Оксалобактер формигенс
 | Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( март 2010 г. ) |
| Оксалобактер формигенс | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Псевдомонадота |
| Сорт: | Бетапротеобактерии |
| Заказ: | Буркхолдериалес |
| Семья: | оксалобактерии |
| Род: | Оксалобактер |
| Разновидность: | О. formigenes
|
| Биномиальное имя | |
| Оксалобактер формигенс Эллисон и др. , 1985 г. [ 1 ]
| |
| Тип штамма | |
| Оксалобактер формигенес ОхВ Т | |
Oxalobacter formigenes — грамотрицательная оксалат разлагающая анаэробная бактерия, , которая была впервые выделена из желудочно-кишечного тракта овцы в 1985 году. [ 1 ] На сегодняшний день обнаружено, что бактерия колонизирует толстый кишечник многих позвоночных , включая человека, и даже была выделена из пресноводных отложений. [ 2 ] Он перерабатывает оксалат путем декарбоксилирования в формиат ( оксалил-КоА-декарбоксилазу ), производя при этом энергию для себя. [ 3 ]
широкого спектра действия Хинолоновые антибиотики убивают O. formigenes . [ нужна ссылка ] человека Если в желудочно-кишечном тракте отсутствует эта бактерия и, следовательно, отсутствует основной источник фермента оксалил-КоА-декарбоксилазы , то желудочно-кишечный тракт не может расщеплять пищевые оксалаты; после некоторой частичной метаболической деградации, модулированной витамином B6 , в организме оксалаты выводятся в почках, где они осаждаются с образованием камней в почках из оксалата кальция . [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Oxalobacter formigenes может защитить от камней в почках, разлагая оксалат. [ 7 ]
Роль и присутствие O. formigenes в кишечнике человека являются областью активных исследований.
Геном
[ редактировать ]| Размер генома | 2,41-2,47 Мб [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] |
|---|
Геном O. formigenes был секвенирован как минимум тремя разными исследователями. Содержание G+C составляет 49,6%. [ 9 ] [ 11 ]
Таксономия
[ редактировать ]На основании профиля жирных кислот , секвенирования 16S рибосомальной РНК и ДНК-зондов, специфичных к гену oxc ( оксалил-КоА-декарбоксилазы ) и frc ( формил-КоА-трансферазе ), O. formigenes были разделены на две группы. [ 1 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] Группа 1 имеет меньшее разнообразие и лучший рост по сравнению с группой 2. На сегодняшний день большинство исследований сосредоточено на штаммах группы 1 из-за их легкости роста.
Интересно, что анализ с помощью ДНК-зондов показал, что группу 2 можно разделить еще на две подгруппы. [ 13 ] Полногеномное секвенирование показало, что исходный таксон O. formigenes можно разделить на три дополнительных вида: Oxalobacter aliiformigenes , Oxalobacter paeniformigenes и Oxalobacter paraformigenes . [ 11 ]
Метаболизм
[ редактировать ]O. formigenes использует оксалат в качестве основного источника углерода. [ 1 ] Оксалат абсорбируется через антипортер оксалат:формиат ( OxlT ) в соотношении 1:1. [ 15 ] Импортированный оксалат затем преобразуется в оксалил-КоА с помощью формил-КоА-трансферазы ( frc ). Оксалил-КоА декарбоксилируется с помощью H + посредством оксалил-КоА-декарбоксилазы ( oxc ), высвобождая CO 2 и генерируя формил-КоА, который используется для реакции frc . Всего примерно 1 моль формиата и CO 2 . на моль израсходованного оксалата образуется [ 16 ] 3H + импортируются через АТФазу для обеспечения H + для реакции декарбоксилирования. [ 17 ]
Генерация клеточной биомассы
[ редактировать ]Биомасса O. formigenes в основном образуется за счет потребления оксалатов в результате метаболизма оксалил-КоА по глицератному пути . [ 18 ] [ 19 ] Ацетат и карбонат также используются для клеточной биомассы, но в меньшей степени, чем оксалат. [ 18 ]
Рост культуры
[ редактировать ]O. formigenes выделяли на оксалатсодержащих анаэробных средах. [ 1 ] В настоящее время O. formigenes выращивают в анаэробных пробирках Хангейта с использованием оксалатной среды с CO 2 -бикарбонатным буфером. [ 2 ] Оптимальный рост достигается при pH от 6 до 7. Оксалат используется в концентрации 20 мМ для восстановления в морозильной камере и общего обслуживания, но для увеличения плотности клеток концентрация может быть увеличена до 100 мМ. Хотя оксалат является основным источником углерода, небольшие количества ацетата и дрожжевого экстракта способствуют росту. [ 2 ] [ 16 ] O. formigenes может достичь стационарной фазы примерно через 24–48 часов, но иногда задерживается до 72 часов.
