа. [33] Известно, что подвиды, адаптированные к яркому свету, имеют низкое соотношение хлорофилла b2 к хлорофиллу а2. [30] Адаптированные к яркому свету штаммы обитают на глубине от 25 до 100 м. [23] Их геномы могут иметь размер от 1 640 000 до 1 800 000 пар оснований. [32]
Метаболизм [ править ]
Известно, что большинство цианобактерий имеют неполный цикл трикарбоновых кислот (ТЦА). [36] [37] В этом процессе 2-оксоглутаратдекарбоксилаза (2OGDC) и янтарная полуальдегиддегидрогеназа (SSADH) заменяют фермент 2-оксоглутаратдегидрогеназу (2-OGDH). [37] Обычно, когда этот ферментный комплекс соединяется с НАДФ+ , он может превращаться в сукцинат из 2-оксоглутарата (2-ОГ). [37] Этот путь нефункционален у Prochromococcus . [37] поскольку сукцинатдегидрогеназа была потеряна в ходе эволюции для сохранения энергии, которая в противном случае могла бы быть потеряна на метаболизм фосфатов. [38]
Штаммы [ править ]
Напряжение | Подтип | Источник |
---|---|---|
МИТ9515 | ХЛИ | [4] |
EQPAC1 | ХЛИ | [39] |
МЕД4 | ХЛИ | [31] |
XMU1401 | HLII | [40] |
MIT0604 | HLII | [39] |
АС9601 | HLII | [4] |
ГП2 | HLII | [39] |
МИТ9107 | HLII | [39] |
МИТ9116 | HLII | [39] |
МИТ9123 | HLII | [39] |
МИТ9201 | HLII | [39] |
МИТ9202 | HLII | [39] |
МИТ9215 | HLII | [4] |
МИТ9301 | HLII | [4] |
МИТ9302 | HLII | [39] |
МИТ9311 | HLII | [39] |
МИТ9312 | HLII | [39] |
МИТ9314 | HLII | [39] |
МИТ9321 | HLII | [39] |
МИТ9322 | HLII | [39] |
МИТ9401 | HLII | [39] |
СБ | HLII | [39] |
XMU1403 | ЛЛИ | [41] |
XMU1408 | ЛЛИ | [41] |
MIT0801 | ЛЛИ | [39] |
НАТЛ1А | ЛЛИ | [4] |
НАТЛ2А | ЛЛИ | [4] |
РАС1 | ЛЛИ | [39] |
LG | LLII/III | [39] |
MIT0601 | LLII/III | [39] |
MIT0602 | LLII/III | [39] |
MIT0603 | LLII/III | [39] |
МИТ9211 | LLII/III | [4] |
СС35 | LLII/III | [39] |
СС52 | LLII/III | [39] |
СС120 | LLII/III | [42] |
СС2 | LLII/III | [39] |
СС51 | LLII/III | [39] |
MIT0701 | ЦВЕТ | [39] |
MIT0702 | ЦВЕТ | [39] |
MIT0703 | ЦВЕТ | [39] |
МИТ9303 | ЦВЕТ | [4] |
МИТ9313 | ЦВЕТ | [4] |
МИТ1303 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1306 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1312 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1313 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1318 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1320 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1323 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1327 | ЦВЕТ | [43] |
МИТ1342 | ЦВЕТ | [43] |
Таблица изменена с [32]
См. также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с Манн, К. (2011). Морская микробиология: Экология и приложения (Второе изд.). Гирляндная наука. [ нужна страница ]
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с Чимилески, Скотт; Колтер, Роберто (25 сентября 2017 г.). Жизнь на краю поля зрения . Белнап Пресс. ISBN 9780674975910 . Проверено 26 января 2018 г. [ нужна страница ]
- ^ Толонен А.С., Аах Дж., Линделл Д., Джонсон З.И., ректор Т., Стин Р., Черч ГМ, Чисхолм С.В. (октябрь 2006 г.). «Глобальная экспрессия генов экотипов прохлорококка в ответ на изменения доступности азота» . Молекулярная системная биология . 2 (1). 53. дои : 10.1038/msb4100087 . ПМК 1682016 . ПМИД 17016519 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к Кеттлер Г.К., Мартини А.С., Хуанг К. и др. (декабрь 2007 г.). «Схемы и последствия приобретения и потери генов в эволюции прохлорококка» . PLoS Генетика . 3 (12). е231. дои : 10.1371/journal.pgen.0030231 . ПМК 2151091 . ПМИД 18159947 .
