Jump to content

Оксоглутаратдегидрогеназный комплекс

оксоглутаратдегидрогеназа
Идентификаторы
Номер ЕС. 1.2.4.2
Номер CAS. 9031-02-1
Базы данных
ИнтЭнк вид IntEnz
БРЕНДА БРЕНДА запись
Экспаси Просмотр NiceZyme
КЕГГ КЕГГ запись
МетаЦик метаболический путь
ПРЯМОЙ профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология АмиГО / QuickGO
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins

Комплекс оксоглутаратдегидрогеназы ( OGDC ) или комплекс α-кетоглутаратдегидрогеназы представляет собой ферментный комплекс, наиболее известный своей ролью в цикле лимонной кислоты .

Подобно пируватдегидрогеназному комплексу (PDC), этот фермент образует комплекс, состоящий из трех компонентов:

Единица Номер ЕС Имя Ген Кофактор
И 1 ЭК 1.2.4.2 оксоглутаратдегидрогеназа ОГДХ тиаминпирофосфат (TPP)
EЕ2 ЭК 2.3.1.61 дигидролипоилсукцинилтрансфераза Экотуризм липоевая кислота , Коэнзим А
Е 3 ЭК 1.8.1.4 дигидролипоилдегидрогеназа междугородная связь ФАД , НАД
Механизм OGDH E1-TPP включает образование стабилизированного промежуточного карбаниона.

Охарактеризованы три класса этих мультиферментных комплексов: один специфичен для пирувата , второй специфичен для 2-оксоглутарата и третий специфичен для α-кетокислот с разветвленной цепью . Комплекс оксоглутаратдегидрогеназы имеет ту же структуру субъединиц и, следовательно, использует те же кофакторы, что и комплекс пируватдегидрогеназы и комплекс дегидрогеназы альфа-кетокислот с разветвленной цепью (ТТР, КоА, липоат, ФАД и НАД). Только субъединица E3 является общей для всех трех ферментов. [ 1 ]

Характеристики

[ редактировать ]

Метаболические пути

[ редактировать ]

Этот фермент участвует в трех различных путях:

Кинетические свойства

[ редактировать ]

Следующие значения взяты из Azotobacter vinelandii.  (1) :

  • КМ мм : 0,14 ± 0,04
  • V макс : 9 ± 3 мкмоль.мин −1 .мг −1

Цикл лимонной кислоты

[ редактировать ]

Реакция, катализируемая этим ферментом цикла лимонной кислоты:

α-кетоглутарат + НАД + + КоА Сукцинил-КоА + CO 2 + НАДН
Оксоглутаратдегидрогеназа (α-кетоглутаратдегидрогеназа)

Эта реакция протекает в три стадии:

ΔG°' для этой реакции составляет -7,2 ккал моль. −1 . Энергия, необходимая для этого окисления, сохраняется при образовании тиоэфирной связи сукцинил-КоА .

Регулирование

[ редактировать ]

Оксоглутаратдегидрогеназа является ключевой контрольной точкой в ​​цикле лимонной кислоты. Он ингибируется его продуктами, сукцинил-КоА и НАДН . Высокий энергетический заряд в клетке также будет тормозить. АДФ и ионы кальция являются аллостерическими активаторами фермента.

Контролируя количество доступных восстанавливающих эквивалентов, генерируемых циклом Кребса , оксоглутаратдегидрогеназа оказывает последующее регулирующее влияние на окислительное фосфорилирование и выработку АТФ . [ 2 ] Восстанавливающие эквиваленты (такие как НАД+/НАДН) доставляют электроны, которые проходят через электрон-транспортную цепь окислительного фосфорилирования. Повышенные уровни активации оксоглутаратдегидрогеназы способствуют увеличению концентрации НАДН по сравнению с НАД+. Высокие концентрации НАДН стимулируют увеличение потока за счет окислительного фосфорилирования.