Обогащенные анаэробные комплексные среды (например, инфузия мозга и сердца ) не поддерживают рост O. formigenes, если не дополнены оксалатом. Следовательно, эти среды можно использовать для оценки чистоты культур O. formigenes .
Устойчивость и чувствительность к антибиотикам
[ редактировать ]Учитывая требовательный характер O. formigenes , традиционных методов определения чувствительности к антибиотикам недостаточно. Вместо этого бактерии культивируют в присутствии антибиотиков и проверяют на жизнеспособность с использованием непрозрачного анаэробного оксалатного агара. [ 2 ] [ 20 ] [ 21 ] Этот метод показал, что O. formigenes устойчив к налидиксовой кислоте, ампициллину, амоксициллину, стрептомицину и ванкомицину. [ 20 ] [ 21 ] Также было обнаружено, что O. formigenes чувствителен к ципрофлоксацину, кларитромицину, клиндамицину, доксициклину, гентамицину, левофлоксацину, метронидазолу и тетрациклину. [ 20 ] [ 21 ]
Распространенность в кишечнике млекопитающих
[ редактировать ]O. formigenes обнаруживается в желудочно-кишечном тракте млекопитающих и часто выделяется из фекалий. Помимо культуральных методов, присутствие O. formigenes выявляют с помощью молекулярных методов, таких как qPCR и секвенирование следующего поколения.
Люди
[ редактировать ]Люди обычно не рождаются с O. formigenes и становятся колониями только тогда, когда начинают ползать по окружающей среде. [ 22 ] Во взрослом возрасте частота O. formigenes в микробиоте кишечника варьируется в разных популяциях. В Северной Индии O. formigenes распространен примерно у 65% населения. [ 23 ] В Южной Корее и Японии O. formigenes присутствует примерно у 75% людей. [ 24 ] [ 25 ] В Соединенных Штатах Америки O. formigenes обнаруживается только примерно у 30% населения. [ 26 ] [ 27 ] Популяции, которые не практикуют современную медицину и не ведут западный образ жизни, обычно имеют повышенную распространенность O. formigenes , что может означать, что эта практика влияет на O. formigenes . колонизацию [ 28 ] [ 29 ]
Жвачные животные
[ редактировать ]Идея о том, что жвачные животные колонизированы бактериями, разлагающими оксалат, возникла из наблюдения, что овцы, пасущиеся на богатых оксалатами растениях (например, Halogeton glomeratus ), потребляли большое количество этого растения и умирали от почечной интоксикации оксалатами. [ 2 ] Однако, медленно приучая овец к потреблению большого количества оксалатов, они смогут пережить потребление большого количества растений, богатых оксалатами. [ 30 ] Это привело к предположению, что резидентные бактерии, разлагающие оксалат, обогащаются за счет постепенного введения рациона, богатого оксалатами, что защищает овец от повреждения почек, вызванного оксалатами. [ 31 ] [ 32 ] В 1980 году из рубца овец были выделены первые бактерии, разлагающие оксалат, и позже они были названы Oxalobacter formigenes . [ 1 ] [ 16 ]
Потенциальная роль в развитии мочекаменной болезни
[ редактировать ]O. formigenes исследовали на предмет его роли в смягчении заболеваний мочекаменной болезнью из оксалата кальция, поскольку он метаболизирует оксалат в качестве основного источника углерода.
