Дептор

Дептор
Идентификаторы
Псевдонимы	Деэптор , Dep.6, Depdc6, DEP-домен, содержащий белок-взаимодействующий mTOR, домен DEP, содержащий взаимодействующий белок mTOR
Внешние идентификаторы	Омим : 612974 ; MGI : 2146322 ; Гомологен : 32551 ; GeneCards : Дептор ; OMA : Дептор - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	120,050,918 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	55,122,667 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	parotid gland; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; decidua; ; glutes; ; vastus lateralis muscle; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; triceps brachii muscle; ; hair follicle; ; gastrocnemius muscle; ; deltoid muscle;
	Top expressed in
	lacrimal gland; ; parotid gland; ; pyloric antrum; ; median eminence; ; triceps brachii muscle; ; brown adipose tissue; ; sternocleidomastoid muscle; ; tunica adventitia of aorta; ; vastus lateralis muscle; ; zygote;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	intracellular anatomical structure; cytoplasm;
Biological process	intracellular signal transduction; regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; negative regulation of cell size; negative regulation of protein kinase activity; negative regulation of TOR signaling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	64798
	97998
	ENSG00000155792
	Ensmusg00000022419
	Q8TB45
	Q570Y9
	NM_022783 ; NM_001283012
	NM_001037937 ; NM_145470
	NP_001269941 ; NP_073620
	NP_001033026 ; NP_663445
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

DEP-домен-содержащий белок MTOR-взаимодействие ( дептор ), также известный как DEP-домен, содержащий белок 6 ( DEPDC6 ), представляет собой белок , который у людей кодируется дептора геном . ^{[ 5 ]}

Структура

Ген -дептор можно найти только у позвоночных. У человека ген Депта находится в хромосоме 8, 8q24.12 с размером белка 409 AA ^{[ 6 ]} Человеческий дептор содержит два N-концевых DEP-домена и C-концевой домен PDZ . ^{[ 7 ]}

Функция

Дептор участвует в сигнальном пути mTOR в качестве эндогенного регулятора. Было показано прямое взаимодействие между дептором и mTOR. ^{[ 7 ]} Сверхэкспрессия дептора подавляет активность mTORC1 и mTORC2 in vitro . MTORC1 и MTORC2 могут оба ингибировать депептор посредством фосфорилирования . ^{[ 7 ]}

Метаболизм

Деэптор-клетки автономно регулирует адипогенез . ^{[ 8 ]} В мышцах BAF60C способствует переходу от окислительного на гликолитический тип миофибра через депток-опосредованную активацию AKT/PKB . ^{[ 9 ]} Внутри мозга депептор высоко экспрессируется в гиппокампе , медио-базале- гипоталамусе и органах округа . ^{[ 10 ]} Сверхэкспрессия дептора в медио-басальном гипоталамусе защищает мышей от ожирения с высоким содержанием жиров за счет модуляции передачи сигналов AKT/PKB . ^{[ 11 ]}

Клинический рак

Хотя при большинстве рака путь mTOR конститутивно активирован, а экспрессия дептора низкая, одно исследование показало, что депеттер сверхэкспрессируется в множественных клетках миеломы и необходим для их выживания. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000155792 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022419 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ "Entrez Gene: DEPDC6 DEP -домен, содержащий 6" .
^ «Homo Sapiens - Ensembl Protein Family - ген: Дептор (ENSG00000155792)» . Бруузер генома Ensembl 78 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Петерсон Т.Р., Лапланте М., Торен С.К., Санкак Ю., Кан С.А., Куэль В.М., Грей Н.С., Сабатини Д.М. (май 2009 г.). «Дептор является ингибитором mTOR, часто сверхэкспрессируемым в множественных клетках миеломы и необходим для их выживания» . Клетка . 137 (5): 873–86. doi : 10.1016/j.cell.2009.03.046 . PMC 2758791 . PMID 19446321 .
^ Лапланте М., Хорват С., Фестучча В.Т., Бирсой К., Радзек З., Эфеян А., Сабатини Д.М. (август 2012 г.). «Деэптор-клетки-автономный способствует адипогенезу, и его экспрессия связана с ожирением» . Клеточный метаболизм . 16 (2): 202–12. doi : 10.1016/j.cmet.2012.07.008 . PMC 3463374 . PMID 22883231 .
^ Meng ZX, Li S, Wang L, Ko HJ, Lee Y, Jung DY, Okutsu M, Yan Z, Kim JK, Lin JD (май 2013). «BAF60C управляет гликолитическим метаболизмом в мышцах и улучшает системный гомеостаз глюкозы посредством активации AKT-опосредованной депет» » . Природная медицина . 19 (5): 640–5. doi : 10.1038/nm.3144 . PMC 3650110 . PMID 23563706 .
^ Карон А., Барабуи Эд, Лапланте М., Ричард Д. (январь 2015). «DEP-домен, содержащий белок-взаимодействующий с mTOR в мозге крысы: распределение экспрессии и потенциальное значение» . Журнал сравнительной неврологии . 523 (1): 93–107. doi : 10.1002/cne.23668 . PMID 25159114 . S2CID 205683672 .
^ Карон, Александр; Labbé, Sébastien M.; Ланфрей, Дэмиен; Бланшар, Пьер-Жиль; Villot, Роман; Рой, Кристиан; Сабатини, Дэвид М.; Ричард, Денис; Лапланте, Матье (2016). «Сверхэкспрессия гипоталамуса гипоталамуса дектора защищает от ожирения с высоким содержанием жиров» . Молекулярный метаболизм . 5 (2): 102–112. doi : 10.1016/j.molmet.2015.11.005 . PMC 4735664 . PMID 26909318 .