Хотя увеличение потока по этому пути генерирует АТФ для клетки, этот путь также генерирует виды свободных радикалов в качестве побочного продукта, которые могут вызвать окислительный стресс в клетках, если их оставить накапливаться.

Оксоглутаратдегидрогеназа считается окислительно-восстановительным сенсором в митохондриях и обладает способностью изменять уровень функционирования митохондрий, помогая предотвратить окислительное повреждение. [ 3 ] В присутствии высокой концентрации свободных радикалов оксоглутаратдегидрогеназа подвергается полностью обратимому ингибированию, опосредованному свободными радикалами. [ 4 ] В крайних случаях фермент также может подвергнуться полному окислительному ингибированию. [ 4 ]

Когда митохондрии обрабатываются избытком перекиси водорода , поток через цепь переноса электронов уменьшается и производство НАДН прекращается. [ 4 ] [ 5 ] После потребления и удаления источника свободных радикалов нормальная функция митохондрий восстанавливается.

Считается, что временное ингибирование функции митохондрий происходит в результате обратимого глутатионилирования домена Е2-липоевой кислоты оксоглутаратдегидрогеназы. [ 5 ] Глутатионилирование, форма посттрансляционной модификации , происходит во время повышенной концентрации свободных радикалов и может быть отменено после потребления перекиси водорода с помощью глутаредоксина . [ 4 ] Глутатионилирование «защищает» липоевую кислоту домена Е2 от окислительного повреждения, что помогает уберечь комплекс оксоглутаратдегидрогеназы от окислительного стресса.

Активность оксоглутаратдегидрогеназы отключается в присутствии свободных радикалов, чтобы защитить фермент от повреждения. Как только свободные радикалы поглощаются клеткой, активность фермента снова включается с помощью глутаредоксина. Снижение активности фермента во время окислительного стресса также способствует замедлению потока через цепь переноса электронов, что замедляет выработку свободных радикалов.

Помимо свободных радикалов и окислительно-восстановительного состояния митохондрий, активность оксоглутаратдегидрогеназы также регулируется соотношением АТФ/АДФ, соотношением сукцинил-КоА и КоА-SH, а также концентрацией различных кофакторов ионов металлов (Mg2+, Ca2+). [ 6 ] Многие из этих аллостерических регуляторов действуют в домене E1 ферментного комплекса, но все три домена ферментного комплекса можно контролировать аллостерически. [ 7 ] Активность ферментного комплекса усиливается за счет высоких уровней АДФ и Pi, Ca2+ и CoA-SH. Фермент ингибируется высокими уровнями АТФ, высокими уровнями НАДН и высокими концентрациями сукцинил-КоА. [ 7 ]

Стрессовая реакция

[ редактировать ]

Оксоглутаратдегидрогеназа играет роль в клеточном ответе на стресс. Ферментный комплекс подвергается временному ингибированию, опосредованному стрессом, при остром воздействии стресса. Период временного торможения вызывает более сильную реакцию повышения регуляции, позволяя повышенному уровню активности оксоглутаратдегидрогеназы компенсировать острое воздействие стресса. [ 8 ] Острые воздействия стресса обычно находятся на более низких, переносимых клетками уровнях.

Патофизиология может возникнуть, когда стресс становится кумулятивным или перерастает в хронический стресс. Реакция повышения регуляции, возникающая после острого воздействия, может истощиться, если ингибирование ферментного комплекса становится слишком сильным. [ 8 ] Стресс в клетках может вызвать нарушение регуляции биосинтеза нейромедиатора глутамата . Токсичность глутамата в мозге вызвана накоплением глутамата во время стресса. Если активность оксоглутаратдегидрогеназы нарушена (отсутствует адаптивная компенсация стресса), накопление глутамата невозможно исправить, и могут возникнуть патологии головного мозга. Дисфункциональная оксоглутаратдегидрогеназа может также предрасполагать клетку к повреждению другими токсинами, которые могут вызвать нейродегенерацию . [ 9 ]

Патология

[ редактировать ]

2-Оксоглутаратдегидрогеназа — аутоантиген, обнаруживаемый при первичном билиарном циррозе печени , форме острой печеночной недостаточности. Эти антитела , по-видимому, распознают окисленный белок , возникший в результате воспалительных иммунных реакций. Некоторые из этих воспалительных реакций объясняются чувствительностью к глютену . [ 10 ] Другие митохондриальные аутоантигены включают пируватдегидрогеназу и комплекс дегидрогеназы альфа-кетокислот с разветвленной цепью , которые представляют собой антигены, распознаваемые антимитохондриальными антителами .