Разложение оксалатов
[ редактировать ]in vitro Эксперименты показали, что O. formigenes является специализированной бактерией, потребляющей оксалат, которая может разлагать оксалат более эффективно, чем другие бактерии общего профиля, потребляющие оксалат. [ 33 ] Первоначальные исследования указали на потерю бактерий, разлагающих оксалат, таких как O. formigenes , после использования антибиотиков в качестве основного фактора, способствующего развитию мочекаменной болезни из оксалата кальция. [ 34 ] [ 35 ] колонизация O. formigenes приводит к снижению содержания оксалатов в моче. Было замечено, что [ 35 ] [ 4 ] и снижение частоты образования камней в почках [ 4 ] [ 7 ] [ 36 ]
В небольшом исследовании пероральный прием O. formigenes HC-1 вместе с ударной дозой оксалатов привел к снижению выведения оксалатов в течение 6 часов сразу после приема. [ 20 ] Однако клинические испытания не смогли выявить O. formigenes и снизить концентрацию оксалатов в моче и плазме. [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ]
Недавняя работа с использованием секвенирования следующего поколения показала, что O. formigenes колонизирует как камни в почках, образующие камни из оксалата кальция, так и контрольные группы, не образующие камни. [ 40 ] [ 41 ] Это наблюдение привело к предположению, что сам по себе O. formigenes не может нести ответственность за регуляцию деградации оксалатов в микробиоте кишечника, но вместо этого он может быть частью сети одновременно встречающихся бактериальных таксонов, которые вместе модулируют деградацию оксалатов. [ 42 ] [ 43 ] [ 44 ]
Секретагоги, способствующие сбросу оксалатов в кишечнике
[ редактировать ]Было высказано предположение, что O. formigenes продуцирует средства, стимулирующие секрецию , которые могут стимулировать транспорт оксалатов в эпителиальных клетках. Хотя секреция эпителиальных оксалатов была продемонстрирована на клеточных линиях человека и моделях грызунов, [ 45 ] [ 46 ] это не было подтверждено у людей. Биоактивные молекулы-кандидаты были идентифицированы и протестированы на животных моделях. [ 45 ] [ 47 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж Эллисон М.Дж., Доусон К.А., Мэйберри В.Р., Фосс Дж.Г. (февраль 1985 г.). «Oxalobacter formigenes gen. nov., sp. nov.: анаэробы, разлагающие оксалат, обитающие в желудочно-кишечном тракте». Архив микробиологии . 141 (1): 1–7. Бибкод : 1985ArMic.141....1A . дои : 10.1007/BF00446731 . ПМИД 3994481 . S2CID 10709172 .
- ^ Jump up to: а б с д и Дэниел С.Л., Моради Л., Пейст Х., Вуд К.Д., Ассимос Д.Г., Холмс Р.П. и др. (август 2021 г.). Петтинари Дж.М. (ред.). «Сорок лет Oxalobacter formigenes, бесстрашный специалист по разложению оксалатов» . Прикладная и экологическая микробиология . 87 (18): e0054421. Бибкод : 2021ApEnM..87E.544D . дои : 10.1128/АЕМ.00544-21 . ПМЦ 8388816 . ПМИД 34190610 .
- ^ Унден Дж. (2013). «Преобразование энергии в анаэробных бактериях». Энциклопедия биологической химии . стр. 204–209. дои : 10.1016/B978-0-12-378630-2.00282-6 . ISBN 978-0-12-378631-9 .
- ^ Jump up to: а б с Троксель С.А., Сидху Х., Каул П., Лоу Р.К. (апрель 2003 г.). «Кишечная колонизация Oxalobacter formigenes у лиц, образующих камни из оксалата кальция, и ее связь с оксалатом мочи». Журнал эндоурологии . 17 (3): 173–176. дои : 10.1089/089277903321618743 . ПМИД 12803990 .
- ^ Тунугунтла HS (2001). «Можно ли предотвратить рецидив оксалатных камней? Роль Oxalobacter formigenes в рецидиве камней». Журнал урологии . 165 : S246.
- ^ Перл М.С., Гольдфарб Д.С., Ассимос Д.Г., Курхан Г., Дену-Чокка С.Дж., Матлага Б.Р. и др. (август 2014 г.). «Медикаментозное лечение камней в почках: рекомендации AUA». Журнал урологии . 192 (2): 316–324. дои : 10.1016/j.juro.2014.05.006 . ПМИД 24857648 . S2CID 206623478 .