- ^ П. В. Джонсон и Дж. М. Зибурт (1979). «Хроококкоидные цианобактерии в море: повсеместная и разнообразная фототрофная биомасса». Лимнология и океанография . 24 (5): 928–935. Бибкод : 1979LimOc..24..928J . дои : 10.4319/lo.1979.24.5.0928 .
- ^ WWC Гискес и Г.В. Краай (1983). «Неизвестные производные хлорофилла А в Северном море и тропической части Атлантического океана, выявленные с помощью ВЭЖХ-анализа» . Лимнология и океанография . 28 (4): 757–766. Бибкод : 1983LimOc..28..757G . дои : 10.4319/lo.1983.28.4.0757 .
- ^ ЮЗ Чисхолм; Р. Дж. Олсон; Э. Р. Зеттлер; Дж. Уотербери; Р. Герике; Н. Вельшмейер (1988). «Новый свободноживущий прохлорофит встречается при высоких концентрациях клеток в эвфотической зоне океана». Природа . 334 (6180): 340–343. Бибкод : 1988Natur.334..340C . дои : 10.1038/334340a0 . S2CID 4373102 .
- ^ «Премия Крафорда в области биологических наук 2019» . Шведская королевская академия наук. 17 января 2019 года . Проверено 26 апреля 2022 г.
- ^ Салли В. Чисхолм , С. Л. Франкель, Р. Герике, Р. Дж. Олсон, Б. Паленик, Дж. Б. Уотербери, Л. Вест-Джонсруд и Э. Р. Зеттлер (1992). « Prochromococcus marinus nov. gen. nov. sp.: оксифототрофный морской прокариот, содержащий дивинилхлорофилл a и b». Архив микробиологии . 157 (3): 297–300. Бибкод : 1992ArMic.157..297C . дои : 10.1007/BF00245165 . S2CID 32682912 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д «Прохлорококк морской» . НКБИ . Проверено 25 апреля 2022 г.
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж Биллер, Стивен Дж.; Берубе, Пол М.; Линделл, Дебби ; Чисхолм, Салли В. (1 декабря 2014 г.). «Прохлорококк: структура и функции коллективного разнообразия» (PDF) . Обзоры природы Микробиология . 13 (1): 13–27. дои : 10.1038/nrmicro3378 . hdl : 1721.1/97151 . ПМИД 25435307 . S2CID 18963108 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д Партенский Ф., Гесс В.Р., Валот Д. (1999). «Прохлорококк, морской фотосинтезирующий прокариот мирового значения» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 63 (1): 106–127. дои : 10.1128/ММБР.63.1.106-127.1999 . ПМК 98958 . ПМИД 10066832 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Ван Мой, BAS; Рокап, Г.; Фредрикс, Х.Ф.; Эванс, Коннектикут; Девол, АХ (26 мая 2006 г.). «Сульфолипиды резко снижают потребность пикоцианобактерий в фосфоре в олиготрофной морской среде» . Труды Национальной академии наук . 103 (23): 8607–8612. Бибкод : 2006PNAS..103.8607V . дои : 10.1073/pnas.0600540103 . ПМЦ 1482627 . ПМИД 16731626 .
- ^ Чисхолм, Юго-Запад; Франкель, С.; Герике, Р.; Олсон, Р.; Паленик, Б.; Уотербери, Дж.; Вест-Джонсруд, Л.; Зеттлер, Э. (1992). «Prochromococcus marinus nov. gen. nov. sp.: оксифототрофный морской прокариот, содержащий дивинилхлорофилл a и b». Архив микробиологии . 157 (3): 297–300. Бибкод : 1992ArMic.157..297C . дои : 10.1007/bf00245165 . S2CID 32682912 .