Активность 2-оксоглутаратдегидрогеназного комплекса снижается при многих нейродегенеративных заболеваниях. Болезнь Альцгеймера , болезнь Паркинсона , болезнь Хантингтона и надъядерный паралич связаны с повышенным уровнем окислительного стресса в мозге. [ 11 ] В частности, у пациентов с болезнью Альцгеймера активность оксоглутаратдегидрогеназы значительно снижается. [ 12 ] Это приводит к возможности того, что часть цикла ТСА, ответственная за накопление свободных радикалов в мозгу пациентов, представляет собой неисправный комплекс оксоглутаратдегидрогеназы. Механизм ингибирования этого ферментного комплекса, связанного с заболеванием, остается относительно неизвестным.

При метаболическом заболевании, сочетающем малоновую и метилмалоновую ацидурию (CMAMMA), вследствие дефицита ACSF3 нарушается митохондриальный синтез жирных кислот (mtFASII), который является реакцией-предшественником биосинтеза липоевой кислоты . [ 13 ] [ 14 ] Результатом является снижение степени липоилирования важных митохондриальных ферментов, таких как комплекс оксоглутаратдегидрогеназы (OGDC). [ 14 ]

  1. ^ Маккартни Р.Г., Райс Дж.Э., Сандерсон С.Дж., Буник В., Линдси Х., Линдси Дж.Г. (сентябрь 1998 г.). «Взаимодействия субъединиц в комплексе альфа-кетоглутаратдегидрогеназы млекопитающих. Доказательства прямой ассоциации компонентов альфа-кетоглутаратдегидрогеназы и дигидролипоамиддегидрогеназы» . Журнал биологической химии . 273 (37): 24158–64. дои : 10.1074/jbc.273.37.24158 . ПМИД   9727038 .
  2. ^ Треттер Л., Адам-Визи В. (декабрь 2005 г.). «Альфа-кетоглутаратдегидрогеназа: мишень и генератор окислительного стресса» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 360 (1464): 2335–45. дои : 10.1098/rstb.2005.1764 . ПМК   1569585 . ПМИД   16321804 .
  3. ^ Маклейн А.Л., Шведа П.А., Шведа Л.И. (январь 2011 г.). «А-кетоглутаратдегидрогеназа: митохондриальный окислительно-восстановительный сенсор» . Свободные радикальные исследования . 45 (1): 29–36. дои : 10.3109/10715762.2010.534163 . ПМК   3169906 . ПМИД   21110783 .
  4. ^ Jump up to: а б с д Маклейн А.Л., Кормье П.Дж., Кинтер М., Шведа Л.И. (август 2013 г.). «Глутатионилирование α-кетоглутаратдегидрогеназы: химическая природа и относительная восприимчивость кофактора липоевой кислоты к модификации» . Свободно-радикальная биология и медицина . 61 : 161–9. doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2013.03.020 . ПМЦ   3883985 . ПМИД   23567190 .
  5. ^ Jump up to: а б Эпплгейт М.А., Хамфрис К.М., Шведа Л.И. (январь 2008 г.). «Обратимое ингибирование альфа-кетоглутаратдегидрогеназы перекисью водорода: глутатионилирование и защита липоевой кислоты». Биохимия . 47 (1): 473–8. дои : 10.1021/bi7017464 . ПМИД   18081316 .
  6. ^ Ци Ф, Прадхан Р.К., Даш Р.К., Бирд Д.А. (сентябрь 2011 г.). «Подробная кинетика и регуляция 2-оксоглутаратдегидрогеназы млекопитающих» . БМК Биохимия . 12 (1): 53. дои : 10.1186/1471-2091-12-53 . ПМК   3195097 . ПМИД   21943256 .