- ^ Jump up to: а б с Зинер Р., Банген У., Сидху Х., Хёнов Р., фон Унру Г., Гессен А. (июнь 2013 г.). «Роль колонизации Oxalobacter formigenes при оксалатно-кальциевой каменной болезни» . Почки Интернешнл . 83 (6): 1144–1149. дои : 10.1038/ki.2013.104 . ПМИД 23536130 .
- ^ Сунь Нью-Йорк, Гао Ю, Юй Х.Дж. (октябрь 2019 г.). Стюарт Ф.Дж. (ред.). «Геномная последовательность штамма Oxalobacter formigenes SSYG-15» . Объявления о ресурсах по микробиологии . 8 (42): e01059–19. дои : 10.1128/MRA.01059-19 . ПМК 6797538 . ПМИД 31624173 .
- ^ Jump up to: а б Хэтч М., Эллисон М.Дж., Ю Ф., Фармери В. (июль 2017 г.). «Геномная последовательность штамма Oxalobacter formigenes OXCC13» . Геномные объявления . 5 (28): e00534–17. doi : 10.1128/genomeA.00534-17 . ПМК 5511905 . ПМИД 28705966 .
- ^ Хэтч М., Эллисон М.Дж., Ю Ф., Фармери В. (июль 2017 г.). «Геномная последовательность штамма Oxalobacter formigenes HC-1» . Геномные объявления . 5 (27): e00533–17. doi : 10.1128/genomeA.00533-17 . ПМК 5502849 . ПМИД 28684568 .
- ^ Jump up to: а б Чмиэль Дж.А., Карр С., Стювенберг Г.А., Венема Р., Чаньи Р.М., Эл К.Ф. и др. (21 декабря 2022 г.). «Новые взгляды на старую группу: геномная и фенотипическая изменчивость Oxalobacter formigenes и значение для профилактики образования камней из оксалата кальция» . Границы микробиологии . 13 : 1011102. дои : 10.3389/fmicb.2022.1011102 . ПМЦ 9812493 . ПМИД 36620050 .
- ^ Дженсен Н.С., Эллисон М.Дж. (1994). Исследования разнообразия анаэробных бактерий, разлагающих оксалат, в настоящее время в виде Oxalobacter formigenes , автореф. И-12 . 94-е общее собрание Американского общества микробиологии, 1994 г. Вашингтон, округ Колумбия, США: Американское общество микробиологии. п. 255.
- ^ Jump up to: а б Сидху Х., Эллисон М., Пек А.Б. (февраль 1997 г.). «Идентификация и классификация штаммов Oxalobacter formigenes с использованием олигонуклеотидных зондов и праймеров» . Журнал клинической микробиологии . 35 (2): 350–353. doi : 10.1128/jcm.35.2.350-353.1997 . ПМК 229578 . ПМИД 9003594 .
- ^ Гаррити ГМ, Белл Дж.А., Лилберн Т. (2005). «Класс II. Класс бетапротеобактерий. Ноябрь». В Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT (ред.). Руководство Берджи® по систематической бактериологии . Бостон, Массачусетс: Springer US. стр. 575–922. дои : 10.1007/978-0-387-29298-4_2 . ISBN 978-0-387-24145-6 . Проверено 10 ноября 2022 г.
- ^ Анантарам, В; Эллисон, MJ; Мэлони, ПК (1989). «Оксалат:формиатный обмен» . Журнал биологической химии . 264 (13): 7244–7250. дои : 10.1016/S0021-9258(18)83227-6 .
- ^ Jump up to: а б с Доусон К.А., Эллисон М.Дж., Хартман П.А. (октябрь 1980 г.). «Выделение и некоторые характеристики анаэробных бактерий, разлагающих оксалат, из рубца» . Прикладная и экологическая микробиология . 40 (4): 833–839. Бибкод : 1980ApEnM..40..833D . дои : 10.1128/aem.40.4.833-839.1980 . ПМК 291667 . ПМИД 7425628 .
- ^ Кунер, CH; Хартман, Пенсильвания; Эллисон, MJ (1996). «Генерация протонной движущей силы анаэробной бактерией Oxalobacter formigenes, разлагающей оксалат» . Прикладная и экологическая микробиология . 62 (7): 2494–2500. Бибкод : 1996ApEnM..62.2494K . doi : 10.1128/aem.62.7.2494-2500.1996 . ISSN 0099-2240 . ПМК 168031 . ПМИД 8779588 .