- ^ Фломбаум, П.; Гальегос, Дж.Л.; Гордилло, РА; Ринкон, Дж.; Забала, LL; Цзяо, Н.; Карл, DM; Ли, WKW; Ломас, Миссури; Венециано, Д.; Вера, CS; Вругт, Дж.А.; Мартини, AC (2013). «Настоящее и будущее глобальное распространение морских цианобактерий Prochromococcus и Synechococcus» . Труды Национальной академии наук . 110 (24): 9824–9829. Бибкод : 2013PNAS..110.9824F . дои : 10.1073/pnas.1307701110 . ПМЦ 3683724 . ПМИД 23703908 .
- ^ Коулман, М.; Салливан, М.; Мартини, А.; Стеглич, К.; Барри, К.; Делонг, Э.; Чисхолм, С. (2006). «Геномные острова, экология и эволюция прохлорококка» . Наука . 311 (5768): 1768–1770. Бибкод : 2006Sci...311.1768C . дои : 10.1126/science.1122050 . ПМИД 16556843 . S2CID 3196592 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Моррис, Джей-Джей; Киркегор, Р.; Сул, MJ; Джонсон, З.И.; Зинзер, ER (23 мая 2008 г.). «Обеспечение устойчивого роста колоний прохлорококка и разбавление жидких культур с помощью гетеротрофных бактерий-помощников» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (14): 4530–4534. Бибкод : 2008ApEnM..74.4530M . дои : 10.1128/АЕМ.02479-07 . ПМЦ 2493173 . ПМИД 18502916 .
- ^ Джонсон, Закари И.; Зинзер, Эрик Р.; Коу, Эллисон; МакНалти, Натан П.; Вудворд, Э. Малкольм С.; Чисхолм, Салли В. (2006). «Распределение ниш между экотипами прохлорококков вдоль экологических градиентов в масштабе океана». Наука . 311 (5768): 1737–1740. Бибкод : 2006Sci...311.1737J . дои : 10.1126/science.1118052 . ПМИД 16556835 . S2CID 3549275 .
- ^ Тинг К.С., Рокап Г., Кинг Дж., Чисхолм С. (2002). «Цианобактериальный фотосинтез в океанах: происхождение и значение различных стратегий сбора света». Тенденции в микробиологии . 10 (3): 134–142. дои : 10.1016/s0966-842x(02)02319-3 . ПМИД 11864823 .
- ^ Герике Р., Репета Д. (1992). «Пигменты Prochromococcus marinus: наличие дивинилхлорофилла а и b у морских прокариот» . Лимнология и океанография . 37 (2): 425–433. Бибкод : 1992LimOc..37..425R . дои : 10.4319/lo.1992.37.2.0425 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Г. Рокап; Ф.В. Лаример; Дж. Ламердин; С. Малфатти; П. Цепь; Н. А. Альгрен; А. Арельяно; М. Коулман; Л. Хаузер; В. Р. Гесс; З.И. Джонсон; М. Лэнд; Д. Линделл ; Почта АФ; В. Регала; М. Шах; С.Л. Шоу; К. Стеглич; МБ Салливан; КС Тинг; А. Толонен; Э.А. Уэбб; Э. Р. Зинзер; SW Чисхолм (2003). «Дивергенция генома двух экотипов Prochromococcus отражает дифференциацию океанических ниш» (PDF) . Природа . 424 (6952): 1042–1047. Бибкод : 2003Natur.424.1042R . дои : 10.1038/nature01947 . ПМИД 12917642 . S2CID 4344597 . Архивировано из оригинала (– [scholar.google.co.uk/scholar?hl=en&lr=&q=intitle%3AGenome+divergence+in+two+%27%27Prochromococcus%27%27+экотипы+отражает+океаническую+нишу+дифференциацию&as_publication=%5B%5BNature+% 28journal%29%7CNature%5D%5D&as_ylo=2003&as_yhi=2003&btnG=Поиск Поиск ученых] ) 11 декабря 2004 г.
