N-концевой домен оранжевого каротиноида
| Карот_N | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура оранжевого белка-каротиноида | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Карот_N | ||
| Пфам | PF09150 | ||
| ИнтерПро | ИПР015233 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1м98 / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / СУПФАМ | ||
| |||
В молекулярной биологии N-концевой домен оранжевого каротиноида представляет собой белковый домен, обнаруживаемый преимущественно на N-конце оранжевого каротиноидного белка (OCP), и участвует в нековалентном связывании каротиноидного хромофора . Он уникален тем, что присутствует в растворимых белках, тогда как подавляющее большинство доменов, способных связывать каротиноиды, являются внутренними мембранными белками. До сих пор он обнаружен исключительно у цианобактерий , среди которых широко распространен. [ 1 ] Домен также существует сам по себе в неохарактеризованных белках цианобактерий, называемых «красным каротиноидным белком» (RCP). Домен имеет альфа-спиральную структуру, состоящую из двух четырехспиральных пучков. [ 2 ]
Оранжевые каротиноид-связывающие белки (OCP) были впервые идентифицированы у цианобактерий , где они встречаются в связи с фикобилисомами в клеточной тилакоидной мембране . Эти белки выполняют функцию фотозащиты и необходимы для нефотохимического тушения (NPQ). [ 3 ] [ 4 ] В полноразмерном OCP активность NPQ регулируется фотоактивацией сильным сине-зеленым светом. OCP, по-видимому, действует как гомодимер и связывает одну молекулу ( 3'-гидроксиэхиненона кетокаротиноида ) и один хлорида ион на субъединицу. каротиноидов Место связывания покрыто поразительным количеством метионина остатков . N-концевой домен OCP обычно сопровождается C-концевым доменом, который принадлежит к суперсемейству NTF2 и помогает связывать каротиноид. OCP может быть протеолитически расщеплен до красной формы (RCP), в которой отсутствуют 15 остатков на N-конце и примерно 150 остатков на C-конце. [ 5 ] Этот домен участвует в связывании комплекса фикобилисом, что тем самым способствует тепловой диссипации (тушению) избыточной поглощенной световой энергии. [ 6 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кириловский Д., Керфельд, Калифорния (июль 2013 г.). «Оранжевый каротиноидный белок: фотоактивный белок сине-зеленого света» . Фотохимические и фотобиологические науки . 12 (7): 1135–43. дои : 10.1039/c3pp25406b . ПМИД 23396391 .
- ^ Керфельд К.А., Савая М.Р., Брахмандам В., Касио Д., Хо К.К., Тревитик-Саттон К.С., Крогманн Д.В., Йейтс Т.О. (январь 2003 г.). «Кристаллическая структура водорастворимого каротиноидсвязывающего белка цианобактерий» . Структура . 11 (1): 55–65. дои : 10.1016/S0969-2126(02)00936-X . ПМИД 12517340 .
- ^ Уилсон А., Айлани Г., Вербавац Дж. М., Васс И., Керфельд К. А., Кириловский Д. (апрель 2006 г.). «Растворимый каротиноидный белок, участвующий в рассеянии энергии, связанном с фикобилисомами, у цианобактерий» . Растительная клетка . 18 (4): 992–1007. дои : 10.1105/tpc.105.040121 . ПМЦ 1425857 . ПМИД 16531492 .
- ^ Уилсон А., Буле С., Уайльд А., Керфельд К.А., Кириловский Д. (февраль 2007 г.). «Светоиндуцированная диссипация энергии у цианобактерий, испытывающих недостаток железа: роль белков OCP и IsiA» . Растительная клетка . 19 (2): 656–72. дои : 10.1105/tpc.106.045351 . ПМЦ 1867334 . ПМИД 17307930 .
- ^ Керфельд, Калифорния (2004). «Структура и функции водорастворимых каротиноидсвязывающих белков цианобактерий». Исследования фотосинтеза . 81 (3): 215–25. дои : 10.1023/B:PRES.0000036886.60187.c8 . ПМИД 16034528 . S2CID 28232976 .
- ^ Уилсон А., Гвиздала М., Меццетти А., Александр М., Керфельд К.А., Кириловский Д. (май 2012 г.). «Существенная роль N-концевого домена оранжевого каротиноидного белка в фотозащите цианобактерий: важность положительного заряда для связывания фикобилисом» . Растительная клетка . 24 (5): 1972–83. дои : 10.1105/tpc.112.096909 . ПМЦ 3442581 . ПМИД 22634762 .