- ^ Jump up to: а б Корник, Северная Каролина; Эллисон, MJ (1996). «Ассимиляция оксалата, ацетата и CO 2 Oxalobacter formigenes» . Канадский журнал микробиологии . 42 (11): 1081–1086. дои : 10.1139/m96-138 . ISSN 0008-4166 . ПМИД 8941983 .
- ^ Корник, Северная Каролина; Эллисон, MJ (1996). «Анаболическое включение оксалата Oxalobacter formigenes» . Прикладная и экологическая микробиология . 62 (8): 3011–3013. Бибкод : 1996ApEnM..62.3011C . doi : 10.1128/aem.62.8.3011-3013.1996 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 1388924 . ПМИД 16535386 .
- ^ Jump up to: а б с д Дункан С.Х., Ричардсон А.Дж., Каул П., Холмс Р.П., Эллисон М.Дж., Стюарт К.С. (август 2002 г.). «Oxalobacter formigenes и его потенциальная роль в здоровье человека» . Прикладная и экологическая микробиология . 68 (8): 3841–3847. Бибкод : 2002ApEnM..68.3841D . дои : 10.1128/АЕМ.68.8.3841-3847.2002 . ПМК 124017 . ПМИД 12147479 .
- ^ Jump up to: а б с Ланге Дж.Н., Вуд К.Д., Вонг Х., Отто Р., Муфарридж П.В., Найт Дж. и др. (июнь 2012 г.). «Чувствительность человеческих штаммов Oxalobacter formigenes к обычно назначаемым антибиотикам» . Урология . 79 (6): 1286–1289. дои : 10.1016/j.urology.2011.11.017 . ПМК 3569510 . ПМИД 22656407 .
- ^ Сидху Х., Енатска Л., Огден С., Уильямс В.Н., Эллисон М.Дж., Пек А.Б. (июнь 1997 г.). «Оценка детей в Украине на предмет колонизации кишечной бактерией Oxalobacter formigenes с использованием системы обнаружения на основе полимеразной цепной реакции». Молекулярная диагностика . 2 (2): 89–97. дои : 10.1016/S1084-8592(97)80015-X . ПМИД 10462596 .
- ^ Кумар Р., Мукерджи М., Бхандари М., Кумар А., Сидху Х., Миттал Р.Д. (март 2002 г.). «Роль Oxalobacter formigenes в оксалатно-кальциевой каменной болезни: исследование из Северной Индии». Европейская урология . 41 (3): 318–322. дои : 10.1016/S0302-2838(02)00040-4 . ПМИД 12180235 .
- ^ Квак С., Чон Б.С., Ким Х.К., Ким Э.К., Чокс М.С., Ким Х.Х. (май 2003 г.). «Молекулярная эпидемиология фекальных форм Oxalobacter у здоровых взрослых, живущих в Сеуле, Корея». Журнал эндоурологии . 17 (4): 239–243. дои : 10.1089/089277903765444384 . ПМИД 12816588 .
- ^ Кодама Т., Миками К., Акакура К., Такей К., Ная Ю., Уэда Т., Ито Х. (июль 2003 г.). «[Обнаружение Oxalobacter formigenes в фекалиях человека и изучение родственных генов в новой бактерии, разлагающей оксалат]». Хиньокика Кийо. Японский урологический акт . 49 (7): 371–376. ПМИД 12968475 .
- ^ Барнетт С., Наззал Л., Гольдфарб Д.С., Блазер М.Дж. (февраль 2016 г.). «Присутствие Oxalobacter formigenes в микробиоме здоровых молодых людей» . Журнал урологии . 195 (2): 499–506. дои : 10.1016/j.juro.2015.08.070 . ПМЦ 4747808 . ПМИД 26292041 .
- ^ Келли Дж.П., Курхан Г.К., Кейв Д.Р., Андерсон Т.Е., Кауфман Д.В. (апрель 2011 г.). «Факторы, связанные с колонизацией Oxalobacter formigenes у взрослых в США» . Журнал эндоурологии . 25 (4): 673–679. дои : 10.1089/конец.2010.0462 . ПМК 3071521 . ПМИД 21381959 .