- ^ А. Дюфрен; М. Саланубат; Ф. Партенский; Ф. Артигенав; И.М. Аксманн; В. Барбэ; С. Дюпра; МОЙ Гальперин; Е.В. Кунин; Ф. Ле Галль; К.С. Макарова; М. Островский; С. Озтас; К. Роберт; И.Б. Рогозин; диджей Сканлан; Н. Тандо де Марсак; Дж. Вайсенбах; П. Винкер; Ю.И. Вольф; В. Р. Гесс (2003). «Последовательность генома цианобактерии Prochromococcus marinus SS120, почти минимального оксифототрофного генома» . Труды Национальной академии наук . 100 (17): 10020–10025. Бибкод : 2003PNAS..10010020D . дои : 10.1073/pnas.1733211100 . ЧВК 187748 . ПМИД 12917486 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с Мартини А.С., Тай А., Венециано Д., Примо Ф., Чисхолм С. (2009). «Таксономическое разрешение, экотипы и биогеография прохлорококка» . Экологическая микробиология . 11 (4): 823–832. Бибкод : 2009EnvMi..11..823M . дои : 10.1111/j.1462-2920.2008.01803.x . ПМИД 19021692 . S2CID 25323390 .
- ^ Чжан, Х.; Хеллвегер, Флорида; Ло, Х. (2024). «Редукция генома произошла у ранних прохлорококков с необычно низким эффективным размером популяции» . Журнал ISME . 18 (1): wrad035. дои : 10.1093/ismejo/wrad035 . ПМЦ 10837832 . ПМИД 38365237 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Касье-Шова С., Водор Т., Шова Ф. Сравнительная геномика рекомбинации и восстановления ДНК у цианобактерий: биотехнологические последствия. Передняя микробиол. 9 ноября 2016 г.;7:1809. дои: 10.3389/fmicb.2016.01809. ПМИД: 27881980; PMCID: PMC5101192
- ^ Крошечное существо, тайно питающее планету | Пенни Чисхолм , получено 26 апреля 2022 г.
- ^ Партенский, Бланшо, Воло (1999). «Дифференциальное распространение и экология прохлорококков и синехококков в океанических водах: обзор». Бюллетень Океанографического института. Монако (спец. 19).
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Зинзер, Эрик Р.; Коу, Эллисон; Джонсон, Закари И.; Мартини, Адам С.; Фуллер, Николас Дж.; Сканлан, Дэвид Дж.; Чисхолм, Салли В. (январь 2006 г.). «Численность экотипа прохлорококка в северной части Атлантического океана, выявленная с помощью усовершенствованного метода количественной ПЦР †» . Прикладная и экологическая микробиология . 72 (1): 723–732. Бибкод : 2006ApEnM..72..723Z . doi : 10.1128/aem.72.1.723-732.2006 . ПМЦ 1352191 . ПМИД 16391112 .