  7. ^ Jump up to: а б Струмило С (2005). «Часто игнорируемые факты о контроле комплекса 2-оксоглутаратдегидрогеназы». Образование в области биохимии и молекулярной биологии . 33 (4): 284–287. дои : 10.1002/bmb.2005.49403304284 . S2CID   86257831 .
  8. ^ Jump up to: а б Граф А, Трофимова Л, Лошинская А, Мкртчян Г, Строкина А, Ловать М и др. (январь 2013 г.). «Повышение регуляции 2-оксоглутаратдегидрогеназы как реакция на стресс». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 45 (1): 175–89. doi : 10.1016/j.biocel.2012.07.002 . ПМИД   22814169 .
  9. ^ Гибсон Г.Е., Бласс Дж.П., Бил М.Ф., Буник В. (2005). «Комплекс альфа-кетоглутарат-дегидрогеназы: медиатор между митохондриями и окислительным стрессом при нейродегенерации». Молекулярная нейробиология . 31 (1–3): 43–63. дои : 10.1385/мин:31:1-3:043 . ПМИД   15953811 . S2CID   10787919 .
  10. ^ Люнг П.С., Россаро Л., Дэвис П.А., Пак О., Танака А., Кикучи К. и др. (ноябрь 2007 г.). «Антимитохондриальные антитела при острой печеночной недостаточности: последствия первичного билиарного цирроза» . Гепатология . 46 (5): 1436–42. дои : 10.1002/hep.21828 . ПМЦ   3731127 . ПМИД   17657817 .
  11. ^ Ши Q, Сюй Х, Ю Х, Чжан Н, Йе Ю, Эстевес А.Г. и др. (май 2011 г.). «Инактивация и реактивация митохондриального комплекса α-кетоглутаратдегидрогеназы» . Журнал биологической химии . 286 (20): 17640–8. дои : 10.1074/jbc.M110.203018 . ПМЦ   3093839 . ПМИД   21454586 .
  12. ^ Сорби С., Берд Э.Д., Бласс Дж.П. (январь 1983 г.). «Снижение активности комплекса пируватдегидрогеназы в мозге Хантингтона и болезни Альцгеймера». Анналы неврологии . 13 (1): 72–8. дои : 10.1002/ана.410130116 . ПМИД   6219611 . S2CID   29106528 .
  13. ^ Левтова, Алина; Уотерс, Паула Дж.; Бухас, Даниэла; Левеск, Себастьен; Оре-Бле, Кристиана ; Кларк, Джо Т.Р.; Лафрамбуаз, Рэйчел; Маранда, Бруно; Митчелл, Грант А.; Брюнель-Гиттон, Кэтрин; Браверман, Нэнси Э. (2019). «Комбинированная малоновая и метилмалоновая ацидурия вследствие мутаций ACSF3: доброкачественное клиническое течение в невыбранной группе» . Журнал наследственных метаболических заболеваний . 42 (1): 107–116. дои : 10.1002/jimd.12032 . ISSN   0141-8955 .
  14. ^ Jump up to: а б Вебе, Зейнаб; Берингер, Сидни; Алатиби, Халед; Уоткинс, Дэвид; Розенблатт, Дэвид; Шпикеркоттер, Юте; Туччи, Сара (2019). «Новая роль митохондриальной синтазы жирных кислот (mtFASII) в регуляции энергетического обмена» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1864 (11): 1629–1643. дои : 10.1016/j.bbalip.2019.07.012 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 785b49b35211b56e8b9c13811daeda15__1719496080
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/78/15/785b49b35211b56e8b9c13811daeda15.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Oxoglutarate dehydrogenase complex - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)