- ^ ПеБенито А., Наззал Л., Ван С., Ли Х., Джей М., Ноя-Аларкон О. и др. (январь 2019 г.). «Сравнительная распространенность Oxalobacter formigenes в трех популяциях человека» . Научные отчеты . 9 (1): 574. Бибкод : 2019НацСР...9..574П . дои : 10.1038/s41598-018-36670-z . ПМК 6346043 . ПМИД 30679485 .
- ^ Клементе Дж.К., Перссон Э.К., Блазер М.Дж., Сандху К., Гао З., Ван Б. и др. (апрель 2015 г.). «Микробиом неконтактных индейцев» . Достижения науки . 1 (3). Бибкод : 2015SciA....1E0183C . дои : 10.1126/sciadv.1500183 . ПМЦ 4517851 . ПМИД 26229982 .
- ^ Джеймс Л.Ф., Кронин Э.Х. (ноябрь 1974 г.). «Методы управления по минимизации смертности овец, пасущихся на территории, зараженной Халогетоном» . Журнал управления ассортиментом . 27 (6): 424–426. дои : 10.2307/3896714 . HDL : 10150/647155 . JSTOR 3896714 .
- ^ Эллисон М.Дж., Литтлдайк Э.Т., Джеймс Л.Ф. (ноябрь 1977 г.). «Изменения в скорости деградации оксалатов в рубце, связанные с адаптацией к приему оксалатов». Журнал зоотехники . 45 (5): 1173–1179. дои : 10.2527/jas1977.4551173x . ПМИД 599103 .
- ^ Дэниел С.Л., Кук Х.М., Хартман П.А., Эллисон М.Дж. (август 1989 г.). «Подсчет анаэробных бактерий, разлагающих оксалат, в содержимом рубца овец» . Письма FEMS по микробиологии . 62 (5): 329–334. дои : 10.1111/j.1574-6968.1989.tb03387.x .
- ^ Федеричи Ф, Виталий Б, Готти Р, Паска М.Р., Гобби С., Пек А.Б., Бриджиди П. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика и гетерологичная экспрессия гена декарбоксилазы оксалил-коэнзима А из Bifidobacterium Lactis» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (9): 5066–5073. Бибкод : 2004ApEnM..70.5066F . дои : 10.1128/АЕМ.70.9.5066-5073.2004 . ПМК 520889 . ПМИД 15345383 .
- ^ Сидху Х., Хоппе Б., Гессен А., Тенброк К., Бремме С., Ритшель Э., Пек А.Б. (сентябрь 1998 г.). «Отсутствие Oxalobacter formigenes у больных муковисцидозом: фактор риска гипероксалурии». Ланцет . 352 (9133): 1026–1029. дои : 10.1016/S0140-6736(98)03038-4 . ПМИД 9759746 . S2CID 25936201 .
- ^ Jump up to: а б Миттал Р.Д., Кумар Р., Бид Х.К., Миттал Б. (январь 2005 г.). «Влияние антибиотиков на колонизацию Oxalobacter formigenes желудочно-кишечного тракта человека». Журнал эндоурологии . 19 (1): 102–106. дои : 10.1089/конец.2005.19.102 . ПМИД 15735393 .
- ^ Кауфман Д.В., Келли Дж.П., Курхан Г.К., Андерсон Т.Е., Дретлер С.П., Премингер Г.М., Кейв Д.Р. (июнь 2008 г.). «Oxalobacter formigenes может снизить риск образования камней в почках из оксалата кальция» . Журнал Американского общества нефрологов . 19 (6): 1197–1203. дои : 10.1681/ASN.2007101058 . ПМК 2396938 . ПМИД 18322162 .
- ^ Хоппе Б., Гроотофф Дж.В., Халтон С.А., Кочат П., Ниоде П., Кемпер М.Дж. и др. (ноябрь 2011 г.). «Эффективность и безопасность Oxalobacter formigenes для снижения содержания оксалатов в моче при первичной гипероксалурии» . Нефрология, Диализ, Трансплантация . 26 (11): 3609–3615. дои : 10.1093/ndt/gfr107 . ПМИД 21460356 .