- ^ Фу, Фэй-Сюэ; Уорнер, Марк Э.; Чжан, Яохун; Фэн, Юаньюань; Хатчинс, Дэвид А. (16 мая 2007 г.). «Влияние повышенной температуры и CO2 на фотосинтез, рост и соотношение элементов морских синехококков и прохлорококков (цианобактерий)». Журнал психологии . 43 (3): 485–496. Бибкод : 2007JPcgy..43..485F . дои : 10.1111/j.1529-8817.2007.00355.x . S2CID 53353243 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д Нью-Джерси Уэст и DJ Scanlan (1999). «Разделение ниш прохлорококка в стратифицированной толще воды в восточной части Северной Атлантического океана» . Прикладная и экологическая микробиология . 65 (6): 2585–2591. дои : 10.1128/АЕМ.65.6.2585-2591.1999 . ПМК 91382 . ПМИД 10347047 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Рокап, Габриэль; Лаример, Фрэнк В.; Ламердин, Джейн; Малфатти, Стефани; Цепочка, Патрик; Альгрен, Натан А.; Арельяно, Андре; Коулман, Морин; Хаузер, Лорен; Гесс, Вольфганг Р.; Джонсон, Закари И. (август 2003 г.). «Дивергенция генома двух экотипов Prochromococcus отражает дифференциацию океанических ниш» . Природа . 424 (6952): 1042–1047. Бибкод : 2003Natur.424.1042R . дои : 10.1038/nature01947 . ISSN 1476-4687 . ПМИД 12917642 . S2CID 4344597 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и Ян, Вэй; Фэн, Сюэджин; Чжан, Вэй; Чжан, Руй; Цзяо, Няньчжи (01 ноября 2020 г.). «Прогресс исследований в области экотипической и субэкотипической дифференциации прохлорококка и его адаптивности к окружающей среде» . Наука Китай Науки о Земле . 63 (11): 1691–1700. Бибкод : 2020ScChD..63.1691Y . дои : 10.1007/s11430-020-9651-0 . ISSN 1869-1897 . S2CID 221218462 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Раш, Дуглас Б.; Мартини, Адам С.; Дюпон, Кристофер Л.; Халперн, Аарон Л.; Вентер, Дж. Крейг (14 сентября 2010 г.). «Характеристика клад Prochromococcus из обедненных железом океанических регионов» . Труды Национальной академии наук . 107 (37): 16184–16189. Бибкод : 2010PNAS..10716184R . дои : 10.1073/pnas.1009513107 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 2941326 . ПМИД 20733077 .
- ^ Ральф, Г.; Репета, Д. (1992). «Пигменты Prochromococcus marinus: наличие дивинилхлорофиллов a и b в морских прокариотах» . Лимнология и океанография . 37 (2): 425–433. Бибкод : 1992LimOc..37..425R . дои : 10.4319/lo.1992.37.2.0425 .
- ^ Зинзер, Э.; Джонсон, З.; Коу, А.; Караджа, Э.; Венециано, Д.; Чисхолм, С. (2007). «Влияние света и температуры на распространение экотипа прохлорококка в Атлантическом океане» . Лимнология и океанография . 52 (5): 2205–2220. Бибкод : 2007LimOc..52.2205Z . дои : 10.4319/lo.2007.52.5.2205 . S2CID 84767930 .
- ^ Гарсиа-Фернандес, Хосе М.; Диес, Хесус (декабрь 2004 г.). «Адаптивные механизмы путей ассимиляции азота и углерода у морских цианобактерий Prochromococcus» . Исследования в области микробиологии . 155 (10): 795–802. дои : 10.1016/j.resmic.2004.06.009 . ISSN 0923-2508 . ПМИД 15567272 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д Чжан, Шуи; Брайант, Дональд А. (16 декабря 2011 г.). «Цикл трикарбоновых кислот у цианобактерий» . Наука . 334 (6062): 1551–1553. Бибкод : 2011Sci...334.1551Z . дои : 10.1126/science.1210858 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 22174252 . S2CID 206536295 .
- ^ Кейси, Джон Р.; Мардиноглу, Адиль; Нильсен, Йенс; Карл, Дэвид М. (27 декабря 2016 г.). Гутьеррес, Марселино (ред.). «Адаптивная эволюция метаболизма фосфора у прохлорококка» . mSystems . 1 (6): e00065–16. дои : 10.1128/mSystems.00065-16 . ISSN 2379-5077 . ПМК 5111396 . ПМИД 27868089 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С аа аб и Биллер, Стивен Дж.; Берубе, Пол М.; Берта-Томпсон, Джесси В.; Келли, Либуша; Роггенсак, Сара Э.; Авад, Лана; Роуч-Джонсон, Кэтрин Х.; Дин, Хуэймин; Джованнони, Стивен Дж.; Рокап, Габриэль; Мур, Лиза Р. (30 сентября 2014 г.). «Геномы разнообразных изолятов морской цианобактерии Prochromococcus» . Научные данные . 1 (1): 140034. doi : 10.1038/sdata.2014.34 . ISSN 2052-4463 . ПМК 4421930 . ПМИД 25977791 .