Дальнейшее чтение

Maruyama K, Sugano S (январь 1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (ноябрь 2000). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Исследование генома . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs". Genome Research. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (Sep 2000). "Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing". EMBO Reports. 1 (3): 287–92. doi:10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (Oct 2004). "From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline". Genome Research. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Jan 2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D415–8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

This article on a gene on human chromosome 8 is a stub. You can help Wikipedia by expanding it.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000155792 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022419 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] "Entrez Gene: DEPDC6 DEP -домен, содержащий 6" .

[Ensembl-6] «Homo Sapiens - Ensembl Protein Family - ген: Дептор (ENSG00000155792)» . Бруузер генома Ensembl 78 .

[Peterson_2009-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Петерсон Т.Р., Лапланте М., Торен С.К., Санкак Ю., Кан С.А., Куэль В.М., Грей Н.С., Сабатини Д.М. (май 2009 г.). «Дептор является ингибитором mTOR, часто сверхэкспрессируемым в множественных клетках миеломы и необходим для их выживания» . Клетка . 137 (5): 873–86. doi : 10.1016/j.cell.2009.03.046 . PMC 2758791 . PMID 19446321 .

[8] Лапланте М., Хорват С., Фестучча В.Т., Бирсой К., Радзек З., Эфеян А., Сабатини Д.М. (август 2012 г.). «Деэптор-клетки-автономный способствует адипогенезу, и его экспрессия связана с ожирением» . Клеточный метаболизм . 16 (2): 202–12. doi : 10.1016/j.cmet.2012.07.008 . PMC 3463374 . PMID 22883231 .

[9] Meng ZX, Li S, Wang L, Ko HJ, Lee Y, Jung DY, Okutsu M, Yan Z, Kim JK, Lin JD (май 2013). «BAF60C управляет гликолитическим метаболизмом в мышцах и улучшает системный гомеостаз глюкозы посредством активации AKT-опосредованной депет» » . Природная медицина . 19 (5): 640–5. doi : 10.1038/nm.3144 . PMC 3650110 . PMID 23563706 .

[10] Карон А., Барабуи Эд, Лапланте М., Ричард Д. (январь 2015). «DEP-домен, содержащий белок-взаимодействующий с mTOR в мозге крысы: распределение экспрессии и потенциальное значение» . Журнал сравнительной неврологии . 523 (1): 93–107. doi : 10.1002/cne.23668 . PMID 25159114 . S2CID 205683672 .

[11] Карон, Александр; Labbé, Sébastien M.; Ланфрей, Дэмиен; Бланшар, Пьер-Жиль; Villot, Роман; Рой, Кристиан; Сабатини, Дэвид М.; Ричард, Денис; Лапланте, Матье (2016). «Сверхэкспрессия гипоталамуса гипоталамуса дектора защищает от ожирения с высоким содержанием жиров» . Молекулярный метаболизм . 5 (2): 102–112. doi : 10.1016/j.molmet.2015.11.005 . PMC 4735664 . PMID 26909318 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]