- ^ Хоппе Б., Ниоде П., Саломон Р., Харамбат Дж., Халтон С.А., Вант Хофф В. и др. (май 2017 г.). «Рандомизированное исследование фазы I/II для оценки эффективности и безопасности перорального приема Oxalobacter formigenes для лечения первичной гипероксалурии». Детская нефрология . 32 (5): 781–790. дои : 10.1007/s00467-016-3553-8 . ПМИД 27924398 . S2CID 52271121 .
- ^ Миллинер Д., Хоппе Б., Гроотофф Дж. (август 2018 г.). «Рандомизированное исследование фазы II/III для оценки эффективности и безопасности перорального приема Oxalobacter formigenes для лечения первичной гипероксалурии» . Мочекаменная болезнь . 46 (4): 313–323. дои : 10.1007/s00240-017-0998-6 . ПМК 6061479 . ПМИД 28718073 .
- ^ Тан Р., Цзян Ю, Тан А, Е Дж, Сянь Х, Се Ю и др. (ноябрь 2018 г.). «Секвенирование гена 16S рРНК выявляет измененный состав микробиоты кишечника у людей с камнями в почках». Мочекаменная болезнь . 46 (6): 503–514. дои : 10.1007/s00240-018-1037-y . ПМИД 29353409 . S2CID 11340007 .
- ^ Тичинези А., Милани С., Герра А., Аллегри Ф., Лауретани Ф., Нувенн А. и др. (декабрь 2018 г.). «Понимание оси кишечник-почки при нефролитиазе: анализ состава микробиоты кишечника и функциональности камнеобразователей». Гут . 67 (12): 2097–2106. дои : 10.1136/gutjnl-2017-315734 . ПМИД 29705728 . S2CID 14055215 .
- ^ Тичинези А, Нувенн А, Мески Т (июль 2019 г.). «Кишечный микробиом и почечнокаменная болезнь: не только история оксалобактерий» . Почки Интернешнл . 96 (1): 25–27. дои : 10.1016/j.kint.2019.03.020 . ПМИД 31229040 . S2CID 195327195 .
- ^ Миллер А.В., Чой Д., Пеннистон К.Л., Ланге Д. (июль 2019 г.). «Подавление мочекаменной болезни с помощью многовидовой бактериальной сети обеспечивает здоровый гомеостаз оксалатов» . Почки Интернешнл . 96 (1): 180–188. дои : 10.1016/j.kint.2019.02.012 . ПМЦ 6826259 . ПМИД 31130222 .
- ^ Лю М., Ко Х., Курц З.Д., Батталья Т., ПеБенито А., Ли Х. и др. (август 2017 г.). «Особенности хозяина, связанные с Oxalobacter formigenes, и структуры микробного сообщества, исследованные с помощью Американского проекта кишечника» . Микробиом . 5 (1): 108. дои : 10.1186/s40168-017-0316-0 . ПМЦ 5571629 . ПМИД 28841836 .
- ^ Jump up to: а б Арванс Д., Юнг Ю.К., Антонопулос Д., Коваль Дж., Гранха И., Башир М. и др. (март 2017 г.). « Биоактивные факторы, полученные из Oxalobacter formigenes, стимулируют транспорт оксалатов эпителиальными клетками кишечника» . Журнал Американского общества нефрологов . 28 (3): 876–887. дои : 10.1681/ASN.2016020132 . ПМК 5328155 . ПМИД 27738124 .
- ^ Хэтч М., Корнелиус Дж., Эллисон М., Сидху Х., Пек А., Фрил Р.В. (февраль 2006 г.). «Oxalobacter sp. снижает экскрецию оксалатов с мочой, способствуя секреции оксалатов в кишечнике» . Почки Интернешнл . 69 (4): 691–698. дои : 10.1038/sj.ki.5000162 . ПМИД 16518326 .
- ^ Арванс Д., Чанг С., Альшейх А., Тесар С., Бабнигг Г., Вольфгехер Д. и др. (июль 2023 г.). «Sel1-подобные белки и пептиды являются основными факторами, производными Oxalobacter formigenes, стимулирующими транспорт оксалатов эпителиальными клетками кишечника человека» . Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 325 (1): C344–C361. doi : 10.1152/ajpcell.00466.2021 . ПМЦ 10393326 . ПМИД 37125773 .