- ^ Ян, Вэй; Чжан, Руй; Вэй, Шучжэнь; Цзэн, Цинлу; Сяо, Силинь; Ван, Цюн; Ян, Ханруй; Цзяо, Няньчжи (11 января 2018 г.). «Проект геномной последовательности штамма Prochromococcus marinus XMU1401, выделенного из западной тропической части северной части Тихого океана» . Геномные объявления . 6 (2): e01431–17. doi : 10.1128/genomeA.01431-17 . ISSN 2169-8287 . ПМК 5764940 . ПМИД 29326216 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Ян, Вэй; Вэй, Шужен; Ван, Цюн; Сяо, Силинь; Цзэн, Цинлу; Цзяо, Няньчжи; Чжан, Жуй (сентябрь 2018 г.). Эллиот, Мари А. (ред.). «Перестройка генома формирует экологическую адаптацию прохлорококка» . Прикладная и экологическая микробиология . 84 (17): e01178–18. Бибкод : 2018ApEnM..84E1178Y . дои : 10.1128/AEM.01178-18 . ISSN 0099-2240 . ПМК 6102989 . ПМИД 29915114 .
- ^ Дюфрен, Алексис; Саланубат, Марсель; Партенский, Фредерик; Артигенав, Франсуа; Аксманн, Илька М.; Барб, Валери; Дюпра, Симона; Гальперин, Михаил Юрьевич; Кунин Евгений Владимирович; Ле Галль, Флоренция; Макарова, Кира С. (19 августа 2003 г.). «Последовательность генома цианобактерии Prochromococcus marinus SS120, почти минимального оксифототрофного генома» . Труды Национальной академии наук . 100 (17): 10020–10025. Бибкод : 2003PNAS..10010020D . дои : 10.1073/pnas.1733211100 . ISSN 0027-8424 . ЧВК 187748 . ПМИД 12917486 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж г час я Кубильос-Руис, Андрес; Берта-Томпсон, Джесси В.; Беккер, Джейми В.; ван дер Донк, Уилфред А.; Чисхолм, Салли В. (3 июля 2017 г.). «Эволюционная радиация лантипептидов морских цианобактерий» . Труды Национальной академии наук . 114 (27): E5424–E5433. Бибкод : 2017PNAS..114E5424C . дои : 10.1073/pnas.1700990114 . ISSN 0027-8424 . ПМК 5502607 . ПМИД 28630351 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Л. Кэмпбелл, Х. А. Нолла и Д. Вало (1994). «Важность прохлорококка для структуры сообщества в центральной части северной части Тихого океана» . Лимнология и океанография . 39 (4): 954–961. Бибкод : 1994LimOc..39..954C . дои : 10.4319/lo.1994.39.4.0954 .
- Джагруп Пандал, Филип К. Райт и Кэтрин А. Биггс (2007). «Количественный протеомный анализ адаптации к свету глобально значимой морской цианобактерии Prochromococcus marinus MED4». Журнал исследований протеома . 6 (3): 996–1005. дои : 10.1021/pr060460c . ПМИД 17298086 .
- Стив Надис (2003). «Клетки, которые управляют морями: мельчайшие обитатели океана, — отмечает биологический исследователь Салли Чизхолм, — содержат ключ к пониманию биосферы — и того, что происходит, когда люди разрушают ее» . Научный Американ : 52f. Архивировано из оригинала 12 октября 2007 г. Проверено 28 сентября 2006 г.
- Мелисса Гаррен (2012). «Море, которое мы почти не видели» . TEDx Монтерей : 52f. Архивировано из оригинала 2 декабря 2013 г. Проверено 22 июня 2012 г.
Внешние ссылки [ править ]
- Доктор медицины Гири. « Прохлорококк С.В. Чисхолм, С.Л. Франкель, Р. Герике, Р. Дж. Олсон, Б. Паленик, Дж. Б. Уотербери, Л. Вест-Джонсруд и Э. Р. Зеттлер 1992: 299» . База водорослей .
- Самый важный микроб, о котором вы никогда не слышали : NPR история о прохлорококке
- Анацитовые лаборатории
- Информация о геноме Prochromococcus marinus : Национальный центр биотехнологической информации.